1. Perbedaan Bioteknologi Modern/molekuler dan Bioteknologi

1. Perbedaan Bioteknologi Modern/molekuler dan Bioteknologi konvensional:
2. Contoh Bioteknologi Konvensional
3. Contoh Bioteknologi Modern/Molekuker
4. Apa pengertian gen ?
5. Apa yang anda fahami tentang enzim endonuklease restriksi ?
6. Berikan contoh endonuklease restriksi dan tunjukkan pola potongannya
7. Jelaskan kenapa enzim endonuklease restriksi tipe II yang paling banyak
digunakan dalam rekayasa Genetika
8. Dalam isolasi/ekstraksi DNA, apa fungsi chloroform: isoamilalkohol ( 24:1)
9. Apa sebenarnya fungsi plasmid alami bagi bakteri ?
10. Apakah bakteri bisa hidup tanpa plasmid? Jelaskan
11. Jelaskan fungsi daerah pada plasmid artifisial pBR322 berikut;
a. origin of replication
b. ampr
dan tet r
c. Berikan penjelasan bagaimana yang terjadi jika plamid pBR322 dipotong
dengan enzim endonuklease restriksi BamHI
Dipotong dengan BamHI
12. Plasmid pUC18/19
Jika pada gen lacZ dipotong dengan enzim endonuklease restriksi dan disisipi gen
tertentu, apa yang terjadi jika plasmid hasil rekayasa itu dimasukkan ke dalam bakteri.
Apa warna koloninya jika bakteri tersebut ditumbuhkan dalam media yang mengandung
IPTG dan X-gal ?
13. Jelaskan bagaimana prinsip pemisahan DNA dengan cara elektroforesis.
Jelaskan bagaimana bisa mengetahui ukuran DNA dalam elektoforesis
14. Dalam PCR jelaskan singkat mengenai:
a. Apa fungsi Primer
b. Apa yang terjadi ketika denaturasi
c. Apa itu annealing
d. Apa pula elongation
e. Apa fungsi magensium klorida
F. Apa nama enzim yang digunakan
G. Apa fungsi dNTP
h. Apa fungsi template
15 Jelaskan apa fungsi promoter dan juga terminator dalam gen. Apa itu fungsi kotak Pribnow
(daerah -10) dan apa fungsi promoter pada daerah -35.
16. Dalam plasmid Ti Agrobacterium tumefaciens ada daerah Vir, T -DNA, Tra, Ori, dan gen
metabolisme opin, Jelaskan fungsi daerah gen -gen tersebut.
17. Hasil potongan gen dengan enzim endonuklease restriksi bisa berupa ujung lekat atau ujung
tumpul. Jelaskan apa maksudnya. Berikan contohnya. Ujung yang mana yang menguntungkan
dalam proses penyambungan berikutnya.
18. Dalam enzim endonuklease restriksi ada tata nama yang diberlakukan. Misalnya untuk EcoRI
Jelaskan apa artinya dan berikan deskripsinya.
19. Jelaskan terbentuknya sel tumor pada tanaman yang terinfeksi Agrobakterium tumefacien
Kenapa plasmid Ti yang digunakan saat ini tidak menyebabkan timbulnya tumor pada tanaman.
20. Jelaskan apa itu promoter ? Tuliskan urutan konsensus promoter gen prokaryot pada daerah
-35 dan -10. Apa itu kotak Pribnow?.
21 Dari hasil elektroforesis berikut, anda diminta menentukan b erapa ukuran DNA sampel ?
Ladder Sampel
5000 bp
2000 bp
1650
1000
850
650
500
400
300
200
100
sampel
sampel sampel
ladder
22. Dari peta plasmid berikut, Jelaskan:
a. Plasmid biner atauka h kointegrasi ?
b. Apa arti left T-DNA border dan rig ht T-DNA border.
c. Apa fungsi termonator
d. apa fungsi promoter
e. Apa itu gene interest ?
f. Replication origin for Agrobacterium
g. Replication origin for E.coli
h. T-DNA region removed
i. Plant selectable marker
j. Bacterial selectable marker