SILABUS MIKROBIOLOGI TANAH I. IDENTITAS MATA KULIAH Jurusan/PS Mata Kuliah Kode SKS Semester Prasyarat II. : Biologi : Mikrobiologi Tanah : : 3 SKS) :5 : Mikrobiologi Umum DESKRIPSI MATA KULIAH: Mata kuliah inidiberikan pada mahasiswa untuk dapat memahami Mikroorganisme dalam tanah dan interaksinya dengan lingkungan, Metoda umum yang digunakan dalam memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah, mikroorganisme dalam tanah yang bermanfaat dalam penggunaan sebagai pupuk hayati (Rhizobium) serta factor-faktor pembatas penggunaan legume dan proses nitrifikasi dan denitrifikasi, pemanfaatan Streptomyces sebagai biobakterisida, jenis jenis mikoriza dan Metoda dan prinsip pengamatan mikoriza . Interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman Penguasaan pengetahuan ini akan memberi manfaat bagi pola berpikir yang melandasi kemampuan teknis dalam bersikap dan bertindak bagi pemanfaatan bakteri yang berada di tanah. Standar Kompetensi : Setelah menyelesaikan matakuliah ini yaitu pada akhir semester 5 mahasiswa dapat memahami dan mengusaai pemanfaatan mikroorganisme dalam tanah bagi umat manusia. Kompetensi Dasar 1 1-5 8 9-10 Materi pokok Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Mikroorganisme penghuni tanah serta pemanfaatannya sebagai pupuk hayati dan penghasil biobakterisida Pengantar tentang mikrobiologi tanah , metoda isolasi bakteri tanah dan interaksinya dengan tanaman legume serta penggunaan sebagai pupuk dan biobakterisida 3 Memahami dan mengusaai pemanfaatan mikroorganis me dalam tanah bagi umat manusia 6-7 Indikator Pencapaian Menguasai pengetahuan mikoriza dan metoda pengamatan mikoriza 4 Mahasiswa dapat menerangkan mikoriza, dan cara pengamatan Pengertian jenis jenis mikoriza dan pengamatan Pengalaman Belajar/Kegiatan Mhs 5 Mampu menganalisa mikroorganisme penghuni tanah yang bermanfaat bagi manusia Aloka Media/Sumbe si r Waktu 6 7 4x100 1. Hand out mnt 2. Buku referensi terkait 3. Diskusi dan presentasi Mahasiswa mengetahui jenis dan manfaat mikoriza 1. 2x100 mnt UTS Menguasai pengetahuan mikroba pengurat nitrat Mahasiswa Peran mikroba mampu dalam proses menjelaskan nitrifikasi dan tentang peranan denitrifikasi mikroba pada peranan pada proses nitrifikasi dan denitrifikasi Mempelajari dan mendiskusikan tentang: proses nitrifikasi dan denitrifikasi bakteri pengurau nitrat 2x100 mnt Hand out 2. Buku referen si terkait 3. Diskusi kelas 4. 1. Hand out 2. Buku referen si terkait Diskusi kelas Penilaian 1. 2. 3. 4. UTS 30% UAS 40% Quiz 10% Presentasi 20% 1.UTS 30% 2.UAS 40% 3.Quiz 10% 4.Presentasi 20% 1.UTS 30% 2.UAS 40% 3.Quiz 10% 4.Presentasi 20% 11 UTS 1214 Menguasai pengetahuan tentang peran bakteri rhizozfer sebagai biokontrol dan PGPR serta interaksinya dengan lingkungan 15 Presentasi 16 UAS Menguasai Mhs mampu pengetahuan menguasai peran tentang Interaksi bakteri sebagai akar dan bakteri biokontrol dan dalam proses PGPR serta biokontrol interaksinya pada penyakit tanaman lingkungan serta Peran bakteri yang hidup bebas di lingkungan rhizozfer dalam mempercepat pertumbuhan makanan Mempelajari dan mendiskusikan tentang: peran bakteri sebagai biokontrol dan PGPR 1. 2. 2x100 mnt 1x 100 mnt Hand out Buku referensi terkait 3. Diskusi kelas UTS 30% 2.UAS 40% 3.Quiz 10% 4.Presentasi 20% Presentasi 20% UAS 40 % Referensi Nishizawa, T., M. Zhaorigetu, Y. Komatsuzaki, N. Sato, Kaneko, and H. Ohta. 2010. Molecular Characterization of Fungal Communities in Non-Tilled, Cover-Cropped Upland Rice Field Soils. Microbes and Environment 25(3):204–210. [cited on 4 Nov.2011.] Available from: http:// wwwsoc. nii.ac.jp/ jsme2/ doi:10.1264/jsme2.ME10108. Miyadoh., M. Misa, R. Lilis, R. Roni, and I.R. Rasti. 2009. Taxonomic and Ecologicl Studies of Fungi and Actinomycetes in Indonesia., vol 2. Join Research Project between LIPI and NITE Japan. Penerbit LIPI Jakarta. Minas, W., J.E. Bailey, and W. Duetz. 2001. Streptomycetes in micro-cultures: Growth, production of secondary metabolites, and storage and retrieval in the 96-well format. Kluwer Academic Publishers. Zurich. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Lechevalier, H.A., and S.A Waksman. 1973. Guide to the Classification and Identification of the Actinomycetes and their Antibiotics. Waverly Press Inc. USA. Brundrett, M. 2004. Diversity and classification of mycorrhizal associations. Brundrett, M., N. Bougher, B. Dell,. T. Grove, dan N. Malajczuk. 2008. Working with Mycorrhizas in Forestry and Agriculture. ACIAR Monograph 32. Australian Centre for International Agricultural Research, Canberra. Hapsoh, 2008. Pemanfaatan Fungi Mikoriza Arbuskula pada Budidaya Kedelai di Lahan Kering. Makalah. Pengukuhan Guru Besar. 14 Juni 2008. Kampus USU. Medan. pp 35 Miyasaka, S.C., M. Habte, J.B. Friday and E.V. Johnson. 2003. Manual on arbuscular mycorrhizal fungus production and inoculation techniques. Soil and Crop Management 5: 4. Powel C.L. and D.J. Bagyaraj.1984. Field inoculation with VA mycorrhizal fungi. In VA-Mycorrhizae. CRC Press. Florida. pp 205-222 Rao, N.S.S.1994. Mikroorganisme tanah dan pertumbuhan tanaman. UI Press.Jakarta Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378 Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12 Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATA KULIAH 3. jumlah SKS 4. WAKTU PERTEMUAN 5. PERTEMUAN KE6. INDIKATOR PENCAPAIAN Mikrobiologi Tanah 3 2 x 50menit 1 Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Mikroorganisme penghuni tanah (autokton dan zimogen) dan Interaksi mikroorganisme dengan lingkungan Pengantar tentang mikrobiologi tanah dan mikroorganisme 7. MATERI POKOK penghuni tanah meliputi bakteri, jamur dan interaksinya dengan lingkungan Mengetahui dan menganalisa mikroorganisme penghuni tanah dan 8. PENGALAMAN interaksinya dengan lingkungan melalui pemaparan, diskusi dan BELAJAR unjuk kerja (presentasi) STRATEGI PEMBELAJARAN TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN (1) (2) (3) (4) Pembukaan Pengantar tentang Melihat, Mikrobiologi tanah mendengarkanpenjelasan, Kehadiran dan limbah sertamencatat Pembahasan tentang Melihat, 1. Kehadiran Penyajian keberadaan dari mendengarkanpenjelasan, 2. Keseriusan mikroorganisme sertamencatat 3. Kemampuan penghuni tanah baik menjawab bakteri, jamur, virus dan interaksinya dengan lingkungan Menjelaskan dan diskusi dua arah factor-faktor yang berperan terhadap keberadaan mikroorganisme penghuni tanah Penutup Merangkum materi yang telah dibahas Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Idem Media dan Komputer, LCD, White board, spidol Alat Pembelajaran Referensi Miyadoh., M. Misa, R. Lilis, R. Roni, and I.R. Rasti. 2009. Taxonomic and Ecologicl Studies of Fungi and Actinomycetes in Indonesia., vol 2. Join Research Project between LIPI and NITE Japan. Penerbit LIPI Jakarta. Minas, W., J.E. Bailey, and W. Duetz. 2001. Streptomycetes in microcultures: Growth, production of secondary metabolites, and storage and retrieval in the 96-well format. Kluwer Academic Publishers. Zurich. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil Tandatangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATA KULIAH 3. jumlah SKS 4. WAKTU PERTEMUAN 5. PERTEMUAN KE6. INDIKATOR PENCAPAIAN 7. MATERI POKOK 8. PENGALAMAN BELAJAR TAHAPAN (1) Pembukaa n Penyajian Mikrobiologi Tanah 3 2 x 50menit 2 Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan metoda umum yang digunakan untuk memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah. Cara pengambilan sampel tanah, isolasi dan identifikasi serta menghitung populasi Mengetahui dan menganalisa metoda yang digunakan dalam mengisolasi mengidentifikasi mdan mengitung totak mikroba. STRATEGI PEMBELAJARAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA (2) (3) Pengantar tentang Melihat, bakteri populasi mendengarkanpenjelasan, mikroba tanah sertamencatat Menjelaskan dan Melihat, mendengarkan diskusi tentang cara penjelasan, sertamencatat identifikasi dan isolasi dan pelarutan tanah dan perhitungan lempeng PENILAIAN (4) Kehadiran 1.Kehadiran 2.Keseriusan 3.Kemampuan menjawab Menjelaskan dan diskusi dua arah metoda MPN untuk Nitrobacter, kultur diperkaya dan pengamatan langsung dengan mikroskop Penutup Merangkum materi yang telah dibahas Media dan Alat Pembelajar an Referensi Komputer, LCD, White board, spidol Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Idem Brockwell.J.1981.A Strategi for legume nodulation research in developing regions of the old world. Plant Soil 58:367-382. Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. SpringerVerlag. New York. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil Tandatangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATA KULIAH 3. jumlah SKS 4. WAKTU PERTEMUAN 5. PERTEMUAN KE6. INDIKATOR PENCAPAIAN 7. MATERI POKOK Mikrobiologi Tanah 3 2 x 50menit 3 Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Bakteri Rhizobium sebagai pupuk hayati serta cara pembuatan dan aplikasinya. Pengertian Rhizobium , cara isolasi dan identifikasi Rhizobium, proses terjadinya simbiosis, faktor-faktor yang menghambat proses simbiosis dan aplikasi Rhizobium sebagai pupuk hayati Rhizobium sebagai pupuk hayati 8. PENGALAMAN BELAJAR TAHAPAN (1) Pembukaa n Penyajian Mengetahui dan menganalisa keuntungan penggunaan pupuk hayati dari Rhizobium melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi) STRATEGI PEMBELAJARAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN (2) (3) (4) Pengantar tentang Melihat, bakteri Rhizobium, mendengarkanpenjelasan, Kehadiran keberadaan dan sertamencatat manfaat Menjelaskan dan Melihat, 1.Kehadiran diskusi tentang cara mendengarkanpenjelasan, 2.Keseriusan identifikasi dan isolasi sertamencatat 3.Kemampuan dan Menjelaskan menjawab bagaimana mekanisme simbiosis antara rhizobium dan tanaman inangnya Menjelaskan dan diskusi dua arah Faktor-faktor yang menghambat dan mendukung proses simbiosis Penutup Media dan Alat Menjelaskan dan diskusi dua arah Pengaplikasiannya pupuk Rhizobium di laboratorium dan rumah kaca Merangkum materi yang telah dibahas Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Komputer, LCD, White board, spidol Idem Pembelajar an Referensi Brockwell.J.1981.A Strategi for legume nodulation research in developing regions of the old world. Plant Soil 58:367-382. Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. SpringerVerlag. New York. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil Tandatangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATA KULIAH 3. jumlah SKS 4. WAKTU PERTEMUAN 5. PERTEMUAN KE6. INDIKATOR PENCAPAIAN 7. MATERI POKOK 8. PENGALAMAN BELAJAR TAHAPAN (1) Pembukaa n Penyajian Mikrobiologi Tanah 3 2 x 50menit 4 Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan ekologi dari bakteri bintil akar (RNB) Pengertian mengenai RNB yaitu tingkah laku bakteri RNB dalam beradaptasi terhadap lingkungan sehingga mampu untuk bertahan pada tanah Mengetahui dan menganalisa factor yang mempengaruhi bakteri RNB melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi) STRATEGI PEMBELAJARAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA (2) (3) Pengantar ekologi Melihat, dari bakteri RNB mendengarkanpenjelasan, sertamencatat Menjelaskan dan Melihat, diskusi tentang mendengarkanpenjelasan, Tingkah laku bakteri sertamencatat RNB dalam beradaptasi terhadap lingkungan sehingga mampu untuk tumbuh dan bertahanh pada tanah PENILAIAN (4) Kehadiran 1.Kehadiran 2.Keseriusan 3.Kemampuan menjawab Menjelaskan dan diskusi dua arah Beberapa metoda untuk mengidentifikasi RNB dan pengukuran aktivitas RNB pada tanah Penutup Media dan Alat Pembelajar Menjelaskan dan diskusi dua arah Fisiologi bakteri RNB toleransi terhadap stress fisik interaksi biotik dan distribusi RNB Merangkum materi yang telah dibahas Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Komputer, LCD, White board, spidol Idem an Referensi Brockwell.J.1981.A Strategi for legume nodulation research in developing regions of the old world. Plant Soil 58:367-382. Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. SpringerVerlag. New York. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil Tandatangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATA KULIAH 3. jumlah SKS 4. WAKTU PERTEMUAN 5. PERTEMUAN KE6. INDIKATOR PENCAPAIAN 7. MATERI POKOK Mikrobiologi Tanah 3 2 x 50menit 5 Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Streptomyces sebagai biobakterisida Bakteri Streptomyces , cara isolasi antibiotika dan enzim, dan cara aplikasinya sebagai biobakterisida. Mengetahui dan mempelajari pembuatan dan penggunaan 8. PENGALAMAN Streptomyces sebagai biobakterisida melalui pemaparan, diskusi BELAJAR dan unjuk kerja (presentasi) STRATEGI PEMBELAJARAN TAHAPAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN (1) (2) (3) (4) Pembukaa Pengantar tentang Melihat, n Streptomyces mendengarkanpenjelasan, Kehadiran penghasil antibiotika sertamencatat Menjelaskan dan diskusi Melihat, mendengarkan 1.Kehadiran Penyajian isolasi metabolit primer penjelasan, sertamencatat 2.Keseriusan yaitu enzim dan 3.Kemampuan metabolit sekunder yaitu menjawab antibiotika sebagai biobakterisida Menjelaskan dan diskusi dua arah aplikasi Streptomyces sebagai biobakterisida di labolatorium, rumah kaca dan di lapangan Penutup Merangkum materi yang telah dibahas Media dan Alat Pembelajar an Referensi Komputer, LCD, White board, spidol Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Idem Neidhart, F.C., J.L. Ingraham, and M. Schaecter. 1990. Physiology of the bacteriology cell; A Molecular Approach. Sinaver Assoc. Inc. New York. Narayana, K. J. P., P. Prabhakar, M. Vijayalakshmi, Y. Venkateswarlu, and P.S.J. Krishna. 2007. Study on bioactive compounds from Steptomyces sp. ANU 6277. Polish Journal of Microbiology 57(1): 35-39. Nishizawa, T., M. Zhaorigetu, Y. Komatsuzaki, N. Sato, Kaneko, and H. Ohta. 2010. Molecular Characterization of Fungal Communities in Non-Tilled, Cover-Cropped Upland Rice Field Soils. Microbes and Environment 25(3):204–210. [cited on 4 Nov.2011.] Available from: http:// wwwsoc. nii.ac.jp/ jsme2/ doi:10.1264/jsme2.ME10108. Miyadoh., M. Misa, R. Lilis, R. Roni, and I.R. Rasti. 2009. Taxonomic and Ecologicl Studies of Fungi and Actinomycetes in Indonesia., vol 2. Join Research Project between LIPI and NITE Japan. Penerbit LIPI Jakarta. Minas, W., J.E. Bailey, and W. Duetz. 2001. Streptomycetes in micro-cultures: Growth, production of secondary metabolites, and storage and retrieval in the 96-well format. Kluwer Academic Publishers. Zurich. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Lechevalier, H.A., and S.A Waksman. 1973. Guide to the Classification and Identification of the Actinomycetes and their Antibiotics. Waverly Press Inc. USA. Dosen : Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil Tandatangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah 3. jumlah SKS 4. WAKTU PERTEMUAN 5. PERTEMUAN KE6. INDIKATOR PENCAPAIAN 7. MATERI POKOK 8. PENGALAMAN BELAJAR TAHAPAN (1) Pembukaa n 3 2 x 50menit 6 Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan Mikoriza Pengertian Mikoriza Mikoriza dan interaksinya dengan tumbuhan vascular, Jenis-jenis mikoriza peranan mikoriza terhadap tanaman dan ekosistem serta mekanisme simbiosis mikoriza dengan tumbuhan Mengetahui dan mempelajari Mikoriza dan melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi) STRATEGI PEMBELAJARAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN (2) (3) (4) Menjelaskan cakupan Melihat, materi (termasuk mendengarkanpenjelasan, Kehadiran pembuatan paper tiap sertamencatat mahasiswa dan presentasi paper) Penyajian Kuliah dan diskusi cakupan materi mikoriza, disertai contoh-contoh mikoriza Melihat, mendengarkan penjelasan, sertamencatat 1.Kehadiran 2.Keseriusan 3.Kemampuan menjawab Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Idem Menjelaskan dan diskusi dua arah bagaimana cara interaksi/simbiosis dengan tanaman inangnya Menjelaskan dan diskusi dua arah factor-faktor yang berperan terhadap simbiosis mikoriza dan tanaman inang Penutup Merangkum materi yang telah dibahas Media dan AlatPembel ajaran Referensi Komputer, LCD, White board, spidol Brundrett, M. 2004. Diversity and classification of mycorrhizal associations. Brundrett, M., N. Bougher, B. Dell,. T. Grove, dan N. Malajczuk. 2008. Working with Mycorrhizas in Forestry and Agriculture. ACIAR Monograph 32. Australian Centre for International Agricultural Research, Canberra. Hapsoh, 2008. Pemanfaatan Fungi Mikoriza Arbuskula pada Budidaya Kedelai di Lahan Kering. Makalah. Pengukuhan Guru Besar. 14 Juni 2008. Kampus USU. Medan. pp 35 Miyasaka, S.C., M. Habte, J.B. Friday and E.V. Johnson. 2003. Manual on arbuscular mycorrhizal fungus production and inoculation techniques. Soil and Crop Management 5: 4. Powel C.L. and D.J. Bagyaraj.1984. Field inoculation with VA mycorrhizal fungi. In VA-Mycorrhizae. CRC Press. Florida. pp 205-222 Dosen : Dr.Dra. Meitini.Wahyuni Proborini. M.Sc.St Tandatangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATA KULIAH Mikrobiologi Tanah 3. jumlah SKS 4. WAKTU PERTEMUAN 5. PERTEMUAN KE6. INDIKATOR PENCAPAIAN 7. MATERI POKOK 3 2 x 50menit 6 Mahasiswa dapat memahami dan menerangkan metode dan prinsip pengamatan mikoriza Metode pengamatan mikoriza 8. PENGALAMAN BELAJAR Mengetahui dan mempelajari metode pengamtatan mikoriza melalui pemaparan, diskusi dan unjuk kerja (presentasi) TAHAPAN (1) Pembukaa n STRATEGI PEMBELAJARAN KEGIATAN DOSEN KEGIATAN MAHASISWA PENILAIAN (2) (3) (4) Diskusi materi minggu Melihat, lalu yang belum mendengarkanpenjelasan, Kehadiran terselesaikan sertamencatat Penyajian Menjelaskan dan diskusi tentang metode pengamatan mikoriza. Penutup Merangkum materi yang telah dibahas Media dan Alat Pembelajara n Referensi Melihat, mendengarkan penjelasan, sertamencatat Menyimak, mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Komputer, LCD, White board, spidol 1.Kehadiran 2.Keseriusan 3.Kemampuan menjawab Idem Powel C.L. and D.J. Bagyaraj.1984. Field inoculation with VA mycorrhizal fungi. In VA-Mycorrhizae. CRC Press. Florida. pp 205-222 Sieverding E 1991. Vesicular-Arbuscular Mycorrhiza Management in Tropical Agrosystems. GTZ, Eschborn, Germany. Simanungkalit, R. D. M. 2003. Teknologi cendawan Mikoriza Arbuskuler: Produksi inokulan dan pengawasan mutunya. Smith, S.E. and D.J. Read. 1997. Mycorrhizal Symbiosis. (2nd edition). Academic Press, London. 605pp. Brundrett, M., N. Bougher, B. Dell,. T. Grove, dan N. Malajczuk. 2008. Working with Mycorrhizas in Forestry and Agriculture. ACIAR Monograph 32. Dosen : Dr.Dra. Meitini.Wahyuni Proborini. M.Sc.St Tandatangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATAKULIAH 3. WAKTU PERTEMUAN 4. PERTEMUAN KE5. INDIKATOR PENCAPAIAN Mikrobiologi Tanah 2 x50 menit 7 Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan mikroba pada proses nitrifikasi 6. MATERI POKOK 7. PENGALAMAN BELAJAR TAHAPAN (1) Pembukaan Penyajian Peran mikroba pada proses nitrifikasi Mempelajari dan mendiskusikan tentang: Peran mikroba dalam proses nitrifikasi pada tanaman legum STRATEGI PEMBELAJARAN MEDIA DAN KEGIATAN KEGIATAN ALAT MAHASISWA PEMBELAJARAN (2) (3) (4) Memberikan ulasan umum Melihat, Kontrak perkuliahan, tentang materi yang akan mendengarkan silabus, SAP, buku teks, dibahas penjelasan, dan tugas terstruktur, mencatat power point presentation, lap top, LCD Menjelaskan tentang: Melihat, Idem Menjelaskan dan diskusi mendengarkan tentang proses nitrifikasi dan penjelasan, mencatat factor factor penghambat dan berdiskusi nitrifikasi pada tanaman legum Penutup Post Test Merangkum materi yang telah dibahas Menyimak, Idem mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap Referensi Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. SpringerVerlag. New York. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen : Drs IBG Darmayasa M.Si Tanda Tangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATAKULIAH 3. WAKTU PERTEMUAN 4. PERTEMUAN KE5. INDIKATOR Mikrobiologi Tanah 2 x 50 menit 8 Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan PENCAPAIAN 6. MATERI POKOK 7. PENGALAMAN BELAJAR TAHAPAN (1) Pembukaan Penyajian Penutup Post Test mikroorganisme dalam proses denitrifikasi Peran mikroba dalam proses dentrifikasi pada tanaman legum Mempelajari dan mendiskusikan tentang: peranan mikroba dalam peristiwa perubahan nitrat dan nitrit menjadi nitrogen molekuler atau oksida nitrogen STRATEGI PEMBELAJARAN MEDIA DAN KEGIATAN KEGIATAN ALAT MAHASISWA PEMBELAJARAN (2) (3) (4) Memberikan ulasan umum Melihat, SAP, buku teks, tugas tentang materi yang dibahas mendengarkan terstruktur, penjelasan, dan power point mencatat presentation, lap top, LCD Menjelaskan tentang Melihat, Idem Proses denitrifikasi, reaksi mendengarkan kimia denitrifikasi, penjelasan, mencatat dekomposisi nitrogen dan dan berdiskusi derivatnya serta pembentukan amonia oleh berbagai mikroba Merangkum materi yang Menyimak, Idem telah dibahas mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap Referensi Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. SpringerVerlag. New York. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen : Drs IBG Darmayasa M.Si Tanda Tangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATAKULIAH 3. WAKTU PERTEMUAN 4. PERTEMUAN KE- Mikrobiologi Tanah 2 x 50 menit 9 5. INDIKATOR PENCAPAIAN 6. MATERI POKOK Mhs mampu menguasai factor-faktor pembatas penggunaan legume di bidang pertanian Pengertian tentang factor factor lingkungan yang menghambat dalam simbiosis tanaman legume dan inangnya 7. PENGALAMAN Mempelajari dan mendiskusikan tentang: factor lingkungan BELAJAR sebagai pembatas simbiosis tanaman legume STRATEGI PEMBELAJARAN MEDIA DAN KEGIATAN TAHAPAN KEGIATAN ALAT MAHASISWA PEMBELAJARAN (1) (2) (3) (4) Pembukaan Memberikan ulasan umum Melihat, Kontrak perkuliahan, tentang materi yang akan mendengarkan silabus, SAP, buku teks, dibahas penjelasan, dan tugas terstruktur, mencatat power point presentation, lap top, LCD Penyajian Menjelaskan tentang: faktor Melihat, Idem lingkungsn sebagai mendengarkan pembatas penggunaan penjelasan, mencatat legum yaitu salinitas, pH, dan berdiskusi temperatur, air, nitrogen terkombinasi, zat tumbuh dan faktor genetik Penutup Merangkum materi yang Menyimak, Idem telah dibahas mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Post Test Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap Referensi Brockwell.J.1981.A Strategi for legume nodulation research in developing regions of the old world. Plant Soil 58:367-382. Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. SpringerVerlag. New York. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen Drs Yan Ramona M.App.Sc, Ph.D. Tanda Tangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATAKULIAH 3. WAKTU PERTEMUAN Mikrobiologi Tanah 2 x 50 menit 4. PERTEMUAN KE5. INDIKATOR PENCAPAIAN 6. MATERI POKOK 10 Menguasai tentang interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman Pengertian tentang bakteri yang dapat digunakan sebagai biokontrol pathogen tanaman 7. PENGALAMAN Mempelajari dan mendiskusikan tentang pengendalian BELAJAR pathogen menggunakan biokontrol STRATEGI PEMBELAJARAN MEDIA DAN KEGIATAN TAHAPAN KEGIATAN ALAT MAHASISWA PEMBELAJARAN (1) (2) (3) (4) Pembukaan Memberikan ulasan umum Melihat, Kontrak perkuliahan, tentang materi yang akan mendengarkan silabus, SAP, buku teks, dibahas penjelasan, dan tugas terstruktur, mencatat power point presentation, lap top, LCD Penyajian Menjelaskan tentang: plant Melihat, Idem growth promoting bacteria mendengarkan PGPR, endophytes, penjelasan, mencatat biokontrol nematoda, dan berdiskusi eksistensi biokontrol pada patogen sistemik dan patogen daun Penutup Post Test Merangkum materi yang telah dibahas Menyimak, Idem mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap Referensi Rao, N.S.S.1994. Mikroorganisme tanah dan pertumbuhan tanaman. UI Press.Jakarta Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378 Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12 Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Somasegaran,P and H.J.Hoben. 1994. Handbook for Rhizobia.. SpringerVerlag. New York. Dosen : Drs Yan Ramona M.App.Sc, Ph.D. Tanda Tangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATAKULIAH 3. WAKTU PERTEMUAN 4. PERTEMUAN KE5. INDIKATOR PENCAPAIAN Mikrobiologi Tanah 2 x 50 menit 11 Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan bakteri penghuni tanah yang dapat digunakan sebagai agen biokontrol 6. MATERI POKOK Pengembangan Biological control agent yang diisolasi dari tanah 7. PENGALAMAN Mempelajari dan mendiskusikan tentang: pengendalian BELAJAR patogen tanaman dengan menggunakan biokontrol STRATEGI PEMBELAJARAN MEDIA DAN KEGIATAN TAHAPAN KEGIATAN ALAT MAHASISWA PEMBELAJARAN (1) (2) (3) (4) Pembukaan Memberikan ulasan umum Melihat, SAP, buku teks, tugas tentang materi yang dibahas mendengarkan terstruktur, penjelasan, dan power point mencatat presentation, lap top, LCD Penyajian Menjelaskan tentang Melihat, Idem a. Interaksi mikroba dalam mendengarkan tanah penjelasan, mencatat b.Peran PGPR dalam dan berdiskusi biokontrol c.Mekanisme biokontrol (kompetisi, antibiosis, dll) Penutup Merangkum materi yang Menyimak, Idem telah dibahas mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Post Test Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap Referensi Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378 Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12 Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen : Drs Yan Ramona M.App.Sc.Ph.D. Tanda Tangan Satuan Acara Perkuliahan (SAP) 1. MATA KULIAH 2. KODE MATAKULIAH 3. WAKTU PERTEMUAN 4. PERTEMUAN KE5. INDIKATOR PENCAPAIAN Mikrobiologi Tanah 2 x 50 menit 12 Mahasiswa mampu menjelaskan tentang peranan bakteri yang hidup pada rhizozfer tanaman 6. MATERI POKOK 7. PENGALAMAN BELAJAR TAHAPAN (1) Pembukaan Penyajian Penutup Post Test Referensi Peran bakteri rhizozfer Mempelajari dan mendiskusikan tentang: peran bakteri rhizozfer dalam menghambat pathogen tanaman STRATEGI PEMBELAJARAN MEDIA DAN KEGIATAN KEGIATAN ALAT MAHASISWA PEMBELAJARAN (2) (3) (4) Memberikan ulasan umum Melihat, SAP, buku teks, tugas tentang materi yang dibahas mendengarkan terstruktur, penjelasan, dan power point mencatat presentation, lap top, LCD Menjelaskan tentang Melihat, Idem Bakteri rhizozfer dalam mendengarkan mekanisme yang bersifat penjelasan, mencatat antibiosis, mekanisme dan berdiskusi ngrowth promotion secara langsung, strategi efektifitas PGPR Merangkum materi yang Menyimak, Idem telah dibahas mengajukan pertanyaan dan pendapat dalam diskusi Pertanyaan lisan, penilaian/evaluasi terhadap proses pembelajaran, dan penilaian terhadap unjuk sikap Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378 Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12 Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Dosen : Drs Yan Ramona M.App.Sc.Ph.D. Tanda Tangan KONTRAK PERKULIAHAN Nama Mata Kuliah Kode Mata Kuliah Pengajar : Mikrobiologi Tanah : : . Dr.Dra.Retno Kawuri.M.Phil Drs.Yan Ramona.M.App.Sc.Ph.D Dr.Dra.Meitini W.Proborini.M.Sc.St Drs IBG Darmayasa M.Si Semester : Genap Hari pertemuan/Jam : Rabu 10.30 – 12.10 Tempat Pertemuan : Ruang BG BB 1. Manfaat Mata Kuliah Mata kuliah inidiberikan pada mahasiswa untuk dapat memahami peran mikroorganisme dalam tanah yang dapat dipergunakan baik sebagai penghasil pupuk hayati, antibiotika, biokontrol patogen, proses nitrifikasi dan denitrifikasi oleh mikroba penambat nitrogen , dan peran bakteri sebagai biokontrol pengendali hayati terhadap patogen di tanaman. Mikoriza bermanfaat bagi pengelolaan lahan kering. Penguasaan pengetahuan ini akan memberi manfaat bagi pola berpikir yang melandasi kemampuan teknis dalam bersikap dan bertindak bagi pemanfaatan bakteri yang berada di tanah. 2. Deskripsi Perkuliahan Mata kuliah ini membahas tentang . Mikroorganisme dalam tanah dan interaksinya dengan lingkungan, Metoda umum yang digunakan dalam memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah, mikroorganisme dalam tanah yang bermanfaat dalam penggunaan sebagai pupuk hayati (Rhizobium) srta factor-faktor pembatas penggunaan legume dan proses nitrifikasi dan denitrifikasi, pemanfaatan Streptomyces sebagai biobakterisida, jenis jenis mikoriza dan Metoda dan prinsip pengamatan mikoriza . Interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman 3. Standar Kompetensi Setelah menyelesaikan matakuliah ini yaitu pada akhir semester mahasiswa dapat memahami dan mengusaai pemanfaatan mikroorganisme dalam tanah bagi umat manusia. 4. Kompetensi dasar Memahami ilmu Mikrobiologi umum. Mikologi, Mikrobiologi lingkungan dan Bioteknologi 5. StrategiPerkuliahan Strategi instruksional yang digunakan pada mata kuliah ini terdiri dari: a. Urutan kegiatan instruksional berupa: pendahuluan, cakupan materi pokok bahasan, dan relevansi), penyajian (uraian, contoh, diskusi, evaluasi), dan penutup (umpan balik, ringkasan materi, petunjuk tindak lanjut, pemberian tugas di rumah, gambaran singkat tentang materi berikutnya) b. Metode instruksional menggunakan: metode ceramah, demonstrasi, tanya-jawab, diskusi kasus, dan penugasan. Ceramah berupa penyampaian bahan ajar oleh dosen pengajar dan penekananpenekanan pada hal-hal yang penting dan bermanfaat untuk diterapkan nantinya dalam praktek sebagai dokter umum. Tanya jawab dilakukan sepanjang tatap muka, dengan memberikan kesempatan mahasiswa untuk memberi pendapat atau pertanyaan tentang halhal yang tidak mereka mengerti atau bertentangan dengan apa yang mereka pahami sebelumnya. Diskusi kasus dilakukan dengan memberikan contoh kasus/kondisi pada akhir pokok bahasan, mengambil tema yang sedang aktual di masyarakat dan berkaitan dengan pokok bahasan tersebut, kemudian mengajak mahasiswa untuk memberikan pendapat atau menganalisis secara kritis kasus/kondisi tersebut sesuai dengan pengetahuan yang baru mereka dapatkan. Penugasan diberikan untuk membantu mahasiswa memahami bahan ajar, membuka wawasan, dan memberikan pendalaman materi. Penugasan bisa dalam bentuk menulis tulisan ilmiah, membuat review artikel ilmiah, ataupun membuat tulisan yang membahas kasus/kondisi yang berkaitan dengan pokok bahasan. Pada penugasan ini, terdapat komponen ketrampilan menulis ilmiah, berpikir kritis, penelusuran referensi ilmiah, dan ketrampilan bahasa Inggris. c. Media instruksionalnya berupa: LCD projector, whiteboard ,jurnal ilmiah, , handout, dan kontrak perkuliahan. 6. Materi Pokok 1. Mikroorganisme dalam tanah dan interaksinya dengan lingkungan 2. Metoda umum yang digunakan dalam memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah 3. Penggunaan mikroba sebagai pupuk hayati 4. Ekologi dari bakteri bintil akar 5. Streptomyces sebagai penghasil agen biobakterisida 6. Mikorhiza dan endomycorhiza 7. Metoda dan prinsip pengamatan mikoriza 8. Proses Nitrifikasi 9. Proses DeNitrifikasi 10. Faktor – factor pembatas dalam penggunaan legume di bidang pertanian 11. Interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman 12. Peran bakteri yang hidup bebas di lingkungan rhizozfer dalam mempercepat pertumbuhan makanan 13. Tugas mandiri, presentasi 7. BacaanPerkuliahan Referensi Nishizawa, T., M. Zhaorigetu, Y. Komatsuzaki, N. Sato, Kaneko, and H. Ohta. 2010. Molecular Characterization of Fungal Communities in Non-Tilled, CoverCropped Upland Rice Field Soils. Microbes and Environment 25(3):204– 210. [cited on 4 Nov.2011.] Available from: http:// wwwsoc. nii.ac.jp/ jsme2/ doi:10.1264/jsme2.ME10108. Miyadoh., M. Misa, R. Lilis, R. Roni, and I.R. Rasti. 2009. Taxonomic and Ecologicl Studies of Fungi and Actinomycetes in Indonesia., vol 2. Join Research Project between LIPI and NITE Japan. Penerbit LIPI Jakarta. Minas, W., J.E. Bailey, and W. Duetz. 2001. Streptomycetes in micro-cultures: Growth, production of secondary metabolites, and storage and retrieval in the 96-well format. Kluwer Academic Publishers. Zurich. Madigan, M. T. and J.M. Martinko, and J. Parker. 2003. Brock Biology of Microorganisms. Eight edition. Prentice Hall, Inc. New Jersey Lechevalier, H.A., and S.A Waksman. 1973. Guide to the Classification and Identification of the Actinomycetes and their Antibiotics. Waverly Press Inc. USA. Brundrett, M. 2004. Diversity and classification of mycorrhizal associations. Brundrett, M., N. Bougher, B. Dell,. T. Grove, dan N. Malajczuk. 2008. Working with Mycorrhizas in Forestry and Agriculture. ACIAR Monograph 32. Australian Centre for International Agricultural Research, Canberra. Hapsoh, 2008. Pemanfaatan Fungi Mikoriza Arbuskula pada Budidaya Kedelai di Lahan Kering. Makalah. Pengukuhan Guru Besar. 14 Juni 2008. Kampus USU. Medan. pp 35 Miyasaka, S.C., M. Habte, J.B. Friday and E.V. Johnson. 2003. Manual on arbuscular mycorrhizal fungus production and inoculation techniques. Soil and Crop Management 5: 4. Powel C.L. and D.J. Bagyaraj.1984. Field inoculation with VA mycorrhizal fungi. In VA-Mycorrhizae. CRC Press. Florida. pp 205-222 Rao, N.S.S.1994. Mikroorganisme tanah dan pertumbuhan tanaman. UI Press.Jakarta Glick, B.R. and Y.Bashan.1997. Genetic manipulation of plant growth promoting rhizobacteria to enhance biocontrol of phytopathogen. Biotecnology Advance 15:353-378 Haggag,W.M. H.A.Latief. A.Muhamed.2007.Biotecnological aspect of microorganism used in plant biological control. American Eurasian J.of Sust.Agric.1(1):7-12 8. Tugas Dalam perkuliahan, diberikan beberapa tugas sebagai berikut: a. Materi perkuliahan sebagaimana disebutkan dalam jadwal perkuliahan harus sudah dibaca sebelum mengikuti tatap muka. Apabila ada, handout sudah akan diserahkan pada mahasiswa sebelum hari kuliah. b. Quiz diberikan pada tiap kali tatap muka untuk menilai pemahaman mahasiswa dan absensi. Kehadiran pada tatap muka minimal 80%. 9. KriteriaPenilaian Penilaian akan dilakukan oleh pengajar dengan menggunakan kriteria PAP sebagai berikut: Nilai dalam huruf A B C D E Point 4,0 3 2,0 1,0 0 Pembobotan nilai adalah sebagai berikut: Nilai Tugas Presentasi : 20% Nilai UTS : 30% Nilai UAS : 40% Nilai Quiz : 10% 10. Jadwal perkuliahan Rentang skor 80-100 70-79 60-69 50-59 00-49 Perte Topik Dosen muan Mikroorganisme dalam tanah dan Retno Kawuri 1 Tanggal interaksinya dengan lingkungan 2 Metoda umum yang digunakan Retno Kawuri dalam memisahkan dan mempelajari mikroorganisme tanah 3 Penggunaan mikroba sebagai Retno Kawuri pupuk hayati Retno Kawuri Ekologi dari bakteri bintil akar 4 5 6 Streptomyces sebagai penghasil Retno Kawuri agen biobakterisida Meitini WP Mikorhiza dan endomycorhiza 8 9 Metoda dan prinsip pengamatan Meitini WP mikoriza UTS I materi 1 - 7 Retno, Meitini IBG Darmayasa Proses Nitrifikasi 10 Proses DeNitrifikasi IBG Darmayasa 11 Faktor – factor pembatas dalam penggunaan legume di bidang pertanian Interaksi akar dan bakteri dalam proses biokontrol penyakit tanaman Peran bakteri yang hidup bebas di lingkungan rhizozfer dalam mempercepat pertumbuhan makanan UTS, II materi 9-10 Presentasi mandiri UAS materi 11-13 Yan Ramona 7 12 13 14 15 16 Yan Ramona Yan Ramona IBG Darmayasa , Y Retno Kawuri Yan Ramona Demikian kontrak perkuliahan ini dibuat, agar disetujui dan ditaati oleh semua pihak. Denpasar, Menyetujui 2015 Mahasiswa (.........................................) Dosen/Koordinator MK (Dr Dra Retno Kawuri. M.Phil) Mahasiswa (........................)