Taman Laut Nasional adalah kawasan pelestarian alam yang mempunyai ekosistem asli, dikelola dengan sistem zonasi yang dimanfaatkan untuk tujuan penelitian, ilmu pengetahuan, pendidikan,menunjang budidaya, pariwisata dan rekreasi (UU No. 5 Tahun 1990 tentang Konservasi SumberDaya Alam Hayati dan Ekosistemnya). Sejak Tahun 1995 Pemerintah pusat menetapkan kawasan tersebut sebagai kawasan Taman Nasional Laut dengan nama Taman Nasional KepulauanWakatobi melalui Surat Keputusan Menteri Kehutanan No. 393/Kpts-VI/1996tanggal 31 Juli 1996. Kawasan tersebut dibagi menjadi lima zona.Nama WAKATOBI diambil dari nama awal empat pulau utama di kawasan tersebut yaitu (Wanci, Kaledupa, Tomia & Binongko). Dengan pengawasan sebuah kantor perwakilan Taman Nasional di kota Baubau. Secara geografis letak kepulauan ini antara Laut Banda dan Laut Flores dan letak administratif berbatasan dengan Laut Banda dan Kabupaten Muna secara keseluruhan lokasi Taman Nasional Laut waktobi terletak di kaki ujung Pulau Sulawesi Bagian Tenggara. Wakatobi berdiri sebagai taman laut nasional di tahun 1996. Taman laut nasional ini termasuk kepulauan Wangi-wangi, Kaledupa, Tomia, dan Binongko, dengan total area 1,39 juta ha. Menyangkut keanekaragaman hayati laut, skala dan kondisi karang, Wakatobi menempati salah satu posisi prioritas tertinggi dari konservasi laut di Indonesia ini juga merupakan bagian terpenting dalam sebuah jaringan