LOGO PROTEIN Mochamad Nurcholis, STP.MP. Daftar Isi 1 Struktur & Jenis Asam Amino 2 Struktur & Jenis Protein 3 Isolasi Protein 4 Pemurnian Protein ASAM AMINO Unit penyusun protein Mengandung : - 1 gugus amino - 1 gugus karboksilat - 1 gugus R Terikat pada C-α (kiral) Amfoter SINGKATAN ASAM AMINO Asam Amino 3 Huruf 1 huruf 3 Huruf 1 huruf Alanine Ala A Leucine Leu L Arginine Arg R Lysine Lys K Asparagine Asn N Methionine Met M (Asam) Aspartat Asp D Phenylalanine Phe F Cystein Cys C Proline Pro P Glutamine Gln Q Serine Ser S (Asam) Glutamat Glu E Threonine Thr T Glycine Gly G Tryptophane Trp W Histidine His H Tyrosine Tyr Y Isoleucine Ile I Valine Val V Klasifikasi Asam Amino Asam Amino Essensial : Tidak bisa disintesa o/ tubuh manusia Diperoleh dari bahan pangan Non-Essensial : Bisa disintesa o/ tubuh manusia Asam Amino Essensial Amino Acid FAO Skim Milk Soya Beef Egg Fish Yeast Lysine 4,2 8,6 6,8 8,3 6,3 6,6 6,8 Tryptophan 1,4 1,5 1,4 1,0 1,5 1,6 0,8 Phenylalanine 2,8 5,5 5,3 3,5 5,7 4,1 4,5 Methionine 2,2 3,2 1,7 2,8 3,2 3,0 2,6 Threonine 2,8 4,7 3,9 4,5 4,9 4,8 5,0 Leucine 4,8 11,0 8,0 7,2 9,0 10,5 8,3 Isoleucine 4,2 7,5 6,0 4,7 6,2 7,7 5,5 Valine 4,2 7,0 5,3 5,1 7,0 5,3 5,9 Kadar asam amino (g/100 gram bahan) Klasifikasi Asam Amino Berdasarkan Gugus -R Asam Amino Non-Polar (Hidrofobik) Polar (Hidrofilik) Polar bermuatan (-) Polar bermuatan (+) Alanine Asparagine Asam aspartat Lysine Methionine Threonine Asam glutamat Arginine Valine Glutamine Histidine Proline Tyrosine Leucine Glycine Phenylalanine Cysteine Isoleucine Serine Tryptophan Pada kondisi pH netral (67) Asam amino glisin Asam amino paling sederhana Gugus R glisin atom Hidrogen Asam amino alanin memiliki gugus R berupa metil (CH3) Prolin A.A yang berbeda dari A.A yg lain karena terdapat 2 ikatan pada atom N dengan bentuk nitrogen sekunder Prolin disebut dengan asam imino PROTEIN Makromolekul penyusun lebih dari separuh bagian sel Menentukan ukuran, struktur sel Komponen utama dari sistem komunikasi sel Struktur Protein Multi-subunit/oligomerik Subunit yang folded α-Helix dan β-Strand Rantai Lurus Struktur Kuartenener Struktur Tersier Struktur Sekunder Struktur Primer Asam amino penyusun menentukan sifat/karakteristik protein Fungsi protein Katalis reaksi biokimia (enzim) Alat pengangkut (hemoglobin) Pengatur pergerakan (otot) Penunjang mekanis (kolagen) Imunitas (antibodi) Penyampai impuls syaraf (rodopsin) Pengendali pertumbuhan (hormon) Sifat Protein Protein bersifat basa mengandung banyak A.A dengan gugus R bermuatan (+) gugus (NH3+) >>> Protein bersifat asam mengandung banyak A.A dengan gugus R bermutan (-) gugus (COO-) >>> Titik Isoelektrik Protein pH dimana protein tidak bermuatan Protein dikatakan basa, asam atau netral tergantung pada muatan protein pada pH fisiologis Penelitian Biokimia Isolat Protein Hormon Antibodi Enzim Insulin Imunoblotting Biokatalis Isolasi Protein Dalam Sel Fraksinasi Pada suhu rendah (0-4oC) Homogenisasi Homogenat (debris sel + organel) Sentrifugasi Isolat Protein Presipitasi (Amonium sulfat) •Supernatan •Pelet Presipitasi Protein Homogenat Larutan keruh : • Debris Sel • Organel sel • Makromolekul penyusun sel Supernatan Fase cair : • Makromolekul BM <<< • Organel terlarut dlm buffer Presipitat Memisahkan protein berdasarkan kelarutannya thd amonium sulfat LOGO www.themegallery.com