Document

23. RANCANGAN PEMBELAJARAN MATA KULIAH BIOLOGI MOLEKULER
1
2
3
4.
5.
6
7
8
9
Fakultas
Program Studi
Tahun Akademik
Semester
Nama Mata Kuliah
Kode Mata Kuliah
SKS
Prasyarat
Tim Pengajar
:
:
:
:
:
Biologi
S1 Biologi
:
:
:
10
Kompetensi
:
3 (2-1)
GENETIKA
Dr. Hendro Pramono, MS
Drs. Agus Heri Susanto, MS
Dr. Nurtjahyo Dwisasongko, MApp.Sc
Drs. Adi Amurwanto, MSc
Drs. Daniel Joko Wahyono, M.Biomed
Ir. Alice Yuniarti, MSc., Ph.D
Saefudin Azis, S.Si
Gasal/Genap
BIOLOGI MOLEKULER
Mahasiswa mampu menjelaskan konsep-konsep dasar biologi molekuler serta aplikasinya dalam
teknologi DNA rekombinan
11
Deskripsi Singkat MK
:
Materi Mata Kuliah Biologi Molekuler meliputi sejarah perkembangan, dan hubungan biologi
molekuler dengan beberapa disiplin ilmu lainnya, asam nukleat, struktur molekuler kromosom,
replikasi DNA, transkripsi, translasi, pengaturan ekspresi gen, mutasi, dasar-dasar teknologi DNA
rekombinan, perpustakaan gen, vektor kloning, metode PCR, sekuensing DNA, bioinformatika, serta
organisme transgenik dan pro-kontra pemanfaatannya.
12
Tujuan Pembelajaran
:
Untuk mencapai kompetensi pembelajaran, tujuan pembelajaran disusun agar mahasiswa mampu:
1. menjelaskan struktur, sifat fisika-kimia asam nukleat, sifat spektroskopik-termal asam nukleat,
superkoiling DNA
2. menjelaskan struktur kromosom prokariot dan eukariot
3. mendiskusikan cara, arah, dan komponen replikasi DNA
4. mendiskusikan transkripsi pada prokariot dan eukariot
5. mendiskusikan translasi pada prokariot dan eukariot
6. menjelaskan pengaturan ekspresi gen pada prokariot dan pada eukariot
7. menjelaskan kloning gen, enzim restriksi, ligasi, transformasi
8. menjelaskan perpustakaan genom dan cDNA, cara konstruksi dan besarnya perpustakaan
Draf kurikulum Baru
1
13
Outcome
:
genom, elektroforesis, prosedur skrining DNA rekombinan (uji fenotipe dan macam-macam
teknik hibridisasi)
9. menjelaskan persyaratan vektor kloning, plasmid, kosmid, YAC, bakteriofag, vektor-vektor
eukariot, dan vektor ekspresi
10. menjelaskan pengertian dan kegunaan PCR, komponen dan optimasi PCR
11. menjelaskan pengertian dan macam teknik sekuensing DNA
12. menjelaskan pangkalan data genom dan analisis komputasi sekuens DNA dan protein
13. menjelaskan pengertian organisme transgenik, kontruksi tanaman dan hewan transgenik, prokontra penggunaannya
Mahasiswa mampu menjelaskan secara garis besar isi artikel ilmiah bidang biologi molekuler
14. Jadwal Kegiatan
a. Perkuliahan
Minggu
Pokok Bahasan (Topik)
ke
1
KONTRAK PEMBELAJARAN
PENDAHULUAN
Substansi
manfaat, deskripsi, tujuan, strategi, dan jadwal
pembelajaran, serta bahan bacaan dan kriteria penilaian
2
ASAM NUKLEAT
3
STRUKTUR KROMOSOM
ruang lingkup, sejarah perkembangan, dan hubungan
Biologi Molekuler dengan disiplin ilmu lainnya
struktur, sifat fisika-kimia asam nukleat, sifat
spektroskopik-termal asam nukleat, superkoiling DNA
struktur kromosom prokariot dan eukariot
4
REPLIKASI DNA
cara, arah, dan komponen replikasi DNA
5
TRANSKRIPSI
transkripsi pada prokariot dan eukariot
6
TRANSLASI
translasi pada prokariot dan eukariot
7
PENGATURAN EKSPRESI GEN
pengaturan ekspresi gen pada prokariot dan pada eukariot
8
9
DASAR-DASAR TEKNOLOGI DNA
REKOMBINAN
Draf kurikulum Baru
UJIAN TENGAH SEMESTER
kloning gen, enzim restriksi, ligasi, transformasi
Metode
Pembelajaran*)
 ceramah
 diskusi
Media
Pembelajaran
 papan tulis
 LCD




























ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
 ceramah
 diskusi
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
 papan tulis
 LCD
2
10
PERPUSTAKAAN GENOM
11
VEKTOR KLONING
12
PCR
13
SEKUENSING DNA
14
BIOINFORMATIKA
15
ORAGNISME TRANSGENIK
16
perpustakaan genom dan cDNA, cara konstruksi dan
besarnya perpustakaan genom, elektroforesis
prosedur skrining DNA rekombinan (uji fenotipe dan
macam-macam teknik hibridisasi)
persyaratan vektor kloning, plasmid, kosmid, YAC,
bakteriofag, vektor-vektor eukariot, dan vektor ekspresi
pengertian dan kegunaan PCR, komponen dan optimasi
PCR,
pengertian dan macam teknik sekuensing DNA
pangkalan data genom dan analisis komputasi sekuens
DNA dan protein
Pengertian organisme transgenik, kontruksi tanaman dan
hewan transgenik, dan pro-kontra penggunaannya
UJIAN AKHIR SEMESTER
 ceramah
 diskusi
 papan tulis
 LCD




















ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
ceramah
diskusi
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
papan tulis
LCD
b. Praktikum
Minggu
ke
1
2
3
4
5
6
7
8
Acara Praktikum
Asistensi
Isolasi DNA kromosom
Isolasi plasmid
Restriksi DNA plasmid
Elektroforesis DNA
Transformasi Eschericia coli
Bioinformatika (1)
Bioinformatika (2)
Substansi
Isolasi DNA kromosom Bacillus sp.
Isolasi plasmid pUC19
Restriksi DNA plasmid pUC19 dengan enzim EcoRI
Elektroforesis DNA kromosom dan plasmid pUC19
Transformasi Eschericia coli menggunakan plasmid pUC19
Cara mengakses pangkalan data, mendapatkan urutan basa gen
yang diinginkan, dan alignment (pensejajaran) urutan basa dan
urutan asam amino menggunakan program BLAST
Analisis restriksi menggunakan program Clone, DNAstar, dan
GenMon.
Tempat






Ruang kuliah
Lab. Genetika
Lab. Genetika
Lab. Genetika
Lab. Genetika
Lab. Genetika
Unit Layanan
Komputer
 Unit Layanan
Komputer
1. Monitoring dan Evaluasi
Draf kurikulum Baru
3
A. Evaluasi proses pembelajaran
1. Monitoring
Monitoring pembelajaran, baik menyangkut pemahaman mahasiswa akan materi yang telah dan sedang dibicarakan maupun motivasi
dan respon mahasiswa terhadap kegiatan pembelajaran, dilakukan oleh staf pengajar Biologi Molekuler selama berlangsungnya proses
pembelajaran. Monitoring pemahaman dan respon dilakukan dalam bentuk tanya-jawab langsung mengenai materi yang telah dan sedang
dibicarakan, sedangkan monitoring motivasi dilakukan melalui pemeriksaan daftar hadir.
2. Evaluasi
Evaluasi pembelajaran meliputi evaluasi proses dan evaluasi hasil pembelajaran. Evaluasi proses dilakukan terutama oleh mahasiswa
melalui pengisian kuisener, baik yang disusun oleh staf pengajar Biologi Molekuler maupun dari Tim Monitoring dan Evaluasi fakultas.
Kuisener dari staf pengajar diberikan pada tengah semester atau pertemuan ke-7 (lihat Rancangan Evaluasi Pembelajaran), sedangkan
kuisener dari tim fakultas diberikan menjelang akhir semester. Di samping itu, evaluasi terhadap kualitas administrasi pembelajaran
dilakukan melalui reviu dokumen dan observasi oleh staf pengajar Biologi Molekuler pada akhir semester (lihat Rancangan Evaluasi
Pembelajaran). Adapun evaluasi hasil pembelajaran dilakukan oleh staf pengajar Biologi Molekuler berupa komponen penilaian terhadap
mahasiswa.
Kuesioner Evaluasi Proses Pembelajaran
No.
Aspek
1
Persepsi mahasiswa terhadap
kemampuan staf pengajar
dalam proses pembelajaran

Indikator
Penguasaan staf pengajar terhadap materi
pembelajaran
Kemampuan staf pengajar dalam menjelaskan
materi pembelajaran
Kemampuan staf pengajar dalam menggunakan
media pembelajaran
Kemampuan staf pengajar dalam membangkitkan
motivasi dan respon mahasiswa
Kualitas bahan ajar

Kemutakhiran bahan bacaan

Sistematika materi pembelajaran

Kualitas kuis dan tugas terstuktur

Kualitas soal ujian tengah semester

Manfaat materi pembelajaran untuk penyelesaian




2
3
Kualitas materi pembelajaran
Dampak pembelajaran
Draf kurikulum Baru
Skor (lingkari angka yang sesuai)
1
2
3
4
5
rendah
tinggi
1
2
3
4
5
rendah
tinggi
1
2
3
4
5
rendah
tinggi
1
2
3
4
5
rendah
tinggi
1
2
3
4
5
rendah
tinggi
1
2
3
4
5
kuno
mutakhir
1
2
3
4
5
buruk
baik
1
2
3
4
5
rendah
tinggi
1
2
3
4
5
rendah
tinggi
1
2
3
4
5
4

Draf kurikulum Baru
tugas akhir
Manfaat materi pembelajaran setelah selesai studi
sedikit
1
2
sedikit
banyak
3
4
5
banyak
5
Pedoman Reviu Dokumen dan Media Pembelajaran
No.
Aspek yang direviu
Kondisi
1
Ketersediaan daftar hadir mahasiswa
awal / tengah / akhir semester
2
Format daftar hadir mahasiswa
ketikan / tulisan tangan mahasiswa
3
Ketersediaan daftar kegiatan staf
awal / tengah / akhir semester
pengajar dalam proses pembelajaran
4
Pengisian daftar kegiatan staf pengajar
.....%
dalam proses pembelajaran
5
Ketersediaan media pembelajaran yang
tersedia / cukup / kurang / tidak tersedia
diperlukan
Pedoman Observasi Pemberlakuan Kontrak Pembelajaran
No.
Aspek yang diobservasi
1
Kesesuaian antara pelaksanaan dan
1
rencana urutan penyampaian materi
tidak
pembelajaran
sesuai
2
Kesesuaian antara pelaksanaan dan
1
rencana strategi pembelajaran
tidak
sesuai
3
Kesesuaian antara pelaksanaan dan
1
ketentuan tugas terstruktur
tidak
sesuai
4
Kesesuaian antara pelaksanaan dan
1
ketentuan ujian tengah semester
tidak
sesuai
5
Kesesuaian antara pelaksanaan dan
1
ketentuan ujian akhir semester
tidak
sesuai
6
Kesesuaian antara pelaksanaan dan
1
jadwal pembelajaran
tidak
sesuai
Draf kurikulum Baru
2
kurang
sesuai
2
kurang
sesuai
2
kurang
sesuai
2
kurang
sesuai
2
kurang
sesuai
2
kurang
sesuai
3
3
3
3
3
3
Kondisi
4
5
cukup
sesuai
sesuai
4
5
cukup
sesuai
sesuai
4
5
cukup
sesuai
sesuai
4
5
cukup
sesuai
sesuai
4
5
cukup
sesuai
sesuai
4
5
cukup
sesuai
sesuai
sangat
sesuai
sangat
sesuai
sangat
sesuai
sangat
sesuai
sangat
sesuai
sangat
sesuai
6
B. Evaluasi Hasil Belajar Mahasiswa
Komponen Evaluasi Hasil Pembelajaran
No.
Komponen penilaian
1
Nilai kuis rata-rata
2
Nilai tugas terstruktur
3
Nilai praktikum
3
Nilai ujian tengah semester
4
Nilai ujian akhir semester
T o t a l (nilai akhir)
Bobot (%)
15
15
20
25
25
100
Nilai tertinggi
100
100
100
100
100
100
Pedoman Penilaian
A. Nilai mutu untuk Nilai ≥80 :
B. Nilai mutu untuk Nilai 66,00-79,99
C. Nilai mutu untuk Nilai 56,00-65,99
D. Nilai mutu untuk Nilai 46,00-56,99
E. Nilai mutu untuk Nilai < 46
16. Referensi :
Loundish H, Berk A, Zipourskey, S.L., Matsudaria P. Baltimore, D., and Darnell, J.E. 2000. Moleculer Cell Biology 4th Ed. W.H. Freeman and Co,
New York.
Turner, P.C. Mc. Leman, A.G. Bates , A.D., Write, M.R.H. 1997. Instant Notes in Moleculer Biology. Bios Scientific Publ. Oxford.
Draf kurikulum Baru
7