Document

(B. MIPA Sains)
Diversitas genetik kambing peranakan etawa di Kab.Sleman dan Kab. Kulon Progo
Yogyakarta: Identifikasi polimorfisme fragmen ND-5 DNA mitokondria dan mikrosatelit
kromosom Y pada kambing peranakan etawa (PE)
Pangastuti, Artini; Sutarno
Fakultas MIPA UNS, Penelitian, BOPTN UNS, Hibah Fundamental, 2012
Kambing Peranakan Etawa (PE) mulai banyak dibudidayakan di Indonesia karena pertumbuhannya
mudah dan produksi susu yang harganya lebih tinggi dibandingkan susu sapi. Tujuan jangka panjang dari
penelitian ini adalah untuk memperoleh marka gen yang dapat dijadikan sebagai dasar dalam
penyilangan untuk menghasilkan keturunan kambing peranakan etawa yang unggul dalam produksi
susu. Tujuan dari penelitian pada tahap pertama ini adalah untuk memperoleh data-data molekuler
tentang variasi sekuen DNA mitokondria dan variasi DNA mikrosatelit yang menunjukkan diversitas
genetik. Data molekuler tentang polimorfisme DNA diperoleh melalui analisis molekuler terhadap 15ml
sampel total darah yang diambil dari lima puluh (50) individu. Ekstraksi DNA genom menggunakan kit
wizard DNA purification system. Teknik polymerase chain reaction restrction fragment length
polymorphism (PCR RFLP) dan variable number of tandem repeat (VnTR) atau mikrosatelit digunakan
untuk mendeteksi adanya variasi pada dua fragmen tersebut. Hasil analisis RFLP menunjukkan tingkat
diversitas genetik yang rendah, diduga karena adanya inbreeding dalam populasi. Dengan menggunakan
2 set primer untuk DNA mitokondria didapatkan 7 haplotipe secara total, dengan 2 haplotipe yang
secara konsisten muncul di semua populasi. Beberapa haplotipe bersifat khas untuk populasi tertentu.
Analisis microsatellite diharapkan menghasilkan keragaman yang lebih tinggi karena tingkat
polimorfisme teknik ini yang lebih tinggi.