Fisiologi mikrobia

Fisiologi mikrobia
Maya Shovitri
Fisiologi mikrobia
Tinjauan dari sudut
keragaman fisiologi bakteri
dalam konservasi energi
KONSENSUS






KULIAH 3 SKS (2/0/1)
KULIAH DIMULAI SESUAI JADWAL
UTS DAN UAS SESUAI PERATURAN ITS
LIHAT PENGUMUMAN
KERJA KELOMPOK
PUSTAKA
LEARNING OUTCOME
Mahasiswa dapat menjelaskan konsep
dasar tentang :
– respon fisiologi mikrobia terhadap factor
abiotik,
– mekanisme oksigenik dan anoksigenik
fotosintesis,
– mekanisme aerobik dan anaerobik respirasi
berdasarkan perbedaan sumber karbon,
pemberi dan penerima elektron.
LEARNING OUTCOME
• Mahasiswa dapat menerapkan metode ilmiah
di laboratorium dan lapangan untuk
membuktikan respon fisiologi mikrobia terhadap
factor abiotik.
• Mahasiswa mampu bekerjasama dalam
teamwork dan menerapkan leadership dalam
kegiatan praktikum dan tugas terstruktur.
• Mahasiswa mampu membaca,
menginterpretasi dan merepresentasi jurnal
tentang metabolisma bakteri dan peranannya di
lingkungan.
•
•
•
•
•
KERAGAMAN BAKTERI
BERDASARKAN METABOLISMENYA
PENDAHULUAN
PROFIL PERTUMBUHAN
RESPON FISIOLOGIS
FOTOTROPS
KEMOORGANOTROP : dengan respirasi oksigenik dan
anoksigenik serta energi dari bahan organik (donor e)
• KEMOLITOTROP : Energi berasal dari oksidasi bahan
anaorganik (donor e)
• ANEROB BAKTERIA :
– ANAEROB RESPIRASI
– FERMENTASI
• PENG-OKSIDASI HIDROKARBON
• PENG-FIKSASI NITROGEN
• ANAMMOX
• SINTROPI
Pokok Bahasan
• Pendahuluan: sel bakteri dan komponen
kimiawi sel, pemberi elektron, penerima electron,
tower electron, proton motive force,
kemoorganotrop, kemolitotrop, fototrop,
heterotrop dan autotrop
• Profil pertumbuhan : nutrisi mikrobia, siklus
hidup, strategi pertumbuhan mikrobia (biofilm,
simbiosis)
Pokok Bahasan
• Respon fisiologis : respon terhadap suhu,
kelembaban, aW, garam, pH, nutrisi, oksigen dan
e-aseptor lainnya, serta diferensiasi sel.
• Fotosintesis: oksigenik dan anoksigenik
fotosintesis, fiksasi karbodioksida dengan siklus
Calvin, kebalikan siklus Krebs dan siklus
hidroksipropionat
Pokok Bahasan
• Kemolitotrop: inorganic pemberi elektron,
oksidasi hydrogen, molekul mengandung sulfur
dan besi, nitrifikasi dan annamox
• Respirasi anaerobik: reduksi nitrat dan
denitrifikasi, reduksi sulfat, metanogenesis,
penerima elekton berupa ion ferik, mangan,
klorat dan senyawa organik
• Fermentasi: energy dan reaksi redoks,
keragaman fermentasi dan sintrofi;
Pokok Bahasan
• Oksidasi hydrogen: molekul oksigen sebagai
reaktan, oksidasi hydrogen, metanotrop dan
metilotrop, lemak sebagai nutrisi
• Fiksasi nitrogen: nitrogenase dan proses fiksasi
nitrogen, genetika dan regulasi dari fiksasi
nitrogen
Pustaka
•
Madigan, M.T. and J.M. Martinko. 2011.
Brock Biology of Microorganism. 13th Ed.
Pearson Prentice Hall. USA.
•
J. L. Slonczewski and J.W. Foster. 2009.
Microbiology,
an
Evolving
Science.
Norton & Company Inc. N.Y
Mekanisme pembelajaran
STUDENT CENTRED LEARNING
(SCL) !!!!
MAHASISWA adalah PELAKU UTAMA
DOSEN adalah PENGARAH dan FASILITATOR
FISIOLOGI MIKROBIA
DOSEN
MAHASISWA
Kuliah adalah tempat
konfirmasi pehamanan
Fungsi Kuliah Kelas
Presentasi dan konfirmasi pemahaman mahasiswa
dan dosen terhadap suatu materi pengetahuan
Penguatan pemahaman mahasiswa terhadap
materi pengetahuan sebagai hasil kegiatan mandiri
dari membaca materi dari pustaka (TEXT BOOK
dan JOURNAL)
PRESENTASE PENILAIAN :
• Ujian Tengah Semester
• Ujian Akhir Semester
• Tugas
– Materi
: 10%
– Presentasi : 15%
• Keaktifan dan praktikum
• Absensi
: 20 %
: 20 %
: 25 %
:10 + 15 %
: 10 %