Biokimia




DISKUSI BIOKIMIA DIMULAI DENGAN SEL KARENA
SEL MERUPAKAN KERANGKA ALAMIAH DARI
HAMPIR SEMUA REAKSI BIOKIMIA
PERBEDAAN UTAMA ANTARA BIOKIMIA DAN
KIMIA ADALAH BAHWA REAKSI BIOKIMIA
BERLANGSUNG DI DALAM BATASAN YANG
DIBERIKAN OLEH UKURAN SEL DAN RUANGRUANG DI DALAMNYA JUGA OLEH SIFAT FISIK
DAN KIMIA YG SEJALAN DENGAN KEHIDUPAN SEL
REAKSI KIMIA BIASA TERJADI DALAM TABUNGTABUNG REAKSI YG TERBUAT DARI BAHAN NONBIOLOGIK, MEMBUTUHKAN SUHU DAN TEKANAN
YANG TINGGI, PEREAKSI KUAT ATAU
PENGGUNAAN ENERGI LISTRIK.
SEMUA SEL MENGANDUNG
BEBERAPA STRUKTUR YG SERUPA


Sel merupakan unit struktural dan fungsional
organisme hidup. Organisme terkecil terdiri
dari sel tunggal ex Amuba suatu makhluk air
tawar ukurannya 300 µm kira-kira sebesar
titik, yang lain stafilokokus suatu sel bulat
dgn diameter kira-kira 1 µm; tubuh manusia
terdiri banyak sel mengandung sedikitnya 6 x
1013 sel yg berbeda-beda.
Berbagai jenis sel menunjukkan kesamaan
ciri-ciri struktur dasar. Salah satu ciri/sifat
sel yang universal/umum adalah adanya
membran pembatas di luar.




Setiap sel dikelilingi oleh membran tipis yang
membuatnya terpisah dr lingkungannya dan
sampai tingkat tertentu mampu mencukupi diri
sendiri. Membran sel disebut juga dgn
membran plasma atau membran
sitoplasma bersifat permeabel-selektif.
Membran berfungsi mengangkut nutrien dan
garam yg dibutuhkan ke dalam sel, dan
produk buangan dari sel ke luar tetapi tidak
permeabel terhadap senyawa-senyawa yg ada
di lingkungan sel yg tidak dibutuhkan.
Membran sel sedemikian tipisnya sehingga
hanya dapat divisualisasi dg pembesaran
tinggi menggunakan mikroskop elektron.
Setiap membran tebalnya sekitar 10 nm.
Terdiri atas 3 lapisan yg tampak sebagai dua
garis gelap dan dipisahkan oleh ruang yang
jernih.




Pada semua sel susunan plasma membran
umumnya serupa terdiri dari dua lapis molekul
lipid yg mengandung protein khusus,
beberapa diantaranya berupa enzim
sementara yg lain dpt mengikat nutrien dari
lingkungan dan mengangkutnya ke dalam sel.
Analisis kimiawi memperlihatkan bahwa
membran mengandung kira-kira 50% lipid dan
50% protein.
Lipid terutama berupa fosfolipid dan
kolesterol. Fosfolipid adalah molekul amfifilik
artinya setiap molekul mengandung kepala
hidrofilik dan ekor hidrofobik.
Protein yg ada pada membran ada dua yaitu
protein ekstrinsik dan protein intrinsik.
Protein ekstrinsik merupakan protein yg
bersifat hidrofilik dan terdapat di permukaan
dalam dan permukaan luar membran sel.
Di dalam tiap sel terdapat sitoplasma
yaitu tempat berlangsungnya hampir semua
reaksi enzimatis dari metabolisme sel. Sel
menggunakan energi kimia untuk
membangun dan mempertahankan
strukturnya serta untuk melakukan
pergerakan sel atau berkontraksi.
Di dalam sitoplasma sel jg terdapat ribosom
suatu granula kecil berdiameter 18-22 nm
yg berfungsi mensintesa protein
Semua sel hidup dilengkapi dgn inti sel
(nukleus) atau suatu badan serupa inti
tempat terjadinya replikasi senyawa genetik
dan penyimpanan dalam bentuk asam
deoksiribonukleat (DNA=deoxyribonucleic
acid).
SEL BERUKURAN AMAT KECIL



Sel mempunyai ciri lain yang penting yaitu
ukurannya relatif kecil
Dalam laboratorium reaksi kimia biasa
berlangsung dlm tabung reaksi dgn volume
berukuran mililiter atau liter, isi tabung
harus diaduk untuk mencampurkan
pereaksi secara merata.
Dalam sel hidup reaksi biokimia terjadi
dalam suatu ruang dengan volume
mikroskopik, ex, volume suatu sel tunggal
bakteri Escherichia coli kira-kira hanya 2 x
10-12 mililiter (mL)






Unit-unit ukuran penting yang sekarang
dipergunakan dalam menyatakan ukuran sel
yakni :
Nanometer (nm) = 10-9 m = 10-6mm = 103 µm.
dan mikrometer (µm)=10-6 m = 10-3 mm =
1000 nm
Ukuran yang lain yaitu angstrom (A) = 0,1
nanometer; mikron (µ) = 1 mikrometer
(µm); 1 milimikron (mµ) = 1 nanometer.
Untuk ukuran-ukuran ini sekarang sudah
tidak banyak digunakan tetapi tetap perlu
untuk dipahami.
Sel bakteri berukuran krng lebih 2
mikrometer, pada hewan tingkat tinggi 20-30



DUA KELAS UTAMA SEL : PROKARYOTIS DAN
EUKARYOTIS
SEL TERKECIL YG PALING SEDERHANA YAITU SEL
YANG PALING TUA DIKENAL SEBAGAI PROKARYOTIS
GOLONGAN INI TERDIRI DARI BERBAGAI KELAS
MIKROORGANISME SEL TUNGGAL YG BIASANYA
DISEBUT BAKTERI.
SEL INI MERUPAKAN MAKHLUK YG PERTAMA-TAMA
MUNCUL DLM EVOLUSI BIOLOG,I FOSILNYA MASIH
BERBENTUK SEL YG KITA KENAL SEKARANG
BERUMUR LEBIH DARI TIGA RIBU JUTA TAHUN
DITEMUKAN PADA BATU TULIS KUNO DI AFRIKA DAN
DI AUSTRALIA
SEL EUKARYOTIS MUNCUL PADA RIBUAN JUTA
TAHUN SETELAH PROKARYOTIS, BERUKURAN LEBIH
BESAR, LEBIH KOMPLEKS DAN MEMPERLIHATKAN
RAGAM YG LEBIH LUAS (JENIS SEL YG DITEMUKAN
PD SEMUA HEWA, TANAMAN DAN JAMUR BERSEL




ISTILAH PROKARYOTIS DAN EUKARYOTIS
DITURUNKAN DARI BAHASA YUNANI KARYON
YG BERARTI KACANG, BIJI, ATAU INTI.
PROKARYOTIS BERARTI PRA INTI DAN
EUKARIOTIS BERARTI INTI YG TERBENTUK
SECARA BAIK
PADA PROKARYOTIS SENYAWA GENETIK
DITEMPATKAN DALAM SUATU BADAN INTI ATAU
BADAN SERUPA INTI YG AGAK ACAK DAN
DIKELILINGI OLEH MEMBRAN
EUKARYOTIS SEBALIKNYA DILENGKAPI DGN
INTI SEL YG AMAT KOMPLEKS DAN TELAH JAUH
BERKEMBANG DIKELILINGI SELUBUNG INTI YG
TERDIRI DUA MEMBRAN.
PROKAROTIS TERDIRI DARI KIRA-KIRA 3000
SPESIES BAKTERI TERMASUK ORGANISME YG
SERING DISEBUT GANGGANG HIJAU BIRU
(BLUE GREEN ALGAE). Ganggang hijau biru
merupakan suatu keluarga khusus bakteri dgn
nama modernnya adalah sianobakteri (cyano=
biru)
GOLONGAN INI MELAKUKAN SISTEM
FOTOSINTESA YG DAPAT MENGHASILKAN
OKSIGEN MENYERUPAI SISTEM PADA
TUMBUHAN HIJAU TINGKAT TINGGI.
TERDAPAT KIRA-KIRA 20 FAMILI PROKARYOTIS
YG DIBEDAKAN ATAU DIBERI NAMA MENURUT
BENTUK, KAPASITAS GERAK, KARAKTERISTIK
PEWARNAAN, ZAT MAKANAN YG DISUKAI ATAU
PRODUK YG DIHASILKAN.




CONTOH :
BASILUS YG BERBENTUK SEPERTI
BATANG
KOKUS BAKTERI YG BERBENTUK
BULAT, KDNG BERPASANGAN ATAU
DIPLOCOCCUS BERGEROMBOL
(STAPHYLOCOCCUS) ATAU RANGKAIAN
(STREPTOCOCCUS)
BENTUK SPIRAL BIASANYA SANGAT
PANJANG SAMPAI 500 MIKROMETER
SEL TUMBUHAN
SEL HEWAN
TUGAS BIOKIMIA



BUAT RINGKASAN TENTANG MACAM
ORGAN SEL DAN FUNGSI MASING
MASING ORGAN SEL TERSEBUT.
KUMPULKAN TUGAS DALAM BENTUK
PRINTOUT PALING LAMBAT tgl 22
Oktober 2014.
EMAIL : [email protected]