garis-garis besar pokok pengajaran

GARIS-GARIS BESAR POKOK PENGAJARAN
(GBPP)
DOSEN
:
PROGRAM STUDI
JUDUL MATA KULIAH
KODE MATA KULIAH
DISKRIPSI SINGKAT MATA
KULIAH
:
:
:
:
TUJUAN INSTRUKSIONAL
UMUM
Dr. Ir. HASANUDDIN, SU
Dr. Ir. EDI BATARA MULIA SIREGAR, MS
Dr. LISNAWITA, SP, M.Si
AGRONOMI
PATOGENESA TUMBUHAN
AGR 511 (3+0)
Mata kuliah ini memberi informasi yang menyeluruh tentang berbagai proses yang terjadi antara
tanaman inang dan patogen sebelum, selama, dan sesudah terjadi infeksi patogen ke dalam jaringan
tanaman inang. Patogen yang menginfeksi tanaman yang di bahas dalam mata kuliah ini seluruhnya
berasal dari jenis mikroba yang memiliki struktur dan fungsi yang khusus untuk dapat menginfeksi dan
berkembang di dalam jaringan tanaman. Dalam hubungannya dengan inang, beberapa peristiwa terjadi
seperti infeksi dan kolonisasi, epidemiologi, pengaruh infeksi terhadap inang yang ditunjukkan dengan
beberapa gejala serangan, dan tanaman dalam hal ini membentuk struktur pertahanan baik yang
bersifat passiv maupun aktif, bahkan pertahanan biokemikal. Sementara itu patogen juga
mengmbangkan sistem yang cerdas dan efisien untuk dapat mempertahankan hidup dan berkembang di
dalam inangnya yang terjadi secara genetik ataupun karena tekanan seleksi jenis
: Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa dapat menganalisis berbagai proses yang terjadi dalam
hubungan patogen dan tumbuhan sebelum, selama, dan sesudah timbulnya gejala sakit pada tumbuhan.
Untuk itu mahasiswa lebih dahulu dapat mengenal, mamahami, dan menganalisis jenis-jenis patogen
mikrob, konsep dasar tentang hubungan inang dan patogen, Fungsi, Struktur, Penyebaran, dan
dormansi Patogen, Infeksi dan Kolonisasi Patogen, Epidemiologi, Effek Infeksi Terhadap Inang,
Peran Enzim dan Toksin dalam Patogenesa Tumbuhan, Mekanisme Pertahanan Tumbuhan terhadap
Patogen, Variabilitas Genetik Dalam Patogenesa Tumbuhan, Variabilitas Genetik Dalam Patogenesa
Tumbuhan, Basis Genetik dan Molekuler Interaksi Inang-Patogen, Effek Lingkungan Terhadap
Patogenesis, Nutrisi dan Patogenesa Tumbuhan.
2
No
Tujuan Instruksional Khusus
1
1
2
Mahasiswa dapat menganalisis konsep
dasar
patologi
tumbuhan
dan
dampaknya terhadap sosial ekonomi
masyarakat dari berbagai jenis patogen
yang dapat dikenal dari gejala dan
identifikasi
2
3
4
Pokok Bahasan
3
Patologi Tumbuhan
Mahasiswa dapat menganalisis jenisjenis patogen mikrob dan proses
patogenesis
di
dalam
jaringan,
resistensi inang dan virulensi patogen
dan perubahan yang terjadi secara
genetik selama infeksi
Mahasiswa dapat menganalisis struktur
dan fungsi Patogen mikroba yang
beragam yang secara significant
mempengaruhi sistem penyebaran dan
dormansi patogen mikrob tersebut
Patogen Mikrob
Mahasiswa dapat menganalisis proses
infeksi dan kolonisasi dan perubahanperubahan fisiologi yang terjadi akibat
infeksi dan kolonisasi patogen.
Infeksi
Patogen
4
Konsep dasar Patologi Tumbuhan
Signifikansi Sosial-ekonomi Patologi
Tumbuhan
Klassifikasi Patogen Mikrob
Gejala dan idenfikasi Patogen
Tumbuhan
Diagnosa Patogen Tumbuhan
Pendahuluan dan Penutup
Patogen dan patogenesis
Biotrof dan Nekrotrof
Resistensi inang dan virulensi patogen
Genetika resistensi dan virulensi
Pendahuluan dan penutup
Fungsi, Struktur, Penyebaran,
dan dormansi Patogen
dan
Subpokok Bahasan
Kolonisasi
Morfologi dan pertumbuhan patogen
mikrob
Pembiakan Patogen dan Variasinya
Penyebaran Patogen
Kemandirian Patogen (Dormansi)
Pendahuluan dan Penutup
Inokulum dan inokulum potensial
Pre-penetrasi
Penetrasi
Infeksi
Kolo nisasi patogen dalam inang
Keberlangsungan patogen
Faktor-faktor yang mempengaruhi
infeksi
Pendahuluan dan Penutup
Estimasi
Waktu
Sumber Kepustakaan
5
30’
30’
6
Buku 1. Hal 5-22
Buku 2. Hal 31-45
30’
30’
30’
30’
35’
35’
35’
35’
10’
35’
Buku 1. Hal 22-35
Buku 2. Hal 46-50
Buku 1. Hal. 23-66
Buku 2. Hal. 56-67
35’
35’
35’
10’
20’
20’
20’
20’
20’
20’
20’
10’
Buku 1. Hal. 67-86
Buku 2. Hal. 87-104
3
No
Tujuan Instruksional Khusus
1
5
2
Mahasiswa
dapat
menganalisis
berkembang dan menyebar Penyakit
tumbuhan dalam ruang dan waktu,
penyebaran ini dipengaruhi oleh
populasi inang sebagai sumber
makanan, secara umum ini disebut
sebagai Epidemiologi
6
7
Mahasiswa
dapat
menganalisis
pengaruh infeksi patogen terhadap
proses fisiologi inang
Mahasiswa
dapat
menganalisis
pengaruh infeksi patogen terhadap
proses fisiologi inang
Pokok Bahasan
3
Epidemiologi
Effek Infeksi Terhadap Inang I
Effek Infeksi Terhadap Inang
II
Subpokok Bahasan
4
Penyakit Berbunga Majemuk
Penyakit Berbunga Sederhana
Ephiphytotics
Kondisi Essensial Untuk Suatu
Epidemi
Keparahan Penyakit
Model Matematik Dan Curve
Penyakit
Epidemi Analisis
Pendahuluan Dan Penutup
Disintegrasi Jaringan Inang
Effek Terhadap Pertumbuhan Inang
Effek Terhadap Reproduksi
Effek Terhadap Penyerapan Dan
Translokasi Air Dan Nutrisi
Effek Terhadap Respirasi Inang
Effek Patogen Terhadap Fotosintesis
Effek Terhadap Permiabilitas
Membran Sel
Pendahuluan Dan Penutup
Glikolisis
Respirasi Inang Selama Patogenesis
Mekanisme Percepatan Respiratori
Perubahan Jalur Respiratori Selama
Infeksi
Perubahan Bentukan Karbohidrat Dan
Enzim
Terminal Oksidasi Dan Transfort
Elektron
Resistensi Dan Kerentanan
Pendahuluan Dan Penutup
Estimasi
Waktu
Sumber Kepustakaan
5
20’
20’
20’
20’
6
Buku 1. Hal 87-115
Buku 2 Hal. 109-121
20’
20’
20’
10’
20’
20’
20’
20’
Buku 2. Hal 125-149
Buku 4. Hal 327-348
20’
20’
20’
10’
20’
20’
20’
20’
20’
20’
20’
10’
Buku3. Hal 113-128
4
No
Tujuan Instruksional Khusus
Pokok Bahasan
1
8
2
Mahasiswa
dapat
menganalisis
pengaruh infeksi patogen terhadap
proses fisiologi inang
3
Effek Infeksi Terhadap Inang
III
9
10
11
Mahasiswa dapat menganalisis peran
enzim dan toksin dalam patogenesa
tumbuhan
terutama dalam proses
patogenesa patogen dan tumbuhan
sama-sama menghasilkan toksin dan
enzim untuk dapat menginfeksi atau
mematahkan infeksi oleh patogen
Mahasiswa
dapat
menganalisis
mekanisme
pertahanan
patogen
terhadap infeksi patogen melalui
beberapa cara diantaranya pertahanan
passiv , pertahanan aktif, dab
pertahanan biokemikal.
Subpokok Bahasan
4
Fenol
Arti Penting Oksidasi Fenol pada
tanaman terinfeksi
Growth Regulators pada tumbuhan
terinfeksi
Phytoalexins
Pendahuluan dan Penutup
UJIAN TENGAH SEMESTER
Peran Enzim dan Toksin
Enzim dalam Penyakit tumbuhan
dalam Patogenesa Tumbuhan
Berbagai jenis enzim dalam penyakit
tumbuhan
Inaktifasi enzim
Toxin dalam penyakit tumbuhan
Efek toxin pada jaringan tumbuhan
Klassifikasi toksin (spesifiknonspesifik toksin)
Pendahuluan dan penutup
Mekanisme
Pertahanan
Pertahanan passiv
Tumbuhan terhadap Patogen
Pertahanan biokemikal
Pertahanan aktif
Bentuk-bentuk pertahanan postinfection
Reaksi hipersensitif
Senyawa fenol dan peranannya
Fitoaleksin
Pendahuluan dan penutup
Estimasi
Waktu
Sumber Kepustakaan
5
25’
25’
6
Buku 2. Hal 129-158
Buku 5. Hal 349-374
45’
45’
10’
20’
30’
Buku 2. Hal. 151-158
Buku 3. Hal. 56-95
20’
20’
20’
30’
10’
20’
20’
20’
20’
20’
20’
20’
10’
Buku 2. Hal. 163-185
Buku 3. Hal. 159-190
5
No
Tujuan Instruksional Khusus
Pokok Bahasan
1
12
2
Mahasiswa
dapat
menganalisis
variabilitas genetik dalam patogenesa
tumbuhan yang sangat dipengaruhi
oleh jenis mikrobanya, selanjutnya
infeksi juga berpengaruh terhadap
sintesa RNA dan protein
3
Variabilitas Genetik Dalam
Patogenesa Tumbuhan
Mahasiswa dapat menganalisis basis
genetik dan molekuler interaksi antara
inang-patogen
yang peristiwanya
terjadi terbatas pada daerah infeksi saja
karena tanaman tidak mempunyai
sistem immun.
Basis Genetik dan Molekuler
Interaksi Inang-Patogen
Mahasiswa
dapat
menganalisis
pengaruh faktor-faktor lingkungan
terhadap patogenesa tumbuhan baik
lingkungan biotik dan abiotik, dan
interaksi tanaman dengan mikrobial
yang
bersimbiotik
dipermukaan
tanaman.
Mahasiswa
dapat
menganalisis
pengaruh faktor-faktor lingkungan
terhadap patogenesa tumbuhan baik
lingkungan biotik dan abiotik, dan
interaksi tanaman dengan mikrobial
yang
bersimbiotik
dipermukaan
tanaman.
Effek Lingkungan Terhadap
Patogenesis I
13
14
15
Effek Lingkungan Terhadap
Patogenesis II
Subpokok Bahasan
4
Variabiliti virus
Variabiliti bakteri
Varibiliti dan genetika jamur
Level dan variabiliti dalam patogen
tumbuhan
Efek infeksi terhadap sintesis RNA
dan Protein
Pendahuluan dan penutup
Evolusi parasitisme
Genetik interaksi inang-parasit
Interrelasi gene-for-gen dan
kriterianya
Interaksi inang-parasit tingkat
molekul
Interaksi inang-parasit
Pendahuluan dan penutup
Effek faktor-faktor iklim terhadap
patogen
Effek konsentrasi oksigen dan Karbon
dioksida
Herbisida dan insektisida
Nutrisi Tumbuhan
Pendahuluan dan penutup
Lingkungan Biotik
Interaksi Mikrobial pada permukaan
tumbuhan
Pendugaan serangan penyakit
tumbuhan
Beberapa contoh pendugaan
Pembukaan dan penutup
Estimasi
Waktu
Sumber Kepustakaan
5
20’
30’
30’
30’
6
Buku 2. Hal. 200-208
Buku 6. Hal. 375-390
30’
10’
30’
50’
20’
20’
Buku 2. Hal. 209-229
Buku 3. Hal. 191-210
20’
10’
35’
Buku 2. Hal. 230-249
35’
35’
35’
10’
50’
30’
30’
30’
10’
Buku 2. Hal. 250-278
6
No
Tujuan Instruksional Khusus
1
16
2
Mahasiswa
dapat
menganalisis
metodologi dan kaidah yang umum dan
spesifik dalam nutrisi dan patogenesa
tumbuhan terutama untuk melakukan
studi lanjutan tentang pantogenesa
tumbuhan.
17
18
Mahasiswa mempresentasikan hasil
kajian pustakan dan analisis mendalam
tentang berbagai proses yang terjadi
sebelum, selama, dan sesudah terjadi
hubungan inang-patogen dan interaksi
antara kedua-duanya
Pokok Bahasan
3
Nutrisi
dan
Tumbuhan
Seminar tugas akhr
Subpokok Bahasan
Patogenesa
4
Metodologi
Faktor-faktor yang mempengaruhi
pertumbuhan patogen
Kaidah-kaidah nutrisi di laboratorium
Nutrisi karbon, isomerism, dan gula
alkohol
Nitrusi nitrogen dan sumber-sumber
nitrogen
Pendahuluan dan penutup
Pre penetrasi patogen (kasus)
Penetrasi Patogen (kasus)
Interaksi inang-patogen (kasus)
Enzim dan Toksin (kasus)
Resistensi inang (kasus)
Estimasi
Waktu
Sumber Kepustakaan
5
20’
30’
6
Buku 3. Hal. 232-264
30’
30’
30’
30’
150’
UJIAN AKHIR SEMESTER
Buku 1. Dickinson, C.H, dan J.A. Lucas, 1989, Plant Pathology and Plant Pathogen, Blacwell Scientific Publication, London
Buku 2. Singh, R.S., 2002, Introduction to Prtinciples of Plant Pathology, Oxford & IBH Publishing Co. PVT LTD
Buku 3. Mehrotra, R.S., 1983, Plant Pathology, Tata McGraw-Hill Publ. C.Ltd. New Delhi
Buku 4. Wheeler, H, 1978, Disease Alterations in apermeability And Menbrans, Dalam Horsfall, J.G. dan E.B. Cowling (Eds),Plant Disease “An Advanced Treatise” Vol. III,
Academic Press, London
Buku 5. Joseph. KUC, 1978, Changes In Intermediary Metabolism Caused by Disease, Dalam Horsfall, J.G. dan E.B. Cowling (Eds),Plant Disease “An Advanced Treatise”
Vol. III, Academic Press, London
Buku 6. Sambroski, D.J., R. Rohringer, and W.K. Kim, 1976, Transcription and Translation in Diseased Plant, Dalam Horsfall, J.G. dan E.B. Cowling (Eds),Plant Disease
“An Advanced Treatise” Vol. III, Academic Press, London