Skema Teknik Yang Digunakan Untuk Studi Struktur Ribosom Dan

Skema Teknik Yang Digunakan Untuk Studi Struktur Ribosom Dan
Merangkum Hasil Dari Penelitian Tersebut
Nama kelompok :
Ummul Khasanah
Apriliani Bambang R
Akhmad Ghozi
Qiqi Rizqiyyah
(B1J005107)
(BIJ005113)
(BIJ005116)
(BIJ005217)
K54-PAG-03
Ringkasan
STRUKTUR RIBOSOM
Struktur Ribosom telah dikembangkan selama lebih dari 50 tahun.Pada awalnya disebut
(Mikrosomes). Struktur ini hanya dapat dilihat dengan mikroskop elektron. Pada tahun 1940an dan
1950-an, pertama elektron micrographs menunjukkan bahwa bakteri ribosomes yang berbentuk
lonjong, dengan dimensi 29 nm × 21 nm, agak lebih kecil daripada ribosom eukaryotik, perbedaan
yang kedua adalah ukuran bergantung pada beberapa jenis spesies,tetapi rata-rata ukuran ribosom
sekitar 32 nm × 22 nm. Ultracentrifugation dapat digunakan untuk mengukur ukuran ribosom dan
berbagai komponen yang ada di dalamnya.
Ultracentrifugation Digunakan Untuk Mengukur Ukuran Ribosomes Dan Komponen
Teknik yang digunakan Ultracentrifugation Untuk Mengukur Ukuran Ribosomes Dan
Komponennya:
- Setiap ribosome terdiri dari dua subunits. Dalam eukaryotes ini subunits adalah 60S dan 40-an; di
bakteri mereka 50S dan 30-an. Perlu diketahui bahwa koefisien sedimentasi tidak tambahan
karena mereka tergantung pada bentuk serta massa; ini dapat diterima dengan baik untuk utuh
ribosome S untuk memiliki nilai kurang dari jumlah dua subunits.
-Subunit besar yang berisi tiga rRNAs di eukaryotes (yang 28S, 5.8S dan 5S rRNAs) tetapi
hanya dalam dua bakteri (23S dan 5S rRNAs). Dalam bakteri yang setara dari eukaryotic 5.8S
rRNA terdapat dalam 23S rRNA.
-Subunit kecil yang berisi satu rRNA di kedua jenis organisme: di sebuah 18S rRNA
eukaryotes dan 16S rRNA dalam bakteri.
-Kedua subunits berisi berbagai ribosomal protein, angka-angka rinci dalam Gambar
11,10. Ribosomal protein yang kecil dari subunit dipanggil S1, S2, dll; mereka yang
subunit besar adalah L1, L2, dll Terdapat hanya satu dari setiap protein per ribosome, kecuali untuk
L7 dan L12, yang hadir sebagai dimers.
Gambar 1: komposisi ribosom eukaryoatik dan baketeri. Detail ini mengarahkan “tipikal”ribosom
eukaryotik dan Escherichia coli. Variasi bebedaakan terjadi pada tiap spesies yang terfokus pada
jumlah protein ribosom.
Memeriksa Struktur Ribosome
Setelah komposisi dasar dari ribosom eukaryotic dan bakteri telah diketahui, langkah
selanjutnya adalah mengamati cara rRNAs dan protein saling bekerjasama. Hal ini penting
berfokus pada cara di mana berbagai rRNAs dan protein bertaut. informasi yang diberikan oleh
rRNA urutan pertama, perbandingan antara ini mengidentifikasi daerah yang dilindungi dapat dasarpasangan untuk membentuk kompleks dua-dimensi struktur.
Gambar 2 : Struktur Escherichia coli 16S rRNA. Bentuk standar (G-C,A-U), dan tidak standar
(Contoh:G-U) yang ditunjukkan sebagai titik
Dijelaskan rRNAs menyediakan sebuah tempat dalam ribosome, dimana protein terpasang, yang
berperan aktif dalam rRNAs sintesis protein yang dapat digunakan untuk penelitian berikutnya.
Sebagian besar dari penelitian terkonsentrasi pada ribosome bakteri, yang lebih kecil dibandingkan
dengan versi eukaryotic dan tersedia dalam jumlah besar dari ekstrak dari sel untuk tumbuh tinggi
kepadatan cair dalam budaya. Sejumlah pendekatan teknis telah digunakan untuk mempelajari
struktur bakteri ribosome:
•
Pendekatan
Nuclease
memungkinkan
kontak
antara
rRNAs
dan
protein
yang akan diidentifikasi.
+ Protein-protein crosslinking mengidentifikasi pasangan atau kelompok protein yang terletak
dekat satu sama lain dalam ribosome.
+ Electron mikroskopi secara bertahap telah menjadi lebih canggih, memungkinkan keseluruhan
struktur dari ribosome untuk diselesaikan secara lebih detail. Misalnya, inovasi tersebut
immunoelectron sebagai mikroskopi, di ribosomes yang diberi label dengan antibodi spesifik
ribosomal protein untuk setiap sebelum ujian, telah digunakan untuk mencari
posisi ini protein pada permukaan dari ribosome.
Situs-diarahkan hydroxyl radikal memeriksa menggunakan kemampuan Fe (II) ion-ion
menghasilkan hydroxyl radikal yang membelah Asam ribonukleat phosphodiester obligasi yang
terletak dalam 1 nm dari lokasi radikal produksi. Teknik ini telah digunakan untuk menentukan
posisi yang tepat ribosomal protein S5 di E. coli ribosome. Asam amino yang berbeda dalam S5
yang diberi label dengan Fe (II) dan hydroxyl radikal dengan peristiwa-peristiwa di reconstituted
ribosomes. Posisi di 16S rRNA yang telah melekang ini kemudian digunakan untuk mengambil
keputusan yang topologi dari rRNA di sekitar S5 protein (Gambar 11,12; Heilek dan Noller, 1996).
yang diserati dengan X-ray crystallography yang telah bertanggung jawab dalam struktur ribosome.
Bakteri yang ribosome. Thermus thermophilus. Kecil subunit adalah di atas, dengan 16S rRNA
dalam biru muda dan kecil subunit ribosomal protein dalam warna biru gelap. RRNAs subunit besar
yang berada di abu-abu dan protein dalam ungu.
Gambar Ribosom bakteri Thermus thermophilus.
Daftar Pustaka:
Brown, T.A. 2002. Genomes 2. Department of Biomolecular Sciences, UMIST, Manchester, M60
1QD, UK.
Situs terakit :
http://www.dikmentidki.go.id/belajar/biologi/seltumbuhan.swf
www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/642301.
www.present.udel.edu/biotech/rDNA.
http://www.beckam.com/resourcecenter/elabnotebook
http://www.beckmancoulter.co.uk/images/mainflash.swf
http://www.ucopenaccess.org/courses/CPBiology/bio_3_1_2_4.swf
http://web.centre.edu/bmb/movies/bmb210translation2.swf
http://isite.lps.org/cbittle/web/celloverviewslidenotes.swf
http://www.wiley.com/legacy/college/boyer/0470003790/animations/translation/translation.swf
http://www.d155.org/pr/faculty/bleile/CellStructureFxn.swf
http://www.agrowknow.org/lo/swf/plant-cell.swf
http://www.dlshs.org/webpages/shivelys/MasterList.swf?POPUP_ENABLED=true
http://www.slideshare.net/BiologieUU/hoofdstuk-17-2008-deel-4-presentation
http://www.biolchem.ucla.edu/labs/plath/kathrin.swf