BIOINFORMATIKA

BIOINFORMATIKA
Materi 1
MK Bioinformatika
S1 Kesmas - MIK
Pengantar
1. Kontrak Kuliah :
a. Pertemuan = 14 TM
b. Presensi = minimal 75%
c. Teori, Tugas mandiri
d. Evaluasi : Tugas (20%), UTS (40%), UAS (40%)
e. RPKPS dan Silabus
Pengantar
2. Materi Bioinformatika 1 semester :
a. Pengantar : Kontrak kuliah, Overview mata
kuliah, Pendahuluan Manajemen Informasi
dalam Biomedis
b. Bioinformatika : konsep, pengertian
c. Revolusi Informasi di bidang
Kedokteran/Medis
d. Perkembangan Biomedis Informatika
e. Data Biomedis : sumber data, penyimpanan
dan manfaat
Pengantar
2. Materi Bioinformatika 1 semester :
e. Pengambilan Keputusan Biomedis : peluang
kejadian klinis
f. Pendekatan ilmu kognitif dan Biomedis
informatika
g. Rekayasa program komputer dalam
pelayanan kesehatan dan biomedis
h. Standar dalam Biomedis informatika
i. Pencitraan dalam Biomedis informatika
Pengantar
2. Materi Bioinformatika 1 semester :
j. Evaluasi sumber daya Biomedis dan
Informasi kesehatan
k. Aplikasi Biomedis Informatika : e-Health
l. Infrastruktur Informasi Kesehatan
m. Informatika Kesehatan Masyarakat
Referensi
1. Biomedical Informatics, Computer
Applications in Health care and Biomedicine.
Fourth edition. Edward H Shortliffe and
James J Cimino (editors). Springer
BIOINFORMATIKA
- Bioinformatika merupakan suatu bidang ilmu
biologi yang memanfaatkan teknologi Komputer
untuk pendukung ilmu biologi.
- Bioinformatika terdiri atas bioinformatika baru dan
klasik.
Bioinformatika klasik masih focus pada sekuens
DNA, sedangkan bioinformatika baru pemetaan
genom manusia sudah selesai dengan melakukan
perbandingan genom dari berbagai spesies yang
berbeda, mengukur jumlah relatif dari
kopi atau cetakan dari sebuah pesang enetik,
menemukan fungsi dan keterkaitan dari gen, dan
melihat kerja fungsi genom.
BIOINFORMATIKA
- Bioinformatika memiliki keterkaitan dengan
beberapa cabang ilmu IPA lainnnya, seperti,
Biophysics, Computational biology, Medical
informatics,Cheminformatics,Mathematical Biology,
Proteomics, dan
Pharmacogenomics.Bioinformatika memiliki jenis
data, yaitu 7.1 Manajemen Data ,
Struktur danSekuens Protein dan Gen, Struktur
molekuler 3D, Fungsi dan Struktur Genom ,dan
Data Bibliofrafik
BIOINFORMATIKA
- Definisi :
(Molecular) bio – informatics: bioinformatics is
conceptualising biology in terms of molecules (in
the sense of physical chemistry) and applying
"informatics techniques" (derived from disciplines
such as applied maths, computer science and
statistics) to understand and organise the
information associated with these molecules, on a
large scale. In short, bioinformatics is a
management information system for molecular
biology and has many practical applications.
BIOINFORMATIKA
- Bioinformatika menggabungkan berbagai bidang
ilmu komputer, matematika, danengineering
untuk memproses data biologi. Supercomputer
digunakan untukmembaca dan memproses data
biologi supaya hasilnya semakin cepat
didapatkan.Berbagai sistem informasi dan
database digunakan untuk menyimpan
danmenyusun data biologi. Dalam menganalisa
data biologi, juga diperlukan berbagaialgoritma
Artificial Intelligence, Machine Learning, Soft
Computing, DataMining, Image Processing, dan
Simulation ( James, 2001 )
BIOINFORMATIKA
Perkembangan ilmu Bioinformatika : sejak awal 1940an sampai saat ini
sangat pesat
Potensi Aplikasi Bioinformatika
• Potensi komersial dari aplikasi bioinformatika sangat menggiurkan. Pada
tahun 1998 saja, pangsa pasarnya mencapai sekitar $290 juta, dan
diperkirakan akan mencapai $2 milyar pada tahun 2005.
• Selama bulan Maret tahun 2000 investasi pada bidang ini sedikitberkurang.
Hal tersebut disebabkan oleh pernyataan Presiden AS Bill Clinton dan PM
Inggris Tony Blair, yang membebaskan akses terhadap informasi genom
manusia sehingga dianggap menghalangi paten terhadap genom manusia.
Tapi, pada akhir bulan, investasi mulai kembali normal karena
bioinformatika masih dianggap cukup prospektif di masa depan.
• Menurut laporan Ventureone di Amerika Serikat pada tahun 2001 danadana ventura telah mencapai $700 juta digunakan untuk pengembangan
bioinformatika. Sementara itu, kepala Divisi Teknologi Khusus untuk
Bioinformatika yang pertama di Microsoft menganggap, ini adalah peluang
yang amat besar. Penjualan komputer untuk ilmuwan-ilmuwan akan
mencapai $43 juta.
PENERAPAN BIOINFORMATIKA
1. Basis data sekuens Biologis :
PENERAPAN BIOINFORMATIKA
2. Penyejajaran sekuens :
PENERAPAN BIOINFORMATIKA
3. Prediksi struktur protein :
Bidang yang terkait Bioinformatika
Bidang yang terkait Bioinformatika
Bidang yang terkait Bioinformatika
Tugas Individu
Paper “What is bioinformatics? An introduction
and Overview”
- masing-masing mahasiswa menterjemahkan
paper tersebut (dibagi per halaman)
- Diketik, arial 11, spasi 1,5
- Tuliskan nama dan NIM
- Dikumpulkan Paling lambat, Senin, 26
September 2016.