agb-c-genetika-2

DNA Replication
&
Gene Expression
Priyambodo, M.Sc.
Struktur DNA
•Phosphodiester
“backbone”
•Directional
•Antiparallel
•H-bonds
Struktur DNA
Acid
Base
5’
1’
4’
Monophosphate
Diphosphate
Triphosphate
Sugar
3’
2’
Ribose,
Deoxyribose
Adenine
Guanine Purine
Thymine
Cytosine Pyrimidine
Uracil
Aturan Chargaff
• Jumlah basa purine sebanding dengan jumlah
basa pyrimidine
• (A+G) = (C+T)
• Jumlah basa adenine sebanding dengan
jumlah basa thymine A = T
• Jumlah basa guanine sebanding dengan
jumlah basa cytosine G = C
• CHARGAFF`s Ratios atau CHARGAFF`s Rule
DNA dan RNA
• Struktur
– Gula Pentosa
– Basa Nitrogen
•
•
•
•
Jenis rantai
Panjang rantai
Lokasi
Fungsi/Peran
QUIZ
• Posisikan tempat duduk agar tidak saling
berdekatan.
• Simpan seluruh gadget.
• Siapkan selembar kertas, tulis NPM, Nama dan
Kelas.
• Bagi yang tidak berminat untuk ikut kuis, boleh
tinggalkan ruang kelas.
QUIZ
1. DNA sel kulit katak memiliki kandungan Basa
Nitrogen Adenin sebanyak 28%. Hitung berapa
persentase Guanin dalam seutas rantai DNA sel
kulit katak tersebut!
2. Isolasi RNA dari jaringan palisade Gnetum
gnemon yang dilakukan pada siang hari
menunjukkan adanya Guanin sebanyak 30% dari
total basa nitrogen. Hitung persentase basa
Nitrogen Timin yang bisa diisolasi!
WAKTU: 5 menit
Jawaban QUIZ
1. Diket: DNA sel kulit katak
Adenin= 28%
Ditanya: Guanin dalam seutas DNA
Jawab:
Adenin = Timin = 28%
Guanin + Sitosin = 100% - (2x28%)
= 44%
Guanin = 44% : 2 = 22%
DNA dalam seutas rantai = 22% : 2 = 11%
Jawaban QUIZ
2. Diket: Isolasi RNA Gnetum gnemon
Guanin 30%
Ditanya: Timin hasil isolasi
Jawab: 0%
Tidak ada timin di dalam RNA
Dogma Sentral Biologi
Replikasi DNA
Replikasi DNA Semikonservatif
KODON (Kode Genetik)
• Kodon
Suatu aturan yang menetapkan bahwa pada
sintesis protein suatu triplet nukleotida akan
mengkode asam amino tertentu.
• Degenerasi Kode Genetik
Suatu keadaan yang memperlihatkan bahwa
satu asam amino dikode oleh lebih dari satu
kodon disebut degenerasi.
Degenerasi Kode Genetik
Ekspresi Gen
Melalui dua proses:
• TRANSKRIPSI (sintesis/pembentukan RNA)
- terjadi di dalam nukleus (inti sel)
• TRANSLASI (sintesis protein)
- berlangsung di sitoplasma
Ekspresi Gen pada Eukariotik
dan Prokariotik
Outline
5`
3`
coding DNA strand
5`
3`
template DNA strand
Transcription
5`
3`
mRNA
Translation
N
C
Peptide chain
•
•
Molekul RNA merupakan antiparalel terhadap template DNA strand atau
paralel terhadap coding DNA strand.
Pada molekul RNA, T diganti oleh U.
Rantai DNA Sense
Transkripsi
• Transkripsi pada prokaryot dan eukaryot:
1. Initiation - melekatnya RNA polymerase pada
double-stranded DNA; RNA polymerase melekat
pada sekuens DNA yang disebut promoter.
(Initiation is the most important step in gene expression)
1. Elongation – pemanjangan mRNA
2.Termination – penyelesaian sintesis mRNA.
Kodon START dan STOP
• Adapun kodon AUG berfungsi sebagai inisiator,
sehingga disebut kodon inisiator atau START
CODON.
• Tiga macam kodon yaitu UAA, UAG, dan UGA
disebut kodon terminator atau STOP CODON,
karena berfungsi untuk mengakhiri suatu proses
sintesa protein. Ketiga kodon tersebut juga
disebut kodon nonsense, karena tidak
mengkode satu asam amino pun.
Macam RNA
messengerRNA (mRNA):
membawa informasi genetik keluar
nucleus untuk protein synthesis.
dari
transferRNA (tRNA):
membaca informasi genetik.
ribosomalRNA (rRNA)
merupakan
molecular
assembly
berperan dalam sintesisprotein
yang
Macam RNA
Mekanisme post-transkripsi
Translasi
Free
amino
acids
Growing
Protein Chain
AA:tRNA
free
tRNA
mRNA
Codon
Ribosome
Codon for
specific AA
Anti-codon