laporan hasil karya tulis ilmiah - Eprints undip

KOLONISASI BAKTERI PATOGEN POTENSIAL PENYEBAB
INFEKSI DAERAH OPERASI PADA KULIT PASIEN
PRAOPERATIF
(Studi terhadap Faktor Risiko Jenis Kelamin, Diabetes Melitus, Status Gizi,
dan Riwayat Penggunaan Antibiotik di RSUP dr Kariadi)
LAPORAN HASIL
KARYA TULIS ILMIAH
Diajukan sebagai syarat untuk memenuhi persyaratan
guna mencapai gelar sarjana strata-1 pendidikan dokter
MESAYU NADYA PRAMESWARI
22010111130123
PROGRAM PENDIDIKAN SARJANA KEDOKTERAN
FAKULTAS KEDOKTERAN
UNIVERSITAS DIPONEGORO
2015
LEMBAR PENGESAHAN LAPORAN HASIL KTI
KOLONISASI BAKTERI PATOGEN POTENSIAL PENYEBAB INFEKSI
DAERAH OPERASI PADA KULIT PASIEN PRAOPERATIF
(Studi terhadap Faktor Risiko Jenis Kelamin, Diabetes Melitus, Status Gizi,
dan Riwayat Penggunaan Antibiotik di RSUP dr Kariadi)
Disusun oleh
MESAYU NADYA PRAMESWARI
Telah disetujui
Semarang, 1 Juli 2015
Pembimbing I
dr. Helmia Farida, Sp.A, M.Kes
19661213 200112 2 001
Ketua Penguji
Penguji
dr. Endang Sri Lestari, Ph.D
19661016 199702 2 001
dr. Moh. Syarofil Anam, Sp.A, MSi.Med
19661016 199702 2 001
Mengetahui,
a.n. Dekan
Ketua Program Studi Pendidikan Dokter
dr. Erie BPS Andar, Sp.BS,PAK(K)
195412111981031014
ii
PERNYATAAN KEASLIAN
Yang bertanda tangan di bawah ini,
Nama
: Mesayu Nadya Prameswari
NIM
: 22010111130123
Program Studi : Program Pendidikan Sarjana Program Studi Pendidikan
Dokter Fakultas Kedokteran Universitas Diponegoro
Judul KTI
: Kolonisasi Bakteri Patogen Potensial Penyebab Infeksi
Daerah Operasi pada Kulit Pasien Praoperatif (Studi
Terhadap Faktor Risiko Jenis Kelamin, Diabetes Melitus,
Status Gizi, dan Riwayat Penggunaan Antibiotik di RSUP
Dr Kariadi)
Dengan ini menyatakan bahwa:
1) KTI ini ditulis sendiri tulisan asli saya sendiri tanpa bantuan orang lain
selain pembimbing dan narasumber yang diketahui oleh pembimbing.
2) KTI ini sebagian atau seluruhnya belum pernah dipublikasi dalam
bentuk artikel ataupun tugas ilmiah lain di Universitas Diponegoro
maupun di perguruan tinggi lain.
3) Dalam KTI ini tidak terdapat karya atau pendapat yang telah ditulis
orang lain kecuali secara tertulis dicantumkan sebagai rujukan dalam
naskah dan tercantum padaa daftar kepustakaan.
Semarang, 3 Juli 2015
Yang membuat pernyataan,
Mesayu Nadya Prameswari
iii
KATA PENGANTAR
Puji syukur saya panjatkan kehadirat Allah SWT, karena atas berkat dan
rahmat-Nya kami dapat menyelesaikan tugas Karya Tulis Ilmiah ini.Penulisan
karya tulis ilmiah ini dilakukan dalam rangka memenuhi salah satu syarat untuk
mencapai gelar Sarjana Kedokteran di Fakultas Kedokteran Universitas
Diponegoro. Kami menyadari sangatlah sulit bagi kami untuk menyelesaian
Karya Tulis Ilmiah ini tanpa bantuan dan bimbingan dari berbagai pihak sejak
penyusunan proposal sampai dengan terselesaikannya laporan hasil Karya Tulis
Ilmiah ini. Bersama ini penulis ingin mengucapkan terima kasih yang sebesarbesarnya serta penghargaan setinggi-tingginya kepada:
1. Rektor Universitas Diponegoro yang telah memberikan kesempatan
kepada kami untuk belajar dan menimba ilmu di Universitas Diponegoro.
2. Dekan
Fakultas
Kedokteran
Universitas
Diponegoro
yang
telah
memberikan sarana dan prasarana sehingga penulis dapat menyelesaikan
karya tulis ilmiah dengan baik dan lancar.
3. Direktur Kariadi yang telah memberikan ijin dan kesempatan untuk
melakukan penelitian di bangsal bedah.
4. Kepala Laboratorium Mikrobiologi yang telah memberikan ijin dan
kesempatan untuk melakukan penelitian di laboratorium.
5. Kepala SMF Bedah Fakultas Kedokteran Universitas Diponegoro yang
telah memberikan ijin dan kesempatan untuk melakukan penelitian di
bangsal bedah.
6. Kepala Instalasi B RSUP dr Kariadi yang telah memberikan ijin dan
kesempatan untuk melakukan penelitian di bangsal bedah.
7. Kepala ruang bangsal bedah yang telah memberikan ijin serta mendukung
kami selama penelitian berlangsung.
8. dr. Helmia Farida, Sp.A, M.Kes, Ph.D dan dr. Stefani Chandra Firmanti,
M.Sc selaku dosen pembimbing yang telah menyediakan waktu, tenaga,
dan pikiran dalam penyusunan karya tulis ilmiah ini.
9. dr. Endang Sri Lestari, Ph.D selaku ketua penguji yang telah menyediakan
waktu, tenaga, dan pikiran untuk mengarahkan penulis.
iv
10. dr. M. Syarofil Anam, Msi. Med, Sp.A selaku dosen penguji yang telah
memberikan saran dan arahan dalam penyusunan karya tulis ilmiah ini.
11. Orang tua, Ir. Hadi Wahyono, MA dan Ir. Yusminar, MT beserta kakak,
Mayora Hayundra,SE dan Jasminah yang senantiasa memberikan
dukungan moral maupun material kepada penulis.
12. Gina Dhani W. selaku sahabat dan teman seperjuangan yang telah
membantu serta selalu bersama sama dalam suka maupun duka
menyelesaikan Karya Tulis Ilmiah ini.
13. Addy Saputro yang telah memberikan dukungan dan semangat selama
penyusunan karya tulis ilmiah ini.
14. Bapak Bambang, Ibu Indah, Ibu Lilis serta segenap staf mikrobiologi dan
laboratorium yang telah membantu jalannya penelitian.
15. Segenap staf dan karyawan RSUP dr Kariadi yang telah membantu dalam
penelitian ini.
16. Segenap saudara dan keluarga besar yang telah memberikan dukungan dan
semangat selama penyusunan karya tulis ilmiah ini.
17. Segenap sahabat yang telah memberikan dukungan dan semangat selama
penyusunan karya tulis ilmiah ini.
18. Teman teman Medallion dan MALADICA yang telah memberikan
dukungan dan semangat selama penyusunan karya tulis ilmiah ini.
19. Serta semua pihak yang tidak mungkin kami sebutkan satu persatu atas
bantuannya secara langsung maupun tidak langsung sehingga Karya Tulis
Ilmiah ini dapat terselesaikan dengan baik.
Akhir kata, kami berharap Allah SWT berkenan membalas segala
kebaikan semua pihak yang telah membantu. Semoga Karya Tulis Ilmiah ini dapat
bermanfaat bagi kita semua.
Semarang, 3 Juli 2015
Penulis
v
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL ..........................................................................................
i
LEMBAR PENGESAHAN ...............................................................................
ii
PERNYATAAN KEASLIAN PENELITIAN ..................................................
iii
KATA PENGANTAR ........................................................................................ iv
DAFTAR ISI ...................................................................................................... vi
DAFTAR TABEL ............................................................................................... ix
DAFTAR LAMPIRAN ...................................................................................... x
DAFTAR GAMBAR ........................................................................................
xi
DAFTAR SINGKATAN .................................................................................... xii
PENDAHULUAN ............................................................................................. 1
1.1
Latar Belakang ......................................................................................... 1
1.2
Permasalahan Penelitian ......................................................................... 3
1.3
Tujuan Penelitian ..................................................................................... 4
1.3.1 Tujuan Umum ......................................................................................... 4
1.3.2 Tujuan Khusus ........................................................................................ 4
1.4
Manfaat Penelitian .................................................................................. 5
1.5
Keaslian Penelitian ................................................................................. 5
BAB 2 TINJAUAN PUSTAKA ....................................................................... 9
Infeksi Daerah Operasi ....................................................................................... 9
2.1
Faktor Risiko Infeksi Daerah Operasi .....................................................
12
2.2
Faktor Risiko Kolonisasi Bakteri Patogen Potensial pada Kulit ............
14
2.2.1 Jenis Kelamin ...........................................................................................
15
2.2.2 Status Gizi
...............................................................................................
16
vi
2.2.3 Diabetes Melitus
......................................................................................
17
2.2.4 Riwayat Penggunaan Antibiotik
.............................................................
17
2.3
Bakteri Patogen Potensial Penyebab Infeksi Daerah Operasi ................. 18
2.3.1 Staphylococcus aureus ............................................................................ 19
2.3.2 Escherichia coli ...................................................................................
20
2.3.3 Enterobacter sp. ..................................................................................
21
2.3.4 Pseudomonas sp. .................................................................................
22
2.3.5 Klebsiella sp. .......................................................................................... 23
2.3.6 Identifikasi Bakteri Patogen Potensial ................................................... 24
BAB 3 KERANGKA TEORI, KERANGKA KONSEP, DAN HIPOTESIS..
3.1
Kerangka Teori
36
..........................................................................................
36
3.2
Kerangka Konsep
......................................................................................
37
3.3
Hipotesis
....................................................................................................
37
BAB 4 METODE PENELITIAN ...................................................................... 38
4.1
Ruang lingkup penelitian ......................................................................... 38
4.2
Tempat dan waktu penelitian .................................................................... 38
4.3
Jenis dan rancangan penelitian ................................................................. 38
4.4
Populasi dan sampel .................................................................................. 39
4.4.1 Populasi target ........................................................................................... 39
4.4.2 Populasi terjangkau ................................................................................... 39
4.4.3 Sampel ....................................................................................................... 39
4.4.4 Cara sampling ............................................................................................ 39
4.4.5 Besar sampel .............................................................................................. 40
4.5
Variabel penelitian ..................................................................................... 40
4.5.1 Variabel bebas ........................................................................................... 40
4.5.2 Variabel terikat .......................................................................................... 40
vii
4.6
Definisi operasional .................................................................................. 41
4.7 Cara pengumpulan data ................................................................................ 42
4.7.1 Bahan .......................................................................................................... 42
4.7.2 Alat ........................................................................................................... 43
4.7.3 Jenis Data .................................................................................................. 44
4.7.4 Cara Kerja ................................................................................................. 42
4.8
Alur Penelitian .......................................................................................... 50
4.9
Analisis Data ............................................................................................. 50
4.10 Etika Penelitian .......................................................................................... 50
4.11 Jadwal Penelitian ....................................................................................... 51
BAB 5 HASIL PENELITIAN ........................................................................... 52
5.1
Analisis Sampel dan Subjek Penelitian ..................................................... 52
5.2
Karakteristik Subjek Penelitian ................................................................. 52
5.3
Distribusi Kolonisasi Bakteri Patogen Potensial Penyebab IDO pada Kulit
Pasien Praoperatif ...................................................................................... 53
5.4
Distribusi Faktor Risiko ............................................................................ 55
5.5
Analisis Bivariat ........................................................................................ 55
5.6
Analisis Multivariat ................................................................................... 57
BAB 6 PEMBAHASAN .................................................................................... 58
6.1
Prevalensi kolonisasi bakteri potensial patogen pada kulit ....................... 58
6.2
Hubungan faktor risiko dengan kolonisasi bakteri potensial patogen
penyebab IDO ........................................................................................... 60
BAB 7 SIMPULAN DAN SARAN ................................................................... 64
DAFTAR PUSTAKA ......................................................................................... 65
LAMPIRAN ....................................................................................................... 82
viii
DAFTAR TABEL
Tabel 1. Keaslian penelitian
Tabel 2. Klasifikasi Indeks Massa Tubuh
Tabel 3. Definisi operasional
Tabel 4. Hasil isolasi primer
Tabel 5. Hasil identifikasi bakteri
Tabel 6. Karakteristik subjek penelitian berdasarkan jenis kelamin
Tabel 7. Karakteristik subjek penelitian berdasarkan usia.
Tabel 8. Distribusi faktor risiko
Tabel 9. Analisis bivariat
ix
DAFTAR GAMBAR
Gambar 1.
Ilustrasi klasifikasi IDO berdasarkan letak
Gambar 2.
S. aureus pada pengecatan gram
Gambar 3.
E. coli pada pengecatan gram
Gambar 4.
Enterobacter sp. pada pengecatan gram
Gambar 5.
P. aeruginosa pada pengecatan gram
Gambar 6.
Klebsiella sp. pada pengecatan gram
Gambar 7.
Beta hemolisis pada koloni S. aureus
Gambar 8.
Alfa hemolisis pada Streptococcus species grup Viridans
Gambar 9.
Gamma hemolisis pada koloni Enterococcus faecalis
Gambar 10.
MSA menunjukan hasil positif dan negatif
Gambar 11.
Koloni E. coli pada MAC memfermentasi laktosa
Gambar 12.
Bakteri coccus gram positif
Gambar 13.
Bakteri batang gram negatif
Gambar 14.
Hasil uji katalase
Gambar 15.
Hasil uji koagulase positif
Gambar 16.
Hasil uji TSIA
Gambar 17.
Hasil uji Indol
Gambar 18.
Hasil uji Metil Red
Gambar 19.
Hasil uji Voges Proskauer
Gambar 20.
Hasil uji Sitrat
Gambar 21.
Hasil uji Motilitas
Gambar 22.
Hasil uji Urease
Gambar 23.
Kerangka teori
Gambar 24.
Kerangka konsep
Gambar 25.
Alur penelitian
Gambar 26.
Jadwal penelitian
Gambar 27.
Distribusi kolonisasi bakteri patogen potensial penyebab IDO
x
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1. Informed consent
Lampiran 2. Kuesioner
Lampiran 3. Ethical clearance
Lampiran 4. Surat ijin penelitian
Lampiran 5. Surat ijin bagian ilmu bedah
Lampiran 6. Surat pernyataan penelitian
Lampiran 7. Hasil analisis
Lampiran 8. Dokumentasi penelitian
Lampiran 9. Biodata mahasiswa
xi
DAFTAR SINGKATAN
ASA
:
American Society of Anesthesiologist
BA
:
Blood agar
BMI
:
Body Mass Index
Depkes RI
:
Departemen kesehatan Republik Indonesia
ICU
:
Intensive Care Unit
IDO
:
Infeksi daerah operasi
IMT
:
Indeks massa tubuh
LOS
:
Length of stay
MAC
:
Mac Conkey agar
MSA
:
Mannitol salt agar
OR
:
Odd ratio
NIDDM
:
Non insulin dependent diabetes melitus
NSHN
:
National Healthcare Safety Network
RSCM
:
Rumah sakit dr Cipto Mangunkusumo
RSUD
:
Rumah sakit umum daerah
RSUP
:
Rumah sakit umum pusat
TSIA
:
Triple Sugar Iron agar
VP
:
Voges Proskauer
WHO
:
World Health Organizaton
xii
ABSTRACT
Latar belakang : Infeksi Daerah Operasi (IDO) dikaitkan dengan morbiditas dan
mortalitas pasien pasca operasi. Bakteri patogen yang paling sering menyebabkan
IDO antara lain S. aureus, E. coli, Enterobacter sp., Pseudomonas sp., dan
Klebsiella sp. Kolonisasi kulit oleh bakteri potensial patogen merupakan faktor
risiko IDO.
Tujuan : Untuk menentukan prevalensi kolonisasi kulit oleh bakteri potensial
patogen penyebab IDO serta menganalisis apakah jenis kelamin, diabetes melitus,
status gizi, dan riwayat penggunaan antibiotik 3 hari sebelum operasi merupakan
faktor risiko.
Metode : Penelitian observasional analitik dengan metode cross sectional telah
dilakukan. Tiga puluh delapan pasien praoperatif di bangsal bedah RSUP dr
Kariadi diambil apusan kulitnya di daerah insisi dalam waktu 2 jam sebelum
operasi. Data pasien diambil dari catatan medis. Status gizi diukur berdasarkan
Indeks Massa Tubuh. Isolat dari apusan kulit diidentifikasi di laboratorium
mikrobiologi. Asosiasi antara faktor risiko dan kolonisasi kulit oleh bakteri
patogen potensial dianalisis menggunakan uji chi square / fischer exact test.
Hasil : Prevalensi kolonisasi kulit oleh S. aureus, E. coli, Enterobacter sp.,
Pseudomonas sp., dan Klebsiella sp. masing masing sebesar 94,7%, 0%, 2,6%,
5,3% dan 5,3%. Hasil analisis bivariat tidak terdapat nilai yang signifikan untuk
semua variabel.
Simpulan : Prevalensi kolonisasi kulit oleh S. aureus sangat tinggi; sedangkan
bakteri batang gram negatif rendah. Tidak ada perbedaan yang signifikan dari
prevalensi kolonisasi kulit dengan jenis kelamin, diabetes melitus, status gizi, dan
riwayat penggunaan antibiotik dalam 3 hari terakhir.
Keyword : SSI, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Enterobacter sp,
Pseudomonas sp. , Klebsiella sp., colonization, preoperative
xiii
ABSTRACT
Background : Surgical site infection (SSI) is associated with morbidity and
mortality of postoperative patient. The most common pathogen bacteria that
caused SSI were S. aureus, E. coli, Enterobacter sp, Pseudomonas aeruginosa,
and Klebsiella sp. Skin colonization by potential pathogenic bacteria is risk factor
for SSI.
Aim : To determine the prevalence of skin colonization by potential pathogenic
bacteria causing SSI and to analyze whether gender, diabetes mellitus, nutritional
status, and history of using antibiotic within three days before surgery were the
risk factors.
Methods : Observational analytic study with cross sectional data retrieval was
performed. Thirty-eight preoperative patients in the surgical ward of Dr Kariadi
hospital were taken their skin swab around the incision area within 2 hours before
the surgery. Patients’ data were taken from medical record. Nutritional status was
measured based on Body Mass Index. Isolates from skin swab were identified in
microbiology laboratory. The association between risk factors and skin
colonization by potential pathogenic bacteria were analyzed using chi
square/fischer exact test.
Result : The prevalence rate for S. aureus, E. coli, Enterobacter sp, Pseudomonas
sp., and Klebsiella sp. skin colonization were 94.7%, 0%, 2.6%, 5.3% and 5.3%
respectively. Bivariate analysis resulted in no significant value for all variables.
Conclusion : The prevalence of skin colonization by S. aureus was very high;
That of Gram negative bacili was low. There was no significant difference of skin
colonization prevalence with regard to gender, diabetes mellitus, nutritional status,
and history of using antibiotic within three previous days.
Keyword : SSI, Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Enterobacter sp,
Pseudomonas sp. , Klebsiella sp., colonization, preoperative
xiv