iv ABSTRAK Andi Irma. Deteksi Morfologi dan Molekuler Parasit

ABSTRAK
Andi Irma. Deteksi Morfologi dan Molekuler Parasit Anisakis sp pada Ikan
Cakalang (Katsuwonus pelamis). Di bawah bimbingan Hilal Anshary dan Gunarto
Latama.
Penelitian ini bertujuan mengetahui tingkat infeksi parasit Anisakis sp.,
pada ikan cakalang dan melakukan deteksi molekuler Anisakis sp., dengan
Polymerase Chain Reaction (PCR). Ikan cakalang adalah ikan bernilai komersial
tinggi, dan dijual dalam bentuk segar, beku, atau diproses sebagai ikan kaleng,
ikan kering, atau ikan asap.
Ikan cakalang bisa berperan sebagai inang perantara dalam siklus hidup
cacing-cacing tertentu seperti Anisakidae. Anisakiasis adalah penyakit yang
disebabkan oleh cacing dari family Anisakidae terutama Anisakis sp dan
tergolong zoonosis yang berbahaya. Sumber infeksi utama pada manusia adalah
mengkonsumsi ikan mentah yang mengandung larva Anisakis sp. Indonesia
sebagai pusat diversitas parasit di dunia, kemungkinan memiliki spesies parasit
Anisakis sp., yang lebih besar dan belum terdeskripsi. Oleh karena itu, sebagai
langkah awal dari penelitian ini, kegiatan yang dilakukan adalah mengoleksi
parasit nematoda dari ikan cakalang (Katsuwonus pelamis) dan menentukan
tingkat infeksi Anisakis sp., dari Perairan Sulawesi Selatan, dan selanjutnya
melakukan deteksi dan diagnosa secara molekuler dengan teknik Polymerase
Chain Reaction (PCR).
Jumlah ikan yang diperiksa sebanyak 36 ekor, dengan panjang rata-rata
ikan kecil (<30 cm ) dan ikan besar (≥30 cm) yang diambil dari pelelangan ikan,
yaitu, 1. Pelelangan ikan Rajawali, 2. Pelelangan ikan Paotere dan 3. Pelelangan
ikan Beba. Ikan diperiksa dengan terlebih dahulu mengukur panjang ikan, lalu
dilakukan pemeriksaan pada organ dalam dan otot ikan. Parsit nematode
dilepaskan dan jaringan, ditempatkan pada cawan petri berisi air fisiologis dan
dibersihkan dari kotoran dan selanjutnya diidentifikasi secara morfologi dibawah
sterio mikroskop. Beberapa parasit Anisakis sp., akan difiksasi pada alcohol 70%
untuk uji PCR.
Berdasarkan pengamatan morfologi dan PCR parasit nematode yang
menginfeksi ikan cakalang adalah Anisakis sp. Parasit ini menyerang pada
bagian usus, lambung dan hati ikan cakalang. Berdasarkan hasil penelitian
secara mikroskopik Anisakis memiliki tubuh yang bulat panjang berwarna putih
trasparan, pada bagian anterior terdapat ventriculus (0,2163 ± 0,0025 mm) yang
berwarna putih. Parasit Anisakis sp., tidak ditemukan pada ikan berukuran kecil
(≤ 30 cm), dan prevalensi mencapai 58,33 % pada ikan berukuran besar (> 30
cm). Secara molekuler DNA yang teramplifikasi dengan praimer universal
dengan ukuran 950 bp adalah Anisakis sp.
iv
KATA PENGANTAR
Puji dan syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT, karena atas
rahmat dan hidayah-Nya, selanjutnya skripsi yang berjudul Deteksi Morfologi
dan Molekuler Parasit Anisakis sp pada Ikan Cakalang (Katsuwonus
pelamis) dapat penulis selesaikan dengan baik.
Penulis menyadari bahwa skripsi ini tidak akan terselesaikan tanpa
bantuan dariberbagai pihak, Oleh karena itu penulis mengucapkan terima kasih
kepada :
1. Dr. Ir. Hilal Anshary, M. Sc, selaku pembimbing utama atas bimbingan,
arahan, waktu, dan kesabaran yang telah diberikan kepada penulis selama
penyusunan skripsi ini.
2. Dr. Ir. Gunarto Latama, M. Sc, selaku pembimbing anggota yang telah
meluangkan waktunya dalam memberi bimbingan, saran dan dampingan
kepada penulis.
3. Ir. Margaretha Bunga MP, Ir. Sriwulan MP dan Dr. Ir. Asmi Citra Malina,
M.Sc selaku dosen penguji pada ujian sidang penulis yang telah meluangkan
waktunya serta memberikan kritik dan saran demi perbaikan skripsi ini.
4. Rahmi S. Pi selaku teknisi Laboratorium Parasit dan Penyakit Ikan yang
telah
membantu,
membimbing,
dan
memfasilitasi
penulis
selama
menjalankan kegiatan penelitian.
5. Seluruh Dosen dan Staf Fakultas Ilmu Kelautan dan Perikanan atas perhatian
dan bantuannya selama penulis menempuh studi hingga akhir.
v
6. Ayahanda Andi Muhamad Arief, SE dan Ibunda H. Andi Maryam Iskandar,
serta segenap keluarga besar yang telah tulus dan penuh kasih sayang telah
memberikan doa, perhatian, semangat dan bantuan moril maupun materil
serta mencurahkan perhatian lebih kepada penulis.
7. Seluruh teman – temanku di Jurusan Perikanan terkhusus BDP 2006 dan
HMP-BDP yang penulis tidak dapat sebutkan satu persatu.
Penulis menyadari bahwa dalam penyusunan skripsi ini masih jauh dari
kesempurnaan, Untuk itu melalui kesempatan ini penulis mengharapkan kritik
dan saran dari berbagai pihak yang bersifat membangun demi kesempurnaan
skripsi ini dan semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi pembaca, Amien Ya
Rabbalalamin.
Makassar,
Penulis
vi
Oktober 2011
RIWAYAT HIDUP
Penulis Lahir di Palu Pada Tanggal 5 Juli 1987. Anak ketiga
dari empat bersaudara dari pasangan Andi Muhammad Arief
Marzuki, SE dan H. Andi Maryam Iskandar. Pada tahun 2000
penulis lulus dari SD Negeri Mangkura III dan selanjutnya
mengenyam sekolah menengah pertama di SMP Negeri 8
Makassar sampai tahun 2003. Pada tahun 2006 penulis lulus
dari SMA Negeri 13 Makassar dan pada tahun yang sama
penulis diterima sebagai mahasiswa Budidaya Perairan
Jurusan Perikanan Fakultas Ilmu Kelautan dan Perikanan Universitas
Hasanuddin melalui jalur SPMB.
vii
DAFTAR ISI
HALAMAN
HALAMAN PENGESAHAN……………………………………………
iii
ABSTAK……………………………………………………………………
iv
KATA PENGANTAR……………………………………………………..
v
DAFTAR ISI………………………………………………………………..
vii
DAFTAR TABEL………………………………………….......................
ix
DAFTAR GAMBAR……………………………………………………….
x
I. PENDAHULUAN
Latar Belakang………………………………………………………….
1
Tujuan dan Kegiatan…………………………………………………..
3
II. TINJAUAN PUSTAKA
Sistematika dan Morfologi…………………………………………….
4
Parasit Anisakis sp pada Ikan cakalang……………………………..
6
Sistematika dan Morfologi Anisakis sp………………………………
7
Siklus Hidup Larva Parasit Anisakidae………………………………
9
Jenis dan Distribusi Parasit Anisakidae……………………………..
12
Anisakis Simplekx Complex………………………………………
13
A. simplex s.s…………………………………………………
13
A. pegreffii……………………………………………………..
13
A. simplex C…………………………………………………..
13
A. typical……………………………………………………….
13
A. ziphidarum…………………………………………………
14
Anisakis sp…………………………………………………….
14
A. physeteris…………………………………………………..
14
A. paggiae……………………………………………………..
14
Anisakiasis………………………………………………………………
15
Perkembangan Penelitian Molekuler Anisakis sp…………………..
16
III. METODE PENELITIAN
Waktu dan Tempat……………………………………………………..
17
Alat dan Bahan…………………………………………………………
17
viii
Hewan Uji……………………………………………………………….
17
Prosedur Kerja………………………………………………………….
18
1. Survei Ikan Katsuwonus pelamis pada Beberapa Pelelangan
Ikan (Beba, Rajawali dan Paotere)……………………………..
18
2. Identifikasi Morfologi Parasit Anisakis sp………………………
18
3. Identifikasi Molekuler Parasit Anisakis sp……………………...
19
Ekstraksi DNA Parasit Anisakis sp……………………………..
19
Amplifikasi DNA…………………………………………………..
21
Komposisi PCR…………………………………………………...
21
Primer Universal (ITS 1, 5.58 dan ITS2)………….……………
21
Kondisi PCR………………………………………………………
21
Elektroforesis……………………………………………………...
22
Perubah yang Diamati……………………………………………
22
IV.HASIL DAN PEMBAHASAN
A. Identifikasi dan Deskripsi Jenis Parasit………………………….
24
B. Tingkat Serangan Parasit (Prevalensi dan Intensitas)…………
31
V. KESIMPULAN DAN SARAN
Kesimpulan……………………………………………………………..
35
Saran…………………………………………………………………….
35
DAFTAR PUSTAKA
LAMPIRAN
ix
DAFTAR TABEL
Nomor
1
HALAMAN
Teks
Prevalensi dan intensitas parasit………………………
x
31
DAFTAR GAMBAR
Nomor
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
HALAMAN
Teks
Bentuk umum serta bagian-bagian tubuh ikan
cakalang (Katsuwonus pelamis)……………………….
Anisakis sp……………………………………………….
Morfologi Anisakis simplex pada ikan salmon……….
Bagian posterior dari Anisakis sp dewasa……………
Siklus hidup Anisakis sp….……………………………
Morfologi Anisakis sp (40x40)………………………….
Gambar ventriculus larva Anisakis sp………………...
Morfologi parasit Anisakis sp bagian anterior
(40x40)……………………………………………………
Morfologi parasit Anisakis sp bagian posterior
(40x40)……………………………………………………
Anisakis sp pada jeroan ikan cakalang (Katsuwonus
pelamis)…………………………………………………..
Larva Anisakis yang terdapat pada hati ikan
cakalang (Katsuwonus pelamis)………………………
Larva Anisakis yang terdapat pada otot ikan
cakalang (Katsuwonus pelamis)………………………
Grafik frekuensi parasit Anisakis sp berdasarkan
panjang ventriculus……………………………………..
Hasil PCR dengan menggunakan primer F: (5-GTC
GAA TTC GTA GGT GAA CCT GCG GAA GGA TCA-3)
dan R: (5-GCC GGA TCC GAA TCC TGG TTA GTT TCT
TTT CCT-3)……………………………………………………
xi
5
7
8
9
11
24
25
26
26
27
29
29
30
32