vii Novarizka, R. G., 2013, Amplifikasi dan Identifikasi D

ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga
Novarizka, R. G., 2013, Amplifikasi dan Identifikasi D-loop DNA Mitokondria
Sel Akar Rambut Beberapa Anggota Populasi dari kecamatan Manyar, Gresik
Guna Pengembangan Database Forensik, skripsi, dibawah bimbingan Dr.
Purkan, M.Si dan Prof. Dr. Afaf Baktir, MS Departemen Kimia, Fakultas Sains
dan Teknologi, Universitas Airlangga, Surabaya
ABSTRAK
Genom mtDNA manusia terdiri dari dua daerah yaitu daerah pengkode dan
daerah non pengkode yang lebih dikenal dengan daerah D-loop. D-loop memiliki
tingkat polimorfisme yang tertinggi dalam mtDNA terutama pada daerah
hipervariable region 1 (HVR1) Tingginya laju mutasi pada daerah HVR1 mtDNA
dapat memberikan berbagai manfaat dalam bidang forensik dan identifikasi hubungan
kekerabatan. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan varian nukleotida pada
individu di kecamatan Manyar, Gresik. Untuk tujuan tersebut maka telah dilakukan
penentuan urutan nukleotida pada daerah HVR1 D-Loop mtDNA individu dengan
menggunakan sampel akar rambut. Penelitian ini terdiri dari isolasi mtDNA sampel,
amplifikasi daerah D-Loop mtDNA dengan teknik PCR, pemurnian fragmen D-loop
mtDNA hasil PCR, sekuensing dan analisis varian pada daerah HVR 1 D-loop
mtDNA. Penelitian ini telah berhasil mengamplifikasi daerah D-loop mtDNA pada
sampel akar rambut individu kecamatan Manyar, Gresik dengan kondisi umum PCR
pada suhu 55ºC. Analisis varian sampel adalah G1 pada G16129A; A16162G;
T16172C; T16304C. Pada G2 T16032G; C16076A T16189; insersi C 16194;
A16183C; T16196G; C16202A; G16205T. Pada G3 C16223T; T16311C; T16315A;
A16318T ;A16322T; A16340T; A16345T. Pada sampel G4 T16024G; C16075A
G16128A; A16161G; T16171C; C16200T. Pada G5 T16189C; C16198T A16183C;
C16202A dan insersi C 16194
Kata kunci : mtDNA, D-loop, HVR1, varian
vii
SKRIPSI
AMPLIFIKASI DAN IDENTIFIKASI D-LOOP DNA MITOKONDRIA SEL
AKAR RAMBUT BEBERAPA ANGGOTA POPULASI DARI KECAMATAN
MANYAR, GRESIK GUNA PENGEMBANGAN DATABASE FORENSIK
REDIANTI GALUH N.
ADLN - Perpustakaan Universitas Airlangga
Novarizka, R. G., 2013,.Amplification and Identification D-loop Mitocondrial
DNA of Human Hair Root Cell From Several Population Member In District
Manyar, Gresik for Forensic Database Development, undergraduate thesis,
under Guidance Dr. Purkan, M.Si and Prof. Dr. Afaf Baktir, MS , Department
of Chemistry, Science and Technology Faculty, Universitas Airlangga, Surabaya
ABSTRACT
Human mtDNA genome has two regions, coding region and non-coding
[]pregions known as the D-loop region. D-loop region has the highest level of
polymorphism, especially in the area hipervariable region 1 (HVR1). High rate of
mutations in mtDNA HVR1 region give many benefits in the field of forensics and
identification of kinship. This study aims to determine the nucleotide variants in
individuals in district Manyar, Gresik. For this purpose it has to determine the
nucleotide sequence regions of HVR1 mtDNA D-Loop individuals using hair root
samples. The study sample consisted of mtDNA isolation, amplification of D-loop
region of mtDNA by PCR technique, purification of results mtDNA D-loop PCR,
sequencing and analysis of variance on the HVR region 1 mtDNA D-loop. This study
has successfully amplify regions D-loop mtDNA the individual hair root samples in
district Manyar, Gresik with common PCR conditions at a temperature of 55 º C.
Analysis of the sample variance is G1 at G16129A; A16162G; T16172C; T16304C.
At G2 T16032G; C16076A; T16189; insertion C at 16194; A16183C; T16196G;
C16202A; G16205T. at G3 C16223T; T16311C; ; T16315A; A16318T; A16322T;
A16340T; A16345T. At G4. T16024G; C16075A G16128A; A16161G; T16171C;
C16200T. At G5 T16189C; C16198T A16183C; C16202A and insertion C at 16194
Key words: mtDNA, D-loop, HVR1, variant
DAFTAR ISI
Halaman
viii
SKRIPSI
AMPLIFIKASI DAN IDENTIFIKASI D-LOOP DNA MITOKONDRIA SEL
AKAR RAMBUT BEBERAPA ANGGOTA POPULASI DARI KECAMATAN
MANYAR, GRESIK GUNA PENGEMBANGAN DATABASE FORENSIK
REDIANTI GALUH N.