Bioinformatika-TS06-Study case-kelompok 4

advertisement
Muhammad Ferdyansyah Sechan
10407018
Kelompok 4
Asisten: Sopian
Hasil analisis filogeni dari sekuens yang diberikan adalah sebagai berikut:
Dan organisme-organisme tersebut ialah:
• gi|1091503 Bacillus anthracis
• gi|2612868 Bacillus thuringiensis
• gi|2612596 Bacillus circulans
• gi|9511578 Bacillus substilis
• gi|2562594 Bacillus coagulans
• gi|2613625 Bacillus licheniformis
Dari pohon filogeni di atas, bisa dilihat bahwa B. circulans memiliki hubungan
kekerabatan yang sangat erat dengan B. coagulans; kemungkinan dulunya kedua bakteri
tersebut adalah bakteri satu spesies (beda strain) yang kemudian mengalami perubahan
karakteristik (biokimia atau genetis) sehingga menjadi dua bakteri berbeda spesies.
Kedua bakteri itu memiliki hubungan kekerabatan dengan B. licheniformis, yang tampak
memiliki ke-hampir-miripan karakter dengan bakteri ancestor B. circulans dan B.
coagulans.
Bakteri B. substilis dan B. thuringiensis memiliki hubungan kekerabatan yang cukup
jauh dengan B. circulans. Bila diibaratkan silsilah keluarga, kedua bakteri tersebut
berturut-turut bertindak sebagai buyut dan nenek bagi B. circulans. Bakteri yang
memiliki hubungan paling jauh adalah B. anthracis. Bisa dikatakan, bakteri inilah yang
paling mirip dengan ancestor dari seluruh genus Bacillus.
Download