ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG
(Chanos chanos) ASAP YANG TELAH MENGALAMI PEMBUSUKAN
SKRIPSI
Diajukan Untuk Memenuhi Sebagian Syarat
Mencapai Derajat Sarjana S –1
Oleh :
NEIRA WILUYANDARI
0901070056
PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI
FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO
2013
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
MOTTO
"Hai orang-orang yang beriman, apabila dikatakan kepadamu: “Berlapang-lapanglah dalam
majelis”, maka lapangkanlah, niscaya Allah akan memberi kelapangan untukmu. Dan apabila
dikatakan: Berdirilah kamu, maka berdirilah, niscaya Allah akan meninggikan orang-orang
yang beriman di antaramu dan orang-orang yang diberi ilmu pengetahuan beberapa derajat.
Dan Allah Maha Mengetahui apa yang kamu kerjakan (Surah Al-Mujaadilah : 11).
 Dream what you dare to dream, go where you want to go, Be what you want to be.
 Musuh terbesar adalah keangkuhan diri kita sendiri.
 Orang bijaksana tidak pernah duduk meratapi kegagalannya, tapi dengan gembira hati
mencari jalan bagaimana memulihkan kembali kerugian yang dideritanya.
 Bahagia adalah ketika kita melihat orang yang kita sayangi tersenyum.
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
PERSEMBAHAN
Sujud syukurku Kehadirat Illahi Robbi atas semua yang telah diberikan kepada penulis
sehingga dapat menyelesaikan skripsi ini tanpa ada halangan, dan penulis ingin
mempersembahkan skripsi ini untuk:
 Bapak dan Ibu tercinta ananda senantiasa mengucapkan rasa terimakasih yang mendalam
atas Do’a yang tiada hentinya dan dukungan untuk selalu semangat dalam menyelesaikan
skripsi ini. “Engkaulah pahlawan sejati dalam hidupku”
 Adiku tersayang yang telah mendoakan dan memberikan semangat.
 Embah putri (Rumyati) dan embah kakung (Sunarjo) yang sudah menjaga ku dari kecil
hingga sekarang, selalu memberikan nasihat dan memarahi ku ketika ku berbuat salah.
 My beloved Barkah Riadi terima kasih atas semangat, doa, dan bantuannya dalam
penyusunan skripsi selama ini, kau selalu membuat ku tersenyum.
 Sahabat-sahabatku Siti Nur Amanah, Mega Mareta, Diah Waryanti terimakasih selalu ada
disaat aku merasa putus asa, selalu memberikan semangat dan dorongan untuk tetap kuat
dan terus semangat.
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
UCAPAN TERIMAKASIH
Bismillahirrohmaanirrohim
Alhamdulillahirrobbil’alamiin, Puji Syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT
yang telah melimpahkan rahmat dan inayah-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan
skripsi yang berjudul “Isolasi dan Identifikasi Bakteri pada Ikan Bandeng (Chanos
chanos) Asap yang telah Mengalami Pembusukan”.
Penulis menyadari bahwa terselesainya penyusunan skripsi ini pastinya berkat
dukungan, bimbingan, serta bantuan dari berbagai pihak yang terlibat langsung maupun tidak
langsung. Dalam kesempatan ini, perkenankanlah penulis mengucapkan terimakasih yang
tulus ikhlas penulis sampaikan kepada bapak Drs. Heri Maryanto, M.Si dan Ibu Dini Siswani
Mulia, S.Pi, M.Si selaku Dosen Pembimbing skripsi yang dengan segala kesabaran
memberikan bimbingan, arahan serta dorongan sehingga penulis dapat menyelesaikan
penelitian dan penulisan skripsi dengan baik dan lancar.
Selain itu penulis juga mengucapkan terimakasih kepada:
1.
Drs. Ahmad, M.Pd selaku Dekan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan
Universitas
Muhammadiyah Purwokerto.
2.
Drs. Arief Husin, M.Si selaku Ketua Program Studi Pendidikan Biologi
Fakultas
Keguruan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah Purwokerto atas fasilitasi
kelancaran skipsi.
3.
Segenap Dosen Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah
Purwokerto yang selalu memberikan tambahan ilmu.
4.
Staf karyawan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan.
5.
Staf laboran yang telah memberi bantuan selama penelitian: Kurniawan, S.Si,
Alhikmah, S.Si, R. Nindra, S.Si.
6.
Bapak dan Ibu tercinta yang senantiasa selalu memberikan Doa dan semangat, beriburibu terima kasih untuk semuanya yang tak akan cukup jika diungkapkan dengan katakata dan yang tak akan mungkin terbalaskan sampai kapanpun “Engkaulah pahlawan
sejati dalam hidup ku”.
7.
Adik dan keluarga besarku yang telah memberikan dukungan dan doa.
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
8.
My Beloved Barkah Riadi terimakasih atas doa, dukungan, dan segala bantuan yang
telah diberikan, kau selalu membuatku tersenyum.
9.
Sahabat-sahabatku Siti Nur Amanah, Mega Mareta, Diah waryanti, terima kasih selalu
ada disaat aku merasa putus asa, kalian selalu memberikan semangat dan dorongan untuk
tetap kuat dan terus semangat.
10. Teman-teman seperjuangan di Prodi Pendidikan Biologi 2009 atas kerjasamanya selama
ini.
11. Kepada semua pihak yang tidak bisa penulis sebutkan satu persatu yang
telah
membantu dalam penyusunan skripsi ini.
Semoga amal dan kebaikan yang telah diberikan Bapak dan Ibu dosen serta teman-teman
semua kepada penulis mendapat balasan yang setimpal dari Allah SWT.
Penulis menyadari karya ini masih sangat jauh dari sempurna. Oleh karena itu, kritik dan
saran yang membangun sangat diharapkan. Semoga dapat bermanfaat bagi pembaca.
Purwokerto, 12 Agustus 2013
Penulis
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG (Chanos chanos)
ASAP YANG TELAH MENGALAMI PEMBUSUKAN
Oleh
NEIRA WILUYANDARI
0901070056
ABSTRAK
Penelitian yang berjudul Isolasi dan Identifikasi Bakteri pada Ikan Bandeng (Chanos
chanos) busuk yang telah diawetkan dengan Pengasapan bertujuan untuk mengetahui jenisjenis bakteri pada ikan bandeng busuk yang telah diawetkan melalui proses pengasapan.
Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret-April 2013 di Laboratorium Mikrobiologi
Progam Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto. Metode yang
digunakan yaitu metode survey, kemudian data yang diperoleh dianalisis secara deskriptif.
Sampel diambil dari Desa Sitanggal Kabupaten Brebes, dan pengambilan sampel dilakukan
sebanyak 3 kali dengan rentang waktu satu bulan. Sampel yang digunakan adalah ikan
bandeng asap yang dibiarkan sampai membusuk, kemudian diambil bagian yang membusuk.
Isolasi akan dilakukan dengan metode dillution plating (pengenceran) sampai tingkat
pengenceran 10-3. Hasil isolasi disimpan dalam stock culture dan working culture. Hasil
isolasi tersebut akan diidentifikasi dengan melihat karakteristik makroskopis dan mikroskopis
serta serangkaian uji biokimia dari sel bakteri tersebut. Hasil identifikasi bakteri dicocokkan
dengan buku identifikasi bakteri Bergey’s of Determinative Bacteriology9th (Holt, dkk. 1994).
Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus yaitu Salmonella,
Plesiomonas, Pseudomonas, Edwardsiella, Yersinia, Proteus, dan Megamonas yang
termasuk bakteri Gram negatif dan Listeria yang termasuk bakteri Gram positif.
Kata Kunci: bakteri, bandeng busuk, identifikasi, isolasi.
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
DAFTAR ISI
Halaman
UCAPAN TERIMAKASIH ....................................................................... vii
DAFTAR ISI ............................................................................................. x
DAFTAR TABEL ..................................................................................... xi
DAFTAR GAMBAR ................................................................................. xii
DAFTAR LAMPIRAN .............................................................................. xiii
BAB I. PENDAHULUAN
1.1 Latarbelakang ................................................................................ 1
1.2 Rumusan Masalah .......................................................................... 4
1.3 Tujuan Penelitian ........................................................................... 4
1.4 Manfaat Penelitian ......................................................................... 4
BAB II TINJAUAN PUSTAKA
2.1 Ikan Bandeng ................................................................................ 5
2.1.1 Klasifikasi Ikan Bandeng ..................................................... 5
2.1.2 Morfologi Ikan Bandeng ...................................................... 5
2.1.3 Kandungan Gizi Ikan Bandeng ............................................ 6
2.2 Cara Pengawetan Ikan Bandeng .................................................... 7
2.2.1 Pengasapan .......................................................................... 7
2.2.2 Pemanggangan .................................................................... 9
2.2.3 Pendinginan ......................................................................... 10
2.2.4 Pembekuan .......................................................................... 10
2.2.5 Penambahan Bahan Kimia ................................................... 11
2.2.6 Suhu Tinggi ......................................................................... 12
2.2.7 Fermentasi Ikan ................................................................... 12
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
2.3 Bakteri ...................................................................................... 12
2.3.1 Ukuran Bakteri .................................................................... 13
2.3.2 Bentuk Bakteri ..................................................................... 13
2.3.3 Struktur Sel Bakteri ............................................................. 14
2.3.4 Nutrisi Bakteri ..................................................................... 16
2.4 Jenis-jenis Bakteri Pembusuk yang ada pada Ikan Bandeng ............ 16
2.4.1 Moraxella ............................................................................. 16
2.4.2 Pseudomonas ....................................................................... 17
2.4.3 Shewanella .......................................................................... 18
2.4.4 Micrococus .......................................................................... 19
2.5 Isolasi .......................................................................................... 19
2.6 Identifikasi .................................................................................... 20
BAB III METODE PENELITIAN
3.1 Lokasi dan Waktu ......................................................................... 22
3.2 Alat dan Bahan .............................................................................. 22
3.3 Metode Penelitian .......................................................................... 22
3.4 Cara Kerja ..................................................................................... 23
3.4.1 Pengambilan Sampel ........................................................... 23
3.4.2 Pembuatan Medium ............................................................. 23
3.4.2.1 Medium nutrient agar (NA) .................................... 23
3.4.2.2 Medium Uji nitrate broth (NB) ................................ 23
3.4.2.3 Medium Uji triple sugar iron agar (TSIA) ............... 23
3.4.2.4 Medium Uji trypticase soy agar (TSA) .................... 24
3.4.2.5 Medium Uji protease (MR-VP) ............................... 24
3.4.2.6 Medium Uji simmon sitrat agar ............................... 24
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
3.4.2.7 Medium Uji SIM agar .............................................. 25
3.4.3 Isolasi dan Pemurnian .......................................................... 25
3.4.4 Pemeliharaan ....................................................................... 26
3.4.5 Pengamatan Karakteristik Bakteri ........................................ 27
3.4.5.1 Pengamatan Karakteristik Makroskopis Bakteri ....... 27
3.4.5.1 Pengamatan Karakteristik Mikroskopis Bakteri ........ 27
3.4.6 Uji Biokimia ........................................................................ 28
3.4.7 Identifikasi Bakteri .............................................................. 31
3.4.8 Parameter yang Diamati ....................................................... 31
3.4.9 Analisis Data ....................................................................... 31
BAB 1V HASIL DAN PEMBAHASAN
4.1 Hasil
.......................................................................................... 33
4.2 Pembahasan .................................................................................. 48
BAB V SIMPULAN DAN SARAN
5.1 Simpulan ....................................................................................... 59
5.2 Saran
.......................................................................................... 59
DAFTAR PUSTAKA ................................................................................ 60
LAMPIRAN .............................................................................................. 62
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
DAFTAR TABEL
Halaman
Tabel 4.1. Kode isolasi bakteri yang berhasil diisolasi dari ikan bandeng asap33
Tabel 4.2. Hasil pengamatan karakteristik mikroskopis isolat ................... 34
Tabel 4.3. Hasil uji biokimia .................................................................... 35
Tabel 4.4. Hasil identifikasi genus Salmonella ......................................... 40
Tabel 4.5. Hasil identifikasi genus Plesiomonas ....................................... 41
Tabel 4.6. Hasil identifikasi genus Pseudomonas ..................................... 42
Tabel 4.7. Hasil identifikasi genus Edwardsiella ...................................... 43
Tabel 4.8. Hasil identifikasi genus Listeria ............................................... 44
Tabel 4.9. Hasil identifikasi genus Yersinia .............................................. 45
Tabel 4.10. Hasil identifikasi genus Proteus .............................................. 47
Tabel 4.11. Hasil identifikasi genus Megamonas ....................................... 48
Tabel 4.12. Tabel isolat bakteri hasil identifikasi ....................................... 49
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
DAFTAR GAMBAR
Halaman
Gambar 2.1. Morfologi ikan bandeng (Channos channos F) ....................... 6
Gambar 4.1. Hasil pengamatan karakteristik makroskopis morfologi koloni bakteri .... 34
Gambar 4.2. Hasil uji penggunaan sitrat .................................................... 36
Gambar 4.3. Hasil uji methyl red ............................................................... 37
Gambar 4.4. Hasil uji voges preskauer ...................................................... 37
Gambar 4.5. Hasil uji indole ..................................................................... 38
Gambar 4.6. Hasil uji H2S ......................................................................... 39
Gambar 4.7. Persamaan reaksi penguraian H2O2 oleh enzim katalase ........ 51
Gambar 4.8. Persamaan reaksi (I) dan (II) fermentasi asam sitrat .............. 52
Gambar 4.9. Persamaan reaksi hidrolisis glukosa ...................................... 55
Gambar 4.10. Persamaan reaksi (I) dan (II) fermentasi karbohidrat ............ 55
Gambar 4.11. Persamaan reaksi penguraian tryptophan oleh enzim tryptophanase ....... 56
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013
DAFTAR LAMPIRAN
Halaman
Lampiran 1. Hasil Identifikasi Isolat-Isolat Bakteri........................................ 62
Lampiran 2. Tabel Isolat Bakteri Hasil Identifikasi ........................................ 63
Lampiran 3. Pengamatan Mikroskopis Bakteri .............................................. 64
Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013