ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI
advertisement
ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI NOSOKOMIAL PADA LINGKUNGAN RUMAH SAKIT MARGONO SOEKARJO PURWOKERTO SKRIPSI Skripsi diajukan untuk memenuhi salah satu syarat memperoleh gelar Sarjana Farmasi (S. Farm) Diajukan oleh MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF 1208010123 Kepada Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto Purwokerto 2017 1 ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENYEBAB INFEKSI NOSOKOMIAL PADA LINGKUNGAN RUMAH SAKIT MARGONO SOEKARJO PURWOKERTO SKRIPSI Diajukan oleh MOHAMMAD ZULFIKAR RASHIF 1208010123 Kepada Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto Purwokerto 2017 2 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 3 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 4 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 HALAMAN PERNYATAAN Yang bertanda tangan dibawah ini, saya : Nama : Mohammad Zulfikar Rashif NIM : 1208010123 Program Studi : Farmasi Fakultas/Universitas : Farmasi/Universitas Muhammadiyah Purwokerto Menyatakan dengan sebenar-benarnya bahwa skripsi ini adalah hasil dari proses penelitian saya yang telah dilakukan sesuai prosedur penelitian yang benar dengan arahan dari dosen pembimbing dan bukan hasil penjiplakan dari hasil karya orang lain atau terdapt karya yang pernah diajukan untuk memperoleh gelar kesarjanaan di suatu perguruan tinggi dan sepanjang pengetahuan penulis juga tidak terdapat karya atau pendapat yang pernah ditulis atau diterbitkan orang lain kecuali yang secara tertulis diacu dalam naskah ini dan disebutkan dalam daftar pustaka. Demikian Pernyataan ini dan apabila kelak dikemudian hari terbukti ada unsur penjiplakan, maka saya bersedia mempertanggung jawabkan sesuai dengan ketentuan yang berlaku. Purwokerto, Agustus 2017 Yang menyatakan Mohammad Zulfikar Rashif 5 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 ABSTRAK Infeksi nosokomial merupakan infeksi yang didapat selama pasien dirawat di rumah sakit 3 x 24 jam atau infeksi yang terjadi pada lokasi yang sama tetapi disebabkan oleh mikroorganisme yang berbeda dari mikroorganisme pada saat masuk rumah sakit atau mikroorganisme penyebab sama tetapi lokasi berbeda. Penelitian ini bertujuan untuk mengisolasi dan mengidentifikasi famili bakteri penyebab infeksi nosokomial yang kemungkinan terdapat di lingkungan RS Margono.Metode penelitian dengan Uji identifikasi bakteri meliputi pengamatan karakteristik mikroskopik dan uji biokimia. Pada penelitian ini menggunakan 3 uji biokimia yang terdiri dari uji katalase, uji oksidase dan uji fermentasi karbohidrat. Dari 5 ruang yang diambil acak sampel pada lantai, dinding dan air maka didapat hasil mengidentifikasi bakteri di lingkungan RS Margono Soekarjo Purwokerto didapat famili bakteri yaitu sampel dinding 1 , lantai 1-3 merupakan Bacillaceae; dinding 2 , air 1-3 itu Pseudomonas ; dinding 3-5 , lantai 4 dan 5 itu Staphylococcaceae serta pada air 4 dan 5 itu Lactobacillaceae.Hasil penelitian identifikasi bakteri di lingkungan rumah sakit Margono berhasil beberapa bakteri yang diantaranya dikelompokkan menjadi famili bakteri. Famili bakteri yang didapat dari hasil identifikasi dengan uji biokimia telah dilakukan yang kemungkinan penyebab infeksi nosokomial yaitu Bacillaceae, Staphylococcaceae dan Pseudomonas. Kata Kunci: infeksi nosokomial, RS Margono Soekarjo Purwokerto, identifikasi, bakteri 6 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 ABSTRACT Nosocomial infection is an infection acquired during hospitalized patients 3 x 24 hours or infection occurring at the same site but caused by different microorganisms from microorganisms at the time of admission or similar cause microorganisms but different sites. This study aims to isolate and identify the bacterial families that cause nosocomial infections that may exist in the environment Margono Hospital. Methods of research with bacterial identification tests include observations of microscopic characteristics and biochemical tests. In this study used 3 biochemical tests consisting of catalase test, oxidase test and carbohydrate fermentation test. From 5 random samples taken on the floor, wall and water, the result of identifying bacteria in Margono Soekarjo Purwokerto Hospital was obtained by bacterial family, 1st wall, 1-3rd floor samples were Bacillaceae; wall 2, water 1-3 is Pseudomonas; walls 3-5, The 4th and 5th floors were Staphylococcaceae as well as on water 4 and 5 were Lactobacillaceae. The result research that the presence of bacteria found in the hospital environment Margono successes get some bacteria that among them grouped into bacterial families. Bacterial families obtained from the results of identification with biochemical tests have been conducted which are likely causes of nosocomial infections such as Bacillaceae, Staphylococcaceae and Pseudomonas. Keywords: nosocomial infection, Margono Soekarjo Purwokerto Hospital, Identification, bacterial 7 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 HALAMAN PERSEMBAHAN Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah memberikan kekuatan, kemudahan serta keridhoannya dalam menyelesaikan skripsi ini. Skripsi ini saya persembahkan untuk 1. Bapak Sugiarto dan Ibunda Rosi Heniwati yang selalu memberikan dukungan dalam menyelesaika studi 2. Kakak tercinta Meili Eka Listiani yang senantiasa memberikanku semangat, motivasi, do’a dan nasehat sehingga skripsi ini dapat diselesaikan dengan hasil yang memuaskan 3. Untuk sahabat-sahabat Tamtama 2012 dan teman-teman Allosteric yang selalu mendukung saya dalam menyelesaikan skripsi ini 8 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 9 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 KATA PENGANTAR Assalamu’alaikum warohmatullohi wabarokatuh Alhamdulillah puji syukur kehadirat Allah SWT dan Nabi Muhammad SAW, yang telah melimpahkan rahmat dan hidayah-Nya serta pencerahan yang dibawakan oleh Rasullullah SAW sehingga penulis mampu menyelesaika skripsi ini yang berjudul. Skripsi ini disusun untuk memenuhi persyaratan untuk mencapai derajat Sarjana Farmasi di Fakultas Farmasi Univeristas Muhammdiyah Purwokerto. Penulis menyadari bahwa selesainya skripsi ini tidak terlepas dari bantuan berbagai pihak. Oleh karena itu penulis ingin mengucapkan terimakasih kepada : 1. Dr. H. Syamsuhadi Irsyad, S.H., M.H selaku Rektor Universitas Muhammadiyah Purwokerto yang telah memimpin dengan arif dan bijaksana serta memberikan fasilitas belajar mengajar di Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto sehingga penulis dapat menyelesaikan studi ini 2. Dr. Agus Siswanto, M.Si., Apt.selaku Dekan Fakutas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto yang telah memimpin keseluruhan proses mengajar di tempat penulis menuntut ilmu, dengan segala kedisiplinan, kemudahan dan perhatian sehingga memberikan semngat dan kemudhan penulis dalam menyelesaikan studi 3. Nunuk Aries Nurulita, M.Si.,Apt selaku pembimbing I dan Elza Sundhani, M.Sc.,Apt selaku pembimbing II yang telah memberikan inspirasi kepada penulis dan berkenan membimbing serta mengarahkan penulis dalam menyelesaikan skripsi ini 4. Githa Fungie Galistiani, M.Sc., Apt. Dan Retno Wahyuningrum, M.Sc., Apt selaku penguji yang telah mengarahkan penulis demi kesempurnaan skripsi ini 5. Bapak dan Ibu tercinta yang selalu memberikan do’a dan semangat serta dukungan moral maupun material 6. Semua pihak yang telah membantu penyelesaian skripsi ini, semoga Allah SWT memberikan imbalan yang sesuai. Aamiin 7. Untuk Laboratorium Terpadu Mikrobiologi yang telah memberikan ijin untuk penelitian sehingga dapat terselesaikan penyusunan skripsi ini 10 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 Penulis menyadari bahwa skripsi ini masih jauh sempurna karena faktor keterbatasan yang ada dalam diri penulis, oleh sebab itu penulis mengharapkan kritik dan saran yang membangun dan semoga skripsi ini dapat bermanfaat bagi yang membacanya. Purwokerto, Agustus 2017 Mohammad Zulfikar Rashif 11 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 12 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 `DAFTAR ISI Halaman .................................................................................................................................. i Hal Persetujuan ....................................................................................................................... ii Hal Pengesahan ....................................................................................................................... iii Pernyataan ............................................................................................................................... iv Abstrak .................................................................................................................................... v Abstract ................................................................................................................................... vi Hal Persembahan .................................................................................................................... vii Motto ....................................................................................................................................... viii Kata Pengantar ........................................................................................................................ ix Riwayat Hidup ........................................................................................................................ x DAFTAR ISI ........................................................................................................................... xi DAFTAR TABEL ................................................................................................................... xiii DAFTAR GAMBAR .............................................................................................................. xiv DAFTAR LAMPIRAN ........................................................................................................... xv BAB I. PENDAHULUAN ...................................................................................................... 1 A. Latar Belakang ...................................................................................................... 1 B. Perumusan Masalah .............................................................................................. 3 C. Tujuan Penelitian .................................................................................................. 3 D. Manfaat Penelitian ................................................................................................. 3 BAB II. TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................................... 4 A. Sanitasi Lingkungan .............................................................................................. 4 B. Infeksi Nosokomial ............................................................................................... 4 1. Cara Pengendalian Infeksi Nosokomial .......................................................... 5 2. Pembagian Infeksi Nosokomial ...................................................................... 6 a. Infeksi Saluran kemih ............................................................................... 6 b. Infeksi Luka operasi .................................................................................. 6 13 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 3. Bakteri yan dapat menyebabkan infeksi nosocomial dengan beberapa cara: . 6 a. Flora tetap atau sementara pada pasien (endogen) ................................... 7 b. Flora dari pasien atau petugas rumah sakit (exogen) ................................ 7 4. Pengelolaan lingkungan dan ruangan rumah sakit dalam upaya pencegahan infeksi nosokomial .......................................................................................... 8 C. Bakteri ................................................................................................................... 9 1. Ukuran Bakteri ................................................................................................ 10 2. Bentuk Bakteri ................................................................................................ 10 D. Isolasi Bakteri ....................................................................................................... 11 E. Identifikasi Bakteri ................................................................................................ 11 F. Pewarnaan Bakteri ................................................................................................ 12 BAB III METODE PENELITIAN ......................................................................................... 16 A. Rancangan Penelitian ...................................................................................... 16 B. Batasan Variabel Operasional ......................................................................... 16 C. Jalannya Penelitian .......................................................................................... 16 D. Bahan dan Alat yang digunakan ..................................................................... 16 BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN ................................................................................ 22 BAB V KESIMPULAN DAN SARAN ................................................................................. 33 A. Kesimpulan ............................................................................................... 33 B. Saran ......................................................................................................... 33 DAFTAR PUSTAKA ............................................................................... 34 LAMPIRAN .............................................................................................. 36 14 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 DAFTAR TABEL Tabel 1. Hasil Uji Katalase berdasarkan sampel ...................................................... 25 Tabel 2. Hasil Uji Oksidase berdasarkan sampel ..................................................... 27 Tabel 3. Hasil Uji Fermentasi Karbohidrat ............................................................... 28 Tabel 4. Hasil Pewarnaan Gram ................................................................................ 29 Tabel 4. Hasil Identifikasi Bakteri ............................................................................ 30 15 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 DAFTAR GAMBAR Gambar 1. Hasil Isolasi Bakteri ..................................................................................... 23 Gambar 2. Hasil Uji Katalase ........................................................................................ 24 Gambar 3. Hasil Uji Oksidase ....................................................................................... 26 Gambar 4. Hasil Uji Fermentasi Karbohidrat ................................................................ 28 Gambar 5. Hasil Pewarnaan Gram ................................................................................ 29 16 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017 DAFTAR LAMPIRAN Lampiran 1. Hasil Isolasi Bakteri ............................................................................. 36 Lampiran 2. Hasil Uji Fermentasi Karbohidrat ........................................................ 37 Lampiran 3. Hasil Uji Katalase ................................................................................. 39 Lampiran 4. Hasil Uji Oksidase ................................................................................ 39 Lampiran 5. Hasil Pewarnaan Gram ......................................................................... 40 17 Isolasi Dan Identifikasi…, Mohammad Zulfikar Rashif, Fakultas Farmasi UMP, 2017
