Isolasi Dan Identifikasi Bakteri di Lingkungan Laboratorium

advertisement
Original Article
Volume 1 Nomor 4:1-8
Agustus-November 2016
Jurnal Ilmiah
Mahasiswa
Kedokteran
Komunitas
Isolasi Dan Identifikasi Bakteri di Lingkungan Laboratorium
Mikrobiologi Klinik RSUDZA Banda Aceh
Isolation and Identification of Bacteria At Clinical Microbiology Laboratory
of Zainoel Abidin General Hospital Banda Aceh
1Amiril
Arifin, 2Zinatul Hayati, 3Kurnia Fitri Jamil
1Program
Studi Pendidikan Dokter - Fakultas Kedokteran Universitas Syiah Kuala
Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Universitas Syiah Kuala Banda Aceh
3Bagian/SMF Penyakit Dalam Fakultas Kedokteran Universitas Syiah Kuala - RSUDZA
2Bagian
ABSTRACT
One of the roles of Clinical Microbiology Laboratory is a supporting-investigation data provider about
bacterial patogens that may cause infection disease to the patients. Hence, it’s accuracy is
considered necessary. Living Bacteria in the Clinical Microbiology Laboratory environment is one
source of the contaminants to clinical sample, therefore misidentification can occur. Research
objectives
were to isolate and identificate bacteria in the Clinical Microbiology Laboratory
environment, RSUDZA Banda Aceh, and to determine its source. The research type was laboratory
observations. The research samples were surfaces such as tables, wall, floor, Biosafety Cabinet
(BSC), incubator, handle of door and refrigerator, computer keyboard, laboratory staffs’ nasal
mucosa and unwashed palm. Thirty four isolates were obtained from 25 samples. The identification
result showed Gram positive rods bacteria, Pantoea spp, Acinetobacter baumannii, Staphylococcus
warneri, Staphylococcus haemolyticus, Staph. hominis spp hominis, Staphylococcus aureus,
Staphylococcus epidermidis, Leuconostoc pseudomesenteroides, Citrobacter koseri, Burkholderia
cepacia, Sphingomonas paucimobilis, Lactococcus garvieae, and Staphylococcus gallinarum.
Keywords: bacterial contaminants, environtment of laboratory.
ABSTRAK
Salah satu peran laboratorium mikrobiologi klinik adalah sebagai penyedia data pemeriksaan
penunjang mengenai bakteri patogen penyebab penyakit infeksi pada pasien. Oleh karena itu,
keakuratan hasil identifikasi dinilai perlu. Bakteri yang hidup di lingkungan laboratorium mikrobiologi
klinik adalah salah satu sumber kontaminan terhadap sampel klinik, sehingga dapat terjadi hasil
yang salah pada identifikasi bakteri. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan isolasi dan identifikasi
bakteri di lingkungan Laboratorium Mikrobiologi Klinik Rumah Sakit dr. Zainoel Abidin Banda Aceh
(RSUDZA) Banda Aceh dan menentukan sumber bakteri tersebut. Jenis penelitian ini adalah
observasional laboratorium. Sampel penelitian ini adalah permukaan benda yang ada di laboratorium
seperti permukaaan meja, dinding, lantai, Biosafety Cabinet (BSC), inkubator, gagang pintu masuk
dan pintu kulkas, keyboard komputer, mukosa hidung dan telapak tangan petugas laboratorium yang
belum dicuci. Hasil isolasi bakteri dari 25 sampel diperoleh 34 isolat bakteri. Hasil identifikasi bakteri
bakteri diperoleh bakteri Gram Positif Batang (GPB), Pantoea spp, Acinetobacter baumannii,
Staphylococcus warneri, Staphylococcus haemolyticus, Staph. hominis spp hominis, Staphylococcus
aureus, Staphylococcus epidermidis, Leuconostoc pseudomesenteroides, Citrobacter koseri,
Burkholderia cepacia, Sphingomonas paucimobilis, Lactococcus garvieae, dan Staphylococcus
gallinarum.
Kata kunci: bakteri kontaminan, lingkungan laboratorium.
.
1
Original Article
Volume 1 Nomor 4:1-8
Agustus-November 2016
Jurnal Ilmiah
Mahasiswa
Kedokteran
Komunitas
PENDAHULUAN
Sampel klinik adalah bahan yang berasal dan/atau diambil dari tubuh manusia untuk tujuan
diagnostik, penelitian, pengembangan, pendidikan, dan/atau analisis lainnya, termasuk newemerging dan re-emerging, dan penyakit infeksi berpotensi pandemik.1 Bahan biologis yang
termasuk dalam sampel klinik antara lain feses, darah, sputum, swab tenggorokan, urin, sekret, pus,
aspirat, eksudat, efusi, kerokan kulit dan hidung, dan cairan serebrospinal.2
Di tempat pelayanan kesehatan, sampel klinik akan mengalami berbagai perlakuan mulai dari
pengambilan, penyimpanan, pengiriman, dan tahap terakhir adalah pengelolaan sampel. 3 Sampel
berasal dari berbagai pasien, baik pasien rawat inap ataupun pasien rawat jalan. Pengambilan
sampel klinik dilakukan oleh analis kesehatan.4 Setiap sampel diambil dengan teknik, alat, waktu,
dan media penyimpanan yang berbeda-beda.5 Setelah diambil dan disimpan dalam media
penyimpanan yang sesuai, sampel dikirim ke laboratorium sesegera mungkin untuk menghindari
kerusakan.6 Pengelolaan sampel juga dilakukan oleh analis kesehatan di laboratorium klinik.4
Laboratorium klinik terdiri dari laboratorium mikrobiologi klinik, parasitologi klinik, imunologi klinik,
patologi klinik, dan patologi anatomik. Laboratorium mikrobiologi klinik menangani sampel untuk
identifikasi mikrobiologi (bakteri, virus, dan jamur) penyebab penyakit dan uji kepekaan antibiotik. 7
Dalam penelitian ini, peneliti mengkhususkan pembahasan pada kultur bakteri saja.
Semua perlakuan-perlakuan, mulai dari pengambilan sampai pengelolaan sampel klinik, harus sesuai
dengan prosedur yang berlaku di laboratorium RSUDZA. Jika perlakuan-perlakuan tersebut tidak
sesuai prosedur, dapat terjadi hasil positif palsu,8 negatif palsu, sampel tidak layak uji,6 atau
mikrobiota patogen dapat menular ke orang lain.9 Keadaan tersebut dapat menimbulkan kerugian
bagi rumah sakit, petugas kesehatan, pasien, atau orang lain di lingkungan rumah sakit.
Salah satu masalah yang ditimbulkan dari perlakuan yang tidak sesuai prosedur adalah
terkontaminasimya sampel klinik oleh bakteri lain yang bukan merupakan bakteri penyebab penyakit
pada pasien. Bakteri kontaminan bisa mengontaminasi sampel pada saat pengambilan sampel.
Sebagai contoh, pada saat pengambilan sampel urin, pot urin sedikit mengenai alat genital sehingga
flora normal di epitel genital mengontaminasi sampel.10
Bakteri kontaminan juga bisa
mengontaminasi sampel pada saat pengelolaan sampel di laboratorium. Kesalahan bisa berasal dari
personel laboratorium atau lingkungan laboratorium yang tidak memenuhi standar biosafety. Hal ini
menyebabkan hasil positif palsu pada identifikasi bakteri. Sebagai contoh, pada sampel darah yang
akan dikultur, angka kejadian positif palsu masih cukup tinggi yaitu sekitar 0,6% sampai dengan
12,5%. Padahal batasan kejadian positif palsu yang diperbolehkan oleh American Society for
Microbiology (ASM) dan the Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) tidak boleh melebihi 3%.11
Hal tersebut menyebabkan penegakan diagnosis dan pemberian antibiotik yang tidak tepat sehingga
menimbulkan kerugian bagi pasien.11,12
Penelitian identifikasi pola bakteri yang berpotensi sebagai penyebab infeksi nosokomial pernah
dilakukan di Ruang Rawat Bedah dan Ruang Operasi RSUDZA Banda Aceh. Penelitian tersebut
mengambil sampel dengan melakukan swab terhadap mukosa hidung dan tangan, peralatan
kesehatan, dan udara. Hasil yang didapatkan adalah Staphilococcus aureus, Pseudomonas
aeruginosa, Eschericia coli, dan Acinetobacter.13,14 Penelitian sejenis yang dilakukan di Ruang
Pediatric Intensive Care Unit (PICU), Ruang Intermediet Care (IMC), Ruang Neonatal Intensive Care
Unit (NICU), dan Ruang Operasi Rumah Sakit Umum Pusat (RSUP) Prof. Dr. R. D. Kandou Manado
ditemukan pola bakteri yang lebih banyak. Sampel diambil dengan melakukan swab pada permukaan
meja, lantai, tempat tidur, udara, peralatan medis, dan dinding. Hasil yang didapatkan adalah
Enterobacter sp, Bacillus subtillis, Staphylococcus sp, Lactobacillus sp, Klebsiella Pneumonia, Serratia
liquefaciens, Candida sp., Pseudomonas sp., Streptococcus sp. dan Salmonela. 15,16,17,18
Pada penelitian ini, peneliti fokus pada faktor lingkungan laboratorium yang berpotensi
mengontaminasi sampel klinik. Penelitian sebelumnya yang dilakukan di Kolkata, India, didapatkan
bahwa bakteri kontaminan umum di laboratorium adalah Micrococus (52,94%), Bacillus subtilis
(23,52%), Diphteroids (11,3%), Staphilococcus epidermidis (8,8%), dan Staphilococcus aureus
(3,44%).19
2
Original Article
Volume 1 Nomor 4:1-8
Agustus-November 2016
Jurnal Ilmiah
Mahasiswa
Kedokteran
Komunitas
METODE PENELITIAN
Jenis penelitian yang digunakan pada penelitian ini adalah penelitian deskriptif dengan pendekatan
observasional laboratorium untuk mengisolasi dan mengidentifikasi bakteri di lingkungan
Laboratorium Mikrobiologi Klinik RSUDZA Banda Aceh.
Isolasi dan identifikasi bakteri dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi Klinik RSUDZA Banda Aceh.
Penelitian ini dilakukan mulai dari tanggal 2 sampai tanggal 27 Februari 2016.
Subjek penelitian adalah bakteri dari swab permukaan dalam Biosafety Cabinet (BSC), lantai BSC,
telapak tangan yang belum dicuci dan mukosa hidung petugas laboratorium Mikrobiologi Klinik
RSUDZA Banda Aceh, permukaan meja register, meja pemeriksaan mikroskopik, meja sampel, meja
pewarnaan Gram, lantai meja, keran pewarnaan Gram, keran cuci tangan, inkubator besar, inkubator
kecil, keyboard komputer Vitek, keyboard komputer API, gagang pintu laboratorium, gagang pintu
kulkas biakan dan kulkas reagen, dan dinding sisi kiri ruangan laboratorium. Swab dilakukan dengan
menggunakan cotton swab. Petugas laboratorium yang menjadi responden terlebih dahulu diberikan
lembar permohonan menjadi responden dan menandatangani lembar persetujuan menjadi
responden.
Pembuatan medium terdiri dari pembuatan medium Blood Heart Infussion (BHI), Blood Agar (BA),
dan MacConkey Agar (MCA). Medium BHI dibuat dengan cara melarutkan sebanyak 37 gram serbuk
BHI dalam 1 liter aquades murni secara perlahan-lahan. Campuran tersebut dipanaskan hingga larut
kemudian disterilkan dengan menggunakan autoklaf pada suhu 121 oC selama 15 menit kemudian
campuran dibiarkan hingga temperatur turun hingga 45 oC. Tahap terakhir adalah campuran
dituangkan ke dalam tabung Broth sesuai dengan kebutuhan pemeriksaan. Medium BA dibuat
dengan cara melarutkan sebanyak 21 gram serbuk BA dalam 500 ml aquades murni secara perlahanlahan. Campuran tersebut dipanaskan hingga larut kemudian disterilkan dengan menggunakan
autoklaf pada suhu 121oC selama 15 menit kemudian campuran dibiarkan hingga temperatur turun
hingga 45oC. Darah 5% ditambahkan secara aseptik sambil diaduk dan dicegah terjadinya
gelembung udara. Tahap terakhir adalah campuran dituangkan ke dalam cawan Petri sesuai dengan
kebutuhan pemeriksaan. Selanjutnya campuran dikontrol dengan cara diinkubasi pada suhu 37 oC
selama 24 jam. Medium MCA dibuat dengan cara melarutkan sebanyak 18,8 gram serbuk MCA ke
dalam Erlemeyer dan ditambahkan 400 ml aquades. Campuran tersebut dipanaskan hingga larut
kemudian disterilkan dengan menggunakan autoklaf pada suhu 121 oC selama 15 menit. Campuran
dibiarkan mendingin kira-kira hingga suhu 45oC kemudian dituangkan ke dalam cawan Petri yang
steril. Selanjutnya campuran dikontrol dengan cara diinkubasi pada suhu 37oC selama 24 jam.
Subjek penelitian di-swab dengan menggunakan cotton swab yang telah dibasahi aquades steril
kemudian cotton swab tersebut ditanam pada medium BHI. Sampel dimasukkan ke dalam inkubator
selama 18-24 jam. Setelah 18-24 jam, sampel diisolasi dengan teknik apusan/goresan tanpa
merusak permukaan medium kemudian dimasukkan lagi ke dalam inkubator selama 18-24 jam.
Setelah 18-24 jam, cawan Petri yang mengandung pertumbuhan bakteri campuran (lebih dari satu
spesies bakteri) dipisahkan melalui kultur sekunder untuk mendapatan kultur murni.
Identifikasi spesies dilakukan dengan menggunakan mesin Vitek 2.
HASIL PENELITIAN
Sebanyak 25 sampel yang telah diisolasi dan diinkubasi, seluruhnya ditemukan pertumbuhan bakteri.
Pada penelitian ini, pengambilan sampel penelitian melalui teknik swab dilakukan sebelum kegiatan
dekontaminasi. Oleh sebab itu, ada kemungkinan jika pengambilan sampel dilakukan setelah
kegiatan dekontaminasi maka akan didapatkan jumlah pertumbuhan bakteri yang berbeda.
Pertumbuhan bakteri ada yang spesies tunggal dan ada yang campuran. Identifikasi bakteri
dilakukan sampai tahap spesies kecuali bakteri Gram Positif Batang (GPB) dan Pantoea spp karena
keterbatasan alat, sehingga hasil dituliskan sebagaimana adanya.
3
Original Article
Volume 1 Nomor 4:1-8
Agustus-November 2016
Jurnal Ilmiah
Mahasiswa
Kedokteran
Komunitas
Hasil kultur ditampilkan pada Tabel di bawah ini.
No
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
Tabel Hasil Kultur Bakteri Berdasarkan Sumber Isolat
Sumber Isolat
Bakteri
BSC
Staphylococcus hominis spp hominis
Lantai BSC
Bakteri GPB - Burkholderia cepacia
Mukosa hidung responden 1
Bakteri GPB
Mukosa hidung responden 2
Staphylococcus epidermidis
Mukosa hidung responden 3
Leuconostoc pseudomesenteroides
Mukosa hidung responden 4
Citrobacter koseri
Mukosa hidung responden 5
Bakteri GPB
Telapak tangan responden 1
Bakteri GPB - Staphylococcus aureus
Telapak tangan responden 2
Bakteri GPB - Pantoea spp
Telapak tangan responden 3
Staphylococcus warneri, Sphingomonas
paucimobilis
Meja register
Pantoea spp
Meja pemeriksaan
Staphylococcus haemolyticus
mikroskopik
Meja sampel
Acinetobacter baumannii
Meja pewarnaan Gram
Acinetobacter baumannii
Lantai meja
Bakteri GPB
Lactococcus garvieae
Pantoea spp
Keran pewarnaan Gram
Bakteri GPB
Keran cuci tangan
Staphylococcus warneri
Staphylococcus gallinarum
Inkubator besar
Bakteri GPB
Inkubator kecil
Bakteri GPB
Keyboard komputer Vitek
Bakteri GPB
Pantoea spp
Keyboard komputer API
Bakteri GPB
Gagang pintu
Staphylococcus haemolyticus
Staphylococcus hominis spp hominis
Gagang pintu kulkas biakan
Bakteri GPB
Gagang pintu kulkas reagen
Bakteri GPB
Dinding sisi kiri laboratorium
Bakteri GPB
Peneliti tidak bisa memutuskan secara pasti dari mana bakteri tersebut berasal. Namun, berdasarkan
asumsi yang didukung oleh studi pustaka, bakteri yang ditemukan di lingkungan laboratorium ada
yang berasal dari sampel klinik pasien, flora normal pada kulit dan membran mukosa hidung, debu,
air, atau bakteri umum penyebab infeksi nosokomial. Bakteri patogen seperti Acinetobacter
baumannii21 dan Staphylococcus haemolyticus22 umumnya didapat dari sampel klinik pasien.
Staphylococcus aureus bisa didapat dari sampel klinik23 dan sebagai flora normal pada kulit.24
Namun, karena pada penelitian ini Staphylococcus aureus didapat dari swab telapak tangan, maka
kemungkinan besar bakteri ini berperan sebagai flora normal. Bakteri flora normal lain yang
ditemukan adalah Staphylococcus epidermidis,20 Staphylococcus warneri,25 dan Citrobacter koseri.26
Staphylococcus hominis spp hominis adalah flora normal, tetapi ditemukan pada BSC. Bakteri ini
kemungkinan didapat dari sampel klinik karena bakteri ini dapat menyebabkan penyakit pada pasien
dengan penurunan sistem imun.27 Staphylococcus gallinarum adalah flora normal pada kulit unggas.
Kemungkinan bakteri ini berasal dari sampel klinik karena ada laporan kasus endoftalmitis traumatik
yang disebabkan oleh Staphylococcus gallinarum.28 Bakteri yang terdapat pada debu adalah bakteri
GPB.. Burkholderia cepacia29 dan Lactococcus garvieae30 umumnya ditemukan di air dan lingkungan
yang lembab, tetapi pada penelitian ini keduanya ditemukan pada lantai. Tumpahan air keran atau
alas kaki yang basah kemungkinan berperan dalam penyebaran bakteri ini sehingga ditemukan pada
4
Original Article
Volume 1 Nomor 4:1-8
Agustus-November 2016
Jurnal Ilmiah
Mahasiswa
Kedokteran
Komunitas
lantai. Selain bakteri patogen yang telah disebut di atas, bakteri lain penyebab infeksi nosokomial
yang ditemukan adalah Sphingomonas paucimobili31 dan Pantoea spp.32
Petugas laboratorium selalu memakai sarung tangan saat menangani sampel klinik. Namun, di selasela kegiatan tersebut tidak bisa dijamin bahwa mereka tidak menyentuh permukaan benda lain
(seperti meja, gagang pintu, keyboard komputer, dan lain-lain) dengan sarung tangan yang sudah
terkontaminasi oleh sampel klinik tersebut. Bahkan saat sedang tidak menangani sampel klinik dan
tidak sedang memakai sarung tangan, transmisi bakteri melalui sentuhan tangan pada permukaan
benda-benda di lingkungan laboratorium turut berperan penting sebagai media transmisi bakteri dari
satu tempat ke tempat lain.
Menurut WHO, perpindahan bakteri yang diperantai oleh telapak tangan terjadi melalui 5 proses,
yaitu (i) Mikroorganisme harus ada pada permukaan benda. (ii) Melalui kontak langsung,
mikroorganisme berpindah dari permukaan benda ke telapak tangan. (iii) Mikroorganisme tersebut
mampu bertahan hidup pada telapak tangan. (iv) Mencuci tangan yang kurang adekuat masih
menyisakan mikroorganisme. (v) Kontaminasi silang dari tangan ke tangan atau benda lain melalui
sentuhan langsung.33 Hal ini dapat menjelaskan mengapa bakteri ditemukan pada berbagai
permukaan benda di lingkungan Laboratorium Mikrobiologi Klinik RSUDZA.
Penelitian yang dilakukan oleh Jayashree Konar dan Sanjeev Das di India menemukan bahwa di
permukaan meja ditemukan Mirococcus dan Bacillus Subtilis. Bacillus subtilis adalah salah satu
bakteri Gram Positif Batang (GPB). Selain itu, di telapak tangan petugas laboratorium ditemukan
Micrococcus, Diphterhoids, Staphylococcus epidermidis, dan
Staphylococcus aureus.19 Pada
penelitian ini, di permukaan meja ditemukan Pantoea spp, Staphylococcus haemolyticus, dan
Acinetobacter baumannii. Di telapak tangan petugas laboratorium ditemukan bakteri GPB,
Staphylococcus aureus, Pantoea spp, Staphylococcus warneri, dan Sphingomonas paucimobilis.
Data penelitian tentang bakteri yang ditemukan di lingkungan laboratorium klinik sangat terbatas.
Oleh sebab itu, peneliti mencoba membandingkan data hasil temuan penelitian ini dengan ruangan
lain di lingkungan rumah sakit.
Penelitian yang dilakukan di RSUD dr. Zainoel Abidin Banda Aceh menunjukkan hasil yang bervariasi.
Di ruang rawat bedah, Staphylococcus sp ditemukan pada telapak tangan atau mukosa hidung
petugas kesehatan.13 Di ruang operasi, Acinetobacter sp ditemukan pada telapak tangan atau
mukosa hidung petugas kesehatan.14 Peneliti tersebut tidak memisahkan bakteri hasil temuan yang
di dapat dari telapak tangan dan mukosa hidung, sehingga tidak bisa diputuskan dari mana asal
bakteri tersebut. Pada penelitian ini, di mukosa hidung petugas laboratorium ditemukan bakteri GPB,
Staphylococcus epidermidis, Leuconostoc pseudomesenteroides, dan Citrobacter koseri.
Penelitian yang dilakukan di RSUP Prof. Dr. R.D. Kandou Manado pada beberapa ruangan juga
menunjukkan hasil yang bervariasi. Di ruang Rawat Inap Mata, Bacillus subtilis ditemukan di
permukaan dinding dan Lactobacillus sp ditemukan di lantai.34 Di ruang NICU, pada lantai dan
dinding ditemukan Serratia Liquefaciens, Lactobacillus, Bacillus subtilis, Klebsiella pneumonia, dan
Enterobacter agglomerans. Pada gagang pintu dan permukaan meja, ditemukan Bacillus subtilis dan
Klebsiella pneumonia.16 Di ruang PICU, pada lantai dan dinding ditemukan Enterobacter
agglomerans, Serratia rubidaea, Enterobacter aerogenes, dan Streptococcus sp. Pada permukaan
meja ditemukan Bacillus subtilis, Candida sp, Enterobacter agglomerans, Enterobacter aerogenes,
dan Enterobacter cloacae.17 Di ruang IMC, pada lantai dan dinding ditemukan Staphylococcus sp,
Bacillus subtilis, Enterobacter agglomerans, dan Enterobacter aerogenes.18 Di ruang operasi, pada
permukaan dinding ditemukan Bacillus subtilis, Staphylococcus sp, Enterobacter cloacae. Pada lantai
ditemukan Citrobacter difersus, Enterobacter aerogenes, Bacillus subtilis, Enterobacter agglomerans,
dan Serratia marcescens.15 Pada penelitian ini, pada lantai ditemukan bakteri GPB, Burkholderia
cepacia, Lactococcus garvieae, dan Pantoea spp. Pada permukaan dinding dan gagang pintu masuk
laboratorium ditemukan bakteri GPB.
5
Original Article
Volume 1 Nomor 4:1-8
Agustus-November 2016
Jurnal Ilmiah
Mahasiswa
Kedokteran
Komunitas
Upaya desinfeksi dilakukan setiap hari. Permukaan meja dan BSC didesinfeksi dengan zat
desinfektan berbahan dasar alkohol setiap selesai menangani sampel klinik. Selain itu, zat
desinfektan tersebut juga digunakan untuk mendesinfeksi gagang pintu masuk dan kulkas minimal
satu kali sehari. Lantai didesinfeksi menggunakan produk pembersih lantai anti bakterial dengan
bahan aktif 1% benzalkorium klorida pada saat pagi dan sore hari. Ada kewajiban mencuci tangan
bagi petugas laboratorium setelah menangani sampel klinik walaupun mereka memakai sarung
tangan saat bekerja. Sabun antiseptik dan air digunakan untuk mencuci tangan.
Menurut Rutala dan Weber, zat disinfektan hanya dapat membunuh bakteri vegetatif, tapi tidak
membunuh sporanya. Contoh zat disinfektan adalah alkohol 90% (etanol dan isopropanol) dan
hipoklorit 5,25%–6,15% (sodium hipoklorit dan kalsium hipoklorit). Upaya sterilisasi diperlukan
untuk membunuh spora tersebut, tetapi zat sterilan cenderung meninggalkan residu dan bersifat
toksik untuk manusia bahkan beberapa zat bersifat karsinogenik. Berbeda dengan alkohol, hipoklorit
bersifat korosif, sehingga tidak cocok diaplikasikan pada permukaan benda yang terbuat dari logam
seperti BSC, keran air, gagang pintu, dan inkubator. Kelebihan lain dari alkohol adalah waktu
paparan (exposure time) untuk membunuh bakteri kurang dari 15 detik, sedangkan hipoklorit dan
zat sterilan membutuhkan waktu kontak bervariasi mulai dari beberapa menit sampai beberapa
jam.35 Oleh karena itu, zat disinfektan berbahan dasar alkohol menjadi pilihan untuk mendisinfeksi
laboratorium klinik dengan jam kerja 9 jam sehari.
Karena dibersihkan setiap hari, maka bakteri vegetatif akan mati atau minimal jumlah koloninya
berkurang. Selain itu, kandungan nutrien pada tempat tersebut yang mungkin terbawa saat terjadi
sentuhan oleh sarung tangan infeksius petugas laboratorium juga akan berkurang. Saat terjadi
kekurangan makanan, bakteri GPB yang hidup pada debu, seperti Bacillus dan Clostridium, memiliki
kemampuan membentuk endospora untuk bertahan hidup dalam keadaan dorman sampai nutrien
terdapat pada lingkungan .36,37
Proses perubahan bentuk bakteri dari fase vegetatif ke fase endospora disebut sporulasi. Sporulasi
terdiri dari tahap 0 (nol) sampai tahap VII. Tahap 0 adalah menentuan kutub tempat calon
endospora yang akan dibentuk. Tahap I adalah membagi DNA untuk endospora dan sel induk,
kemudian dilanjutkan dengan tahap II yaitu pembentukan kantung yang membungkus masingmasing DNA pada endospora dan sel induk. Pada tahap III, sitoplasma sel induk menyelubungi
endospora sehingga endospora terperangkap di dalam sel induk. Tahap IV adalah hancurnya DNA sel
induk dan terbentuknya korteks yang menyelubungi endospora. Korteks yang terbuat dari
peptidoglikan ini berfungsi melindungi DNA endospora dari kerusakan akibat paparan suhu tinggi.
Tahap V adalah pembentukan pembungkus (coat) yang menyelubungi korteks. Korteks dan
pembungkus tersebut berfungsi sebagai barrier yang melindungi endospora dari zat desinfektan.
Pada tahap VI, disebut juga pematangan spora, terjadi sintesis asam dipokolinat di sitoplasma sel
induk dan diabsorbsi ke dalam endospora. Asam dipokolinat akan berikatan dengan ion kalsium dan
mengikat molekul air, Hal ini menyebabkan dehidrasi endospora sehingga resistensi terhadap panas
meningkat. Tahap VII adalah pengeluaran endospora dari sel induk (kini disebut sporangium. Tidak
ada aktifitas metabolik yang terjadi pada endospora selama keadaan dorman. Jika keadaan
lingkungan sudah memungkinkan, yaitu tersedia nutrisi, maka fase endospora akan berubah kembali
menjadi fase vegetatif. Proses ini dinamakan germinasi.38
Pada penelitian ini, bakteri GPB banyak ditemukan pada berbagai tempat. Ada kemungkinan
beberapa bakteri tersebut ikut terbawa oleh cotton swab saat swab dilakukan pada permukaan
benda-benda yang menjadi subjek penelitian. Pada saat cotton swab ditanam dalam BHI yang kaya
nutrien, proses germinasi berlangsung sehingga terjadi multiplikasi bakteri GPB dalam bentuk
vegetatif dan akhirnya teridentifikasi pada penelitian ini.
KESIMPULAN
Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa hasil isolasi dan identifikasi 25 sampel seluruh sampel
dijumpai pertumbuhan bakteri. Bakteri yang ditemukan adalah bakteri GPB,
Pantoea spp,
Acinetobacter baumannii, Staphylococcus warneri, Staphylococcus haemolyticus, Staph. hominis spp
hominis, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Leuconostoc pseudomesenteroides,
6
Original Article
Volume 1 Nomor 4:1-8
Agustus-November 2016
Jurnal Ilmiah
Mahasiswa
Kedokteran
Komunitas
Citrobacter koseri, Burkholderia cepacia, Sphingomonas paucimobilis, Lactococcus garvieae, dan
Staphylococcus gallinarum.
Sumber bakteri tersebut berbagai macam tempat yaitu permukaan dalam BSC, lantai BSC, telapak
tangan yang belum dicuci dan mukosa hidung petugas laboratorium Mikrobiologi Klinik RSUDZA
Banda Aceh, permukaan meja register, meja pemeriksaan mikroskopik, meja sampel, meja
pewarnaan Gram, lantai meja, keran pewarnaan Gram, keran cuci tangan, inkubator besar, inkubator
kecil, keyboard komputer Vitek, keyboard komputer API, gagang pintu laboratorium, gagang pintu
kulkas biakan dan kulkas reagen, dan dinding sisi kiri ruangan laboratorium.
SARAN
Berdasarkan kesimpulan di atas, maka peneliti memberi saran bahwa disinfeksi permukaan bendabenda yang dianggap sering disentuh oleh petugas laboratorium/orang lain dan permukaan benda
yang terpapar dengan sampel klinik perlu dilakukan sesering mungkin. Hal ini penting agar jumlah
koloni bakteri kontaminan menurun. Selain itu, kepatuhan petugas laboratorium terhadap Standard
Operational Prosedure (SOP) dalam penanganan sampel klinik, limbah, dan disinfeksi lingkungan
laboratorium sangat diperlukan untuk mencegah terkontaminasinya sampel klinik oleh bakteri lain
dari lingkungan laboratorium.
DAFTAR PUSTAKA
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
Peraturan Menteri Kesehatan Republik Indonesia Nomor 657/MENKES/PER/VIII/2009 Tentang
Pengiriman dan Penggunaan Sampel Klinik, Materi Biologik, dan Muatan Informasinya.
Mahode AA, editor. Pedoman Teknik Dasar untuk Laboratorium Kesehatan, Ed. 2. Chairlan,
Lestari E, translators. Jakarta: EGC; 2011.373 p.
Baron EJ, Miller JM, Weinstein MP, Richter SS, Gilligan PH, Thomson RB Jr, et al. A Guide to
Utilization of the Microbiology Laboratory for Diagnosis of Infectious Diseases: 2013
Recommendations by the Infectious Diseases Society of America (IDSA) and the American
Society for Microbiology (ASM). Clinical Infectious Diseases. 2013; 2.
Keputusan Menteri Kesehatan Republik Indonesia Nomor 370/Menkes/SK/III/2007 tentang
Standar Profesi Ahli Teknologi Laboratorium Kesehatan.
Hawkey P, Lewis D. Medical Bacteriology : A Practical Approach, 2 nd Ed. UK: Oxford University
Press; 2004.409 p.
Pettross B. Specimen Collection and Transportation of Microbiology Specimens. Fremont
Laboratory. 2010:2-3.
Peraturan Menteri Kesehatan Republik Indonesia Nomor 411/MENKES/PER/III/2010 Tentang
Laboratorium klinik.
Hall KK, Lyman JA. Updated Review of Blood Culture Contamination. Clinical Microbiology
Reviews. 2006;19(4):788-802.
World Health Organization. Laboratory biosafety manual, 3rd ed. Geneva: WHO; 2004. 186 p.
Franz M, Horl WH. Common Errors in Diagnosis and Management of Urinary Tract Infection:
Pathophysiology and Diagnostic Techniques. Nephrol Dial Transplant. 1999;14:2746-53.
Snyder SR, Favoretto AM, Baetz RA, Derzon JH, Madison BM, Mass D, et al. Effectiveness of
practices to reduce blood culture contamination: A Laboratory Medicine Best Practices
systematic review and meta-analysis. Clin Biochem. 2012;45(0):999–1011.
Burman WJ, Reves RR. Review of False-Positive Cultures for Mycobacterium tuberculosis and
Recommendations for Avoiding Unnecessary Treatment. Clinical Infectious Diseases.
2000;31:1390–5.
Puspita I. Pola dan Sensitifitas Bakteri yang Berpotensi sebagai Penyebab Infeksi Nosokomial di
Ruang Rawat Bedah RSUDZA Banda Aceh [skripsi]. [Banda Aceh]: Universitas Syiah Kuala;
2011.
Fitriani D. Pola dan Sensitifitas Bakteri yang Berpotensi sebagai Penyebab Infeksi Nosokomial
di Ruang Operasi RSUDZA Banda Aceh [skripsi]. [Banda Aceh]: Universitas Syiah Kuala; 2012.
7
Original Article
Volume 1 Nomor 4:1-8
Agustus-November 2016
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
Jurnal Ilmiah
Mahasiswa
Kedokteran
Komunitas
Sofyan AF, Homenta H, Rares F. Pola Bakteri Aerob yang Berpotensi Menyebabkan Infeksi
Nosokomial di Kamar Operasi Cito Blu RSUP Prof. Dr. R. D. Kandou Manado. J eBm.
2015;3(1):381-5.
Saleh M, Rares F, Soeliongan S. Pola Bakteri Aerob Penyebab Infeksi Nosokomial pada
Ruangan Neonatal Intensive Care Unit (NICU) Blu RSUP Prof. Dr. R. D. Kandou Manado. J eBm.
2015;3(1):236-42.
Baharutan A, Rares F, Soeliongan S. Pola Bakteri Penyebab Infeksi Nosokomial pada Ruang
Perawatan Intensif Anak di Blu RSUP Prof. Dr. R. D. Kandou Manado. J eBm. 2015;3(1):41219.
Sulistya CE, Waworuntu O, Porotu’o J. Pola Bakteri yang Berpotensi Menjadi Sumber Penularan
Infeksi Nosokomial di Iriana C Ruangan Intermediate Care (IMC) Blu RSUP Prof. Dr. R. D.
Kandou Manado. J eBm. 2015;3(1):130-7.
Konar J, Das S. Common Contaminants of Bacteriology Laboratory: Microbiological Paramores.
Int J Pharmaceutical Science Invention. 2013;2(11):36-7.
Fey PD, editor. Staphylococcus Epidermidis: Methods and Protocols. USA: Humana Press;
2013:1.
Peleg AY, Seifert H, Paterson DL. Acinetobacter baumannii: Emergence of a Successful
Pathogen. Clin Microbiol. 2008;21(3):538-82.
Barros EM. Ceotto H, Bastos MCF, Santos KRN, Marval MG. Staphylococcus haemolyticus as an
Important Hospital Pathogen and Carrier of Methicillin Resistance Genes. J Clin Microbiol. 2011:
166-8.
Tong SYC, Davis JS, Eicenberger E, Holland TL, Fowler VG. Staphylococcus aureus Infections:
Epidemiology, Pathophysiology, Clinical Manifestations, and Management. Clin Microbiol.
2015;28(3):603-61.
Grice EA, Segre JA. The skin microbiome. Nat Rev Microbiol. 2011;9(4): 244–53.
Kini GD, Patel K, Parris AR, Tang JS. An Unusual Presentation of Endocarditis Caused by
Staphylococcus warneri. Open Microbiol J. 2010;4:103-5.
Ella AD, Szwebel TA, Loubinoux J, Coignard S, Bouvet A, Jeunne C, et al. Infective Endocarditis
Due to Citrobacter koseri in an Immunocompetent Adult. J Clin Microbiol. 2009;47(12):4185-6.
Olazaran SM, Otera RM, Noriega ER, Diaz JL, Trevino SF, Gonzales GG, et al. Microbiological
and Molecular Characterization of Staphylococcus hominis Isolates from Blood. Plos One.
2013;8(4):6 p.
Tibra NK, Jalali S, Reddy AK, Narayanan R, Agarwal R. Traumatic endophthalmitis caused by
Staphylococcus gallinarum. J Med Microbiol. 2010;59:365-6.
Torbeck L, Raccasi D, Guyfuile DE. Burkholderia cepacia: This Decision Is Overdue. PDA J
Pharm Sci and Tech. 2011;65:535-43.
Sharifiyazdi H, Akhlaghi M, Tabatabaei M, Mostafavi ZSM. Isolation and characterization of
Lactococcus garvieae from diseased rainbow trout (Oncorhynchus mykiss, Walbaum) cultured
in Iran. J Iranian Vet Research. 2010;4(33):342-50.
Ryan MP, Adley CC. Sphingomonas paucimobilis: a persistent Gram-negative nosocomial
infectious organism. J Hosp Inf. 2010;75(3): 153-7.
Bicudo EL, Macedo VO, Carrara MA, Castro FFS, Rage RI. Nosocomial outbreak of Pantoea
agglomerans in a pediatric urgent care center. Braz J Infect Dis. 2007;2(2):3 p.
World Health Organization. WHO Guidelines on Hand Hygiene in Health Care (Advanced Draft) .
Switzerland: WHO Press; 2006:14-7.
Japanto AS, Soeliongan S, Rares FES. Isolasi dan Identifikasi Bakteri Aerob yang Berpotensi
Menyebabkan Infeksi Nosokomial di Ruang Rawat Inap Mata Iriana F Prof. Dr. R. D. Kandou
Manado. J eBm. 2016;4(1):9 p.
Rutala WA, Weber DJ. Guideline for Disinfection and Sterilization in Healthcare Facilities. North
Carolina: Healthcare Infection Control Practices Advisory Committee; 2008:38-58.
Tam NKM, Uyen NQ, Hong HA, Duc LH, Hoa TT, Serra CR, et al. The Intestinal Life Cycle of
Bacillus subtilis and Close Relatives. J Bacteriol. 2006;188(7):2692–2700.
Hallit RR, Afridi M, Sison R, Salem E, Jack B, Slim J. Clostridium tetani bacteraemia. J Med
Microbiol. 2013;62:155-6.
Legget MJ, McDonnell G, Denyer SP, Setlow P, Maillard JY. Bacterial spore structures and their
protective role in biocide resistance. J Applied Microbiol. 2012;113(3):485–98.
8
Download