Contoh tugas biokimia “STRUKTUR DAN FUNGSI PROTEIN” Nama : NIM : RESEPTOR ESTROGEN KODE PROTEIN : 1ERE GAMBAR DESKRIPSI Estrogen receptor Terdiri dari rantai: a, b, c, d, e, f. Fungsi: Estrogen banyak terlibat dalam proses perkembangan, pertumbuhan dan homeostasis dari sejumlah jaringan. Efek fisiologis steroid ini dimediasi oleh faktor transkripsi yaitu reseptor estrogen (ER). Hormon estrogen akan terikat pada domain pengikatan ligan/ligan binding domain (LBD) dari ER dan memulai serangkaian peristiwa molekuler yang berpengaruh pada aktivasi atau represi gen target. PUSTAKA Brzozowski, A.M., Pike, A.C., Dauter, Z., Hubbard, R.E., Bonn, T., Engstrom, O., Ohman, L., Greene, G.L., Gustafsson, J.A., Carlquist, M., 1998, Molecular basis of agonism and antagonism in the oestrogen receptor, (1997) Nature 389: 753-758 Ini ada bantuan cara mencari protein: (lihat lingkaran merah, SEARCH di sini, misal Tubulin). Akan muncul banyak sekali, pilih salah satu. Beberapa material yang termasuk dalam jenis protein adalah: • STRUKTURAL/PENDUKUNG (misal tubulin/misal 1Z28) • PENYIMPANAN, misal albumin • TRANSPORT • HORMONAL (misal insulin) • RESEPTOR (reseptor ada banyak, ingat MK Farmol, masukan reseptor favorit di search, misal Tyrosin kinase/ 1FPU, GPCR, rhodopsin/ 1F88, reseptor estrogen, dll) • KONTRAKTIL • PERTAHANAN MELAWAN ZAT ASING, misal imunoglobulin, MHC/3OX8, dll • ENZIM (ada banyak, terserah mau enzim apa), silahkan klik salah satu mau golongan enzim apa, http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do Lalu klik, enzyme classifaction. Muncul 6 katergori enzim (di sebelah kanan), lalu klik salah salah 1, dan silahkan pilih enzim favorit. Angka dalam kurung menunjukkan jumlah protein/enzim pada kategori tsb.