JENIS-JENIS BAKTERI GRAM NEGATIF POTENSIAL PATOGEN PADA IKAN KERAPU LUMPUR (Epinephelus tauvina) PRASETIA AJITAMA 100302020 PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA 2014 Universitas Sumatera Utara JENIS-JENIS BAKTERI GRAM NEGATIF POTENSIAL PATOGEN PADA IKAN KERAPU LUMPUR (Epinephelus tauvina) SKRIPSI PRASETIA AJITAMA 100302020 PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA 2014 Universitas Sumatera Utara JENIS-JENIS BAKTERI GRAM NEGATIF POTENSIAL PATOGEN PADA IKAN KERAPU LUMPUR (Epinephelus tauvina) SKRIPSI PRASETIA AJITAMA 100302020 Skripsi Sebagai Satu diantara Beberapa Syarat untuk Dapat Memperoleh Gelar Sarjana Perikanan di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan Fakultas Pertanian Universitas Sumatera Utara PROGRAM STUDI MANAJEMEN SUMBERDAYA PERAIRAN FAKULTAS PERTANIAN UNIVERSITAS SUMATERA UTARA 2014 Universitas Sumatera Utara LEMBAR PENGESAHAN Judul Penelitian : Jenis-Jenis Bakteri Gram Negatif Potensial Patogen Pada Ikan Kerapu Lumpur (Epinephelus tauvina) Nama : Prasetia Ajitama NIM : 100302020 Program Studi : Manajemen Sumberdaya Perairan Disetujui Oleh Komisi Pembimbing Prof. Dr. Dwi Suryanto, M.Sc Ketua Dr. Ir. Yunasfi, M.Si Anggota Mengetahui Dr. Ir. Yunasfi, M.Si Ketua Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan Universitas Sumatera Utara PERNYATAAN MENGENAI SKRIPSI DAN SUMBER INFORMASI Saya yang bertandatangan di bawah ini: Nama : Prasetia Ajitama NIM : 100302020 menyatakan bahwa skripsi yang berjudul “Jenis-Jenis Bakteri Gram Negatif Potensial Patogen Pada Ikan Kerapu Lumpur (Epinephelus tauvina)” Adalah benar merupakan hasil karya saya sendiri dan belum diajukan dalam bentuk apapun kepada perguruan tinggi manapun. Semua sumber data dan informasi yang berasal atau dikutip dari karya yang diterbitkan maupun tidak diterbitkan dari penulis lain telah disebutkan dalam teks dan dicantumkan dalam Daftar Pustaka di bagian akhir skripsi ini. Medan, September 2014 Prasetia Ajitama NIM. 100302020 Universitas Sumatera Utara ABSTRAK PRASETIA AJITAMA. Jenis-Jenis Bakteri Potensial Patogen Ikan Kerapu Lumpur (Epinephelus tauvina). Dibimbing oleh DWI SURYANTO dan YUNASFI. Ikan kerapu lumpur (E. tauvina) merupakan ikan yang populer di kalangan masyarakat luas dan menjadi kegemaran banyak orang di Indonesia. Hama serta penyakit yang ada pada budidaya ikan kerapu lumpur menjadi salah satu faktor yang cukup menentukan akan keberhasilan budidaya ikan kerapu lumpur. Ikan kerapu lumpur sakit diperoleh dari Keramba Jaring Apung (KJA) yang berlokasi di perairan Belawan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui bakteri penyebab penyakit yang menginfeksi ikan kerapu lumpur dan bakteri patogen di air KJA. Penelitian ini dilaksanakan selama empat bulan yaitu bulan Mei sampai dengan Agustus 2014 di Laboratorium SKIPM Kelas I Medan II. Isolasi dan karakterisasi bakteri patogen pada ikan kerapu lumpur dan air KJA menggunakan seri pengenceran dan metode cawan gores. Berdasarkan pengamatan menunjukkan bahwa ikan kerapu lumpur memiliki 3 spesies yang berpotensi sebagai bakteri patogen pada ikan dan air sebanyak 41 isolat, yaitu Aeromonas salmonicida, Edwardsiella ictaluri, dan Vibrio harveyi. Kata Kunci: Epinephelus tauvina, Keramba Jaring Apung, Bakteri patogen Universitas Sumatera Utara ABSTRACT PRASETIA AJITAMA. Kinds of Bacterial Pathogens to Mud Grouper (Epinephelus tauvina). Supervised by DWI SURYANTO and YUNASFI. Mud Grouper (E. tauvina) is a popular fish among Indonesian people, which becomes a favorite dish for Indonesian people. Weevil and disease that derive from the aquaculture of the mud grouper becomes one of the most determining factors of the success of the aquaculture of the Mud Grouper. The sick mud grouper were taken from Floating Net Cages or Keramba Jaring Apung (KJA) that is located in Belawan waters. The research is aimed at finding bacteria that cause disease, which infects the mud grouper and discovering the bacterial pathogens in the KJA. The research was conducted for four months from May to August 2014 in SKIPM laboratory of Class I Medan II. The isolation and characterization of the bacterial pathogen in the mud grouper and in the KJA water use the dilution series and the scratch cup method. Based on the observation, it is found that the mud grouper has three species that are potential as the bacterial pathogens on the mud grouper and water by the total number of 41 isolats, which are Aeromonas salmonicida, Edwardsiella ictaluri, and Vibrio harveyi. Keywords: Epinephelus tauvina, Keramba Jaring Apung, Bacterial pathogens Universitas Sumatera Utara RIWAYAT HIDUP Penulis lahir di kota Tanjung Pinang, Provinsi Kepulauan Riau pada tanggal 24 Oktober 1992 dari Ayahanda Jamhur dan Ibunda Siti Khairani. Penulis merupakan anak pertama dari dua bersaudara. Penulis mengawali pendidikan formal di TK Ekadyasa Tanjung Pinang Pada tahun 1998-2004, pada tahun 1997-1998. penulis meneruskan pendidikan di SD Negeri 002 Tanjung Pinang dan pendidikan menengah pertama ditempuh dari tahun 2004-2007 di SMP Negeri 7 Tanjung Pinang. Penulis menyelesaikan pendidikan menengah atas di SMA Negeri 4 Tanjung Pinang dengan jurusan IPA pada tahun 2007-2010. Penulis melanjutkan pendidikan di Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara melalui jalur Ujian Masuk Bersama (UMB). Penulis melaksanakan Praktik Kerja Lapangan (PKL) di Stasiun Karantina Ikan, Pengendalian Mutu dan Keamanan Hasil Perikanan (SKIPM) Kelas I Medan II Belawan, Provinsi Sumatera Utara. Selain mengikuti perkuliahan penulis juga menjadi asisten laboratorium Pencemara Perairan dan Pengolahan Limbah tahun 2012-2013, dan Hama Penyakit Ikan tahun 2013-2014. Universitas Sumatera Utara KATA PENGANTAR Puji dan syukur penulis ucapkan kehadirat Allah SWT karena atas berkat rahmat, dan karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi yang berjudul “Jenis-Jenis Bakteri Potensial Patogen Ikan Kerapu Lumpur (Epinephelus tauvina)”, yang merupakan tugas akhir dalam menyelesaikan studi pada Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan, Fakultas Pertanian, Universitas Sumatera Utara. Penulis mengucapkan terima kasih yang sebesar-besarnya dan penghargaan yang setinggi-tingginya kepada ayahanda Jamhur dan Ibunda Siti Khairani yang selalu memberi motivasi dan dukungan sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Penulis mengucapkan terima kasih kepada adinda Ridho Nurrohman. Ucapan terima kasih juga penulis sampaikan kepada Bapak Prof. Dr. Dwi Suryanto, M.Sc selaku ketua komisi pembimbing dan Bapak Dr. Ir. Yunasfi, M.Si selaku anggota komisi pembimbing sekaligus Ketua Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan, yang telah banyak memberikan arahan dan masukan dalam penyelesaian skripsi ini. Penulis juga mengucapkan terima kasih kepada Bapak Pindi Patana, S.Hut, M.Sc selaku sekretaris Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan dan seluruh staf pengajar serta pegawai Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan. Terima kasih kepada Bapak Ir. Felix Lumban Tobing, S.Pi, M.P selaku kepala SKIPM Kelas I Medan II, Bapak Sondang Sitorus, S.Si selaku Kasubsie Tata pelayanan SKIPM Kelas I Medan II , Ibu Cut Rina Meutia, S.H selaku Universitas Sumatera Utara Kepala Urusan Tata Usaha SKIPM Kelas I Medan II, Bapak Diky Agung Setiawan, S.St. Pi selaku Kasubsie Wasdalin SKIPM Kelas I Medan II, Ibu Ied Parinduri, S.Si selaku Kepala Laboratorium SKIPM Kelas I Medan II sekaligus Pembimbing penelitian ekstern, serta seluruh staf SKIPM Kelas I Medan II yang telah memberikan dukungan baik materi maupun bantuan kepada penulis selama terlaksananya kegiatan penelitian. Terimakasih kepada Green Alfath Siregar, S.Pi, Adil Junaidi, Achmad Taher Daulay, Pahrurrozi, Muhammad Irfan Maulana, Ofi Sabrina Sitompul, S.Pi, Tantri Ayu Syahfitri, Pesta Saulina Sitohang, S.Pi, Sabilah Fi Ramadhani, S.Pi, Sudoyo Lumban Tobing, S.Pi, Albino Panjaitan, Ernawati Butar-butar dan seluruh teman-teman seperjuangan di angkatan 2010 Program Studi Manajemen Sumberdaya Perairan. Terimakasih penulis juga sampaikan kepada Muhammad Dafikri, Fadil Muhammad Syah, dan Fajar Prasetya Kembaren serta berbagai pihak yang telah banyak membantu penulis dalam menyelesaikan skripsi ini. Penulis berharap semoga skripsi ini bermanfaat dalam pengembangan ilmu pengetahuan khususnya dalam bidang manajemen sumberdaya perairan. Medan, September 2014 Penulis Universitas Sumatera Utara DAFTAR ISI Halaman ABSTRAK ............................................................................................ i ABSTRACT ........................................................................................... ii RIWAYAT HIDUP .............................................................................. iii KATA PENGANTAR ........................................................................... iv DAFTAR ISI ......................................................................................... vi DAFTAR GAMBAR ............................................................................ viii DAFTAR TABEL ................................................................................ ix DAFTAR LAMPIRAN ........................................................................ x PENDAHULUAN Latar Belakang............................................................................... Perumusan Masalah ...................................................................... Kerangka Pemikiran ...................................................................... Tujuan Penelitian .......................................................................... Manfaat Penelitian ........................................................................ 1 3 3 5 5 TINJAUAN PUSTAKA Ikan Kerapu Lumpur (Epinephelus tauvina) .................................. Gejala Penyakit pada Ikan ............................................................. Jenis-Jenis Penyakit Pada Ikan Kerapu Lumpur ........................... Bakteri Vibrio sp ........................................................................... Bakteri Aeromonas sp ................................................................... Bakteri Edwaesiella sp .................................................................. Penularan Penyakit Ikan Melalui Air ............................................. Suhu ............................................................................................. Salinitas ........................................................................................ Kecerahan ..................................................................................... Derajat Keasaman (pH) ................................................................. 6 8 9 11 13 15 16 17 18 18 19 METODE PENELITIAN Waktu dan Tempat Penelitian ....................................................... Alat dan Bahan .............................................................................. Pelaksanaan Penelitian .................................................................. Pengambilan Sampel Ikan dan Sampel Air .................................... Isolasi dan Identifikasi Bakteri Potensial Patogen dari Sampel Ikan Isolasi dan Identifikasi Bakteri Potensial Patogen dari Sampel Air . Karakterisasi dan Identifikasi Bakteri ............................................ 20 20 21 21 21 22 23 Universitas Sumatera Utara HASIL DAN PEMBAHASAN Hasil Ikan Terserang Penyakit ......................................................... Bakteri Potensial Patogen pada Ikan dan Air .......................... Morfologi Koloni Bakteri Potensial Patogen Ikan dan Air ...... Morfologi Sel Bakteri Potensial Patogen Ikan dan Air ............ Kualitas Air ........................................................................... Pembahasan Penyakit pada Ikan ................................................................. Bakteri Potensial Patogen Pada Ikan dan Air ........................... Morfologi Koloni Bakteri Potensial Patogen pada Ikan dan Air ......................................................................................... Morfologi Sel Bakteri Potensial Patogen Pada Ikan dan Air .... Kualitas Air ........................................................................... KESIMPULAN DAN SARAN Kesimpulan ................................................................................... Saran ............................................................................................ 25 26 26 27 32 32 33 34 35 38 39 39 DAFTAR PUSTAKA LAMPIRAN Universitas Sumatera Utara DAFTAR GAMBAR No. Teks Halaman 1. Kerangka Pemikiran .......................................................................... 4 2. Ikan Kerapu Lumpur (Epinephelus tauvina) ....................................... 7 3. Ikan Kerapu Lumpur yang terinfeksi penyakit ................................... 25 4. Organ Dalam (Hari, Ginjal, dan Limfa) ............................................. 26 5. Bentuk isolat koloni bakteri Vibrio harveyi, Aeromonas salmonicida, Dan Edwardsiella icatulari ................................................................ 28 Bentuk sel dari isolat bakteri ............................................................. 29 6. Universitas Sumatera Utara DAFTAR TABEL No. Teks Halaman 1. Jumlah isolat bakteri potensial patogen pada sampel air .................... 26 2. Morfologi koloni bakteri potensial patogen pada ikan dan air ........... 27 3. Hasil pengamatan morfologi sel bakteri Vibrio harveyi ..................... 29 4. Hasil pengamatan morfologi sel bakteri Aeromonas salmonicida ...... 30 5. Hasil pengamatan morfologi sel bakteri Edwardsiella icatulari .......... 31 6. Hasil pengukuran kualitas air di KJA perairan Belawan .................... 32 Universitas Sumatera Utara DAFTAR LAMPIRAN No. Teks Halaman 1. Sterilisasi alat dan bahan .................................................................. 45 2. Pembuatan media bakteri ................................................................. 46 3. Pengambilan sampel ikan dan sampel air .......................................... 49 4. Isolasi bakteri pada ikan dan air ....................................................... 50 5. Isolat pada media selektif ................................................................ 52 6. Pewarnaan Gram .............................................................................. 53 7. Uji reaksi biokimia .......................................................................... 55 8. Hasil bakteri pada media TSA .......................................................... 62 Universitas Sumatera Utara