BIOLOGI SEL Drs. H. Hery Purnobasuki, MSi., PhD. SEL Unit struktural dan fungsional dari organisme Bentuk, ukuran dan struktur sel sangat bervariasi Tipe sel: Sel prokariota dan Sel Eukariota (sel hewan dan tumbuhan) Fraksionasi sel metode pemisahan sel untuk mempelajari fungsi sel Bagian-bagian sel Bagian mati (inklusio) Bagian hidup protoplasma Dinding sel sitoplasma nukleoplasma Senyawa-senyawa: -Pigmen antosianin organel Membran sel RE Aparatus Golgi Mitokondria Ribosom Sentrosom Lisosom Plastida Vakuola -Nukleolus -Asam nukleat -Alkaloid -Tanin -Glikosida -Garam nitrat -Butir glikogen -Garam oksalat Sel tumbuhan Sel hewan Mahluk Hidup Prokariotik Inti sel primitif dan tidak jelas batas-batasnya. Bahan inti berbatasan dengan sitoplasma Contoh: - Bakteri - Ganggang biru - PPLO (The pleuropneumonia like organism) Eukariotik Inti sel jelas dan dibatasi dengan membran inti. Bahan inti ada di dalam inti sel Anaerobic bacteria living in hot acid conditions (e.g. sulfur bacteria) Archaebacteria (procaryotes) Bacteria living in extreme salt conditions (extreme halophyte) Anaerobic bacteria that reduce CO2 to methane (methanogens) Ancestral procaryote Gram positive bacteria Green photosynthetic bacteria (anaerobic) Eubacteria (procaryotes) Cyanobacteria (blue-green algae) Purple photosynthetic bacteria Nonphotosynthetic gram negative bacteria spirochetes Bakteri Semua tergolong prokaryotik 1,25m, bakteri terkecil Dialister pneumosister (0,15 -0,3 panjangnya), bakteri terbesar Spirillum volutans (13 -15 panjangnya) Bentuk bulat (coccus), batang (bacillus) dan spiral (spirillum) Struktur Sel Bakteri a. Bagian luar sebagai penutup sel, terdiri dari: 1. Kapsula Bagian paling luar berupa lendir untuk melindungi sel. Struktur kimia : polisakarida 2. Dinding sel Terdiri dari KH, protein, fosfor dan beberapa garam anorganik (asam amino, asam diamino pimalat dan asam asetil muramat Fungsinya: - sebagai pelindung - mengatur pertukaran zat - reproduksi 2. Dinding sel Bagian penutup paling dalam, mengandung enzim oksida atau enzim respirasi Membentuk lipatan-lipatan yang berlapis-lapis (desmosom) Membentuk lipatan-lipatan ke dalam/invaginasi (mesosom) Fungsi mesosom: -Respirasi -Sekresi -Menerima DNA saat konjungasi a. Bagian sitoplasma Membentuk koloid yang mengandung butiran protein, glikogen, lemak, asam poli-hidroksi butirat, granulosa, volutin dan sulfur Mengandung ribosom bebas Tidak mempunyai RE, badan golgi, mitokondria, lisosom dan sentriol Badan genetik: AND/kromosom/genophore terdapat dalam daerah inti (nucleoid) Beberapa bakteria mengandung kromatophore (klorofil) Bakteria bentuk batang dan spiral punya alat gerak flagel / silia Beberapa mempunyai fili untuk menempel pada permukaan Ganggang Biru Morfologi: bersel tunggal, berbentuk benang, berkelompok a. Bagian luar - Selubung gelatin - Dinding sel - Membram sitoplasma Dinding sel terdiri atas: lipoprotein, liposakarida, dan mukoprotein b. Bagian dalam Sitoplasma mengandung ribosom dan tidak mengandung: -RE -Badan golgi -Mitokondria -Lisosom Bagian lamela mengandung pigmen karotenoid + klorofil + fikosianin dan fikoeretrin PPLO (The Pneuropneumonia-Like Organism) W.V. Iterson (1969) digolongkan dalam bakteri kelas Mycoplastaceae Novikoff & Holzman (1970) tidak menggolongkan dalam bakteri Merupakan mikroorganisme patogen pada manusia dan hewan yang merusak saluran pernafasan Ukuran terkecil 0,1 – 0,3 Tidak mempunyai dinding sel, mesosom dan strukturnya sangat sederhana PPLO Sel dikelilingi membram sitoplasma (tebal 75 Å) DNA terkumpul di daerah inti, berupa fibril-fibril menyerupai lingkaran double helix Daerah inti dikelilingi ribosom sintesis protein Sitoplasma mengandung enzim untuk proses replikasi, transkripsi dan translasi RNA Pembentukan ATP dari gula secara respirasi anaerob Tidak memerlukan host untuk pembelahan sel Cara reproduksi: membelah diri, membentuk tunas & membentuk spora Sel Eukaryotik Mempunyai 2 macam membran: -Membran sitoplasma -Membran inti Terdapat pada tumbuhan dan hewan dan mengandung: Membran plasma Sitoplasma Organel: RE, badan golgi, lisosom, mitokondria dan nukleus Sel Hewan Bagian luar membran plasma / plasmalema, dapat membentuk lipatan mikrovili (untuk memperluas permukaan) Hubungan antar membran plasma dengan desmosom Sitoplasma sel mengandung organel-organel: -RE -Ribosom -Lisosom -Mitokondria -Badan golgi Struktur dan fungsi komponen sel hewan 1. Membran plasma / plasmalema Mengatur pertukaran zat antara sitoplasma dengan larutan di luar sel Bersifat semipermeabel, hidup dan sangat tipis Komponen kimia: - Bagian luar + dalam protein - Tengah lemak 2. Retikulum Endoplasma Membran lipoprotein Terletak antara membran inti dan membran sitoplasma Macamnya: 1. RE granuler (kasar) pada permukaan menempel ribosom 2. RE nongranuler (halus) tidak mengandung ribosom Fungsinya: alat transportasi zat yang diperlukan inti sel dari luar inti sel - Suatu sistem membran yang menembus semua daerah sel eukariot antara membran plasma dan salut inti - Komponen sistem membran intra sel yang dinamis - Membentuk jalinan rongga sel (cytocavitary) - Membentuk sistem peredaran di dalam sel dengan cara fusi membran Dua jenis RE: 1. RE Kasar - Tempat sintensis dan transport protein - merakit dan mengekspor protein - melekatnya ribosom 2. RE Halus / Licin - Sintesis lain dan modifikasi kimia ber BM rendah - Produksi sterol, sintesis kolesterol, pigmen retina, sel interstitial testis - metabolisme dan mekanisme detoksifikasi 3. Badan Golgi Camilo Gollgi (1898) sel saraf burung hantu Struktur: bentuk tumpukan kantong-kantong pipih yang kompleks, bagian dalam kantong terdapat ruang kecil (vakuola) Fungsi: menghasilkan sekret berupa butiran getah, lisosom primer, menyimpan protein dan enzim Pada tumbuhan disebut: dictyosome Setiap kantung pipih dinamakan sisterna, sakula atau lamela, di dalamnya terdapat ruang lebar (lumen) Menunjukkan suatu polaritas Kompleks Golgi vesikula vakuola Permukaan luar / pembentukan/ sis Ke arah RE Permukaan dalam / matang / trans Ke arah permukaan sel Enzim dominan enzim transferase, dengan enzim marker glikosiltransferase Vesikula transisi RE ribosom Fungsi Kompleks Golgi 1. Perakitan makromolekul kaya karbohidrat - Biosintesis glikoprotein dan glikolipida - Keduanya berasosiasi dengan membran-membran dan permukaan sel - Contohnya pada sekresi kelenjar tiroid dan pempentukan glikoprotein membran plasma - Glikoprotein membran plasma tidak dilepaskan ke lumen sakula kompleks Golgi - Sel tiroid terlibat dalam satu saur aktivitas yang melibatkan beberapa organel 2. Pembentukan lisosom dan akrosom - Lisosom timbul dari permukaan matang Golgi - Terbentuknya hidrolase dalam vesikula berkaitan dengan pembentukan lisosom - Akrosom merupakan tudung menutupi inti pada ujung anterior sperma 3. Pembentukan dinding sel tumbuhan - Polisakarida matriks dikumpulkan di Golgi - Papan sel dibentuk oleh vesikula yang memadat - Golgi berperan mengarahkan dan menambahkan beberapa bahan dinding sel ke tempatnya yang baru 4. Lisosom Bentuk bola , diameter 500 nm Mengandung enzim Fungsi: mencernakan bahan makanan yang masuk ke dalam baik secara pinositosis atau fagositosis Pinositosis : makanan yang berupa cairan yang masuk secara ditelan Fagositosis : makanan padat yang masuk secara ditelan LISOSOM Definisi: Setiap partikel sel dapat diidentifikasi sbg lisosom jika: -Diliputi oleh suatu membran pembatas -Bentuk dan ukuran heterogen -Mengandung 2 atau lebih enzim hidrolase asam -Bersifat enzyme latency Membran mengandung proteinprotein yang sangat terglikolisasi (unusually highly glycosylated) untuk melindungi dari protease di lumen lisosom pH lumen sekitar 5, dipelihara oleh pompa H+ATPase Khusus jaringan hewan FUNGSI 1. Pemecahan debris intra dan ekstrasel (endositosis & eksositosis) 2. Destruksi mikroorganisme yang terfagositosis 3. Pemecahan bahan untuk nutrien sel (autolisosis) STRUKTUR LISOSOM bakteri ekstraseluler Membran plasma fagosom fagositosis (1) Endosom awal Endosom akhir lisosom endositosis (2) mitokondria RE otofagosom otofagositosis (3) Tiga jalur transpor menuju pencernaan lisosomal, yaitu melalui endositosis (endosom), fagositosis (fagosom) dan otofagositosis (otofagosom) 5. Mitokondria Bentuk bulat lonjong / bercabang Ukuran: 500-2000 nm Banyak pada sel yang sedang aktif Ada 2 lapisan: membran dalam dan membran luar Fungsi: tempat respirasi/oksidasi KH yang menghasilkan energi (ATP) STRUKTUR MITOKONDRIA MATRIX INNER MEMBRANE OUTER MEMBRANE INTERMEMBRANE SPACE