adln - perpustakaan universitas airlangga penggunaan metilasi dna

ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
ABSTRAK
Perkiraan umur sangat penting dalam analisis forensik. Umur individu lebih
sering diperkirakan dengan menggunakan tulang dan gigi. Namun, hanya terbatas
pada kasus-kasus tertentu yang berhubungan dengan adanya kerangka manusia.
Metilasi DNA merupakan salah satu cara dalam memperkirakan umur pada sampel
biologis. Perkiraan umur menggunakan metode metilasi DNA dengan penggunaan
sampel urine hingga saat ini belum pernah ada yang melakukan, oleh sebab itu
penelitian ini digunakan isolasi metilasi DNA dalam memperkirakan umur individu
pada sampel urine. Pada penelitian ini digunakan dari 10 sampel urine yang
didapatkan dari pendonor sehat. Tahap pertama adalah isolasi DNA dengan
menggunakan DNAzol dan kloroform setelah itu, dikonversi bisulfit dengan kit DNA
metilasi. Hasil isolasi kemudian di amplifikasi dan di elektroforesis dengan gel
agarosa. Hasil elektroforesis dapat sebagai acuan panjang pita yang di sekuensing.
Hasil sekuensing dianalisis persen metilasinya dan korelasinya dengan perkiraan
umur. Hasil dari pembacaan aplikasi dan perhitungan tersebut pada sampel 001
menunjukkan 56,94%, sampel 002 menunjukkan 67,70%, sampel 003 menunjukkan
64,99%, sampel 004 menunjukkan 69,45%, sampel 005 menunjukkan 57,52%,
sampel 006 menunjukkan 58,61%, sampel 007 menunjukkan 63,66%, sampel 008
menunjukkan 61,19%, sampel 009 menunjukkan 54,52%, dan sampel 010
menunjukkan 60,39%. Berdasarkan hasil penelitian ini merupakan langkah awal dalam
penggunaan metilasi DNA dalam perkiraan umur individu terutama pada sampel urine.
Kata kunci—perkiraan umur, metilasi DNA, konversi, bisulfit, sekuensing, urine
xiv
TESIS
PENGGUNAAN METILASI DNA..
ROSALINDA AVIA ERYATMA
ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA
ABSTRACT
Age estimation on forensic analysis is very important thing. The age of
individual is more often estimated by bone and teeth. However, it is only limited on
several cases which related with human skeleton. DNA methylation is one of
methods how to estimate the age on biology sample. Age estimation using DNA
methylation method with urine sample has never been done till now, so this
experiment used isolation DNA methylation to estimate individual age with urine
samples. This experiment used 10 urine samples by healthy donors. First step is
isolate DNA by DNAzol and chlorophorm, then convert bisulfite with DNA
methylation kit. The result of isolation then amplify and electrophoresis with gel
agarose. The electrophoresis result be used as reference of length band then
sequencing it. Then, sequencing result is analyzed the percentage methylation and
corelation with age estimation. The result of read and count on sample 001 is 56.94%,
sample 002 is 67.70%, sample 003 is 64.99%, sample 004 is 69.45%, sample 005 is
57.52%, sample 006 is 58.61%, sample 007 is 63.66%, sample 008 is 61.19%, sample
009 is 54.52%, and 010 is 60.39%. Base on experiment result step used DNA
methylation to estimate individual age, especially on urine samples.
Keywords—prediction age, DNA methylation, conversion, bisulfite, sequencing,
urine
xv
TESIS
PENGGUNAAN METILASI DNA..
ROSALINDA AVIA ERYATMA