pola kepekaan bakteri gram negatif dari pasien infeksi saluran
advertisement
.. UNIVERSITAS INDONESIA POLA KEPEKAAN BAKTERI GRAM NEGATIF DARI PASIEN INFEKSI SALURAN KEMIH TERHADAP ANTIBIOTIK GENTAMISIN DAN KOTRIMOKSAZOL DI LABORATORIUM MIKROBIOLOGI KLINIK FKUI TAHUN 2001-2005 SKRIPSI Diajukan sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar sarjana kedokteran. ASEP KOMARA 0105007063 FAKULTAS KEDOKTERAN UNIVERSITAS INDONESIA JAKARTA Juni 2009 Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 PERNYATAAN ORISINALITAS Skripsi ini adalah hasil karya saya sendiri, dan semua sumber baik yang dikutip maupun dirujuk telah saya nyatakan dengan benar. Nama : Asep Komara NPM : 0105007063 Tanda tangan : Tanggal : 15 Juni 2009 Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 ii LEMBAR PENGESAHAN Skripsi ini diajukan oleh : Nama : Asep Komara NPM : 0105007063 Program Studi : Pendidikan Dokteran Umum Judul Skripsi : Pola Kepekaan Bakteri Gram Negatif dari Pasien Infeksi Saluran Kemih terhadap Antibiotik Gentamisin dan Kotrimoksazol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI tahun 2001-2005 Telah berhasil dipertahankan di hadapan Dewan Penguji dan diterima sebagai bagian persyaratan yang diperlukan untuk memperoleh gelar sarjana pada Program Pendidikan Dokter Umum Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. DEWAN PENGUJI Pembimbing : dr. Tjahjani Mirawati Sudiro, Sp.MK, PhD ( ) Penguji ( ) : Prof. Dr.dr. Rianto Setiabudy, Sp.FK Ditetapkan di : Jakarta Tanggal : 23 Juni 2009 Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 iii KATA PENGANTAR Puji syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yang Maha Esa, karena atas berkat dan rahmat-Nya penulis dapat menyelesaikan skripsi ini. Penyusunan skripsi ini dilakukan dalam rangka memenuhi salah satu syarat untuk mencapai gelar Sarjana Kedokteran pada Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia. Penulis menyadari bahwa tanpa bantuan dan bimbingan dari berbagai pihak, baik dari masa perkuliahan sampai pada penyusunan skripsi ini sangatlah sulit bagi penulis untuk menyelesaikan skripsi ini. Untuk itu penulis mengucapkan terima kasih kepada: 1. dr. T. Mirawati Sudiro, SpMK, selaku dosen pembimbing yang telah menyediakan waktu, tenaga dan pikiran dalam mengarahkan penulis dalam penyusunan skripsi ini. 2. Pihak labolatorium mikrobiologi FKUI yang telah banyak membantu dalam usaha memperoleh data yang diperlukan penulis. 3. Orang tua dan keluarga saya yang telah memberikan bantuan dukungan material maupun moril; dan 4. Sahabat yang telah banyak membantu penulis dalam menyelesaikan skripsi ini. penulis berharap semoga Tuhan Yang Maha Esa berkenan membalas segala kebaikan semua pihak yang telah membantu. Penulis menyadari bahwa masih terdapat banyak kekurangan dalam penulisan skripsi ini. Untuk itu penulis memohon maaf yang sebesar-besarnya. Akhir kata, penulis berharap semoga skripsi ini membawa manfaat bagi pengembangan ilmu. Jakarta, 15 Juni 2009 Asep Komara Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 iv LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS Sebagai sivitas akadmik Universitas Indonesia, saya yang bertanda tangan di bawah ini: Nama : Asep Komara NPM : 0105007063 Program Studi : Pendidikan Dokter Umum Fakultas : Kedokteran Jenis karya : Skripsi demi pengembangan ilmu pengetahuan, menyetujui untuk memberikan kepada Universitas Indonesia Hak Bebas Royalti Non-Eksklusif (Non-Exclusive RoyaltyFree Right) atas karya ilmiah saya yang bejudul: ” Pola Kepekaan Bakteri Gram Negatif dari Pasien Infeksi Saluran kemih terhadap Antibiotik Gentamisin dan Kotrimoksazol di Laboratorium Mikrobiologi Klinik FKUI tahun 2001-2005” beserta perangkat yang ada (bila diperlukan). Dengan Hak Bebas Royalti NonEksklusif ini Universitas Indonesia berhak menyimpan, mengalihmedia/formatkan, mengelolanya dalam bentuk pangkalan data (database), mendistribusikannya, dan menampilkan/ mempublikasikannya di Internet atau media lain untuk kepentingan akademis tanpa perlu meminta izin dari saya selama tetap mencantumkan nama saya sebagai penulis/pencipta dan sebagai pemilik Hak Cipta. Segala bentuk tuntutan hukum yang timbul atas pelanggaran Hak Cipta dalam karya ilmiah ini menjadi tanggung jawab saya pribadi. Demikian pernyataan ini saya buat dengan sebenarnya. Jakarta, 15 Juni 2009 Yang menyatakan, Asep Komara Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 v DAFTAR ISI HALAMAN JUDUL ................................................................................... i PERNYATAAN ORISINALITAS ............................................................... ii LEMBAR PENGESAHAN .......................................................................... iii KATA PENGANTAR ................................................................................. iv LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS ....................................... v ABSTRAK ................................................................................................. vi ABSTRACT ................................................................................................ vii DAFTAR ISI ............................................................................................... viii DAFTAR TABEL ....................................................................................... xi DAFTAR GAMBAR .................................................................................. xii 1. PENDAHULUAN .................................................................................. 1 1.1 Latar Belakang .................................................................................. 1 1.2 Rumusan Masalah ............................................................................. 2 1.3 Tujuan Penelitian .............................................................................. 2 1.3.1 Tujuan Umum ......................................................................... 2 1.3.2 Tujuan Khusus ......................................................................... 2 1.4 Manfaat Penelitian ............................................................................ 3 II. TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................ 2.1 Infeksi Saluran Kemih ...................................................................... 2.1.1 Definisi.................................................................................... 2.1.2 Epidemiologi .......................................................................... 2.1.2 Etiologi ................................................................................... 2.1.3 Patogenesis patogen urin pada ISK ......................................... 2.1.4 Manifestasi Klinis .................................................................. 2.1.5 Pemeriksaan penunjang dan diagnosis ISK ............................ 2.2 Bakteri............................................................................................... 2.2.1 Definisi ................................................................................... 2.2.2 Klasifikasi .............................................................................. 2.2.3 Bakteri Gram Negatif .............................................................. 2.2.4 Pertumbuhan dan Reproduksi ................................................. 2.3 Bakteri yang menyebabkan ISK ......................................................... 2.3.1 Enterobacteriaceae ................................................................. 2.3.2 Escherichia coli ...................................................................... 2.3.3 Klebsiella ............................................................................... 2.3.4 Enterobacter aerogen ............................................................. 2.3.5 Proteus mirabilis .................................................................... 2.3.6 Pseudomonas aeruginosa ....................................................... 2.4 Antibiotik .......................................................................................... 2.4.1 Gentamisin ............................................................................. 2.4.1.1 Mekanisme Resistensi Bakteri Terhadap Gentamisin .... 2.4.2 Kotrimoksazol ......................................................................... 2.4.2.1 Mekanisme Resistensi Bakteri Terhadap Kotrimoksazol Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 viii 4 4 4 4 6 7 10 10 12 12 12 13 13 15 15 17 18 18 18 18 21 22 26 27 30 Universitas Indonesia ix III. METODE PENELITIAN .................................................................... 3.1 Desain Penelitian ........................................................................... 3.2 Waktu dan Tempat Penelitian ........................................................ 3.3 Populasi dan Sampel ...................................................................... 3.4 Kriteria Inklusi dan eksklusi ........................................................... 3.5 Besar Sampel ................................................................................. 3.6 Definisi Operasional ...................................................................... 3.7 Cara Kerja ..................................................................................... 3.8. Pengolahan dan Analisis Data ....................................................... 3.9 Etika Penelitian .............................................................................. 3.10 Kerangka Teori dan Kerangka Konsep........................................... 31 31 31 31 31 31 32 33 34 34 35 IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ............................................................ 4.1 Distribuis Data Penelitian ............................................................. 4.2 Distribusi data Penelitian Berdasarkan Antibiotik Gentamisin dan kotrimoksazol . ............................................................................. 4.3 Distribusi nilai rata-rata bakteri Gram negatif yang sensitif dan resisten terhadap antibiotik gentamisin dan kotrimoksazol pada tahun 2001-2005 .................................................................. 4.4 Kepekaan Bakteri Escherichia coli terhadap Antibiotik Gentamisin dan Kotrimoksazol dari tahun 2001-2005...................................... 4.5 Kepekaan Bakteri Enterobacter Terhadap Gentamisin dan Kotrimoksazol dari tahun 2001-2005...................................... 4.6 Kepekaan Bakteri Klebsiella pneumoniae Terhadap Gentamisin dan Kotrimoksazol dari tahun 2001-2005...................................... 4.7 Kepekaan Bakteri Proteus mirabilis Terhadap Gentamisin dan Kotrimoksazol dari tahun 2001-2005 ..................................... 4.8 Kepekaan Bakteri Pseudomonas aeruginosa Terhadap Gentamisin dan Kotrimoksazol dari tahun 2001-2005 ..................................... 4.9 Perbandingan Nilai Rata-Rata Bakteri Gram Negatif Terhadap Antibiotik Gentamisin dan Kotrimoksazol Tahun 2001-2005 dari Beberapa Peneliti ......................................................................... 36 36 57 V. KESIMPULAN DAN SARAN ............................................................... 5.1 Kesimpulan ................................................................................... 5.2 Saran ............................................................................................. 59 59 60 DAFTAR REFERENSI ............................................................................. 62 Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 37 37 38 44 46 49 52 Universitas Indonesia DAFTAR TABEL Tabel 2.1.3 Tabel 2.1.4 Tabel 4.1 Tabel 4.2 Tabel 4.3 Tabel 4.9 Jenis-jenis bakteri penyebab ISK ............................................. 6 Faktor predisposisi terjadinya ISK ........................................... 8 Deskripsi Jumlah dan Distribusi Isolat ...................................... 36 Distribusi Subjek Berdasarkan Antibiotik ................................ 37 Distribusi nilai rata-rata kepekaan tahun 2001-2005 ................. 38 Perbandingan Nilai Rata-Rata Bakteri Gram Negatif Terhadap Antibiotik Gentamisin dan Kotrimoksazol Tahun 2001-2005 dari Beberapa Peneliti ..................................................................... 57 Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 x Universitas Indonesia DAFTAR GAMBAR Gambar 2.1.2 Grafik prevalensi bakteriuria asimtomatik dengan usia ....... 6 Gambar 2. 1.4.1 Masuknya bakteri secara ascending ke dalam saluran kemih 7 Gambar 2.1.4.2 Grafik infeksi nosokomial yang paling sering terjadi........... 9 Gambar 2.1.5 Hubungan antara lokasi infeksi dengan gejala klinis ........... 10 Gambar 2.4.1.1 Struktur gentamisin............................................................. 24 Gambar 2.4.1.2 Kadar gentamisin dalam plasma ......................................... 24 Gambar 2.4.2.1 Struktur kimia trimetoprim.................................................. 27 Gambar 2.4.2.2 Mekanisme kerja kotrimoksazol.......................................... 28 Gambar 4.4.1 Kepekaan Escherichia coli terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2001 .................................................. 39 Gambar 4.4.2 Kepekaan Escherichia coli terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2002 ................................................... 39 Gambar 4.4.3 Kepekaan Escherichia coli terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2003 ................................................... 40 Gambar 4.4.4 Kepekaan Escherichia coli terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2004 ................................................... 41 Gambar 4.4.5 Perbandingan tingkat kepekaan bakteri Escherichia coli antara antibiotik gentamisin dan kotrimoksazol pada tahun 2004... 41 Gambar 4.4.6 Kepekaan Escherichia coli terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2005 ................................................... 42 Gambar 4.4.7 Perbandingan tingkat kepekaan bakteri Escherichia coli antara antibiotik gentamisin dan kotrimoksazol pada tahun 2005... 42 Gambar 4.4.8 Pertumbuhan kepekaan Escherichia coli terhadap gentamisin dan kotrimoksazol dari tahun 2001 – 2005 .......................... 43 Gambar 4.5.1 Kepekaan Enterobacter terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2001 ................................................................ 44 Gambar 4.5.2 Kepekaan Enterobacter terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2002 ................................................................. 44 Gambar 4.5.3 Kepekaan Enterobacter terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2003 ................................................................. 45 Gambar 4.5.4 Pertumbuhan Kepekaan bakteri Enterobacter terhadap gentamisin dan kotrimoksazol dari tahun 2001 – 2003 ........ 45 Gambar4.6.1 Kepekaan Klebsiella pneumoniea terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2001 .................................................. 46 Gambar4.6.2 Kepekaan Klebsiella pneumoniea terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2002 .................................................. 47 Gambar4.6.3 Kepekaan Klebsiella pneumoniea terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2003 .................................................. 47 Gambar4.6.4 Kepekaan Klebsiella pneumoniea terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2004 .................................................. 48 Gambar4.6.5 Kepekaan Klebsiella pneumoniea terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2005 .................................................. 48 Gambar4.6.6 Pertumbuhan kepekaan bakteri Klebsiella pneumoniae terhadap gentamisin dan kotrimoksazol pada tahun 2001 – 2005 ....... 49 Gambar 4.7.1 Kepekaan Proteus mirabilis terhadap gentamisin dan Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 Universitas Indonesia Gambar 4.7.2 Gambar 4.7.3 Gambar 4.7.4 Gambar 4.7.5 Gambar4.8.1 Gambar4.8.2 Gambar 4.8.3 Gambar 4.8.4. Gambar 4.8.5 Gambar 4.8.6. Gambar 4.8.7 Gambar 4.8.8 kotrimoksazol tahun 2001 .................................................. Kepekaan Proteus mirabilis terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2002 .................................................. Kepekaan Proteus mirabilis terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2003 ................................................... Kepekaan Proteus mirabilis terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2004 ................................................... Pertumbuhan kepekaan bakteri Proteus mirabilis terhadap gentamisin dan kotrimoksazol pada tahun 2001 – 2004 ..... Kepekaan Pseudomonas aeruginosa terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2001 ............................................ Kepekaan Pseudomonas aeruginosa terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2002 ............................................ Kepekaan Pseudomonas aeruginosa terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2003 ............................................ Kepekaan Pseudomonas aeruginosa terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2004 ............................................ Perbandingan tingkat kepekaan bakteri Pseudomonas aeruginosa antara antibiotik gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2004 ......................................................................... Kepekaan Pseudomonas aeruginosa terhadap gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2005 ............................................ Perbandingan tingkat kepekaan bakteri Pseudomonas aeruginosa antara antibiotik gentamisin dan kotrimoksazol tahun 2005 ......................................................................... Pertumbuhan kepekaan bakteri Pseudomonas aeruginosa terhadap gentamisin dan kotrimoksazol pada tahun 2001 – 2005 .............................................................. Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 50 50 51 51 52 53 53 54 54 55 55 56 56 Universitas Indonesia DAFTAR ISTILAH FKUI : Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia ISK : infeksi saluran kemih UTI : Urinary Tract Infection NCCLS : National Committee for Clinical Laboratory Standards PMN : polimononukleus USG : Ultrasonografi LPS : lipopolisakarida MIC : minimum inhibitory concentration MLC : minimum lethal concentration PABA : P-aminobenzoic acid Pola kepekaan ..., Asep Komara, FK UI., 2009 Universitas Indonesia
