Ulangan Tengah Semester Dasar Bioteknologi Nama: Yasmine Nur Hasna Kelas: K NIM: 135100607111003 1. Apa yang Saudara ketahui tentang DNA dan RNA? Jelaskan perbedaannya! DNA (Deoxyribo Nucleic Acid) atau disebut juga Asam deoksiribonukleat merupakan asam nukleat yang merupakan tempat penyimpanan informasi genetik.. Sedangkan RNA (Ribo Nucleic Acid) atau disebut juga asam ribo nukleat merupakan bahan genetik dan memainkan peran utama dalam ekspresi genetik. Perbedaan DNA dan RNA adalah: a. Struktur DNA mempunyai rantai ganda (double helix) dengan urutan dari 5’ ke 3’ dan 3’ ke 5’. Sedangkan RNA mempunyai rantai tunggal (single helix) dengan urutan 5’ ke 3’. b. Gula penyusun DNA mempunyai gula deoxiribosa sedangkan RNA mempunyai gula ribosa. Pada RNA, gula ribosanya mengikat gugus –OH. c. Basa Nitrogen DNA mempunyai basa nitrogen Adenin, Guanin, Sitosin dan Timin. Sedangkan DNA basa nitrogennya adalah Adenin, Guanin, Sitosin dan Urasil. d. Peran DNA berperan untuk mewariskan sifat dan mensintesis protein sedangkan RNA hanya berperan dalam mensintesis protein saja. e. Kadar Kadar DNA dalam sel tetap, sementara kadar RNA berubah-ubah sesuai dengan kebutuhan sintesis protein 2. Mengapa replikasi DNA perlu dilakukan? Jelaskan prosesnya! Replikasi DNA perlu dilakukan untuk mengganti sel yang rusak dan untuk regenerasi sel. Proses replikasi DNA: -Pengenalan Origin of Replication (ORI) Titik awal dimulainya replikasi disebut Origins of Replication (titik ORI), merupakan suatu unique sequence yang akan dikenali suatu protein inisiator. Protein Origin Recognition Complex (ORC) berperan sebagai protein inisiator yang akan mengenali sekuens ORI dan menginisiasi penempelan helicase. ORC ini akan selalu menempel pada saat proses replikasi berlangsung, penghancuran ORC oleh protein tertentu dapat menghambat proses replikasi. -Inisiasi Replication Fork Helicase yang menempel pada ORI berfungsi membuka pilinan DNA double strand menjadi dua single strand DNA terpisah sehingga membentuk struktur Replication Fork. Single Strand Binding Protein (SSB) akan menempel pada single strand DNA yang baru terbentuk agar stabil sehingga tidak bergabung kembali (renaturasi). Pembukaan pilinan oleh helicase dimulai dari ORI menuju ke dua arah, membentuk 2 Replication Fork yang tampak sebagai Replication Bubble. -Replikasi pada Leading Strand Replikasi pada Leading strand diawali dengan aktivitas primase (DNA primase) yang mensintesis RNA primer. Setelah adanya RNA primer, sintesis DNA dapat dimulai oleh DNA polimerase secara kontinyu dari arah 5' ke 3' searah dengan pembukaan replication fork. -Replikasi pada Lagging Strand Sintesis DNA harus terjadi pada arah 5' ke 3' maka arah replikasi berlawanan arah dengan pembukaan Replication Fork atau antiparalel dengan arah Leading strand. Replikasi pada lagging strand terjadi secara tidak kontinyu. Sintesis DNA diawali dengan pembentukan RNA primer kemudian dilanjutkan sintesis DNA oleh DNA polimerase, demikian berulang-ulang setelah helicase membuka untaian double helix DNA. Oleh karena itu, pada lagging strand dijumpai fragmen-fragmen DNA yang disebut fragmen Okazaki. DNA polimerase akan menganti RNA primer dengan sekuens DNA dan meninggalkan celah antar fragmen (gap). Fragmen-fragmen tersebut akhirnya disatukan oleh Ligase sehingga membentuk untai DNA baru yang utuh dan komplementer dengan template DNA induk. 3. Bagaimana proses transkripsi dan translasi yang terjadi di dalam sel? a. Transkripsi Bahan-bahan transkripsi adalah DNA template, RNA polymerase, enzim helicase dan SSB protein. Pertama-tama untaian DNA double helix dibuka oleh enzim helicase dan ditahan oleh SSB protein agar DNA tidak tertutup kembali. Leading strand disebut dengan anti-sense, lagging strand disebut dengan sense (cetakan). Lalu, RNA polymerase membaca kode yang dibawa oleh cetakan dan memperpanjangnya. Proses transkripsi diawali apabila ada basa nitrogen T-A-T-A (Tata box) dan diakhiri apabila bertemu dengan basa nitrogen guanine dan sitosin (G-C-G-C) yang berurutan. b. Translasi Bahan-bahan yang digunakan untuk proses translasi adalah, messenger-RNA (mRNA), transfer-RNA (t-RNA) dan ribosom-RNA (r-RNA). Pada ribosom RNA ada small unit dan large unit. Mereka disebut dengan kompleks ribosom, yang digunakan sebagai tempat terjadinya translasi. Tahapannya, pertama-tama start kodon (AUG, UGA dan UAA) dibaca oleh large unit ribosom. Lalu, m-RNA membawa kodon yang akan diproses pada translasi. T-RNA kemudian membawa anti-kodon yang sesuai kepada m-RNA. dan terjadi penggabungan asam amino yang dibawa oleh t-RNA. Hasilnya akan terbentuk polipeptida atau protein. 4. Bagaimana aplikasi mata kuliah bioteknologi terhadap ilmu teknik bioproses? Pada mata kuliah dasar bioteknologi pada ilmu teknik bioproses terdapat dalam bioremediasi, yaitu menggunakan mikroorganisme yang mempunyai enzim untuk mengurangi polutan di lingkungan. Bioteknologi juga berperan dalam fermentasi industri untuk mengubah bahan baku menjadi produk yang bernilai lebih tinggi. Selain itu, bioteknologi juga berperan dalam pembuatan fermentor, yaitu tangki berisi mikroba yang berguna untuk mengubah produk biokimia dengan atau tanpa produk sampingan. 5. Berikan penilaian, masukkan dan saran terhadap kegiatan perkuliahan dasar bioteknologi! Kegiatan perkuliahan dasar bioteknologi itu menyenangkan, penyampaian materinya mudah dimengerti. Video yang digunakan juga menarik namun sedikit sulit untuk dipahami, karena berbahasa inggris.