Cara Pengkajian Transkriptom Dan Aplikasinya

Cara Pengkajian Transkriptom Dan Aplikasinya






Nama
NIM
Kelas
Email
Blog
Jenis Topik
: Akhsan Nur Fahmi
: B1J005138
: A1
: [email protected]
: http://akhsanb1j005138.wordpress.com
: A1-TP5
Ringkasan
Sebelum kita membahas mengenai penilitian transkriptom alangkah baiknya kita
ketahui gulu apa itu transkriptom. Proteom adalah produk akhir ekspresi genom dan
mengandung seluruh protein yang ada dalam sel pada waktu tertentu.transkriptom lebih dari
4%dari total sel,dimana merupakan komponen yang penting untuk mengkode RNA khususnya
komposisi proteom dan kapasitas biochemikal dalam sel. Setiap sel menerima setengah dari
transkriptom induknya ketika pertama kalinyadari divisi sel.
Organisme yang sederhana contohnya adalah bakteri dan yeast,beberapa gen aktif pada
satu waktu. Transkriptom yang komplek itu beratus ratus telah dikopi, jika tidak ribuan dari
prbedaan mRNA. Kadang-kadang beberapa mRNAghanya disertai fraksi yang kecil bersama
dengan itu memberikan tidak lebih dari 1%dari total mRNA.
Gambar transkriptom dari yeast. Menjelaskan mengenai pertumbuhan sel dalam
glukosa, selama 2 jam mengalami perubahan selama transkriptom dan setelah glukosa
itu dipakai mengalami perubahan yang signifikan
Lebih dari 6000 gen dari yeast sangat mudah dipelajari tentang transkriptomnya dan
banyak proyek proyek penelitian meneliti yeast. Satu penemuan penting yaitu pada
suatu waktu mensintesis kembali komposisi transkriptom yeast menglami perubahan
kecil jika gen konstan.
Transkriptom yeast selalu terjadi perbedaan perubahan struktur sel. Ini dijelaskan
dengan mempelajari sporolution (spore formation) dalam kondisi yang bagus maupun
stress. Sporulution dibagi menjadi 4 tahap:
1. early
2. midlle
3. mide-late
4. late
kerja dari sporulas yeast mempunyai 2 alasan penting. Yang pertama adalah perubahan
ekspresi gen kaitannya dengan sporulasi, analisis transkriptom membuka untuk
mempelajari hubungan genom dengan sinyal sporulasi. Mempelajari tipe ini,
organismenya sangat simpel contohnya yeast, yeast merupakan model yang komplek
dalam proses perkembangan eukariot tingkat tinggi. Yang kedua mRNA mengalami
perubahan yang signifikan dari sporulasi yang mentranskrip gen yang tidak diketahui
fungsinya. Mempelajari transkriptommembantu jumlah genom yang teridentifikasi.
Daftar Pustaka
Brown, T.A (2002) DNA in Genomes, 2nd ed.,
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=transkriptom dan proteom.section.5234
diakses tanggal 23 September 2008
Situs Terkait
1.
transkriptom