L/O/G/O Penggolongan & Tata Nama Enzim dr.Syazili Mustofa Departemen Biokimia dan Biologi Molekuler Fakultas kedokteran Universitas Lampung Emulsin • Pemecah lemak dalam suatu emulsi? • memecah ikatan glikosida yang pahit pada senyawa amigdalin (terkandung dalam biji amandel) Perlu tata nama enzim Tata Nama Enzim Jenis Substrat Jenis ikatan kimia Jenis reaksi Dengan Penggolongan Substrat • Substrat + akhiran ase • Contoh : amilase, laktase, sakrase, maltase • Permasalahan : enzim dengan substrat yang sama meski terdapat pada organisme berbeda solah-olah akan terlihat sama Jenis Ikatan Kimia Substrat • Jenis ikatan kimia + ase • Contoh : peptidase, esterase • Komunikatif tetapi tidak memiliki kemampuan pembedaan yang tajam • Ikatan kimia dipecah/ dibentuk Jenis Reaksi • Jenis reaksi + ase • Contoh : glukosa oksidase (mengoksidasi glukosa pada kondisi aerob) • Glukosa dehidrogenase (mengoksidasi glukosa pada kondisi anaerob) • Amino transferase ( memindahkan gugus amino) • Deskriptif & informatif Tata Nama dengan Penggolongan • Baldwin (1953) penggolongan enzim berdasarkan jenis reaksi kimia yang dikatalisis Hidrolase dan enzim hidrasi dan dehidrasi Enzim transfer & isomerisasi E. Oksidasi E. Dehidrogenase Peptidase Transfosforilasi Oksidase Karbohidrase Transglikosidasi Dehidrogenase dan kodehidrogenae Lipase & Esterase Transpeptidasi Hidrolase lain Transaminasi Enzim Hidrasi & dehidrasi Transiminasi Enzim pernafasan warburg dan sistem Dehidrogenase sitokrom koenzim tereduksi (flavoprotein) Sistem pembawa tambahan Sist Dehidrogenase Transmidasi Transmetilasi reversibel Transtiolasi E. Pernafasan jaringan & penangkap energi bebas Transasetilasi E. isomerisasi Lanjutan… • Dixon dan Webb (1958) Enzim hidrolisis Enzim pemindah gugus Enzim lain-lain Ikatan Peptida Hidrogen Amina Nitrogen Katalisis reaksi sintetis menggunakan ATP atau GMP Ikatam ester Fosfat Addisi ikatan rangkap Ikatan glikosida Asil Ikatan anhidrida asam Glikosil Katalisis perubahan konfigurasi ruang Reaksi dekarboksilasi non-oksidatif koenzimA Lain-lain Ikatan lain-lain Metil Lain-lain International Union of Biochemistry • 1. Kelas Oksidoreduktase, kelas ini mengkatalis reaksi oksidasi-reduksi suatu substrat dengan senyawa • 2. Kelas Transferase, mengkatalis pemindahan atau transfer suatu gugus yang bukan H • 3. Kelas Hidrolase, mengkatalis reaksi hidrolisis • 4. Kelas Liase, mengkatalis suatu reaksi dengan cara mengeluarkan suatu gugus dari suatu substrat dengan meninggalkan ikatan rangkap • 5. Kelas Isomerase, mengkatalis reaksi pembentukan isomer, baik isomer optik maupun geometrik • 6. Kelas Ligase atau Sintatase, mengkatalis reaksi sintetis sehingga menghasilkan molekul lebih besar dari substrat awal Lanjutan… • • • • • Digit 1: kelas Digit 2: sub kelas Digit 3 : subsubkelas Digit 4: nama khusus enzim (jika ada) Nama enzim ditulis dalam dua kata, kata pertama adalah substrat, kata kedua adalah satu dari enam jenis rekasi yang diberi akhiran ase Contoh nama sistematik & generik No klasifikasi Nama sistematik enzim Nama generik enzim 1.1.1.1 Alkohol: NAD oksidoreduktase Alkohol dehidrogenase 1.1.1.27 Laktat: NAD oksidoreduktase Laktat dehidrogenase (LDH) 2.7.1.1 ATP:D-heksosa-6-fosfatranferase Heksokinase 3.1.4.1 Ortofofat diester fosfohidrolase fosfodiesterase 4.1.2.7 Ketosa-1-fosfataldehidiase Aldolase Penggolongan khusus enzim tertentu • Enzim pemecah protein kelas 3 sistem klasifikasi IUB peptida hidrolase • Memutus ikatan peptida yang berada dibagian tengah atau dalam pada molekukl protein substrat endopeptidase • Sebgai hasil kerja endopeptidase, terbentuklah molekul-molekul protein yang lebih kecil eksopeptidase • Enzim peptidase yang bekerja pada ikatan peptida di bagian terluar dari molekul protein substrat L/O/G/O Thank You! Searching and giving the best