TUGAS ISTILAH BIOINFORMATIKA No 1. Kata BioSystems Arti Database yang berisi tentang korelasi biologi dari gen, protein dan molekul kecil berdasarkan literatur. 2. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) Software yang dapat digunakan untuk menentukan homologi suatu urutan DNA atau asam amino dengan data yang ada di NCBI. 3. complementary DNA (cDNA) Molekul DNA rantai-tunggal dengan sekuen nukleotida yang bersifat komplementer terhadap sebuah molekul RNA; dibentuk oleh hasil kerja enzim transkriptase reverse terhadap sebuah template RNA. 4. DAVID (database for annotation, visualization and integrated discovery) Sumber bioinformatika online gratis yang dikembangkan oleh Laboratorium Immunopathogenesis dan bioinformatika bertujuan untuk menyediakan interpretasi fungsional dari daftar besar gen yang berasal dari studi genom. 5. Enrichment analysis Metode untuk mengidentifikasi kelas dari gen atau protein yang mewakili kumpulan besar gen atau protein, dan mungkin memiliki hubungan dengan fenotipe penyakit. 6. Ensembl Sistem perangkat lunak yang menghasilkan dan menjaga anotasi/keterangan otomatis mengenai genom eukaryotik, dikembangkan sebagai proyek bersama the European Molecular Biology Laboratory-European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI) dan the Sanger Centre. 7. FASTA Kumpulan basa-basa suatu spesies. 8. Filogenetik Kajian mengenai hubungan evolusi atau pola keturunan diantara organisme atau gen dari unit taksonomi, dipelajari menggunakan kombinasi antara biologi, molekuler dan teknik statistik. 9. Gen Bank Database nukleotida internasional yang bekerja sama dengan DataBank of Japan (DDBJ), the European Molecular Biology Laboratory (EMBL), dan GenBank at NCBI. 10. In Silico 11. KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) Percobaan ilmiah atau penelitian yang dilakukan dengan cara pemodelan atau simulasi pada komputer. Kumpulan database yang berkaitan dengan genom, pathway biologi, penyakit, obat, dan bahan kimia, biasanya digunakan untuk riset dan pengajaran bioinformatika, termasuk analisis data dalam genomika, metagenomika, metabolomika dan studi omika lainnya, perancangan model dan simulasi dalam sistem biologi, serta riset translational dalam pengembangan obat. 12. Microarray Teknologi yang memanfaatkan sumber daya sekuen yang ada untuk mempelajari gen apa yang diekspresikan oleh tipe sel tertentu dari suatu organisme, pada waktu tertentu, dan di bawah kondisi tertentu. 13. Multiple Sequence Alignment (MSA) Penyelarasan dari tiga atau lebih urutan biologis (protein atau asam nukleat) dengan panjang yang sama. Dari output, homologi dapat disimpulkan dan hubungan evolusi antara urutan yang dipelajari. 14. Open Reading Frame Finder (ORF Finder) Software yang diperuntukkan untuk mengidentifikasi OFR (open reading frames) atau menterjemahkan urutan DNA menjadi asam amino. 15. Penyearahan lokal (local alignment) Pencarian regio pendek sebagai padanan hampir sempurna pada salah satu bank data atau basis-data lainnya. 16. PINA (Protein Interaction Network Analysis) Platform terintegrasi untuk konstruksi jaringan interaksi protein, penyaringan, analisis, visualisasi dan manajemen. 17. Primer-BLAST Software yang dikembangkan dari algoritma PRIMER3 untuk mendesain primer berdasarkan sequence yang dimasukkan. 18. Probes 19. Sequence alignment 20. Sequensing DNA Rantai tunggal molekul DNA atau RNA dengan sekuen basa spesifik, yang telah diberi label secara radioaktif atau imunologis, digunakan untuk mendeteksi sekuen basa komplementer dengan hibridisasi. Suatu cara untuk mengatur urutan DNA, RNA, atau protein untuk mengidentifikasi bagianbagian kesamaan yang mungkin merupakan akibat dari fungsional, struktural, atau hubungan evolusi antara sequence. Proses pengurutan DNA atau teknik penentuan urutan basa nukleotida pada suatu molekul DNA. TUGAS MATA KULIAH BIOINFORMATIKA RESUME JURNAL DAN ISTILAH BIOINFORMATIKA Dosen : Aprilia Indra Kartika, M.Biotech Disusun Oleh : Gela Setya Ayu Putri G4C018014 PROGAM S2 SAINS LABORATORIUM MEDIS FAKULTAS ILMU KEPERAWATAN DAN KESEHATAN UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH SEMARANG 2018
