ANALISIS INSTRUKSIONAL GARIS-GARIS BESAR PROGRAM PENGAJARAN KONTRAK PERKULIAHAN MATA KULIAH BIOLOGI DAN FISIOLOGI SEL (AGH 637) OLEH Dr Nurul Khumaida dan Tim Pengajar PROGRAM STUDI PEMULIAAN DAN BIOTEKNOLOGI TANAMAN - SPs DEPARTEMEN AGRONOMI DAN HORTIKULTURA FAKULTAS PERTANIAN INSTITUT PERTANIAN BOGOR 2014 ANALISIS INSTRUKSIONAL Mata Kuliah : Biologi dan Fisiologi Sel Kode MK/sks: AGH 637 / 3 (3-0) Semester : Genap Prasyarat : Standar Kompetensi : Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa akan memiliki pengetahuan mengenai ciri, sifat, struktur dan fungsi sel tanaman, serta pertumbuhan dan perkembangan sel berdasarkan organel yang dimilikinya Mengikuti dan memahami proliferasi yaitu pertumbuhan dan perkembangan sel menjadi individu baru Mengerti dan memahami penjelasan strategi signal kimia pada sel, tranduksi signal, reseptor, dan second messenger Mengerti dan memahami proses diferensiasi perkembangan bagian dari sel yang membelah menjadi sel dewasa yang bergabung Mengerti dan memahami sitokleton, penjelasan menyusun skeleton, essembly dan disassembly serta fungsi dan organisasi skeleton Mengerti dan memahami mitosis dan perbanyakan sel, mitosis normal dan endomitosis Mengerti dan memahami evolusi sel, dari molekul sampai sel, dari prokariyota sampai eukariyota, dari sel tunggal sampai organisasi multi seluler Mengerti dan memahami membrane bilayer lipida, protein dan karbohidrat membrane, serta transpot pada membran Mengerti dan memahami struktur dan fungsi nukleus, mitokodria dan kloroplas GARIS-GARIS BESAR PROGRAM PENGAJARAN I. IDENTITAS MATA KULIAH MATA KULIAH : Biologi dan Fisiologi Sel KODE/sks : AGH 637 / 3 (3-0) SEMESTER : Genap MATA KULIAH PRASYARAT : - PENGAJAR : Dr Nurul Khumaida dan Tim Pengajar DESKRIPSI SINGKAT : Kuliah ini membahas secara konprehensif mengenai sifat biologi dan fisiologi dari sel tanaman. Materi yang dibahas meliputi organel sel (nukleus, mitokondria, dan kloroplas), pembelahan dan perbanyakan sel, proliferasi dan deferensiasi sel, sel sebagai bagian jaringan, evolusi sel, mumbran, sito skeleton, dan signal pada sel. CAPAIAN PEMBELAJARAN MATA KULIAH : Setelah mengikuti kuliah ini dengan baik mahasiswa diharapkan akan memiliki pengetahuan dan mampu menjelaskan mengenai ciri, sifat, struktur dan fungsi, pertumbuhan dan perkembangan sel berdasarkan organel yang dimilikinya. KOMPETENSI LULUSAN MAGISTER PS PBT 1. Mampu mengembangkan pengetahuan dan teknologi di bidang genetika tanaman, pengelolaan keragaman genetik, pembentukan rekombinan, seleksi dan pengujian dalam rangka perbaikan genetik tanaman sehingga menghasilkan karya inovatif dan teruji. 2. Menguasai pengetahuan lanjut tentang genetika tanaman, pengelolaan dan sumber daya genetik, analisis keragaman genetik, perakitan rekombinan dan seleksi, perancangan pengujian lapangan dan analisis data untuk dapat melakukan pengelolaan keragaman genetik, pembentukan rekombinan, seleksi dan pengujian dalam rangka perbaikan genetik tanaman 3. Mampu mengelola riset dan pengembangan di bidang pengelolaan keragaman genetik, pembentukan rekombinan, seleksi dan pengujian dalam rangka perbaikan genetik tanaman yang bermanfaat bagi masyarakat dan keilmuan, serta mampu mendapat pengakuan nasional, berbudi luhur dan memiliki 4 sifat kreatif, inovatif , dan partisipatif KOMPETENSI LULUSAN DOKTOR PS PBT 1. Mampu mengembangkan ilmu pengetahuan dan teknologi dalam bidang genetika tanaman, pengelolaan keragaman genetik, pembentukan rekombinan, seleksi dan pengujian dalam rangka perbaikan genetik tanaman melalui riset untuk menghasilkan karya kreatif, original, dan teruji dalam bidang perbaikan genetik tanaman 2. Menguasai pengetahuan lanjut dan mendalam tentang genetika tanaman, pengelolaan dan sumber daya genetik, analisis keragaman genetik, perakitan rekombinan dan seleksi, perancangan percobaan pengujian lapangan dan analisis data untuk dapat melakukan pengelolaan keragaman genetik, pembentukan rekombinan, seleksi dan pengujian dalam rangka perbaikan genetik tanaman 3. Mampu mengelola, memimpin dan mengembangkan riset dan pengembangan di bidang pengelolaan keragaman genetik, pembentukan rekombinan, seleksi dan pengujian dalam rangka perbaikan genetik tanaman yang bermanfaat bagi ilmu pengetahuan dan kemaslahatan umat manusia, serta mampu mendapatkan pengakuan nasional dan internasional, berbudi luhur dan memiliki sifat kreatif, inovatif , dan partisipatif 5 II. RENCANA PEMBELAJARAN SATU SEMESTER – KULIAH Minggu ke- LO PS yang didukung Kemampuan Akhir yang Diharapkan Bentuk dan Bobot Penilaian - Ujian tertulis - 14.3% nilai UTS Bahan Kajian (Materi Ajar) Bentuk Pembelajaran 1. Penjelasan kontrak belajar 2. Pengertian sel dan fungsinya 3. Pengertian ciri-ciri tanaman, sifat-sifat sel tanaman 4. Kemampuan sel untuk tumbuh dan berkembang 5. Struktur dan macam organel Penyajian materi ajar Tanya jawab C2 Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa melaksanakan tata tertib mata kuliah dan menjelaskan sel baik ciri maupun sifatnya ditinjau dari aspek biologi dan fisiologinya Mahasiswa melaksanakan tata tertib mata kuliah serta mampu menjelaskan sel dan fungsinya, ciri-ciri tanaman, sifat-sifat sel tanaman, kemampuan sel untuk tumbuh dan berkembang, serta struktur dan macam organel B1, B4 Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami mekanisme pembelahan dan perbanyakan sel 1. Siklus dan proses atau tahapan mitosis 2. Mitosis normal dan lainnya 3. Endomitosis Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis mekanisme pembelahan dan - 14.3% nilai perbanyakan sel UTS B1 Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami pembelahan, perkembangan sel menjadi individu dewasa 1. Tahapan perkembangan sel dari bagian yang membelah 2. Pertumbuhan dan berkembangnya sel menjadi dewasa membentuk individu baru Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis memahami pembelahan, - 14.3% nilai perkembangan sel menjadi UTS individu dewasa 4 B1, B4 Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami proses proliferasi dan diferensiasi sel, dan jaringan tanaman 1. Proses proliferasi sel tanaman 2. Diferensiasi sel 3. Pembentukan jaringan tanaman Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis proses proliferasi dan - 14.3% nilai diferensiasi sel, dan jaringan UTS tanaman 5 B1 Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami struktur dan 1. Struktur dan fungsi nukleus 2. Struktur dan fungsi kromosom Penyajian materi ajar Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis struktur dan fungsi nucleus, - 14.3% nilai 1 2 3 Kriteria Penilaian (Indikator) 6 6 7 8 B1 B1, B4 B1 9 A2, B1 10 A2, B1 fungsi nukleus yang memiliki khromosom dan gen sebagai pembawa sifat 3. Struktur dan fungsi inti sel (nucleus) Tanya Jawab struktur dan fungsi kromosom Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami struktur dan fungsi nukleus yang memiliki khromosom dan gen sebagai pembawa sifat 1. Struktur dan fungsi nukleus 2. Struktur dan fungsi kromosom 3. Struktur dan fungsi inti sel (nucleus) 4. Struktur dan fungsi DNA/RNA Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis struktur dan fungsi nucleus, - 14.3% nilai struktur dan fungsi kromosom , UTS serta DNA/RNA Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami struktur dan fungsi organel mitokondria serta regulasinya 1. Struktur dan fungsi mitokondria 2. Regulasi mitokondria Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis memahami struktur dan fungsi - 14.3% nilai organel mitokondria serta UTS regulasinya Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami struktur dan fungsi membrane sel 1. Struktur membrane 2. Komponen penyusun membrane 3. Fungsi membran Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis struktur, fungsi membrane sel - 14.3% nilai tanaman serta komponen UTS penyusunnya. Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami struktur dan fungsi kloroplas 1. Proses sintesis kloroplas 2. Struktur kloroplas Fungsi kloroplas 1. Ragam kloroplas pada sel penjaga, sel palisade dan sel spong Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis proses sintesis kloroplas, - 12.5% nilai struktur dan fungsi kloroplas, UAS serta ragam kloroplas pada sel penjaga, sel palisade, dan sel spong Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami membran pada 1. Jenis dan macam membran pada kloroplas 2. Fungsi membran kloroplas Penyajian materi ajar Tanya Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis membran kloroplas dan - 12.5% nilai fungsinya serta peran beberapa UAS UTS 7 11 12 13 14 kloroplas dan fungsinya serta peran beberapa enzim penting 3. Peran beberapa enzim penting (PS I, PS II, Cytochrome, dan ATPase) A2, B1 Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami membran pada kloroplas dan fungsinya serta peran beberapa enzim penting 4. Jenis dan macam membran pada kloroplas 5. Fungsi membran kloroplas 6. Peran beberapa enzim penting (PS I, PS II, Cytochrome, dan ATPase) Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis membran kloroplas dan - 12.5% nilai fungsinya serta peran beberapa UAS enzim penting (PS I, PS II, Cytochrome, dan ATPase) A2, B1 Setelah mengikuti kuliah ini mahasiswa mampu memahami hubungan kloroplas dengan light signal transduction 1. Spectrum cahaya dan PAR 2. Hubungan cahaya dengan fungsi kloroplas Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan spektrum cahaya dan PAR, serta hubungan cahaya dengan fungsi kloroplas Mahasiswa memahami strategi signal kimia pada sel-sel tanaman 1. 2. 3. 4. Strategi signal kimia pada sel Reseptor, Tranduksi signal, second messenger, (channellinked, G protein linked, catalytic); Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis strategi signal kimia pada sel- 12.5% nilai sel tanaman UAS Mahasiswa memahami strategi signal kimia pada sel-sel tanaman 1. second messenger, (channellinked, G protein linked, catalytic); 2. peran e AMP, Ca2t, IP3, diasit gliserol 3. Protein kinase-e P1P2, dalam amplikasi sinyal hormon, signal dan proses dalam sel. Penyajian materi ajar Tanya Jawab Mahasiswa mampu menjelaskan - Ujian tertulis strategi signal kimia pada sel- 12.5% nilai sel tanaman UAS B1 B1 Jawab enzim penting (PS I, PS II, Cytochrome, dan ATPase) 8 9 III. RENCANA PEMBELAJARAN SATU SEMESTER - PRAKTIKUM Jumlah pertemuan 1 LO PS yang didukung Kemampuan Akhir yang Diharapkan Bahan Kajian (Materi Ajar) Setelah mengikuti praktikum ini mahasiswa melaksanakan tata tertib praktikum Menjelaskan kontrak dan tata tertib praktikum Bentuk Pembelajaran Penyajian materi ajar Tanya Jawab Kriteria Penilaian (Indikator) Mahasiswa melaksanakan tata tertib praktikum Bentuk dan Bobot Penilaian - Observasi dalam pelaksanaan praktikum - xx % nilai praktikum 2 5 4 Mampu menyiapkan dan menjelaskan bahan tanaman (in vitro) dan in vivo, berkeping satu (monokotil) dan berkeping dua (dikotil) Mampu melaksanakan percobaan untuk mempelajari struktur dan anatomi sel pada bagian daun, batang, dan akar Berbagai jenis tanaman monokotil dan dikotil Kajian pustaka mandiri Presentasi paper Kesipan bahan tanaman Persiapan Observasi xx % nilai akhir m.k. Perbedaan struktur dan anatomi sel pada bagian tanaman yang berbeda Perbedaan anatomi tanaman asal in vitro dan in vivo Keaktifan mahasiswa dan kebenaran dalam melaksanakan kegiatan Kemampuan dalam mengolah data dan menuliskan laporan Kemampuan dalam presentasi Aktivitas di tempat praktikum Laporan hasil percobaan Presentasi 7.5 % nilai akhir m.k. Mampu memahami persiapan prparasi preparat resin, pemotongan, staining, dan menoperasikan TEM Demo persiapan bahan dan reagen Demo penyiapan sampel kapsul resin Demo pemotongan dan staining Demo mengoperasikan Transmision Electron Microscup Melakukan percobaan Mengamati hasil percobaan Membuat laporan hasil percobaan Menyajikan hasil percobaan Melakukan percobaan di Lab Eijkman Jakarta Membuat laporan hasil percobaan Keaktifan mahasiswa dan kebenaran dalam melaksanakan kegiatan Kemampuan dalam mengolah data dan menuliskan laporan Kemampuan dalam presentasi Aktivitas di tempat praktikum Laporan hasil percobaan xx % nilai akhir m.k. 10 IV. STRATEGI PERKULIAHAN Strategi instruksional yang digunakan dalam proses pembelajaran adalah dengan metode ceramah dan didukung dengan pendekatan student centered learning berupa diskusi. V. STRATEGI PRAKTIKUM Strategi instruksional yang digunakan dalam proses praktikum adalah dengan demonstrasi metode, praktek langsung oleh peserta praktikum, dan didukung dengan pendekatan student centered learning berupa diskusi paper-paper terkait (review paper) terkini. VI. SUMBER BACAAN 1. Albert. 1989. Moleculer Biology of the cell Garland Publ. New York 2. Bonner, J and J.E. Vainer. 1976. Plant Biochemistry. Academic Press. New York. 925p. 3. De Robertis; W.W. Nowinski and F.A. Saez. 1966. Cell Biology. W.B. Saunders Co. Philadelphia. 446p. 4. Taiz, L and E. Zenger. 2002. Plant Physiology. Sinaver Publ. California. 5. Wetson, J.P; N.H. Hopkins; J.W. Roberts; J.A. Steitz and A.M. Werner. 1987. Molecular Biology of the Gene. The Benjamin/Commings Publ. Co. 744p. 6. The Cell 7. Plant Cell Biology 8. Jurnal-jurnal internasional terkini VII. KEMUNGKINAN TUMPANG TINDIH MATA KULIAH -VIII. PENILAIAN Penilaian hasil belajar dilaksanakan dengan Ujian Tengah Semester, Ujian Akhir Semester, praktikum. Proporsi penilaian terhadap nilai akhir adalah: UTS : 35 %; UAS : 35 %; Praktikum : 30 % Kriteria perolehan nilai akhir ditentukan sebagai berikut: Kisaran nilai X > 80 75.0 < X < 80 70.0 < X < 75 65.0 < X < 70 55.0 < X < 65 45.0 < X < 55 Huruf mutu A AB B BC C D Nilai 4.00 3.50 3.00 2.50 2.00 1.00 11 KONTRAK PERKULIAHAN MATA KULIAH : Biologi dan Fisiologi Sel KODE M.K./sks : AGH 637 / 3 (3-0) SEMESTER : Genap MATA KULIAH PRASYARAT : - PENGAJAR : Dr Nurul Khumaida dan Tim Pengajar HARI PERTEMUAN : Kamis DESKRIPSI SINGKAT : Kuliah ini membahas secara konprehensif mengenai sifat biologi dan fisiologi dari sel tanaman. Materi yang dibahas meliputi organel sel (nukleus, mitokondria, dan kloroplas), pembelahan dan perbanyakan sel, proliferasi dan deferensiasi sel, sel sebagai bagian jaringan, evolusi sel, mumbran, sito skeleton, dan signal pada sel. CAPAIAN PEMBELAJARAN MATA KULIAH : Setelah mengikuti kuliah ini dengan baik mahasiswa diharapkan akan memiliki pengetahuan dan mampu menjelaskan mengenai ciri, sifat, struktur dan fungsi, pertumbuhan dan perkembangan sel berdasarkan organel yang dimilikinya. STRATEGI PERKULIAHAN Strategi instruksional yang digunakan dalam proses pembelajaran adalah dengan metode ceramah dan didukung dengan pendekatan student centered learning berupa diskusi. STRATEGI PRAKTIKUM SUMBER BACAAN 1. Albert. 1989. Moleculer Biology of the cell Garland Publ. New York 2. Bonner, J and J.E. Vainer. 1976. Plant Biochemistry. Academic Press. New York. 925p. 3. De Robertis; W.W. Nowinski and F.A. Saez. 1966. Cell Biology. W.B. Saunders Co. Philadelphia. 446p. 4. Taiz, L and E. Zenger. 2002. Plant Physiology. Sinaver Publ. California. 5. Wetson, J.P; N.H. Hopkins; J.W. Roberts; J.A. Steitz and A.M. Werner. 1987. Molecular Biology of the Gene. The Benjamin/Commings Publ. Co. 744p. 6. The Cell 7. Plant Cell Biology 8. Jurnal-jurnal internasional terkini TATA TERTIB PERKULIAHAN DAN PRAKTIKUM 12 Peraturan Rektor IPB No 09/I3/PP/2010 tentang Tata tertib Kehidupan Kampus bagi mahasiswa IPB Peserta perkuliahan dianggap sah apabila tercantum dalam daftar peserta perkuliahan yang diterbitkan oleh Fakultas/Program Studi. Semua mahasiswa diwajibkan mengikuti kuliah minimum 80 persen dari seluruh jam tatap muka yang terjadwal pada semester yang bersangkutan. Semua mahasiswa diwajibkan mengikuti seluruh jam praktikum yang terjadwal pada semester yang bersangkutan. Mahasiswa yang berhalangan mengikuti perkuliahan karena alasan yang sangat penting harus menyampaikan pemberitahuan tertulis kepada dosen mata kuliah yang bersangkutan selambatlambatnya pada hari perkuliahan berikutnya, dan selanjutnya meminta surat izin tidak mengikuti perkuliahan kepada Sekolah Pascasarjana dengan melampirkan keterangan atau bukti pendukung. Apabila ketentuan di atas tidak dipenuhi maka mahasiswa dianggap lalai mengikuti perkuliahan. Mahasiswa diharuskan hadir di ruang perkuliahan sebelum kuliah dimulai. Mahasiswa yang datang terlambat sesudah perkuliahan dimulai wajib meminta izin kepada dosen pengajar sebelum masuk ke ruang perkuliahan. Mahasiswa yang datang lebih dari 15 menit sesudah perkuliahan dimulai tidak diperkenankan masuk ke ruang perkuliahan dan dianggap lalai mengikuti perkuliahan pada jam perkuliahan yang bersangkutan. Mahasiswa yang hadir dalam perkuliahan wajib mengisi daftar hadir perkuliahan. Daftar hadir perkuliahan tersebut dibuat rangkap dua, satu untuk dosen dan satu untuk Subbagian Pendidikan atau Pelaksana Administrasi Pendidikan Fakultas. Mahasiswa yang lalai tidak mengisi daftar hadir dianggap lalai mengikuti perkuliahan pada jam perkuliahan yang bersangkutan. Selama mengikuti perkuliahan mahasiswa diwajibkan berpakaian rapi dan bersepatu sesuai dengan norma-norma kesopanan, kepantasan, dan ketentuan yang berlaku. Pada ruang tertentu memakai pakaian, alas kaki, dan atribut lain sesuai dengan peruntukannya (SK Rektor No: 119/K13.12.1/KM/1999). Selama mengikuti perkuliahan mahasiswa dilarang melakukan aktivitas yang dapat menggangu jalannya perkuliahan dan ketenangan mahasiswa lain. Dosen memberi peringatan kepada mahasiswa yang menggangu perkuliahan dan berhak mengeluarkan mahasiswa yang bersangkutan dari ruang perkuliahan apabila mahasiswa tetap mengganggu jalannya perkuliahan. Mahasiswa yang karena keperluan yang sangat mendesak terpaksa meninggalkan tempat perkuliahan pada waktu perkuliahan berlangsung wajib meminta izin kepada dosen. PENILAIAN Penilaian hasil belajar dilaksanakan dengan Ujian Tengah Semester, Ujian Akhir Semester, praktikum. Proporsi penilaian terhadap nilai akhir adalah: UTS : 35 %; UAS : 35 %; Praktikum : 30 % Kriteria perolehan nilai akhir ditentukan sebagai berikut: Kisaran nilai X > 80 75.0 < X < 80 Huruf mutu A AB Nilai 4.00 3.50 13 70.0 < X < 75 65.0 < X < 70 55.0 < X < 65 45.0 < X < 55 B BC C D 3.00 2.50 2.00 1.00 JADWAL KULIAH JADWAL PRAKTIKUM Demikian kontrak perkuliahan ini dibuat, agar disetujui dan ditaati oleh semua pihak. Bogor, Februari 2014 Menyetujui: Mahasiswa Koordinator MK, (……………………………..…..) NIM. ( .......................................................) NIP. Ketua PS (.................................................) NIP 14