DISKUSI BIOKIMIA DIMULAI DENGAN SEL KARENA SEL MERUPAKAN KERANGKA ALAMIAH DARI HAMPIR SEMUA REAKSI BIOKIMIA PERBEDAAN UTAMA ANTARA BIOKIMIA DAN KIMIA ADALAH BAHWA REAKSI BIOKIMIA BERLANGSUNG DI DALAM BATASAN YANG DIBERIKAN OLEH UKURAN SEL DAN RUANG-RUANG DI DALAMNYA JUGA OLEH SIFAT FISIK DAN KIMIA YG SEJALAN DENGAN KEHIDUPAN SEL REAKSI KIMIA BIASA TERJADI DALAM TABUNGTABUNG REAKSI YG TERBUAT DARI BAHAN NONBIOLOGIK, MEMBUTUHKAN SUHU DAN TEKANAN YANG TINGGI, PEREAKSI KUAT ATAU PENGGUNAAN ENERGI LISTRIK. SEMUA SEL MENGANDUNG BEBERAPA STRUKTUR YG SERUPA Sel merupakan unit struktural dan fungsional organisme hidup. Organisme terkecil terdiri dari sel tunggal ex Amuba suatu makhluk air tawar ukurannya 300 µm kira-kira sebesar titik, yang lain stafilokokus suatu sel bulat dgn diameter kira-kira 1 µm; tubuh manusia terdiri banyak sel mengandung sedikitnya 6 x 1013 sel yg berbeda-beda. Berbagai jenis sel menunjukkan kesamaan ciri-ciri struktur dasar. Salah satu ciri/sifat sel yang universal/umum adalah adanya membran pembatas di luar. Setiap sel dikelilingi oleh membran tipis yang membuatnya terpisah dr lingkungannya dan sampai tingkat tertentu mampu mencukupi diri sendiri. Membran sel disebut juga dgn membran plasma atau membran sitoplasma bersifat permeabel-selektif. Membran berfungsi mengangkut nutrien dan garam yg dibutuhkan ke dalam sel, dan produk buangan dari sel ke luar tetapi tidak permeabel terhadap senyawa-senyawa yg ada di lingkungan sel yg tidak dibutuhkan. Membran sel sedemikian tipisnya sehingga hanya dapat divisualisasi dg pembesaran tinggi menggunakan mikroskop elektron. Setiap membran tebalnya sekitar 10 nm. Terdiri atas 3 lapisan yg tampak sebagai dua garis gelap dan dipisahkan oleh ruang yang jernih. Pada semua sel susunan plasma membran umumnya serupa terdiri dari dua lapis molekul lipid yg mengandung protein khusus, beberapa diantaranya berupa enzim sementara yg lain dpt mengikat nutrien dari lingkungan dan mengangkutnya ke dalam sel. Analisis kimiawi memperlihatkan bahwa membran mengandung kira-kira 50% lipid dan 50% protein. Lipid terutama berupa fosfolipid dan kolesterol. Fosfolipid adalah molekul amfifilik artinya setiap molekul mengandung kepala hidrofilik dan ekor hidrofobik. Protein yg ada pada membran ada dua yaitu protein ekstrinsik dan protein intrinsik. Protein ekstrinsik merupakan protein yg bersifat hidrofilik dan terdapat di permukaan dalam dan permukaan luar membran sel. Di dalam tiap sel terdapat sitoplasma yaitu tempat berlangsungnya hampir semua reaksi enzimatis dari metabolisme sel. Sel menggunakan energi kimia untuk membangun dan mempertahankan strukturnya serta untuk melakukan pergerakan sel atau berkontraksi. Di dalam sitoplasma sel jg terdapat ribosom suatu granula kecil berdiameter 18-22 nm yg berfungsi mensintesa protein Semua sel hidup dilengkapi dgn inti sel (nukleus) atau suatu badan serupa inti tempat terjadinya replikasi senyawa genetik dan penyimpanan dalam bentuk asam deoksiribonukleat (DNA=deoxyribonucleic acid). SEL BERUKURAN AMAT KECIL Sel mempunyai ciri lain yang penting yaitu ukurannya relatif kecil Dalam laboratorium reaksi kimia biasa berlangsung dlm tabung reaksi dgn volume berukuran mililiter atau liter, isi tabung harus diaduk untuk mencampurkan pereaksi secara merata. Dalam sel hidup reaksi biokimia terjadi dalam suatu ruang dengan volume mikroskopik, ex, volume suatu sel tunggal bakteri Escherichia coli kira-kira hanya 2 x 10-12 mililiter (mL) Unit-unit ukuran penting yang sekarang dipergunakan dalam menyatakan ukuran sel yakni : Nanometer (nm) = 10-9 m = 10-6mm = 10-3 µm. dan mikrometer (µm)=10-6 m = 10-3 mm = 1000 nm Ukuran yang lain yaitu angstrom (A) = 0,1 nanometer; mikron (µ) = 1 mikrometer (µm); 1 milimikron (mµ) = 1 nanometer. Untuk ukuran-ukuran ini sekarang sudah tidak banyak digunakan tetapi tetap perlu untuk dipahami. Sel bakteri berukuran krng lebih 2 mikrometer, pada hewan tingkat tinggi 20-30 DUA KELAS UTAMA SEL : PROKARYOTIS DAN EUKARYOTIS SEL TERKECIL YG PALING SEDERHANA YAITU SEL YANG PALING TUA DIKENAL SEBAGAI PROKARYOTIS GOLONGAN INI TERDIRI DARI BERBAGAI KELAS MIKROORGANISME SEL TUNGGAL YG BIASANYA DISEBUT BAKTERI. SEL INI MERUPAKAN MAKHLUK YG PERTAMATAMA MUNCUL DLM EVOLUSI BIOLOG,I FOSILNYA MASIH BERBENTUK SEL YG KITA KENAL SEKARANG BERUMUR LEBIH DARI TIGA RIBU JUTA TAHUN DITEMUKAN PADA BATU TULIS KUNO DI AFRIKA DAN DI AUSTRALIA SEL EUKARYOTIS MUNCUL PADA RIBUAN JUTA TAHUN SETELAH PROKARYOTIS, BERUKURAN LEBIH BESAR, LEBIH KOMPLEKS DAN MEMPERLIHATKAN RAGAM YG LEBIH LUAS (JENIS SEL YG DITEMUKAN PD SEMUA HEWA, ISTILAH PROKARYOTIS DAN EUKARYOTIS DITURUNKAN DARI BAHASA YUNANI KARYON YG BERARTI KACANG, BIJI, ATAU INTI. PROKARYOTIS BERARTI PRA INTI DAN EUKARIOTIS BERARTI INTI YG TERBENTUK SECARA BAIK PADA PROKARYOTIS SENYAWA GENETIK DITEMPATKAN DALAM SUATU BADAN INTI ATAU BADAN SERUPA INTI YG AGAK ACAK DAN DIKELILINGI OLEH MEMBRAN EUKARYOTIS SEBALIKNYA DILENGKAPI DGN INTI SEL YG AMAT KOMPLEKS DAN TELAH JAUH BERKEMBANG DIKELILINGI SELUBUNG INTI YG TERDIRI DUA MEMBRAN. PROKAROTIS TERDIRI DARI KIRA-KIRA 3000 SPESIES BAKTERI TERMASUK ORGANISME YG SERING DISEBUT GANGGANG HIJAU BIRU (BLUE GREEN ALGAE). Ganggang hijau biru merupakan suatu keluarga khusus bakteri dgn nama modernnya adalah sianobakteri (cyano= biru) GOLONGAN INI MELAKUKAN SISTEM FOTOSINTESA YG DAPAT MENGHASILKAN OKSIGEN MENYERUPAI SISTEM PADA TUMBUHAN HIJAU TINGKAT TINGGI. TERDAPAT KIRA-KIRA 20 FAMILI PROKARYOTIS YG DIBEDAKAN ATAU DIBERI NAMA MENURUT BENTUK, KAPASITAS GERAK, KARAKTERISTIK PEWARNAAN, ZAT MAKANAN YG DISUKAI ATAU PRODUK YG DIHASILKAN. CONTOH : BASILUS YG BERBENTUK SEPERTI BATANG KOKUS BAKTERI YG BERBENTUK BULAT, KDNG BERPASANGAN ATAU DIPLOCOCCUS BERGEROMBOL (STAPHYLOCOCCUS) ATAU RANGKAIAN (STREPTOCOCCUS) BENTUK SPIRAL BIASANYA SANGAT PANJANG SAMPAI 500 MIKROMETER SEL TUMBUHAN SEL HEWAN TUGAS BIOKIMIA BUAT POWER POINT TENTANG ORGAN SEL DAN FUNGSI MASING MASING ORGAN SEL TERSEBUT. KIRIMKAN TUGAS LEWAT EMAIL PALING LAMBAT tgl 22 Oktober 2013 EMAIL : [email protected]