1.1 (Nilai 10) Penentuan Region Asal Virus

KEMENTERIAN PENDIDIKAN DAN KEBUDAYAAN
DIREKTORAT JENDERAL PENDIDIKAN MENENGAH
DIREKTORAT PEMBINAAN SEKOLAH MENENGAH ATAS
Test Seleksi Calon Peserta
International Biology Olympiad (IBO) 2016
18–23 Mei 2015
Yogyakarta, DIY
LEMBAR JAWAB
TES PRAKTIKUM
MIKROBIOLOGI DAN BIOLOGI MOLEKULER
Total Point: 100
Waktu: 90 Menit
www.tobi.or.id
Nama
: ………………………………………………
ID OSN
: ………………………………………………
Asal sekolah : ………………………………………………
Olimiade Sains Nasional (OSN) 2015
Bid. Biologi
Yogyakarta, 18-23 Mei 2015
LEMBAR JAWABAN PART A
1. (Nilai 36 @18)Gambarkan hasil pengamatan Anda menggunakan pena berwarna yang telah
disediakan, beri tanda panah dan keterangan di gambar yang menunjukkan kehadiran
bakteri.
(Nilai 18 @ 15+3) Pewarnaan Sederhana
Gambar
Deskripsi
Perbesaran : 1000x
Morfologi
bakteri
(Nilai
bacil/coccus/spiral/coma*
3):
*lingkarilah salah satu morfologi bakteri yang anda pilih
Penilaian Asisten (Preparat dan Gambar)*:
1
2
3
*Diisi oleh asisten
(Nilai 18 @ 15+3)Pewarnaan Negatif
Gambar
Deskripsi
Perbesaran : 1000x
Morfologi
bakteri
(Nilai
bacil/coccus/spiral/coma*
3):
*lingkarilah salah satu morfologi bakteri yang anda pilih
Penilaian Asisten (Preparat dan Gambar)*:
1
2
3
2
Nama
: ………………………………………………
ID OSN
: ………………………………………………
Asal sekolah : ………………………………………………
Olimiade Sains Nasional (OSN) 2015
Bid. Biologi
Yogyakarta, 18-23 Mei 2015
*Diisi oleh asisten
2. (Nilai 2)Apakah tipe Gram dari bakteri yang Anda amati? Beri tanda “X” pada jawaban yang
anda anggap benar
Gram Positif
Gram Negatif
Tidak dapat ditentukan
3. (Nilai 2)Protein dalam kondisi fisiologis umumnya bermuatan negatif.
Apakah sifat keasaman zat warna yang digunakan para praktikum ini?
Methylene Blue
Tinta Cina
Asam/Basa
Asam/Basa
*lingkarilah salah satu jenis keasaman yang anda pilih
3
Nama
: ………………………………………………
ID OSN
: ………………………………………………
Asal sekolah : ………………………………………………
Olimiade Sains Nasional (OSN) 2015
Bid. Biologi
Yogyakarta, 18-23 Mei 2015
LEMBAR JAWABAN PART B
1. (Nilai 12) Data jumlah sel selama kultivasi*
Waktu
(Hari)
Jumlah sel per
plate
1
2
Jumlah sel/mL
3
1
2
3
Rata-rata
jumlah sel/mL
Log jumlah
sel/mL
(Nilai
[email protected])**
0
1
2
3
4
5
6
7
*Penilaian hanya dilakukan pada nilai log jumlah sel/mL yang anda peroleh. Kolom lain diberikan
hanya untuk membantu anda menghitung log jumlah sel/mL
**bulatkan nilai log jumlah sel/mL hingga tiga angka desimal
2. (Nilai 3) Kurva tumbuh bakteri (gunakan kotak dibawah ini untuk membuat coretan/sketsa
kurva tumbuh bakteri)
4
Nama
: ………………………………………………
ID OSN
: ………………………………………………
Asal sekolah : ………………………………………………
Olimiade Sains Nasional (OSN) 2015
Bid. Biologi
Yogyakarta, 18-23 Mei 2015
3. (Nilai 5 ; @ 1) Tentukanlah mana pernyataan di bawah ini yang “Benar (B)” atau “Salah (S)”
No Pernyataan
Jawaban (B/S)
1
Isolat bakteri reservoar menggunakan semua substrat sumber
karbon di medium dalam waktu yang bersamaan
2
Kecepata pertumbuhan bakteri tertinggi terjadi dari hari ke-1
hingga hari ke-2
3
Kurva tumbuh bakteri menunjukkan kehadiran fase stasioner
selama kultivasi
4
Pembentukan misel/droplet minyak di medium kemungkinan
dikarenakan bakteri menghasilkan senyawa surfaktan (semacam
detergen) yang dapat meningkatkan kelarutan minyak tersebut di
air
5
Diamati terjadinya fase lag pertumbuhan bakteri pada hari ke-0
hingga hari ke-1
5
Nama
: ………………………………………………
ID OSN
: ………………………………………………
Asal sekolah : ………………………………………………
Olimiade Sains Nasional (OSN) 2015
Bid. Biologi
Yogyakarta, 18-23 Mei 2015
LEMBAR JAWABAN PART C
1.1 (Nilai 10) Penentuan Region Asal Virus dengan Analisis Konsensus
1.1.1 (Nilai 2.5) Sekuens Konsensus
Kodon
Kodon
Kodon
Kodon
Kodon
Kodon
Kodon
1
2
3
4
5
6
7
Kodon
11
Kodon
12
Kodon
13
Kodon
14
1.1.2 (Nilai 2.5) Proporsi Sekuens Konsensus
Strain
Indonesia
Hongkong
Taiwan
Vietnam
Thailand
1.1.3 (Nilai 2) Metode Penentuan
i
1.1.4 (Nilai 3)Negara Asal Virus
Strain
Indonesia
Hongkong
Taiwan
Vietnam
Thailand
Kodon
15
Kodon
16
Kodon
17
Kodon
8
Kodon
9
Kodon
10
Kodon
18
Kodon
19
Kodon
20
Proporsi (%)
ii
Kemungkinan Asal Virus (X)
6
Nama
: ………………………………………………
ID OSN
: ………………………………………………
Asal sekolah : ………………………………………………
Olimiade Sains Nasional (OSN) 2015
Bid. Biologi
Yogyakarta, 18-23 Mei 2015
1.2 (30 Poin) Analisis Persebaran Virus (Filogeografi)
1.2.1 Pairwise Distance (Lengkapi tabel dalam bentuk desimal dua angka di belakang koma, Nilai
10 @ 1)
Indonesia
Hongkong
Taiwan
Vietnam
Thailand
Indonesia
Hongkong
Taiwan
Vietnam
Thailand
1
1
1
1
1
1.2.2 Kekerabatan Antar Strain (Pilih salah satu topologi yang tepat, kemudian lengkapi dengan
strain yang bersesuaian, Nilai 5 @ 1)
Topologi 1
Topologi 2
7
Nama
: ………………………………………………
ID OSN
: ………………………………………………
Asal sekolah : ………………………………………………
Olimiade Sains Nasional (OSN) 2015
Bid. Biologi
Yogyakarta, 18-23 Mei 2015
Topologi 3
1.2.3 Analisis Arah Persebaran (Peta pada halaman terakhir, Nilai 10)
Perhatikan dengan tepat cara penentuan persebaran, tandai sumber dengan tanda bulat
(●), kemudian gunakan tanda panah ( ) untuk mengindikasikan arah persebaran, seperti
contoh gambar dibawah
1.2.4 Kesimpulan (Berikan tanda X pada jawaban yang tepat, Nilai 5 @ 1)
Pernyataan Benar
Salah
I
II
III
IV
V
8
Nama
: ………………………………………………
ID OSN
: ………………………………………………
Asal sekolah : ………………………………………………
Olimiade Sains Nasional (OSN) 2015
Bid. Biologi
Yogyakarta, 18-23 Mei 2015
Peta Persebaran Virus Influenza A Berdasarkan Urutan
Hemagglutinin Parsial
9