Definisi Biokimia, Sel dan fungsi organel

Definisi Biokimia, Sel dan fungsi
organel
Muhammad Fakhri, S.Pi, MP, M.Sc
Tim Pengajar Biokimia
Budidaya Perairan
FPIK UB
BIOKIMIA ????
•
•
BIOKIMIA: suatu ilmu yang mempelajari tentang kumpulan molekul/senyawa pada jasad
hidup yang saling berinteraksi untuk menampakkan ciri hidup.
CIRI HIDUP :
1. Sangat terorganisir, kompleks, tiap-tiap komponen
berfungsi spesifik
2. Mampu mengekstrak energi dari lingkungan
sekelilingnya
3. Mampu mereplikasi diri dengan tepat dan terencana.
1. Organisasi Molekuler Sel Hidup
JASAD HIDUP
ORGAN
SEL
Ikatan
Kovalen
ORGANEL
Ikatan
Non- kovalen
SUPRAMOLEKUL
Makromolekul
Asam
Nukleat
Protein
Polisakarida
Lipida
Ikatan
Kovalen
Satuan
Penyusun
MonoNukleotida
Asam
Amino
Gula
Sederhana
SENYAWA ANTARA
SENYAWA DASAR
CO2, H2O, N2, PO4, Na dll
As.Lemak/
Gliserol
RUANG LINGKUP
BIOKIMIA AKUAKULTUR
•
•
GROWTH
AQUACULTURE
CAUSE OF VARIATION GROWTH:
– FISH:
•
•
•
•
Species
Sexes
Health
History (age, weight, body composition)
– ENVIRONMENT
• Husbandry
Stress
– Stocking density
Fasility
system,
Fertlizer
– Handling
Digestives
enzym
– Feeding Methods
• Water quality
– Temperature
– Oxygen
– Metabolites
– FEED
•
•
•
•
Feed Composition
Feed Formulation (ingredients)
Feeding Level
Feed Type (physical aspect)
PRODUCTION
Peran biokimia dalam akuakultur
 Pengetahuan tentang ilmu biokimia dapat diaplikasikan
dalam memahami pertumbuhan, perkembangan, dan
reproduksi ikan atau hewan akuatik lainnya.
 Pertumbuhan, perkembangan, dan reproduksi ikan atau
hewan akuatik lainnya sangat ditentukan oleh adanya
keseimbangan asupan nutrisi pakan dan kebutuhan
metabolisme tubuh.
 Asupan nutrisi pakan yg kurang berdampak pada tidak
terpenuhinya kebutuhan metabolisme tubuh, sebaliknya
asupan nutrisi pakan yg berlebih menyebabkan
ketersedian nutrien melebihi kebutuhan metabolisme
sehingga tidak efisien.
Sel ????
• Kumpulan materi paling
sederhana yang dapat
hidup dan merupakan unit
penyusun semua makhluk
hidup
• Organisme hidup yang
paling kecil adalah sel
tunggal,
• Sel adalah unit fungsional
dari organisme multiselular
Jaringan ????
sekumpulan sel yang
memiliki bentuk dan fungsi
yang sama
Perbedaan sel tumbuhan, hewan dan bakteri
Source: http://www.biologi-sel.com
Struktur Sel Hewan
(www.uvm.edu, 2011)
Struktur Sel Tumbuhan
(www.micro.magnet.fsu.edu, 2011)
Bagian-bagian sel dan fungsi
 Membran sel
• Sistem membran berbentuk
kantong pipih yg bertumpuk
• Konstruksi : protein – lipid
• Fungsi: mengatur transportasi
zat dari dan ke dalam sel,
memisahkan bagian dalam sel
dari lingkungan ekstraselular &
membatasi kompartemen
internal yg terdiri dari inti sel
dan organel-organel sitoplasmik
• Zat-zat yang bisa melalui
membran: air, oksigen, CO2,
asam nukleat, dan vitamin
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Sitoplasma
• Bagian sel yang terbungkus membran sel
(bagian non-nukleus)
• Pada sitoplasma terdapat sitoskeleton,
berbagai organel dan sitosol.
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Inti sel
• tempat terjadinya replikasi
senyawa genetik (DNA).
• tempat sintesa NAD
(nicotinamide adenin
dinucleotide).
• terdapat enzim yang akan
mengkatabolisasi glikogen
menjadi glukosa, membentuk
piruvat dan senyawa-senyawa
lainnya.
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Cytosol atau plasma sel
• larutan media yang terletak di dalam sel
di antara organel-organel.
• merupakan gudang karbohidrat, yaitu
glikogen pada hewan dan pati pada
tanaman.
• terdapat enzim yang akan
mengkatabolisasi glikogen menjadi
glukosa, membentuk piruvat dan
senyawa-senyawa lainnya.
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Lisosom
• mensekresi berbagai jenis enzim pencerna,
seperti enzim yang akan menghidrolisa
protein, polisakarida dan lipid sel
• menghancurkan organel yg rusak
 Ribosom
• mengandung asam ribonukleat yang
berfungsi mensintesa protein sel
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Mitokondria
• merupakan pabrik energi sel (sintesa ATP:
Adenosin Tri Phosphat).
• mengandung berbagai enzim yang akan
mengkatalisis zat makanan organik oleh
molekul oksigen untuk menghasilkan
karbondioksida dan air serta energi kimia.
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Plastida
3 macam :
• Leukoplas : tempat penyimpan; elaioplas :
minyak, amiloplas : amilum, aleuroplas : protein
• Kromoplas : plastida, pigmennya bukan utk
fotosintesis (xantofil & karoten)
• Kloroplas: plastida, pigmennya utk fotosintesis
(Klorofil)
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Chloroplasts
• tempat berlangsungnya proses fotosintesis
(thylacoid vesicle) dan fiksasi
karbondioksida, CO2 (stroma)
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Retikulum endoplasmik (RE)
• Retikulum endoplasmik kasar
Permukaan membran dipenuhi oleh ribosom
yang terlibat dalam biosintesa protein.
• Retikulum endoplasmik halus
Tidak dilengkapi ribosom, berperan di dalam
biosintesa lipid dan tempat menyimpan enzim
yang belum aktif seperti zymogen (prekusor
enzim).
Bagian-bagian sel dan fungsi (cont.)
 Golgi komplek
• Menerima protein hasil sintesa dari RE
untuk diteruskan ke membran plasma atau
ke organel lain.
 Peroksisome
• menghasilkan enzim yang memecah asam
lemak dan asam amino.
QUOTE FOR TODAY :
“SESUATU YANG BESAR DIMULAI DARI
SESUATU YANG KECIL “
-Andrew Wood-
Terima Kasih