SEL: STRUKTUR DAN FUNGSI ENDRIKA WIDYASTUTI MATA KULIAH BIOLOGI FAKULTAS TEKNOLOGI PERTANIAN UB 2012 CELLULAR LEVEL OF ORGANIZATION TEORI SEL UKURAN SEL SEL PROKARIOT SEL EUKARIOT ORGANEL SEL TANAMAN DAN HEWAN BAGIAN DAN FUNGSI SEL Cellular Level of Organization TEORI SEL UKURAN SEL TEORI SEL Theodor Schwann (1810-1883) Sel adalah bagian dari organisme Rudolf Virchow (1821-1902) Seorang ahli fisiologi Menyatakan bahwa sel membelah menjadi dua sel Setiap sel berasal dari sel yang sudah ada TEORI SEL 1. Semua organisme tersusun atas satu atau lebih sel German botanist Matthais Schleiden 1838 German zoologist Theodor Schwann 1839 2. Sel adalah unit terkecil yang memiliki semua persyaratan hidup German physician Rudolph Virchow 1850 3. Keberlangsungan kehidupan secara langsung berasal dari pertumbuhan dan pembelahan sel UKURAN SEL Copyright © The McGraw-Hill Companies, Inc. Permission required for reproduction or display. 0.1 nm 1 nm 10 nm 100 nm protein amino acid 1 m 10 chloroplast m 100 plant and animal cells m 1 mm 1 cm 0.1 m 10 m 100 m 1 km rose mouse frog egg 1m virus most bacteria human egg atom ant ostrich egg blue whale human electron microscope light microscope human eye MACAM-MACAM SEL SEL PROKARIOT SEL EUKARIOT ORGANEL JENIS SEL Ada 2 jenis sel: 1. SEL PROKARIOT 2. SEL EUKARIOT SEL PROKARIOT Ukuran relatif kecil (Ø 0,5-1 m) Tidak memiliki membran nukleus (inti) DNAnya kontak dengan sitoplasmanya secara tidak langsung Sitoplasmanya mengandung ribosom Sel dibungkus oleh plasma membran, dinding luar sel yang kompleks, pili, kadang-kadang berflagela SEL PROKARIOT • SITOPLASMA: cairan • • • • didalam sel DNA dalam 1 lingkaran besar PILLI: melekatkan sesuatu FLAGELA : bergerak RIBOSOME: pembentukan protein PROKARYOTE LIFESTYLE • UNICELLULAR: all alone • COLONY: forms a film • FILAMENTOUS: forms a chain of cells PROKARYOTE FEEDING • Photosynthetic: energy from sunlight • Disease-causing: feed on living things • Decomposers: feed on dead things Organelles are membranebound cell parts • Mini “organs” that have unique structures and functions • Located in cytoplasm Prokariotik Eukariotik Bacteria, Archaebacteria Protista, Fungi, Plantae, Animalia Rod-Shaped Bacterium, E. coli, dividing by binary fission (TEM x92,750). This image is copyright Dennis Kunkel Prokaryotic Cells prokaryotic cell. cytoplasm DNA plasma membrane nucleus eukaryotic (plant) cell. Only eukaryotic cells have a nucleus. Figure 4-2 p54 SEL EUKARIOT Ukurannya relatif besar (Ø 10-100 m) Bagian dalam sangat kompleks dengan organel-organel yang dibatasi membran maupun yang tidak dibatasi membran Memiliki inti sejati yang dibatasi membran Organel lain yang dibatasi membran adalah endoplasmik retikulum, Golgi aparatus, mitokondria, lisosom, dan mikrobodies Organel yang tidak dibatasi membran adalah ribosom, mikrotubul, sentriol, flagela, dan sitoskeleton Eukaryotic Cells Typical Animal Cell BAGIAN DAN FUNGSI SEL MEMBRAN CELL BAGIAN PERMUKAAN SEL FUNGSI: PERLINDUNGAN, DUKUNGAN FISIK DAN KOMUNIKASI ATAU HUBUNGAN DENGAN SEL-SEL LAINNYA PADA TANAMAN DINDING SEL YANG KAKU -> KERANGKA PENDUKUNG KOORDINASI ANTAR SEL DILAKUKAN MELALUI STRUKTUR YANG MENGHUBUNGKAN SEL DISEBUT SEL JUNCTION MEMBRAN CELL Sistem Endomembran Structure of the Cell Membrane MEMBRAN CELL Phospholipids Most abundant lipid Polar/hydrophilic head(attracted to water) Pair of nonpolar/hydrophobic tails(repelled by water) Hydrophilic head Hydrophobic tails MEMBRAN CELL Phospholipid bilayer: Polar heads, outside & inside Nonpolar tails in the interior Cell Membranes NUCLEUS FUNGSI INTI ATAU NUKLEUS SEBAGAI PUSAT PENGATUR GENETIK SEL “BLUE PRINT” HEREDITAS SEL YANG MENGATUR: AKTIVITAS SEL DNA DIIKAT PROTEIN MEMBENTUK BENANG PANJANG YANG DISEBUT KROMATIN SELAMA MASA REPRODUKSI SEL, KROMATIN BERGELUNG KE DALAM STRUKTUR YANG DISEBUT KROMOSOM THE NUCLEUS NUCLEUS STRUKTUR NUKLEUS DIBUNGKUS OLEH KANTUNG NUKLEUS (NUCLEAR ENVELOPE) YAITU MEMBRAN LAPIS DUA YANG MEMILIKI LUBANG-LUBANG (PORE) DARI LUBANG-LUBANG TERSEBUT MATERIAL MASUK DAN KELUAR NUKLEUS NUKLEOLUS TERDAPAT DI DALAM NUKLEUS TEMPAT PEMBENTUKAN RIBOSOM NUKLEOLUS TERDIRI ATAS BAGIAN KROMATIN DNA DAN RNA DAN PROTEIN MITOCHONDRION SUMBER ENERGI SEL SEMAIN BESAR ENERGI YANG DIBUTUHKAN, SEMAKIN BANYAK MITOKONDRIA RIBOSOME MEMBENTUK PROTEIN DARI ASAM AMINO PADA SITOPLASMA TERDAPAT BEBAS DI SEL/MENEMPEL PADA ER MEMBUAT RNA RIBOSOME ENDOPLASMIC RETICULUM – SMOOTH: MEMBENTUK LEMAK DAN KARBOHIDRAT – ROUGH: MENYIMPAN PROTEIN YANG DIPRODUKSI OLEH RIBOSOM YANG MENEMPEL DI ER GOLGI COMPLEX MENYELESAIKAN, MENYORTIR, ATAU MEMILIH DAN MENGIRIMKAN HASIL-HASIL SEL (SEL PRODUK) LYSOSOMES LISOSOM TERDIRI ATAS ENZIMENZIM PENCERNAAN (HIDROLITIK) YANG DIKEMAS DALAM SUATU KANTUNG BERMEMBRAN – DIGEST WORN OUT CELL PARTS – DIGEST FOOD ABSORBED BY CELL LISOSOM MENGGAMBARKAN TEMA POKOK STRUKTUR SEL EUKARIOTIK YAITU KOMPARTEMENALISASI ATAU PERKAMARAN LYSOSOMES http://www.people.virginia.edu/~rjh9u/lysosome.html LYSOSOMES Membran lisosom sebagai suatu kompartemen di mana enzim pencernaan disimpan dan secara aman terpisah dari bagian sitoplasma yang lain. Lisosom bergabung dengan vakuola makanan sehingga makanan dapat dicerna enzim yang dimiliki lisosom menjadi molekul-molekul kecil Molekul kecil hasilnya meninggalkan lisosom dan digunakan lagi oleh sel. LYSOSOMES Lisosom juga berfungsi menghancurkan bakteri yang membahayakan. Sel darah putih memasukkan bakteri ke dalam vakuola sel, lalu organel lisosom sel darah putih memasukkan enzimnya ke dalam vakuola untuk mencernakkan dinding sel bakteri Lisosom juga berfungsi penting pada perkembangan embrio. Contohnya, enzim lisosom menghancurkan sel-sel selaput yang menghubungkan antara jari-jari pada tahapan perkembangan awal manusia Lisosom yang abnormal menyebabkan penyakit yang fatal atau menyebabkan kematian CENTRIOLES Menghungkan dua budle tub Mengatur pembelahan sel CYTOSKELETON • SITOSKELETON ADALAH KERANGKA INTERNAL SEL, YANG MERUPAKAN KUMPULAN SERABUT ATAU FILAMEN GLOBULAR, SERABUT PROTEIN • TERBUAT DARI MIKROTUBULUS • DITEMUKAN DI SELURUH SITOPLASMA • MEMBERI BENTUK PADA SEL & ORGANEL BERGERAK DI SEKITAR DI DALAM CYTOSKELETON SITOSKELETON TERDIRI ATAS: 1. MIKROFILAMEN (STRUKTUR MIRIP “ROD” YANG BERUPA PROTEIN GLOBULAR) 2. FILAMEN INTERMEDIATE (PROTEIN SERABUT) 3. MIKROTUBUL (TABUNG BERLUBANG TERDIRI ATAS PROTEIN GLOBULAR) CELL WALL STRUCTURES FOUND IN PLANT CELLS SANGAT KUAT TERBUAT DARI SELULOSA MELINDUNGI SEL DARI PECAH TERPAKU PADA SELSEL LAIN DI SEBELAH CELL WALL VACUOLE STRUCTURES FOUND IN PLANT CELLS – Seperti kantung besar berisi air – Menjaga tekanan pada sel – Penyimpanan pati – Fungsi vakuola berhubungan dengan fungsi lisosom CHLOROPLASTS FUNGSI: • Mengubah energi matahari menjadi energi kimia • Fungsi ini sangat penting dalam kehidupan kita • Organel kloroplast dijumpai paa umumnya sel tanaman dan beberapa protista dan merupakan organel yang dibatasi oleh membran ganda CHLOROPLASTS Organel kloroplast dijumpai pada umumnya sel tanaman dan beberapa protista dan Merupakan organel yang dibatasi oleh membran ganda Kloroplast terdiri atas tiga bagian utama yaitu: Ruangan sempit antar membran protoplast Bagian dalam membran dalam yang mengandung cairan tebal disebut STROMA Dan jaringan tabung dan lubang kaset yang membentuk membran Kaset-kaset bertumpuk-tumpuk dan masing-masing tumpukannya disebut GRANUM, jamaknya GRANA CHLOROPLASTS GRANA adalah tempat di mana klorofil menangkap energi matahari Ruangan di dalam membran tabung dan disket adalah bagian ketiganya Masing-masing kloroplast memainkan peranan khusus untuk memindahkan energi matahari menjadi energi kimia ORGANISME DAN SEL MENGAPA SEL EUKARIOTIK MEMPUNYAI ORGANEL BERMEMBRAN SPESIALISASI FUNGSI (KOMPLEKSITAS) Mengapa sel eukariotik mempunyai organel bermembran Untuk mempertahankan molekul dalam konsentrasi tertentu pada kompartemen Empat kategori fungsi organel pada sel eukariotik 1. Fungsi pembentukan yaitu fungsi pembentukan makromolekul dan mentransportnya atau membawanya dalam sel itu sendiri 2. Fungsi pemecahan, yaitu fungsi pembuangan dan daur ulang materi-materi dalam sel 3. Fungsi pemrosesan, yaitu perubahan energi dari satu bentuk ke bentuk lainnya 4. Fungsi penyangga, pergerakan, dan komunikasi, yaitu fungsi menjaga hubungan sel dengan lingkungan luar sel atau ekstra seluler SEL TANAMAN DAN HEWAN ANIMAL CELL ANATOMY Plasma membrane: outer surface that regulates entrance and exit of molecules protein phospholipid Nucleus: command center of cell Cytoskeleton: maintains cell shape and assists movement of cell parts: Microtubules: protein cylinders that move organelles Nuclear envelope: double membrane with nuclear pores that encloses nucleus Chromatin: diffuse threads containing DNA and protein Nucleolus: region that produces subunits of ribosomes Endoplasmic reticulum: protein and lipid metabolism Intermediate filaments: protein fibers that provide stability of shape Rough ER: studded with ribosomes that synthesize proteins Actin filaments: protein fibers that play a role in change of shape Smooth ER: lacks ribosomes, synthesizes lipid molecules Peroxisome: vesicle that is involved in fatty acid metabolism Centrioles*: short cylinders of microtubules of unknown function Centrosome: microtubule organizing center that contains a pair of centrioles Ribosomes: particles that carry out protein synthesis Lysosome*: vesicle that digests macromolecules and even cell parts Vesicle: small membranebounded sac that stores and transports substances Cytoplasm: semifluid matrix outside nucleus that contains organelles *not in plant cells Polyribosome: string of ribosomes simultaneously synthesizing same protein Mitochondrion: organelle that carries out cellular respiration, producing ATP molecules Golgi apparatus: processes, packages, and secretes modified proteins PLANT CELL ANATOMY Copyright © The McGraw-Hill Companies, Inc. Permission required for reproduction or display. Nucleus: command center of cell Nuclear envelope: double membrane with nuclear pores that encloses nucleus Nucleolus: produces subunits of ribosomes Chromatin: diffuse threads containing DNA and protein Nuclear pore: permits passage of proteins into nucleus and ribosomal subunits out of nucleus Ribosomes: carry out protein synthesis Centrosome: microtubule organizing center (lacks centrioles) Endoplasmic reticulum: protein and lipid metabolism Central vacuole*: large, fluid-filled sac that stores metabolites and helps maintain turgor pressure Cell wall of adjacent cell Middle lamella: cements together the primary cell walls of adjacent plant cells Chloroplast*: carries out photosynthesis, producing sugars Granum*: a stack of chlorophyll-containing thylakoids in a chloroplast Mitochondrion: organelle that carries out cellular respiration, producing ATP molecules Microtubules: protein cylinders that aid movement of organelles Rough ER: studded with ribosomes that synthesize proteins Smooth ER: lacks ribosomes, synthesizes lipid molecules Peroxisome: vesicle that is involved in fatty acid metabolism Golgi apparatus: processes, packages, and secretes modified proteins Cytoplasm: semifluid matrix outside nucleus that contains organelles Actin filaments: protein fibers that play a role in movement of cell and organelles Plasma membrane: surrounds cytoplasm, and regulates entrance and exit of molecules Cell wall*: outer surface that shapes, supports, and protects cell *not in animal cells 2. PANDANGAN MENYELURUH TENTANG SEL Sel tumbuhan dan hewan memiliki sebagian besar organel yang sama Yang tidak ada di sel tumbuhan: Yang tidak ada di sel hewan: lisosom, dinding sel, sentriol, dan flagela kloroplas, vakuola sentral dan tonoplas plasmodesmata How do animal cells move? • Some can crawl with pseudopods • Some can swim with a flagellum • Some can swim very fast with cilia PSEUDOPODS • means “fake feet” • extensions of cell membrane • example: ameoba FLAGELLUM/FLAGELLA • large whiplike tail • pushes or pulls cell through water • can be single, or a pair FLAGELLUM/FLAGELLA FLAGELLUM/FLAGELLA CILIA • fine, hairlike extensions • attached to cell membrane • beat in unison CILIA FLAGELA DAN CILIA Cilia (tunggalnya cilium) dan flagela (tunggalnya flagellum) adalah alat atau mesin pergerakan sel, yang muncul dari suatu sel tertentu Cilia dalam satu sel jumlahnya biasanya banyak, ukurannya pendek Flagella biasanya tunggal atau sedikit jumlahnya dan ukuran biasanya panjang KOMPETENSI: Menjelaskan struktur organel-organel sel dan fungsinya FLAGELA DAN CILIA Baik cilia atau flagela tersusun atas bagian tengah atau pusat mikrotubul dobel dikelilingi oleh 9 mikrotubul dobel Oleh karena itu susunan cilia atau flagela sering disebut struktur atau pola 9±2 disebut struktur axoneme Mikrotubul pada cilia dan flagela bertindak sebagai pendukung sekaligus alat pergerakan ketika organel cilia atau flagela bergetar Pergerakan organel itu disebabkan karena mikrotubul penyusunnya berlekuk KOMPETENSI: Menjelaskan struktur organel-organel sel dan fungsinya