The Characterization of Pigments and Molecular Identification of

Abstract
The search for carotenoids in nature has been extensively
studied because of their applications in foods. One treasure of
the biopigment source is symbiotic-microorganisms with marine
biota. The advantages of symbiont bacteria are easy to culture
and sensitize pigments. The use of symbiont bacteria helps to
conserve fish, coral reefs, seagrass, and seaweed. Therefore, the
bacteria keeps their existence in their ecosystems. In this study,
bacterial symbionts were successfully isolated from brown algae
Padina sp. The bacterial symbionts had yellow pigment
associated with carotenoids. The pigments were characterized
using High Performance Liquid Chromatography (HPLC) with a
Photo Diode Array (PDA) detector. The carotenoid pigments in
the bacterial symbionts were identified as dinoxanthin, lutein
and neoxanthin. Molecular identification by using a 16S rRNA
gene sequence method, reveals that the bacterial symbionts
were closely related to Bacillus marisflavi with a homology of
99%.
Keywords : carotenoid pigments, brown algae, Padina, bacterial
symbionts, 16S rRNA.
Abstrak
Pencarian karotenoid di alam telah dipelajari secara ekstensif
karena aplikasi mereka dalam makanan. Salah satu harta dari
sumber biopigment adalah simbiosis-mikroorganisme dengan
biota laut. Keuntungan dari bakteri simbion yang mudah untuk
membuat kultur dan menghasilkan pigmen. Penggunaan
bakteri simbion membantu untuk melestarikan ikan, terumbu
karang, padang lamun, dan rumput laut. Oleh karena itu,
bakteri terus menjaga kehadiran mereka dalam ekosistem
mereka. Dalam studi ini, simbion bakteri yang berhasil diisolasi
dari coklat ganggang Padina sp. Simbion bakteri memiliki
pigmen kuning yang terkait dengan karotenoid. Pigmen ditandai
dengan
menggunakan
High
Performance
Liquid
Chromatography (HPLC) dengan Photo Diode Array (PDA)
detektor. Pigmen karotenoid dalam simbion bakteri
diidentifikasi sebagai dinoxanthin, lutein dan neoxanthin.
Identifikasi molekuler dengan menggunakan metode urutan gen
16S rRNA menunjukkan bahwa simbion bakteri berhubungan
erat dengan Bacillus marisflavi dengan homologi 99%.
Kata kunci: pigmen karotenoid, alga coklat, Padina, bakteri
simbion, 16S rRNA.