Silabus S3 Biologi Tumbuhan

Silabus S3 Biologi Tumbuhan
Silabus Mata Kuliah
PPS500
Bahasa Inggris
PPS702
Falsafah Sains
BOT701
Kolokium
BIO731
Evolusi Keanekaragaman Tumbuhan
BIO741
Analisis dan Presentasi Data Biologi
BIO742
Biologi Molekular Tumbuhan
Mata kuliah ini berbobot 3 SKS dan merupakan mata kuliah yang terbuka bagi seluruh
mahasiswa pascasarjana baik program magister maupun doktor. Pelajaran Bahasa Inggris
diberikan untuk meningkatkan kemampuan mahasiswa SPs dalam memperdalam ilmu,
khususnya untuk meningkatkan kemampuan membaca materi akademik, menulis, membuat
ringkasan hasil penelitian dan menyusun kalimat dalam Bahasa Inggris, baik secara pasif
maupun secara aktif.
Pengkajian pengetahuan dan sains secara luas yang mencakup epistemologi (logika,
ontologi, aksiologi, teleologi), etika, estetika, dan pembahasan peranan ipteks dan moralitas
dalam kehidupan untuk mencari kebenaran demi kemaslahatan umat manusia. Mata kuliah
ini berbobot 2 SKS.
Kolokium merupakan sarana bagi mahasiswa untuk menyajikan rencana penelitian disertasi
yang telah dikonsultasikan dengan komisi pembimbing. Kolokium dilaksanakan di depan
mahasiswa, dosen pembimbing, dan pengampu mata kuliah. Hasil akhir dari kolokium
berupa proposal penelitian yang telah siap digunakan sebagai acuan dalam pelaksanaan
penelitian disertasi.
Membahas tentang keragaman tumbuhan dari berbagai sudut pandang, seperti keragaman
morfologi, anatomi, fisiologi, dan genetika yang dikaitkan dengan perjalanan evolusi dan
ekologi dari tumbuhan tersebut. Disamping itu juga dibahas tentang mekanisme adaptasi
dari berbagai ragam tumbuhan terhadap ekologi tertentu. Topik-topik terbaru dari aspekaspek tersebut di atas akan menjadi bahan diskusi mahasiswa.
Matakuliah ini menyajikan topik bahasan yang mencakup bagaimana teknik mendapatkan
data biologi, menganalisis dan menginterpretasi-kannya secara benar serta
mempresentasikan hasil melalui presentasi dan poster ilmiah secara efektif sampai menulis
artikel ilmiah untuk dipublikasikan pada jurnal ilmiah, teknik membuat proposal penelitian
ilmiah dan bagaimana menulis disertasi juga dibahas dalam mata kuliah ini. Perkuliahan
dilengkapi dengan tugas dan latihan menganalisis data biologi, membuat poster ilmiah,
mempersiapkan dan melakukan presentasi oral, membuat proposal penelitian, serta menulis
artikel untuk publikasi dalam jurnal ilmiah.
Mata kuliah ini akan membahas pendekatan molekular yang digunakan dalam mempelajari
dan memecahkan masalah-masalah biologi tumbuhan dari mulai pertumbuhan,
perkembangan, respon fisiologi tumbuhan terhadap lingkungan, keragaman dan ekologi
tumbuhan. Dalam kuliah ini akan dipelajari dan didiskusikan topik-topik antara lain,
overview pendekatan dasar molekular dalam biologi tumbuhan: model/sistem ekspresi gen
dan analisis genetik; pendekatan molekular dalam mempelajari: pembelahan sel,
perkembangan tumbuhan (embriogenesis, meristem, akar, pembungaan); pensinyalan
hormon, respons tumbuhan terhadap cekaman biotik dan abiotik, biodiversitas, sistematika
dan ekologi tumbuhan; rekayasa genetik pada tumbuhan, projek genom Arabidopsis dan
Padi.
BIO790
Seminar Biologi Tumbuhan
BIO743
Transpor & Metabolisme Unsur Hara Tumbuhan
BIO745
Interaksi Tumbuhan - Mikroba
BIO744
Fisiologi Tumbuhan Lanjut
BIO747
Genetika Fisiologi Tumbuhan
Mempresentasikan topik khusus dalam biologi tumbuhan sesuai dengan minat mahasiswa
di bawah arahan dosen pembimbing (ketua komisi pembimbing mahasiswa bersangkutan)
dalam suatu seminar departemen biologi yang dihadiri oleh dosen dan mahasiswa
pascasarjana departemen biologi atau mayor biologi tumbuhan. Seminar ini bisa disubtitusi
dengan presentasi seminar pada pertemuan ilmiah nasional atau internasional.
Mata kuliah ini membahas tentang prinsip unsur hara tumbuhan dari pengetahuan klasik
sampai terkini, transport dan metabolismenya di dalam tumbuhan. Topik yang dipelajari
meliputi definisi dan klasifikasi unsur hara tumbuhan, fisiologi hara, ketersediaan hara,
pergerakan hara dari tanah sampai tumbuhan; absorpsi dan tranport yang meliputi ion
uptake, transpor jangka pendek dan panjang di dalam tumbuhan, mobilitas hara dalam
floem, tinjauan fisiologi dan molekular tranport melalui ion channel, transporter dan bagian
lain dari membran; asimilasi dan fungsi unsur hara di dalam tumbuhan yang meliputi
unsur hara makro, fiksasi N biologis, hara mikro; aspek-aspek ekologi, genetik dan
molekular dari unsur hara, variasi genetik dalam pengambilan unsur hara, kompetisi unsur
hara, adaptasi tumbuhan terhadap defisiensi dan keracunan unsur hara. Kuliah akan
dilengkapi dengan seminar dan diskusi.
Matakuliah ini menjelaskan tentang interaksi antara tumbuhan dan mikroba dengan
penekanan pada pengetahuan tentang interaksi yang bersifat simbiotik dan penerapannya
pada bidang pertanian. Materi yang diberikan mulai dari jenis-jenis interaksi, simbiosis
penambat nitrogen, metabolisme karbon-nitrogen, proses dan gen-gen yang terlibat dalam
simbiosis, pendekatan atau metode yang dapat digunakan dalam analisis tentang interaksi
antara tumbuhan dan mikroba, pemanfaatan simbiosis di bidang pertanian. Disampaikan
pula secara terbatas tentang aspek molekular dari interaksi yang bersifat patogenik.
Kuliah ini menjelaskan tentang fisiologi tumbuhan C3, C4, dan CAM, struktur dan
perkembangan ekosistem, respon fotosintesis terhadap CO2 dan suhu global, efek
lingkungan terhadap tumbuhan, fisiologi perakaran, fisiologi tanaman epifit, fitoremediasi,
dan fisiologi tumbuhan penambang polutan.
Organisasi genetik, ekson dan intron, gen struktural, regulasi ekspresi gen; elemen
pengontrol dan fungsi gen; penyaringan selektif; isozim dan penggunaannya sebagai ciri
dan alat genetik; fisiologi dan genetika interaksi parasit dan inangnya; pengontrol genetik
pada protein biji; mutan-mutan yang mempengaruhi fotorespirasi; flavonoid dan
karotenoid; mutan dan zat pengatur tumbuh; transfer DNA ke dalam tumbuhan; mutan
auksotropik pada tumbuhan; peranan genetika fisiologi dalam pemuliaan tanaman.
BIO733
Populasi, Komunitas dan Sistem Ekologi
BIO735
Strategi Konservasi Tumbuhan Tropika
BIO732
Fitogeografi dan Keragaman Tumbuhan Tropika
BIO737
Falsafah Taksonomi
BIO739
Seluk Beluk Konsep Jenis
Mata kuliah ini menjelaskan tentang pengertian dari populasi komunitas dan sistem
ekologi. Pengertian populasi mencakup sifat karakteristik populasi, kepadatan, kelahiran,
kematian, seks ratio, struktur individu dalam `populasi, penyebaran populasi dan pola
pertumbuhan populasi. Pengertian komunitas mencakup sifat karakteristik dari komunitas,
perkembangan komunitas, organisasi komunitas dan fungsi komunitas. Pengertian system
ekologi mencakuop tentang teori dan prinsip dasar sisitem ekologi, teori keseimbangan
dalam system ekologi, Hukum Termodinamik 1 dan 2, Fungsi dari komponen komponen
yang ada dalam system ekologi, jaring jaring makanan, prinsip dasar lingkungan dan
peranan system ekologi dalam pembangunan pertanian
Nilai dari keanekaragaman hayati tropika alami; kehilangan keanekaragaman hayati
tropika; strategi untuk konservasi keanekaragaman hayati tropika; kebijakan nasional dalam
konservasi keanekaragaman hayati tropika; dorongan kebijakan lingkungan internasional
dalam konservasi keanekaragaman hayati tropika; insentif terhadap konservasi keragaman
hayati lokal; pengelolaan keanekaragaman hayati tropika dalam lingkungan manusia;
konservasi spesies, populasi, dan keragaman genetik; pengelolaan sumberdaya manusia
untuk melindungi keanekaragaman hayati tropika.
Matakuliah ini menyajikan materi yang mencakup ulasan mengenai sebaran tumbuhan
tropis dunia, karakteristik tropis dari Flora Afrika, Malesiana dan Amerika Latin. Jenis
penghasil devisa dan kayu serta nir kayu dibelahan Indonesia Barat dan Timur, serta famili
dan jenis utama penghuni pulau-pulau besar Indonesia. Ragam simbiosis tumbuhan dari
makrosimbion dan mikro simbion didalam ekosistem alamiah tropis dan kegiatan pertanian
, optimasi trofobiosis, interaksi cahaya dan produktivitas tanaman terkait analisis gradasi
lahan dalam membangun mimik multistrata komunitas tumbuhan tropis menuju
produktivitas lokal yang optimum.
Mata kuliah ini membahas tentang Perkembangan pemikiran klasifikasi dari Theophrathes
sampai sekarang. Intuisi, diktum, teori Hennig. Intervensi teori evolusi dan kladistika
dalam pola pikir penyusunan Klasifikasi.
Mata kuliah ini membahas tentang perkembangan konsep jenis dan Linneaus sampai kini,
berawal dari konsep jenis morfologi, biologi, internodon dan komposit. Penerapan konsep
tersebut dalam penyelesaian permasalahan taksonomi
BIO734
Filogeni dan Sistematika Tumbuhan
BIO799
Disertasi dan Ujian Akhir
BIO797
Publikasi Ilmiah Internasional
BIO798
Publikasi ilmiah 2
BIO703
Pra Penelitian
PPS790
Seminar
Mata kuliah ini membahas sejarah perkembangan konsep analogi dan homologi,
paralelisme dan konvergensi, filogenetik dan filetik. Pengembangan dendogram menjadi
pohon filogeni, fenogram, kladogram dan makna pengertian klasifikasinya.
Merupakan tugas akhir mahasiswa program doktor di Departemen Biologi sebagai salah
satu syarat kelulusan yang meliputi kegiatan penelitian baik di laboratorium maupun di
lapang, dan penulisan disertasi
Merupakan bagian dari kegiatan penelitian disertasi yang dituangkan ke dalam artikel
ilmiah yang dipublikasikan pada jurnal ilmiah nasional terakreditasi
Merupakan bagian dari kegiatan penelitian disertasi yang dituangkan ke dalam artikel
ilmiah yang dipublikasikan pada jurnal ilmiah internasional yang memiliki reputasi
Pra Penelitian adalah suatu kegiatan terhitung satuan kredit yang menekankan pada tugastugas mandiri untuk mempersiapkan penelitian disertasi yang dilakukan di laboratorium
penelitian dari calon pembimbing utama.
Seminar adalah penyajian hasil-hasil penelitian (tesis atau disertasi) dalam suatu forum
ilmiah Sekolah Pascasarjana untuk mendiseminasikan hasil penelitian , baik secara tertulis
maupun secara lisan, menyerap masukan dari forum untuk penyempurnaan tesis,
menambah wawasan ilmiah, dan meningkatkan kompetensi komunikasi ilmiah Memberikan
cara penulisan berbagai karya ilmiah yang mencakup penulisan usulan proyek dan laporan,
termasuk juga cara penyampaian dan penyajian data, pembuatan slide dan transparansi,
serta penggunaan komputer dengan Liquid Crystal Display (LCD) Viewer