isolasi, seleksi dan identifikasi bakteri penghasil enzim ekstraseluler
advertisement
ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENGHASIL ENZIM EKSTRASELULER DARI SALURAN PENCERNAAN DAN SEDIMEN TAMBAK BUDIDAYA UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) INTENSIF SKRIPSI PROGRAM STUDI S-1 BUDIDAYA PERAIRAN Oleh : ADE KURNIAWATI TULUNGAGUNG – JAWA TIMUR FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN UNIVERSITAS AIRLANGGA SURABAYA 2015 SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA Yang bertanda tangan di bawah ini : Nama NIM Tempat, tanggal lahir Alamat : Ade Kurniawati : 141111057 : Tulungagung, 4 Januari 2015 : Ds. Sambitan RT/RW 02/02 Kec.Pakel Kab.Tulungagung Telp./ Hp. : 087854902720 Judul Skripsi : Isolasi, Seleksi dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler dari Saluran Pencernaan dan Sedimen Tambak Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Intensif Pembimbing : 1. Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si. 2. Agustono, Ir., M.Kes. Menyatakan dengan sebenarnya bahwa hasil tulisan laporan Skripsi yang saya buat adalah murni hasil karya saya sendiri (bukan plagiat) yang berasal dari Dana Penelitian : Mandiri dan Proyek Dosen. Di dalam skripsi / karya tulis ini tidak terdapat keseluruhan atau sebagian tulisan atau gagasan orang lain yang saya ambil dengan cara menyalin atau meniru dalam bentuk rangkaian kalimat atau simbol yang saya aku seolah-olah sebagai tulisan saya sendiri tanpa memberikan pengakuan pada penulis aslinya, serta kami bersedia : 1. Memberikan ijin untuk mengganti susunan penulis pada hasil tulisan skripsi / karya tulis saya ini sesuai dengan peranan pembimbing skripsi; 2. Diberikan sanksi akademik yang berlaku di Universitas Airlangga, termasuk pencabutan gelar kesarjanaan yang telah saya peroleh (sebagaimana diatur di dalam Pedoman Pendidikan Unair 2010/2011 Bab. XI pasal 38 – 42), apabila dikemudian hari terbukti bahwa saya ternyata melakukan tindakan menyalin atau meniru tulisan orang lain yang seolah-olah hasil pemikiran saya sendiri Demikian surat pernyataan yang saya buat ini tanpa ada unsur paksaan dari siapapun dan dipergunakan sebagaimana mestinya. Surabaya, 30 Oktober 2015 Yang membuat pernyataan, Materai Rp 6.000,- Ade Kurniawati NIM. 141111057 SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENGHASIL ENZIM EKSTRASELULER DARI SALURAN PENCERNAAN DAN SEDIMEN TAMBAK BUDIDAYA UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) INTENSIF Skripsi sebagai Salah Satu Syarat untuk Memperoleh Gelar Sarjana Perikanan pada Program Studi Budidaya Perairan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Oleh : ADE KURNIAWATI NIM. 141111057 Menyetujui, Komisi Pembimbing Pembimbing Utama Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si NIP. 19610907 198903 2 001 SKRIPSI Pembimbing Serta Agustono, Ir., M.Kes NIP. 19570630 198601 1 001 ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENGHASIL ENZIM EKSTRASELULER DARI SALURAN PENCERNAAN DAN SEDIMEN TAMBAK BUDIDAYA UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) INTENSIF Oleh : ADE KURNIAWATI NIM. 141111057 Telah diujikan pada Tanggal : 30 Oktober 2015 KOMISI PENGUJI SKRIPSI Ketua : Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP. Sekretaris : Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes. Anggota : Dr. Laksmi Sulmartiwi, S.Pi., MP. Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si Agustono, Ir., M.Kes Surabaya, 4 Nopember 2015 Mengetahui, Dekan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, drh., DEA. NIP. 19520517 197803 2 001 SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA RINGKASAN ADE KURNIAWATI. Isolasi Seleksi dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler dari Saluran Pencernaan dan Sedimen Tambak Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Intensif. Dosen Pembimbing Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si dan Agustono, Ir., M.Kes. Karakteristik budidaya intensif adalah padat tebar tinggi dan dosis pakan tinggi, hal tersebut mengakibatkan meningkatnya kandungan bahan organik yang berasal dari sisa pakan dan hasil metabolisme. Bahan organik yang tinggi akan menurunkan kualitas lingkungan perairan, sehingga dapat menyebabkan kegagalan dalam budidaya. Bahan organik dapat dirombak oleh bakteri heterotrofik karena menghasilkan enzim ekstraseluler (protease, lipase dan amilase). Bakteri penghasil enzim ekstraseluler dapat diperoleh dari saluran pencernaan (lambung, hepatopankreas dan usus) dan dari sedimen tambak budidaya. Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri penghasil enzim ekstraseluler dari saluran pencernaan dan sedimen tambak budidaya udang vaname intensif. Metode penelitian menggunakan metode deskriptif. Sampel udang dan sedimen tambak budidaya diambil di tambak budidaya udang vaname intensif. Langkah pertama penelitian ini adalah isolasi bakteri, pemurnian bakteri, uji aktivitas enzim (protease, lipase dan amilase) dan identifikasi. Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa terdapat 8 isolat bakteri dari saluran pencernaan, dan yang dapat menghasilkan tiga enzim yaitu Bacillus3 dan Alcaligenes, isolat bakteri dari sedimen tambak budidaya terdapat 17 bakteri dan yang menghasilkan tiga enzim yaitu Genus Corynbacterium, 1 2 Flavobacterium,Pseudomonas, Bacillus dan Bacillus . SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA SUMMARY ADE KURNIAWATI. Isolation, Selection and Identification of Extrcellular Enzyme Producing Bacteria from Digestive Tract and Sediment of White Shirmp (Litopenaeus vannamei) in Intensive Culture. Academic Advisors Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si and Agustono, Ir., M.Kes. Intensive cultivation characteristics one of which is a high stocking density and high feed doses, it resulted in an increased content of organic matter derived from feed remains and the metabolism. High organic material will degrade the quality of the aquatic environment, which can cause failure in cultivation. Organic materials can be overhauled by heterotrophic bacteria because produce extracellular enzymes (protease, lipase and amylase). Extracellular enzymeproducing bacteria can be obtained from the digestive tract (stomach, hepatopancreas and intestines) and of the sediment pond aquaculture. This study aimed to obtain extracellular enzyme-producing bacteria of the digestive tract and sediment ponds vaname intensive shrimp farming. This research method is descriptive method. Shrimp and sediment samples taken in the pond shrimp culture. The first step of this research is the isolation, purification of the bacteria, enzyme activity test (protease, lipase and amylase) and identified These results showed that the isolated bacteria from the digestive tract there are 8 isolate and can produce three enzymes such as Genus Bacillus 3 and Alcaligenes. Bacteria from the sediment pond there are 17 isolate and produces three enzyme such as Genus Corynbacterium, Flavobacterium, Pseudomonas, Bacillus1 and Bacillus2. SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA KATA PENGANTAR Puji syukur kehadirat Allah SWT, atas limpahan rahmat, taufiq dan hidayah-Nya, sehingga penulis dapat menyelesaikan Skripsi dengan judul “Isolasi dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler dari Saluran Pencernaan dan Sedimen Tambak Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Intensif”. Skripsi ini disusun dalam rangka memenuhi persyaratan untuk memperoleh gelar Sarjana Perikanan pada program Studi Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya. Ucapan terima kasih juga tdiak lupa penulis sampaikan kepada: 1) Ibu Dr. Woro Hastuti S, Ir., M.Si selaku dosen pembimbing utama dan Bapak Agustono, Ir., M.Kes yang telah memberikan petunjuk dan arahan sejak penyusunan usulan penelitian hingga penyusunan Karya Ilmiah Skripsi ini selesai, 2) Ibu Dr. Endang Dewi Masithah. Ir., MP, Ibu Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes., dan Ibu Dr. Laksmi Sulmartiwi, S.Pi., MP. selaku dosen penguji yang telah memberikan masukan dan saran atas perbaikan Skripsi ini, 3) Ibu Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, Drh., DEA. Selaku Dekan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya, 4) para teman yang selalu membantu dan mendukung penulis dalam melaksanakan dan menyelesaikan Skripsi ini, serta semua pihak yang telah membantu dalam penyelesaian Skripsi ini. Penulis menyadari bahwa Karya Ilmiah Skripsi ini masih belum sempura, sehingga kritik dan saran yang membangun sangat penulis harapkan demi perbaikan Karya Ilmiah ini. Penulis berharap semoga Karya Ilmiah ini dapat bermanfaat bagi semua pihak, khususnya bagi Mahasiswa Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga di bidang Teknologi Industri Hasil Perikanan. Surabaya, 30 Oktober 2015 Penulis SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA DAFTAR ISI Halaman SKRIPSI RINGKASAN .................................................................................................. iv SUMMARY ..................................................................................................... v KATA PENGANTAR ..................................................................................... vi DAFTAR ISI .................................................................................................... vii DAFTAR TABEL ............................................................................................ ix DAFTAR GAMBAR ....................................................................................... x DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xi I. PENDAHULUAN .................................................................................... 1 1.1 Latar Belakang .................................................................................... 1 1.2 Perumusan Masalah ............................................................................ 3 1.3 Tujuan Penelitian ................................................................................ 3 1.4 Manfaat Penelitian .............................................................................. 3 II. TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................... 4 2.1 Klasifikasi dan Morfologi Udang Vaname ......................................... 2.2 Makanan dan Kebiasaan Makan Udang Vaname ............................... 2.3 Lingkungan Budidaya Intensif ............................................................ 2.4 Bakteri 2.4.1 Bakteri Saaluran Pencernaan .................................................... 2.4.2 Bakteri Sedimen ....................................................................... 2.4.3 Enzim Ekstraseluler .................................................................. 4 6 7 8 9 9 III. KERANGKA KONSEPTUAL DAN HIPOTESIS .................................. 12 3.1 Kerangka Konseptual ......................................................................... 12 3.2 Hipotesis ............................................................................................. 13 IV. METODOLOGI ........................................................................................ 15 4.1 Tempat dan Waktu ............................................................................. 4.2 Materi Penelitian ................................................................................. 4.2.1 Peralatan Penelitian ................................................................. 15 15 15 ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA SKRIPSI 4.2.2 Bahan Penelitian ...................................................................... 4.3 Metode Penelitian ............................................................................... 4.3.1 Rancangan Penelitian .............................................................. 4.3.2 Prosedur Kerja ......................................................................... A. Sterilisasi Alat dan Bahan ................................................... B. Pembuatan Media ............................................................... C. Pengambilan Sampel ........................................................... D. Tahap Isolasi ....................................................................... E. Seleksi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler ................... F. Identifikasi Bakteri .............................................................. V. HASIL DAN PEMBAHASAN ................................................................. 15 16 16 16 16 16 17 18 19 20 26 5.1 Hasil Penelitian ................................................................................... 5.1.1 Isolasi Bakteri ........................................................................... 5.1.2 Uji Hidrolisis Kasein, Pati dan Lemak ..................................... 5.1.3 Identifikasi Bakteri ................................................................... 5.2 Pembahasan......................................................................................... 26 26 27 29 32 VI. KESIMPULAN DAN SARAN ................................................................. 38 6.1 Kesimpulan ......................................................................................... 38 6.2 Saran ................................................................................................... 38 DAFTAR PUSTAKA ...................................................................................... 39 LAMPIRAN ..................................................................................................... 45 ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA DAFTAR TABEL Tabel Halaman 1. Isolat Bakteri dari Saluran Pencernaan Udang Vaname ................. 26 2. Isolat Bakteri dari Sedimen Tambak Budidaya Udang Vaname ..... 26 3. Hasil Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler dari Saluran Penceernaan dan Sedimen Tambak Udang Vaname Intensif.............................................................................................. SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... 30 ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA DAFTAR GAMBAR Gambar Halaman 1. Udang Vaname ................................................................................. 4 2. Diagram Kerangka Konseptual ........................................................ 14 3. Diagram Alir Penelitian ................................................................... 25 4. Zona Bening Aktivitas Protease, Lipase dan Amilase Isolat SD10 . 27 5. Grafik Hasil Uji Kemampuan Hidrolisis Kasein, Lemak dan Pati Bakteri Saluran Pencernaan ............................................................. 28 6. Grafik Hasil Uji Grafik Hasil Uji Kemampuan Hidrolisis Kasein, Lemak dan Pati Bakteri Sedimen Tambak Intensif.......................... SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... 28 ADE KURNIAWATI ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA DAFTAR LAMPIRAN Lampiran SKRIPSI Halaman 1. Hasil Uji Hidrolisis Enzim ..................................................................... 45 2. Gambar Uji Hidrolisis Enzim Ekstraseluler ............................................ 46 3. Gambar Pewarnaan Gram Perbesaran 1000x .......................................... 48 4. Hasil Uji Biokimia Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler .................... 49 ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI
