Document

Studi Dinamika Molekuler Mekanisme Reaktivasi p53 (Tumor Supresor) Termutasi dengan
PRIMA-1
Fajar Rakhman Wibowo, Muhammad Widyo Wartono, Winarto Haryadi
Apoptosis, kematian sel terprogram merupakan target yang menjanjikan untuk rekayasa obat
kemoterapi yang spesifik. Reaktivasi mutant p53-tumor-suppressor memicu terjadinya
apoptosis massal mengingat lebih dari 50% sel tumor kehilangan fungsi p53
akibat mutasi. Beberapa molekul kecil (contohnya: PRIMA-1 dan turunan maleimida) telah
menunjukkan kemampuannya mengembalikan ekspresi wild-type p53. Pengembalian fungsi
p53 akan memicu kematian sel dan menghilangkan tumor in vivo. Baru-baru ini, mekanisme
pengembalian fungsi pada tingkat molekuler mulai terungkap. Pembentukan kompleks adduct
dari PRIMA-1 terkonversi dengan tiol dari p53 termutasi cukup untuk menginduksi apoptosis
dalam tumor sel. Total simulasi dinamika molekuler sepanjang 800 ns telah kami lakukan untuk
memberikan kontribusi dalam studi mekanisme pengembalian fungsi p53. Simulasi yang telah
dilakukan menghasilkan data sebesar kurang lebih 1 terabyte. Evaluasi awal dari trajektoritrajektori tersebut menunjukkan bahwa sifat dinamis p53 pada status mutasi yang berbeda
akan menentukan kemampuannya berinteraksi dengan DNA targetnya. Turunan maleimida
dapat mengubah dinamika p53. Namun kami masih belum memiliki cukup informasi tentang
pentingnya pembentukan adduct. Melalui penelitian ini kami mempelajari pembentukan
adduct menggunakan metode mekanika kuantum dan mempersiapkan simulasi DM dari adduct
yang terbentuk.