Penelitian membuka rahasia hubungan protein

Penelitian membuka rahasia hubungan protein terhadap
penyebaran virus
Oleh: ScienceDaily, 6 Januari 2010
Profesor Denis Archambault dari Department of Biological Sciences dari Université du Québec à
Montréal (UQAM), dan mahasiswa program doktor Corredor Andrea Gomez telah membuat penemuan
besar di bidang biologi molekular. Mereka telah membuka beberapa rahasia dari protein virus, yang
dikenal sebagai Rev, yang sangat berbeda dari protein lain dari jenis yang sama yang dipelajari pada saat
ini.
Hasil penelitian mereka baru-baru ini diterbitkan dalam Journal of Virology.
Protein Rev memainkan peran penting dalam mekanisme propagasi jenis virus tertentu dalam suatu
organisme. Peneliti Archambault dan Gomez Corredor memfokuskan pada protein ini, dan lebih khusus
lagi pada sebuah struktur yang disebut “lokalisasi sinyal nuklir” (nuclear localization signal/NLS).
Mereka digunakan sebagai model protein Rev dari bovine immunodeficiency virus (BIV), sebuah
retrovirus yang berkaitan dengan HIV pada manusia.
Retrovirus, seperti virus lainnya, ditandai oleh ketidakmampuan untuk memperbanyak mereka sendiri.
Dalam rangka untuk mereproduksi, mereka membutuhkan sel induk. Sebuah sel memiliki sitoplasma dan
sebuah inti sel di pusat. Nukleus mengandung nukleoli, atau sub-kompartemen. Telah diketahui bahwa
protein Rev, yang dihasilkan dalam sitoplasma, bergerak ke dalam nukleus dan nukleolus dari sel yang
terinfeksi dengan retrovirus tertentu. Dengan mengikat RNA virus yang ditemukan di dalam nukleus,
protein Rev memberikan kontribusi untuk transisi dari suatu infeksi tahap awal ke tahap akhir. Untuk
memenuhi fungsi utama ini, protein Rev pertama-tama harus bisa masuk ke nukleus. Untuk
melakukannya, diperlukan sebuah “kunci,”, “NLS” terdiri dari asam amino.
NLS yang lain
Selama bertahun-tahun, beberapa peneliti telah melihat NLS di berbagai protein Rev. Sampai sekarang,
studi dari protein ini menunjukkan adanya monopartite NLS, yaitu suatu NLS terdiri dari satu urutan
asam amino yang terus-menerus. Dengan terkejut, Denis Archambault dan Andrea Gomez Corredor
menemukan bahwa protein Rev BIV memiliki bipartite NLS – terdiri dari dua motif asam amino yang
dipisahkan oleh urutan asam amino tambahan – jenis protein pertama di dunia dari semua retrovirus yang
dipelajari, termasuk HIV.
Di samping itu, meskipun jenis protein lain mengandung bipartite NLS, NLS yang baru ditemukan ini
tidak sesuai dengan bipartite NLS lainnya yang telah diidentifikasi sampai sekarang, apa pun jenis
protein yang dipelajari. Biasanya bipartite NLS terdiri dari dua motif asam amino yang dipisahkan oleh
urutan jarak yang pendek (sekitar 10 asam amino) atau panjang (sekitar 30 asam amino). Dalam protein
Rev BIV, NLS yang ada tidak sama dalam urutan jarak (tidak panjang maupun pendek) dan urutan
komposisi asam amino.
Akhirnya, penulis juga mengidentifikasi tipe baru “lokalisasi sinyal nukleolar” (nucleolar localization
signal/NoLS) yang memungkinkan protein Rev untuk menembus di dalam nukleolus. Walaupun peran
lokalisasi ini tidak diketahui, itu adalah pertama kalinya jenis sinyal ini telah dilaporkan dalam sel atau
protein asal virus.
Sebuah langkah pertama menuju penemuan-penemuan lebih lanjut
Menurut Denis Archambault, “Apa yang kita miliki di sini adalah protein Rev yang karakteristiknya
sangat berbeda dari protein lain dari jenis yang sama yang telah dipelajari hingga saat ini. Walaupun
temuan kami belajar lebih banyak tentang virus, dan khususnya virus yang berasal dari hewan. Kami
sekarang memiliki model tertentu yang akan memungkinkan kita untuk mempelajari lebih jauh hubungan
antara lokalisasi protein dan efeknya pada sel induk, dan mungkin pada seluruh organisme. “
Hasil penelitian diterbitkan dalam edisi kedua Journal of Virology (Vol. 83, No 24) pada Desember
2009.
Dokumen ini diunduh dari situs web Yayasan Spiritia http://spiritia.or.id/
Penelitian membuka rahasia hubungan protein terhadap penyebaran virus
Artikel asli: Research Unlocks Secrets of Protein Linked to Spread of Viruses
–2–