ix Intisari SELEKSI BAKTERI RIZOSFIR DAN ENDOFIT

advertisement
Intisari
SELEKSI BAKTERI RIZOSFIR DAN ENDOFIT
UNTUK PENGENDALIAN PENYAKIT LAYU FUSARIUM PISANG
(FUSARIUM OXYSPORUM F.SP. CUBENSE RAS 4 TROPIKA)
Rahma Kusbari
08/270078/PN/11448
Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengetahui keragaman serta kerapatan populasi
bakteri rizosfir pada tanah yang tidak terinfeksi dan tanah terinfeksi Fusarium oxysporum f.sp.
cubense ras 4 tropika, memperoleh serta menguji bakteri rizosfir dan endofit yang dapat
menghambat pertumbuhan F. oxysporum f.sp. cubense ras 4 tropika, menguji bakteri rizosfir
dan endofit yang dapat menghambat perkembangan penyakit layu fusarium pada pisang, dan
untuk mengidentifikasi isolat bakteri antagonis yang telah diperoleh, dibandingkan dengan
database sekuen bakteri di GeneBank NCBI. Penelitian dilaksanakan di Laboratorium Ilmu
Penyakit Tumbuhan Klinik dan Bakteriologi Tumbuhan Jurusan Hama dan Penyakit Tumbuhan
Fakultas Pertanian Universitas Gadjah Mada Yogyakarta. Sejumlah 6 sampel tanah (4 sampel
tanah tidak terinfeksi F. oxysporum f.sp. cubense, 2 sampel tanah terinfeksi F. oxysporum f.sp.
cubense) dan 2 isolat bakteri koleksi Laboratorium Ilmu Penyakit Tumbuhan Klinik yang
digunakan pada penelitian ini. Berdasarkan hasil isolasi disimpulkan bahwa sampel tanah tidak
terinfeksi F. oxysporum f.sp. cubense memiliki kerapatan dan keragaman bakteri rizosfir lebih
tinggi dibandingkan sampel tanah terinfeksi F. oxysporum f.sp. cubense, diperoleh 3 isolat
bakteri rizosfir (CJ20GGP, CJ20NTF, SRP/I) dan 2 isolat endofit (6P2, 2P5) yang dapat
menghambat pertumbuhan koloni F. oxysporum f.sp. cubense ras 4 tropika serta menghambat
perkembangan penyakit layu fusarium pisang. Hasil sekuen gen 16S rRNA, isolat 6P2,
CJ20GGP, SRP/I, CJ20NTF memiliki hubungan kekerabatan terdekat dengan Bacillus
amyloliquefaciens, sedangkan isolat 2P5 memiliki hubungan kekerabatan terdekat dengan
Bacillus stratosphericus.
Kata Kunci : bakteri rizosfir, bakteri endofit, Fusarium oxysporum f.sp. cubense, pisang
ix
Abstract
SELECTION OF RHIZO AND ENDOPHYTIC BACTERIA
FOR CONTROLING FUSARIUM WILT DISEASE ON BANANA
(FUSARIUM OXYSPORUM F.SP. CUBENSE TROPICAL RACE 4)
Rahma Kusbari
08/270078/PN/11448
The purpose of this study is to observe the diversity and the population density of
rhizobacteria in F. oxysporum f.sp. cubense uninfected soil and infected soil, to get and examine
rhizobacteria and endophytic bacteria which can suppress F. oxysporum f.sp. cubense tropical
race 4 with can suppress fusarium wilt disease on banana, and for identification the antagonistic
bacterial isolates and compare with the bacteria sequences to NCBI GeneBank database. The
research was done in Laboratory of Clinical Plant Disease and Plant Bacteriology, Faculty of
Agriculture, Universitas Gadjah Mada, Yogyakarta. Six soil samples (4 uninfected soil samples,
2 infected soil samples) and 2 bacterial isolates collection Laboratory of Clinical Plant Disease
was used. The result is that the diversity and population density of rhizobacterial in F.
oxysporum f.sp. cubense uninfected soil is higher than infected soil. There was found out 3
rhizobacterial isolates (CJ20GGP, CJ20NTF, SRP/I) and 2 endophytic isolates (6P2, 2P5) can
suppress F. oxysporum f.sp. cubense tropical race 4 that can suppress fusarium wilt disease on
banana. Isolates of 6P2, CJ20GGP, SRP/I and CJ20NTF was close related to Bacillus
amyloliquefaciens, while the isolate of 2P5 was close related to Bacillus stratosphericus.
Keyword : rhizobacteria, endophytic bacteria, Fusarium oxysporum f.sp. cubense, banana
x
Download