Course Description - fsrd

3
BI5102 Biologi Sistem
Kode Matakuliah:
BI5102
Nama Matakuliah
Silabus Ringkas
Silabus Lengkap
Luaran (Outcomes)
Bobot sks:
3
Semester:
Ganjil
KK / Unit Penanggung Jawab:
Genetika dan Bioteknologi
Molekuler
Sifat:
Wajib Prodi
Biologi Sistem
System Biology
Mata kuliah ini memberikan dasar konsep genome, transcriptome, proteome,
metabolome dan interactome serta aplikasinya.
This course emphasize the study of genome, transcriptome, proteome, metabolome and
interactome, concept and its application.
Sistem biologi adalah bidang baru yang mengeksplorasi genom dan post genomic dengan
data genom set/database yang banyak berikut interpretasinya. Sistem biologi digunakan
untuk memahami secara komprehensif proses perkembangan, fisiologi, metabolisme dan
network regulasigen, dengan melihat semua gen, protein dan metabolitnya dalam
organisme secara bersamaan, dibandingkan dengan hanya berfokus pada hanya satu atau
dua proses. Selanjutnya untuk mempelajari bagaimana seluruhnya berinteraksi untuk
menciptakan karakter dari kehidupan.
Systems biology is a new field which explores the world of genomes and post-genomic ,
which produce large data sets/databases.
The goal of systems biology is to comprehensively understand development, physiology,
metabolic and gene regulatory networks, by looking at all genes, proteins
and metabolites in an organism simultaneously, rather than focusing
on just one or two. Furthermore to learn how all these pieces interact to create
the emergent properties of life.
Mahasiswa mampu mengintegrasikan informasi pada level genome, transcriptome,
proteome, metabolome dan interactome serta menjelaskan hubungan antara
sinyaling dengan respon organisme untuk kepentingan kelulus hidupan/survival .
Matakuliah Terkait
Kegiatan
Penunjang
Pustaka
1. Marian Walhout, Marc Vidal, Job Dekker (2013) Handbook of Systems Biology:
Concepts and Insights. Academic Press
Panduan Penilaian
35 % UTS, 35 % UAS, 15 % Presentasi, 10 % Tugas, 5 % keaktifan di kelas
Catatan Tambahan
Untuk memperdalam kuliah ini mahasiswa dipersilakan untuk mengambil kuliah:
Aplikasi Omics dan Bioinformatika, pada matakuliah pilihan prodi bioteknologi
Mg#
1
2
Topik
Sub Topik
Pendahuluan
Apakah Biologi
sistem
Gen dan Gene
sequencing
- Analisis
Sequencing
- Contoh dan
implikasinya:
genome project
Hubungan dinamis
replikasi-transkripsi
dan translasi
- Proses
- Control regulasi
Capaian Belajar Mahasiswa
Setelah mengikuti perkuliahan
ini, mahasiswa diharapkan :
mampu menjelaskan apa dan
bagaimana kajian biologi sistem
Mampu menjelaskan biologi
dalam level genomic dan
postgenomic, konsep dan
contoh aplikasinya
Sumber Materi
1
1
Mampu menjelaskan biologi
dalam level transkriptomik
1
konsep dan contoh aplikasinya
Mampu mengidentifikasi
- Factor yang
factor internal dan eksternal
4
Ekspresi gen
berpengaruh
1
yang mempengaruhi optimasi
- Regulasi ekspresi
ekspresi gen
- Tipe protein
Mampu menjelaskan biologi
Protein dan
structural
dalam level metabolomic,
5-6
1
metabolisme
- Protein fungsional : konsep dan contoh aplikasinya,
enzim dan
contoh yg sederhana dan dapat
Bidang Akademik dan Kemahasiswaan ITB
Kur2013-Magister Biologi
Halaman 8 dari 77
Template Dokumen ini adalah milik Direktorat Pendidikan - ITB
Dokumen ini adalah milik Program Studi Magister Biologi ITB.
Dilarang untuk me-reproduksi dokumen ini tanpa diketahui oleh Dirdik-ITB dan S2-BI-ITB.
3
metabolism (siklus
TCA)
7
diaplikasikan pada berbagai
kelompok organisme, contoh
siklus TCA)
Ujian Tengah Semester
8
Sinyaling
- Level sel dan
molecular
- Level organism
9
Respon tumbuh
Pada :
Mikroba
Tumbuhan
Hewan
10
Respon
perkembangan
Pada :
Mikroba
Tumbuhan
Hewan
11
Interaktome
12
Aplikasi 1
Bioinformatik &
synthetic life
13
Aplikasi 2
Pemodelan dalam
system biologi :
pengenalan Mat lab
14
Presentasi
15
Presentasi
Setelah mengikuti perkuliahan
ini, mahasiswa diharapkan
mampu menjelaskan proses serta
peran sinyal internal dan
eksternal, baik pada level sel,
molekul, maupun organisme
Setelah mengikuti perkuliahan
ini, mahasiswa diharapkan
mampu menganalisis pengaruh
internal dan eksternal yang
berkaitan dengan respon tumbuh
pada berbagai contoh organisme
Setelah mengikuti perkuliahan
ini, mahasiswa diharapkan
mampu menganalisis pengaruh
internal dan eksternal yang
berkaitan dengan respon
perkembangan pada berbagai
contoh organisme
mampu menjelaskan biologi
dalam level interaktomik, konsep
dan contoh aplikasinya
Setelah mengikuti perkuliahan
ini, mahasiswa diharapkan
mengenal salah satu aplikasi
utama dalam menganalisis
database, yaitu dengan tools
bioinformatik
Setelah mengikuti perkuliahan
ini, mahasiswa diharapkan
mengenal salah satu aplikasi
utama dalam menganalisis dan
menyederhanakan system yang
kompleks, yaitu dengan
pemodelan
Setelah mengikuti perkuliahan
ini, mahasiswa diharapkan :
a. mampu mengevaluasi artikel,
b. menyimpulkan proses dalam
system biologi dan aplikasinya
dalam kehidupan
c. mampu berkomunikasi secara
lisan dan tulisan
d. mampu mengevaluasi artikel,
e. menyimpulkan proses dalam
system biologi dan aplikasinya
dalam kehidupan
f. mampu berkomunikasi secara
lisan dan tulisan
1
1
1
1
1
1
1
1
Bidang Akademik dan Kemahasiswaan ITB
Kur2013-Magister Biologi
Halaman 9 dari 77
Template Dokumen ini adalah milik Direktorat Pendidikan - ITB
Dokumen ini adalah milik Program Studi Magister Biologi ITB.
Dilarang untuk me-reproduksi dokumen ini tanpa diketahui oleh Dirdik-ITB dan S2-BI-ITB.