Ful-2-PwKKP3T (jarot)bagian8
advertisement
UJI COBA BERBAGAI MARKA AROMATIK Bradbury (Bradbury et al. 2005) ekson 7 m Nonaromatik N Aromatik C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w FM-E7 (Shi et al. 2008) ekson 7 Nonaromatik Aromatik N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w * * * * FM-E2A (Shi et al. 2008) ekson 2 Nonaromatik Aromatik 2 1 2 1 BADEX7-5 (Sakthivel et al. 2009) ekson 7 Nonaromatik Aromatik N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w 1 1 2 2 * * • Padi Non-Aromatik : N = Nipponbare, C = Ciherang, IR = IR64, F = Fatmawati, T = Taipei 309 • Padi Aromatik : M = Mentik Wangi, G = Gunung Perak, RL = Rojo Lele, P = Pandan Wangi, PM = Pulu Mandoti, PK = Pare Kembang, Si = Sintanur, Gi = Gilirang • 2 kelompok tipe mutasi varietas aromatik Indonesia dan mutasi terjadi pada ekson 7 • m = size marker; w = air (kontrol negatif); 1 dan 2 = kelompok 1 dan 2, * = sampel aromatik dengan pola amplifikasi berbeda dibandingkan sampel nonaromatik (kelompok 1) FORWARD SEQUENCE COMPARISON IFAP badh2.7 gene of non-fragrant rices badh2.7 gene mutation/deletion IFAP Exon 7-badh2 gene of group 1fragrant rices: Mentik Wangi and Gunung Perak IFAP Exon 7-badh2 gene of group 2 fragrant rices: Pandan Wangi, Rojolele, Pulu Mandoti , Gilirang, and Pare Kembang GGT ATAT ATTTCAGCTGCTCCTATG IFAP(blk,kplm) Chr TCCTATGGTTAAGGTTTGTTTC AGTTATGAAACTaGGTaaAAAGATTATGGCTTCAGCTGC TCCTATGGTTAAGGTTTGTTTC AGTTATGAAACT-GGT-------ATAT-ATTTCAGCTGC MW T-CTATGGTTAAGGTTTGTTTC AGTTA-GGAGCT-GGT--AACCGCCATGGTCACCG-TGC PW GT AACCGCCATGGTCACCG TGCT CTATG new IFAP ESP INSP IFAP EAP ESP INSP IFAP EAP = = = = TTGTTTGGAGCTTGCTGAGT CTGGTAAAAAGATTAGGCTTA CATAGGAGCAGCTGAAATATATACC AGTGCTTTACAAAGTCCCGC REVERSE SEQUENCE COMPARISON INSP badh2.7 gene mutation/deletion INSP badh2.7 gene of non-fragrant rices INSP IFAP Exon 7-badh2 gene of group 2 fragrant Exon 7-badh2 gene of group 1fragrant rices: Pandan Wangi, Rojolele, Pulu rices: Mentik Wangi and Gunung Perak Mandoti , Gilirang, and Pare Kembang G originally T in Bradbury marker GAAGCCATAATCTTTTTACCAG INSP, blk, kplt Chr CATAGGAGCAGCTGAAGCCATAATCTTTtTACCAGTTTCATAACTCCCAGTAAATGCAAC MW CATAGGAGCAGCTGAA------ATATAT--ACCAGTTTCATAACTCCCAGTAAATGCAAC PW CATAGGAGCAGCTGAAGCCATAATCTCC-TACCAGTTTCATAACTCCCAGTAAACGCAAC ESP INSP IFAP EAP ESP INSP IFAP EAP = = = = TTGTTTGGAGCTTGCTGAGT CTGGTAAAAAGATTAGGCTTA CATAGGAGCAGCTGAAATATATACC AGTGCTTTACAAAGTCCCGC SISTEM MARKA MULTIPLEK DAN DUPLEK MULTIPLEK (4 PRIMER) DUPLEK (2 PRIMER) Aromatik InDel Nonaromatik TARGET PEMULIAAN TANAMAN PADI Pra Panen Toleransi biotik (hama dan penyakit): Panen Pasca Panen Produktivitas tinggi Rasa (pulen/pera) Serangga Ratoon tinggi Aromatik: Jamur Waktu tanam Mikroorganisme (bakteri dan virus) -Nilai Ekonomi Peningkatan produktivitas Toleransi abiotik : Nontransgenik (GMO) Kekeringan Salinitas tinggi Genangan/banjir Lokasi (kondisi tanah, temperatur, dsb.) Resiko kegagalan panen Kuantitas panen Kualitas panen/aspek komersial PERBANDINGAN METODA PEMULIAAN TANAMAN PADI Uraian Persilangan konvensional/acak (Random crossing) Persilangan terarah (Sitedirected crosing) Rekayasa Genetik Produk NonGMO NonGMO GMO Stabilitas Puluhan tahun Puluhan tahun Belum teruji untuk waktu lama Introduksi sifat NonSpesifik/Selektif Spesifik/Selektif Spesifik/Selektif Tidak terarah Terarah Terarah Waktu pengerjaan 4-5 bulan hingga 8 – 10 bulan • 2 – 3 tahun bila mulai dari awal • 4 -5 bulan hingga 8 – 10 bulan bila tersedia BC4F1 2 – 3 tahun Tidak ada Efek negatif Pemasaran produk Tidak bermasalah Tidak ada Tidak bermasalah ? Terhambat regulasi GMO