Document

Disusun Oleh :
Titik Tri Wahyuni
Izatu Mutahiyati
Isnaini Rizka H
Nila Komariah
Kode tugas
Email
B1J006168
B1J006176
B1J006178
B1J006180
: K62-SPP-07
: [email protected]
Draw the general structure of a transfer RNA (tRNA) and explain how this
structure enables the tRNA to play both a physical and an informational role
during protein synthesis
Peran tRNA dalam sintesis protein
Transfer RNAs memainkan peranan penting dalam translasi dan merupakan molekul
adaptor.Untuk mengetahui bagaimana tRNAs memainkan dua peranan ini, harus
dilakukan pengujian aminoacylation, prosesnya dengan mengoreksi asam amino yang
berdekatan dengan tRNA lainnya dan pengenalan kodon-antikodon, interaksi antara
tRNA dan mRNA.
Gambar : Peran adaptor pada tRNA dalam tranlasi
11.1.1.Aminoacylation: penambahan asam amino ke tRNAs
Bakteri mengandung 30–45 tRNAs berbeda dan eukaryotes mempunyai lebih dari 50
tRNA. Hanya 20 asam amino yang digunakan sebagai kode genetik, ini berarti bahwa
semua organisme mempunyai sedikitnya beberapa tRNAs isoaccepting, tRNAs yang
berbeda merupakan spesifik untuk asam amino yang sama. Untuk mencirikan
isoacceptors yang berbeda : sebagai contoh, dua tRNAs yang spesifik untuk glycine
akan tertulis tRNAGly1 dan tRNAGly2
Setelah beberapa tRNAs disekuens, akan ada satu struktur yang terlihat jelas dari
struktur lainnya yang disebut cloverleaf, dan mempunyai fitur sebagai berikut:
• Lengan Akseptor dibentuk dari tujuh pasang basa antara 5' dan ujung 3' suatu
molekul.
•
•
•
•
lengan D, merupakan modifikasi nucleoside dihydrouridine.
Lengan Anticodon berisi triplet nucleotida disebut antikodon pasangan basa
dengan mRNA selama translasi.
loop V berisi 3–5 nucleotides pada Kelas 1 tRNAs atau 13–21 nucleotides
pada Kelas 2 tRNAs.
Lengan TΨC, merupakan nama dari sekuens thymidine-pseudouridinecytosine
Gambar : struktur cloverleaf dari tRNA
Aminoasil-tRNA sintetase menyisipkan asam amino ke tRNAs
Reaksi kimia dari hasil aminoasilasi terjadi dalam dua tahap. Pengaktifan asam amino
intermediet pertama dibentuk oleh reaksi antara asam amino dan ATP, dan kemudian
asam amino ditransfer ke ujung 3' pada tRNA. Penghubungan ini dibentuk antara
guugus-COOH pada asam amino dan gugus-OH disisipkan ke karbon 2' atau 3' pada
gula nuklotida terakhir, yang mana selalu suatu A.
20 Aminoasil-tRNA sintetase jatuh dalam dua kelompok berbeda yaitu Kelas I dan
Kelas II, dengan beberapa perbedaan penting antara keduanya.
Fitur
Enzim Kelas I
Struktur dari lokasi aktif Parallel B - sheet
enzim
Interaksi dengan tRNA
Alur minor pada batang
acceptor
Orientasidari tRNA yang Permukaan V loop yang
terikat
jauh dari enzim
Penyisipan asam amino
Pada
2'-OH
pada
terminal
nukleotida
tRNA
Enzim untuk
Arg, Cys, Gln, Glu, Ile,
Enzim Kelas II
Antiparallel B - sheet
Alur minor pada batang acceptor
Permukaan V loop yang jauh
dari enzim
Pada 3'-'OH pada terminal
nukleotida tRNA
Ala, Asn, Asp, Gly, His, LysII,
Leu, Lys1, Met, Trp, Tyr, Phe, Pro, Thr, Ser
Val
aminoasil-tRNA sintetaseuntuk lisin merupakan enzim Kelas I yang terdapat pada
archaea dan bakteria, sedangkan enzim Kelas II terdapat pada semua organisme lain.
Di beberapa organisme aminoasilasi sebagai pembawa proses yang akan diuraikan,
tapi hanya sedikit yang dibuktikan kebenarannya. Meliputi beberapa contoh dari
aminoasil-tRNA sintetase. Asam amino ini diubah atau dikoreksi dengan reaksi kimia.
Pertama kali ditemukan pada bakteri Bacillus megaterium dengan sintesis glutamine
tRNAcln. Aminoasilasi pembawa dengan respon enzim dari sintesis asam glutamia
tRNAglu dan diambil dari hasil inisiasi dari asam glutamia ke tRNAgln. Asam glutamic
ini diubah ke glutamin dengan katalisis transamidasi dengan proses enzim. Beberapa
archae juga menggunakan transamidasi untuk sintesis asparagin-tRNAasn dari asam
aspartik-tRNAasn yang disintesis dengan proses modifikasi dari 20 kode.
Daftar referensi
Brown, T. A. 2002. Genomes, Second editions. Jhon Wiley and Sons Inc, New York.
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.section.7603 diakses tanggal
19 November 2008
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.7604
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=genomes.figgrp.7612
Situs Terkait
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/bv.fcgi?rid=mcb.section.863
http://www.jbc.org/cgi/content/abstract/245/1/160