(SSR) Genetic Characterization Of Provitamin A

ABSTRAK PENELITIAN POST DOCTORAL
TAHUN 2013
Lembaga Penelitian dan Pengabdian Masyarakat (LP2M)
Universitas Hasanuddin
Kampus Unhas Tamalanrea
Jln. Perintis Kemerdekaan KM. 10 Makassar
Telp. : 0411 587032, , 582500, 588888 Fax.(0411) 587032, 584024
Website : http://www.unhas.ac.id/lppm email : [email protected]
KARAKTERISASI GENETIK JAGUNG PROVITAMIN A LOKAL
SULAWESI SELATAN DENGAN MARKA
SIMPLE SQUENCE REPEAT (SSR)
Genetic Characterization Of Provitamin A Local Corn Of South Sulawesi
With Simple Sequence Repeats Markers
Juhriah1, A. Masniawati1, Muhtadin1
1. Jurusan Biologi FMIPA Universitas Hasanuddin
1. Departemen of Biologi FMIPA Hasanuddin University
[email protected]
Abstrak
Penelitian bertujuan untuk melakukan karakterisasi genetic jagung provitamin A
lokal Sulawesi Selatan berdasarkan marka Simple Sequence Repeat (SSR). 39 individu
dari 13 sumber benih (9 dari Sulawesi Selatan, 2 benih asal CIMMYT, varitas Srikandi
Kuning 1 dan Lamuru) telah dianalisis menggunakan 5 primer Simple Sequence Repeats
(SSR), dilaksanakan di Laboratorium Biologi molekuler Balai Penelitian Serealia
(Balitsereal) Maros Sulawesi Selatan dari bulan juni sampai November 2013. Prosedur
ekstraksi, Polymerase Chain Reaction (PCR) and Electroforesis mengikuti panduan
AMBIONET (2004). Koefisien Similarity dan pengelompokan menggunakan program
NTSYST. Koefisient kesamaan dihitung menggunakan metode Simple Matching
Coefficient ( SMC), dan pengelompokan dengan Unweighted Pair Group Aritmathic
Analysis (UPGMA). Hasil penelitian menunjukkan bahwa jagung provitamin A lokal
Sulawesi Selatan, jagung asal CIMMYT, vareietas Sriukandi kuning 1 dan varietas
Lamuru memiliki kemiripan genetic yang dekat Koefisient kesamaan dari 0,47 sampai
1,00. Pita DNAberada pada posisi 118 – 200 base pair (bp) dengan pita DNA dominan
berada pada 118-151base pair.
Kata kunci : Genetik, jagung, Provitamin A, Sulweasi Selatan, Simple Sequence
Repeat (SSR)