1 BIOKIMIA Prof. Mulyadi, Apt 1. Siklus Krebs: a

1
BIOKIMIA
Prof. Mulyadi, Apt
1. Siklus Krebs:
a. merupakan jalur metabolisme bersama untuk oksidasi molekul bahan bakar seperti
asam amino, asam lemak, dan karbohidrat
b. mempunyai nama lain daur asam trikarboksilat atau daur asam sitrat (DAS)
c. terjadi di mitokondria
d. sebagian besar molekul masuk siklus sebagai asetil KoA
e. semua jawaban benar
2. Komponen piruvat DH terdiri dari 3 enzim yaitu:
a. komponen piruvat DH, dihidrolipoil transasetilase, dan dihidrolipoil DH
b. ?
c. ?
3. Ada 4 macam reaksi redoks yaitu di mana saja?
4. Reaksi yang terjadi di sitosol:
a. glikolisis
b. DAS
c. fosforilasi oksidatif
d. jalur pentosa fosfat
5. Daur glioksilat:
a. ada dua enzim berbeda dari DAS yang terlibat yaitu : isositrat liase dan malat sintetase
b. asetil KoA masuk 2 kali sedangkan pada DAS satu kali
c. memintas 2 langkah dekarboksilasi pada DAS
d. berlangsung di glioksisom
e. all benar
6. Senyawa organik yang mudah terdisosiasi disebut:
a. koenzim
b. aktivator
c. prostetik
d. enzim logam
7. DAS:
a. disebut juga daur asam trikarboksilat karena ...... (alesan salah)
b. ?
c.terjadi di mitokondria
d. ?
8. Reaksi yang tidak dapat balik:
a. reaksi aldolkondensasi
b. ?
2
9. Senyawa 6 karbon:
a. dibentuk dari asetil KoA dan oksaloasetat
b. dipecah manjadi atom 2 C dan 4 C
10. DAS
a. menghasilkan ATP secara tidak langsung
b. tidak ada hubungan dengan metabolik lain
c.?
11. Jalur pentosa fosfat selain menghasilkan ribosa 5-Posfat juga:
1. ?
2. ?
3.?
4. NADPH
12. Glukoneogenesis:
1. terjadi di otot
2. terjadi di hati
3. ?
4. benar...
13. Glikogem
1. sumber energi yang mudah dimetabolisme
2. besar dan bercabang
3. benar
4. benar
14. Glikogen:
a. sumber penyimpanan energi pada hewan
b. ?
c. ?
d. ?
15. Siklus Cori:
1. terjadi glikolisis dan glukoneogenesis
2. ?
16. Debranching enzim:
17. GOT ..... SEBAB ....
18. GPT ......SEBAB .....
19. Epimerase sama dengan isomerase SEBAB isomerase ribulosa Æ ribose
20. Asetil KoA adalah unit 2 karbon SEBAB dihasilkan dari karboksilasi oksidatif
oksidasi asam lemak
21. Asetil KoA adalah unit 3 karbon SEBAB dihasilkan dari dekarboksilasi oksidatif dan
reduksi asam lemak
22. Fosfolipase sebagai enzim berperan dalam pencernaan SEBAB fosfolipase termasuk
enzim oksidasi
23. Rhizobium .....SEBAB ada nitogenase dan reduktase
24. Biosintesis steroid dan ...adalah sama SEBAB memerlukan biotin
3
25. fosfatidil kolin dan fosfatidil serin adalah komponen ... SEBAB mempunyai
komponen sisa asam lemak, gliserol, dan alkohol
26. Fo.... SEBAB donor ... pada pembentukan purin
27. ....SEBAB donor metil
28. NADH dan NADPH adalah reducing agent SEBAB NADH Æ energi, NADPH Æ
biosintesis
29. Glikogen sumber energi besar SEBAB diperhitungkan dari jumlah ATP yang
dihasilkan
30. Lovastatin bisa mengurangi kolestrol SEBAB penghambatan HMG KoA reduktase
31. Kompleks nitrogenasi terdiri dari:
1. reduktase (Mo-protein)
2. reduktase (Fe-protein).
3. nitrogenase (Fe-Protein)
4. nitrogenase (Mo-Fe-protein).
32. Piruvat + glutamate Æ alanin + alfa ketogluatarat. Enzim yang berperan:
a. GOT
b. Transaminase
c. GPT.
d. ?
e. ?
33. GOT dan GPT termasuk enzim:
a. transaminase.
c. oksidase
b. reduktase
d. dehidrogenase
e. liase
34. Piridoksil fosfat termasuk kofaktor: …. (hafalkan yang bagan 4 itu !!)
35. Enzim yang berperan pada pengubahan fenilalanin menjadi tirosin:
a. hidroksilasi
c. ?
e. ?
b. fenilalanin hidroksilase.
d .?
36. Untuk sintesis serin dari 3-fosfogliserol diperlukan enzim:
1. oksidasi.
2. trnsaminasi.
3. hidrolase.
4. ?
4
PAK EDY MEiyanto
1. Di bawah ini termasuk makromolekul, kecuali:
a. glukosa
b. DNA
c. RNA
d. protein
e. glikogen
2. Karakteristik asam amino:
a. punya gugus hidroksil pada C alfa
b. ?
c. punya gugus karbonil pada C alfa
d. punya gugus amida pada C alfa
e. ujungnya N
3. Asam amino yang polar:
a. fenilalanin
b. serin, threonin, tirosin, leusin (salah, harusnya lisin)
c. serin, threonin, tirosin, asam glutamat
d.
4. Struktur primer menunjukkan:
a. urutan asam amino
5. Sttuktur skunder distabilkan oleh : ikatan hidrogen
6. protein serat/fibrous:
1. satu variasi struktur
2. kurang larut dalam air
3. contoh : kolagen
4. disusun oleh beta sheet saja
7. Ikatan yang menyetabilkan kuarterner:
1. hidrogen
2. van der walls
3. hidrofobik
4. ionik
8. reaksi + H2O : enzim hidrolase
9. Protein integral
a. bersifat polar
b. bersifat nonpolar
c. mempunyai domain hidrofobik
10. Km tetap, V max turun:
a. nonkompetitif
5
b. kompetitif
c. lupa
11. [E] + [S] Æ Å [ES] Æ E + P
Persamaan :
a.
b.
c. k+1[E] + [S] – k+2[ES] –k-1[ES]
12. nanti ada persamaan michaelis menten, jika apa ... maka ...
a. V = 1/3 V max (ini jawabannya)
13. Protein integral:
1. kanal ion
2. informasi ...
14. Protein yang terikat karbohidrat:
1.
2.
3.
4.
15. Yang bukan penyusun membran: C. Asam butirat
16. Yang bukan amfilik: A. Asam asetat
17. Pengaruh pH:
1. hidrogen
2. kuarterner
18. Yang meningkatkan fluiditas membran:
1. rantai yang panjang
2. kolestrol
3.
4. tidak jenuh
Jawab: C
19. Sifat membran
a. statis
b. dinamis
c. stabil
20. Tempat terjadinya glikolisis: A. Sitosol
21. Senyawa awal pembentuk glikolisis :
a. glukosa 6-pospat
b. fruktosa 6-posfat
c. glukosa 1-posfat
22. Dari glukosa Æ fruktosa 1,6 bisfosfat : C. Memerluakan 2 ATP
23. ..........................
1....................
6
2. 2 NADH
3. 2 NAD+ dan H=
4. 2 piruvat
24. Vitamin termasuk:
a. holoenzim
b. koenzim
c. regulator
d. katalisator
25. Ada gambar protein bentuk panah:
1. heliks back heliks
2. beta sheet
3. C terminus
4. C terminus
Jawab: C
26. Asam lemak yang jenuh:
1. A 2,3,4
2. A1
3. A2
4. 18:O
27. Bilayer disebabkan oleh: hidrofobik
28. Enzim gliseraldehid 3 pospat DH
1. mengkatalisis pembentukan glukosa 3 pospat
2. mengkatalisis pembentukan 1,3-gli...
3. ...
4. termasuk reduktooksidase
Jawab : C
7
Pembahasan
1. Jawab
:E
DAS (Daur asam sitrat) merupakan kelanjutan dari glikolisis yaitu pengubahan glukosa
menjadi piruvat. Kemudian piruvat mengalami dekarboksilasi oksidatif menjadi asetil
koenzim A (asetil KoA) dan CO2.
Piruvat + KoA + NAD+ Æ asetil KoA + CO2 + NADH
Reaksi di atas berlangsung dalam matriks mitokondria dikatalisis oleh piruvat DH
(degidrogenase).
Gambaran umum DAS:
a. Senyawa 4 karbon (oksaloasetat) berkondensasi dengan unit 2 karbon (asetil KoA di
atas) membentuk unit 6 karbon (sitrat).
H2C
COO-
C
COO-
H2C
COO-
Tuh, ada 3 asam karboksilat khan???
HO
SITRAT
b. Sitrat mengalami isomerisasi menjadi isositrat yang memungkinkan unit 6 C tersebut
bisa melakukan dekarboksilasi. Isomerisasi berlangsung melalui tahap dehidrasi diikuti
hidrasi dengan snyawa antara sis-akonitat.
c. Oksidasi dan dekarboksilasi pertama : isositrat menjadi alfa ketoglutarat
Jadi, dalam DAS ada 4 reaksi redoks. Nah, ini reaksi redoks yang pertama. Kalau
mendengar dekarboksilasi atau ada kompleks NAD+, FAD berarti raksi redoks.
Dalam hal ini, isositrat diubah dengan bantuan enzim isositrat dehidrogenase.
Isositrat + NAD+ Æ alfa ketoglutarat + CO2 + NADH
d. Dekarboksilasi oksidatif kedua : alfa ketoglutarat menjadi suksinil KoA
alfa ketoglutara + NAD+ + KoA Æ suksinil KoA + CO2 + NADH
Katalis : kompleks alfa ketoglutarat dehidrogenase (terdiri dari 3 enzim, mekanisme
mirip kompleks piruvat DH)
e. pembentukan senyawa fosfat energi tinggi dari suksinil KoA
suksinil KoA + Pi + GDP Æ suksinat + GTP + KoA
8
Reaksi ini merupakan stu-satunya langkah dalam DAS yang langsung menghasilkan
senyawa fosfat berenergi tinggi yaitu GTP (digunakan sebagai donor pospat pada sintesis
protein dan transduksi sinyal).
f. Pembentukan kembali oksaloasetat melalui oksidasi suksinat.
Suksinat -----------------Æ oksaloasetat
Ada 3 langkah penting yaitu :
• Oksidasi
• Hidrasi
• Oksidasi kedua
Tuh bener kan, reaksi redoksnya ada 4 macem (yang digaris bawah).
FAD
H2O
NAD+
Suksinat -------Æ Fumarat ---------------Æ Malat -----------------Æ oksaloasetat
•
•
•
Suksinat Æ fumarat : enzim suksinat DH. Digunakan agen pereduksi FAD,
mengapa tidak NAD+? Karena energi bebas tidak cukup untuk mereduksi NAD+.
Pada FAD, dipindahkan 2 atom H dari substrat, makanya terbentuk FADH2.
Fumarat Æ Malat , enzim yaitu fumerase
Malat Æ oksaloasetat, oleh enzim malat DH.
Malat + NAD+ Æ oksaloasetat + NADH + H+
2. Jawab
:A
piruvat mengalami dekarboksilasi oksidatif menjadi asetil koenzim A (asetil KoA) dan
CO2.
Piruvat + KoA + NAD+ Æ asetil KoA + CO2 + NADH
Reaksi di atas berlangsung dalam matriks mitokondria dikatalisis oleh piruvat DH
(degidrogenase).
Komplek piruvat DH
Enzim
Gugus prostetik
Reaksi yang dikatalisis
1. komponen piruvat DH
TPP
Dekarboksilase oksidatif
piruvat
2. dihidrolipoil
Lipoamida
Transfer gugus asetil
transasetilase
kepada KoA
3. dihidrolipoil DH
FAD
Pembentukan kembali
lipoamida bentuk
teroksidasi
9
3. Reaksi redoks terjadi di:
a. isositrat menjadi alfa ketoglutarat
b. alfa ketoglutarat menjadi suksinil KoA
c. suksinat Æ fumarat, hanya ini saja yg pakai FAD, lainya pakai NAD+
d. malat Æ oksaloasetat
4. Jawab: A dan D
DAS terjadi mitokondria
Fosforilasi oksidatif terjadi di membran dalam mitokondria
5. Jawab
:E
Daur glioksilat:
a. kondensasi asril KoA + oksaloasetat menjadi sitrat (enzim : sitrat sintetase)
b. isomerisasi : sitrat menjadi isositrat. Nah, yang ini gak mengalami dekarboksilasi
c. isositrat oleh isositrat liase diubah menjadi suksinat dan glioksilat.
d. setelah ini, asetil KoA yang kedua masuk ke siklus, bereaksi dengan glioksilat dengan
bantuan enzim malat sintetase membentuk malat.
e. malat kemudian diubah menjadi oksaloasetat
6. Jawab
:A
Hafalakan tabel berikut ya!
KOFAKTOR
Organik
Anorganik
TERDISOSIASI
NAD+
NADH
koenzim
NADP
Braktivator
SULIT
prostetik
Enzim logam, misal pada
sitokrom ada Fe
7. Jawab
:C
8. Jawab
:A
9. Jawab
:A
10. Jawab
:A
DAS menghasilkan NADH dan FADH2 yang meuapakan molekul berenergi tinggi
karena masing-masing molekul tersebut mengandung seoasang elektron yang mempunyai
potensial transfer yang tinggi. Jika elektron2 tsb diberikan kepada oksigen, sejumlah
besar energi dilepaskan, dan dapat digunakn untuk menghasilkan ATP.
11. Jawab
12. C
13. E
14. A
15.
16.
17. B
18. C
19. D
:D
10
20. C
21. E
22. D
23. A
24. ?
25. D
26. A
27. A
28. ?
29. ?
30. A
31. C
32. C
33. A
34.
35. B
36. A