Taxonomy dan Klasifikasi

Nurul wiqoyah
• Taxonomy dan Klasifikasi
• TaxonomyPengaturan spesies ke dalam kelompok tertentu
klasifikasi
Sistem phenetik:
hubungan evolusioner
Sequence 16s rRNA
• NOMENCLATURE
•
•
•
•
Binomial nomenclature
Genus & spesies
Classification Hierarchy
Kingdom
Phylum
Class
Ordo
Family
Genus
Spesies
Strain: biovar
serovar
Classification Hierarchy
• Domain
Phylum
Class
Order
Family
Genus
Spesies
Strain
Domain: Archae
Bacteria
Eukarya
• Binomial nomenclature
• Binomial Linneaeus
• Genus
• species
• Ex. Staphylococcus aureus
Kingdom
•
•
•
•
•
•
5 Kingdoms (1967: Whittaker)
Animalia
Plantae
Protista (Unicellular Eucaryotes)
Monera/ Procaryotae
Fungi (Multicellular Eucaryotes)
3
•
•
•
Domain (1978: Woses)
Eubacteria: bacteria
Archaebacteria
Eucaryotes: Protista, Fungi, Plantae and Animalia
Dasar dasar klasifikasi
Karakteristik morfologi
Sifat pengecatan
Sifat fisiologi
Karakteristik ekologi
Karakteristik genetik/ molekuler
Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology 2nded
Seq 16S rRNA
phylogenetik
Vol 1: Archae dan bakteri phototropic dengan cabangnya
Vol 2: Proteobacteria
Vol 3: Bakteri Gram positif dengan G+C rendah
Vol 4: Bakteri Gram positif dengan G+C tinggi
Vol 5: Planctomycetes, spirochaetes, Fibrobacteria,
Bacteroides, Fusobacteria
• 1. Archae dan bakteri phototropic dengan cabangnya
Domain: Archae
Domain: Bacteria
• 2. Proteobacteria (Phyllum Proteobacteria)
Kelas I : Alphaproteobacteria
Ricketsia, Nitrobacter, rhizobium,
Rhodophillum
Kelas II : Betaproteobacteria
Neisseria, Nitrosomonas, Thibacillus
Kelas III : Gammaproteobacteria
Legionella, Pseudomonas, Vibrio, Esobacteria
Kelas IV : Deltaproteobacteria
Bdellovibrio, Myxococcus
Kelas V : Epsiloproteobacteria
Helicobacter, Camphylobacter
3. Bakteri Gram positif dengan G+C rendah (Phyllum Firmicitus)
• Kelas I
: Clostridium
Clostridium, Peptostreptococcus, Desulfumaculum
• Kelas II : Mollicules
• Kelas III: Bacilli
Bacillus, Lactobacillus, Streptococcus,
Enterococcus, Listeria, Staphylococcus
4. Bakteri Gram positif dengan G+C tinggi
• Kelas: Actinobacteria
Actinomyces, Micrococcus, Corynebacterium,
Mycobacterium, Nocardia, Streptomyces
5. Planctomycetes, spirochaetes, Fibrobacteria, Bacteroides,
Fusobacteria
Phyllum: Chlamydia
Chlamydia
Phyllum: Spirochaetes
Spirochaeta, Borrellia, Treponema, Leptospira
Phyllum: Bacteroidetes
Bacteroides, Cytophage
Archae atau Archaebacteria