Silabus+Biokimia+dan+Enzymologi

UNIVERSITAS NEGERI YOGYAKARTA
FAKULTAS MIPA
SILABI
SIL/KIC330/01
18 Februari 2011
Fakultas
Program Studi
Mata Kuliah & Kode
Jumlah sks
Semester
Mata Kuliah Prasyarat
Dosen
: Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (MIPA)
: Kimia
: Biokimia (KIC330)
: Teori 3 sks, Praktek-sks
: Ganjil
: Kimia Organik I dan II
: Togu Gultom, M. Pd, M. Si
I. DESKRIPSI MATA KULIAH
Mata kuliah biokimia terdiri atas tiga bagian yang (1) membahas tentang struktur san fungsi
biomolekul; (2) membahas metabolisme yanitu reaksi-reaksi yang terjadi dalam tubuh makhluk
hidup, dan (3) bagian yang membahas tentang proses-proses kimia yang menyimpan serta
menstransfer informasi biologi dari induk ke anak.
II. STANDAR KOMPETENSI MATA KULIAH
Mendeskripsikan struktur dan fungsi biomolekul, menjelaskan tentang konsep metabolisme
karbohidrat, lemak, protein serta asam lemak; serta mendeskripsikan konsep-konsep biokimia
tentang aliran informasi biologi meliputi replikasi, transkripsi, dan translasi; serta rekayasa
genetika.
III. RENCANA KEGIATAN
Tatap
muka
Kompetensi Dasar
ke :
1
Mendeskripsikan pola fikir
dala biokimia
Materi Pokok
Filosofi Bikimia
1
Strategi
Perkuliahan
1. Diskusi dan
informasi.
Referensi
1. C
2
Mendeskripsikan konsep
struktur dan fungsi
karbohidrat
Karbohidrat:
- Monosakarida
- disakarida
3
Mendeskripsikan hubungan
struktur dengan sifat-sifat
karbohidrat
Karbohidrat dan
polisakarida
4
Mendeskripsikan konsep
struktur dan fungsi lipid
Lipid
- asam lemak
- lemak dan membran
5
Mendeskripsikan konsep
kimia tentang struktur dan
fungsi protein
Protein
- asam amino
- pembagian asam
amino
6
Mendeskripsikan
identifikasi protein dan
asam amino
- Polipeptida
- Pembagian protein
7
Mendeskripsikan struktur
atom
- struktur protein
- identifikasi
protein/as. amino
8
Mendeskripsikan
pengertaian enzim, serta
hubungan antar factor yang
memepengaruhi aktivitas
enzim
Mendeskripsikan konsep
struktur dan fungsi asam
nukleat
9
10
Mendeskripsikan konsep
metabolisme karbohidrat,
hubungannya dengan
kebutuhan energi
11
Mendeskripsikan konsep
metabolisme lipid, dan
hubungannya dengan
kebutuhan energi
UJIAN SISIPAN I
Syruktur enzim, dan
pengelompokan enzim
serta kinetika enzim
Asam nukleat,
penyususn as. Nukleat,
san struktur as. nukleat
Metabolisme karbohidrat
- glikolisis
- siklus pentosa
fosfat
- siklus kreb, dan
fotosintesis
Metabolisme lipid
- β oksidasi
- biosintesis as. lemak
2
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.A.1.C
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.A.1.C
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.A.2.C
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.B.1.C
1.A.1.C
1.A.1.C
1.A.1.C
1.A.1.C
1.A.1.C
1.B.2.C
12
13
14
15
Mendeskripsikan konsep
metabolisme protein, as.
Amino, hubungannya
dengan kebutuhan energi
dan biosintesis protein
Mendeskripsikan konsep
metabolisme nukleotida,
hubungannya dengan
metabolisme karbohidrat,
lipid dan protein
Mendeskripsikan konsep
transformasi inforamsi
biologi
Metabolisme protein
- transsminasi
- deaminasi
- dekarboksilasi
- siklua area
Metabolisme nukletida
dan hubungannya
dengan metabolisme
yang lain
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.B.1.C
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.B.1.C
Transformasi informasi
biologi
- Replikasi
- Transkripsi
- Translasi
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.C.2.C
Menjelaskan hubugnan
antar struktur DNA,
rekayasa genetika dan
penurunan sifat-sifat
gentika
Transformasi dan
rekayasa genetika
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.C.2.C
16
UJIAN SISIPAN II
IV. REFERENSI/ SUMBER BAHAN
1. Acuan Wajib
a. Togu Gultom, 2001, Biokimia Bagian I ” Struktur dan Fungsi”, Yogyakarta : Jurusan Pendidikan
Kimia FMIPA UNY, JICA-IMSTEP.
b. Togu Gultom. 2002. Biokimia Bagian II ” Bagian Metabolisme:, Yogyakarta : Jurusan Pendidikan
Kimia UNY.
c. Lehninger, A, (Alih bahsa Maggy Thenawijaya). 1990. Dasar-dasar Biokimia Jilid I,, II, dan III.
Jakarta : Penerbit Erlangga.
2. Acuan Anjuran.
a. Horton Robert H. Et all, 1996. Principle of Biochemical. Second Edition London : The Prentice Hall
International
b. Wood William B. Et all. 1981. Biochemistry A Problem Approach. London : The
Benjamin/Cumings Publishing Company
c. Akhmaloka. 1990. Asam Nukleat Struktur dan Fungsi. Bandung : Penerbit ITB Bandung
V. EVALUASI
No
Komponen Evaluasi
Bobot (%)
1
Partisipasi Kuliah
10%
2
Tugas-tugas
15 %
3
Ujian Tengah Semester
20 %
4
Ujian Akhir Semester
35 %
JUMLAH
100 %
3
V. KETERANGAN
Strategi Perkuliahan
Tatap Muka
1. Perkuliahan tatap muka
2. Diskusi
3. Presentasi
4. Ujian tengah semester
Non Tatap Muka
5. Kerja lab
6. Tugas individu/kelompok
7. Lainnya
Yogyakarta, Februari 2012
Mengetahui
Ketua Jurusan Pendidikan Kimia
Dosen
Dr. Hari Sutrisno
NIP. 19670407 199203 1 002
Togu Gultom, M. Pd, M. Si dkk
NIP. 19500508 197803 1 001
4
UNIVERSITAS NEGERI YOGYAKARTA
FAKULTAS MIPA
SILABI
SIL/KIM330/01
18 Februari 2011
Fakultas
Program Studi
Mata Kuliah & Kode
Jumlah sks
Semester
Mata Kuliah Prasyarat
Dosen
: Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (MIPA)
: Kimia
: Biokimia (KIM330)
: Teori 3 sks, Praktek-sks
: Ganjil
: Kimia Organik I dan II
: Togu Gultom, M. Pd, M. Si
I. DESKRIPSI MATA KULIAH
Mata kuliah biokimia terdiri atas tiga bagian yang (1) membahas tentang struktur san fungsi
biomolekul; (2) membahas metabolisme yanitu reaksi-reaksi yang terjadi dalam tubuh makhluk
hisup, dan (3) bagian yang membahas tentang proses-proses kimia yang menyimpan serta
menstransfer informasi biologi dari induk ke anak.
II. STANDAR KOMPETENSI MATA KULIAH
Mendeskripsikan struktur dan fungsi biomolekul, menjelaskan tentang konsep metabolisme
karbohidrat, lemak, protein serta asam lemak; serta mendeskripsikan konsep-konsep biokimia
tentang aliran informasi biologi meliputi replikasi, transkripsi, dan translasi; serta rekayasa
genetika.
III. RENCANA KEGIATAN
Tatap
muka
Kompetensi Dasar
ke :
1
Mendeskripsikan pola fikir
dala biokimia
Materi Pokok
Filosofi Bikimia
5
Strategi
Perkuliahan
1. Diskusi dan
informasi.
Referensi
1. C
2
Mendeskripsikan konsep
struktur dan fungsi
karbohidrat
Karbohidrat:
- Monosakarida
- disakarida
3
Mendeskripsikan hubungan
struktur dengan sifat-sifat
karbohidrat
Karbohidrat dan
polisakarida
4
Mendeskripsikan konsep
struktur dan fungsi lipid
Lipid
- asam lemak
- lemak dan membran
5
Mendeskripsikan konsep
kimia tentang struktur dan
fungsi protein
Protein
- asam amino
- pembagian asam
amino
6
Mendeskripsikan
identifikasi protein dan
asam amino
- Polipeptida
- Pembagian protein
7
Mendeskripsikan struktur
atom
- struktur protein
- identifikasi
protein/as. amino
8
Mendeskripsikan
pengertaian enzim, serta
hubungan antar factor yang
memepengaruhi aktivitas
enzim
Mendeskripsikan konsep
struktur dan fungsi asam
nukleat
9
10
Mendeskripsikan konsep
metabolisme karbohidrat,
hubungannya dengan
kebutuhan energi
11
Mendeskripsikan konsep
metabolisme lipid, dan
hubungannya dengan
kebutuhan energi
UJIAN SISIPAN I
Syruktur enzim, dan
pengelompokan enzim
serta kinetika enzim
Asam nukleat,
penyususn as. Nukleat,
san struktur as. nukleat
Metabolisme karbohidrat
- glikolisis
- siklus pentosa
fosfat
- siklus kreb, dan
fotosintesis
Metabolisme lipid
- β oksidasi
- biosintesis as. lemak
6
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.A.1.C
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.A.1.C
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.A.2.C
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.B.1.C
1.A.1.C
1.A.1.C
1.A.1.C
1.A.1.C
1.A.1.C
1.B.2.C
12
13
14
15
Mendeskripsikan konsep
metabolisme protein, as.
Amino, hubungannya
dengan kebutuhan energi
dan biosintesis protein
Mendeskripsikan konsep
metabolisme nukleotida,
hubungannya dengan
metabolisme karbohidrat,
lipid dan protein
Mendeskripsikan konsep
transformasi inforamsi
biologi
Metabolisme protein
- transsminasi
- deaminasi
- dekarboksilasi
- siklua area
Metabolisme nukletida
dan hubungannya
dengan metabolisme
yang lain
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.B.1.C
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.B.1.C
Transformasi informasi
biologi
- Replikasi
- Transkripsi
- Translasi
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.C.2.C
Menjelaskan hubugnan
antar struktur DNA,
rekayasa genetika dan
penurunan sifat-sifat
gentika
Transformasi dan
rekayasa genetika
Diskusi,
Informasi,
Tanya
jawab dan
tugas
1.C.2.C
16
UJIAN SISIPAN II
IV. REFERENSI/ SUMBER BAHAN
1. Acuan Wajib
a. Togu Gultom, 2001, Biokimia Bagian I ” Struktur dan Fungsi”, Yogyakarta : Jurusan Pendidikan
Kimia FMIPA UNY, JICA-IMSTEP.
b. Togu Gultom. 2002. Biokimia Bagian II ” Bagian Metabolisme:, Yogyakarta : Jurusan Pendidikan
Kimia UNY.
c. Lehninger, A, (Alih bahsa Maggy Thenawijaya). 1990. Dasar-dasar Biokimia Jilid I,, II, dan III.
Jakarta : Penerbit Erlangga.
2. Acuan Anjuran.
a. Horton Robert H. Et all, 1996. Principle of Biochemical. Second Edition London : The Prentice Hall
International
b. Wood William B. Et all. 1981. Biochemistry A Problem Approach. London : The
Benjamin/Cumings Publishing Company
c. Akhmaloka. 1990. Asam Nukleat Struktur dan Fungsi. Bandung : Penerbit ITB Bandung
V. EVALUASI
Nomor
Komponen Evaluasi
Bobot (%)
1
Partisipasi Kuliah
10%
2
Tugas-tugas
15 %
3
Ujian Tengah Semester
20 %
4
Ujian Akhir Semester
35 %
JUMLAH
100 %
7
V. KETERANGAN
Strategi Perkuliahan
Tatap Muka
1. Perkuliahan tatap muka
2. Diskusi
3. Presentasi
4. Ujian tengah semester
Non Tatap Muka
5. Kerja lab
6. Tugas individu/kelompok
7. Lainnya
Yogyakarta, 17 September 2011
Mengetahui
Ketua Jurusan Pendidikan Kimia
Dosen
Dr. Suyanta
NIP. 19660508 199203 1 002
Togu Gultom, M. Pd, M. Si dkk
NIP. 19500508 197803 1 001
8
UNIVERSITAS NEGERI YOGYAKARTA
FAKULTAS MIPA
SILABI
SIL/SIK224/02
18 Februari 2011
Fakultas
Program Studi
Mata Kuliah & Kode
Jumlah sks
Semester
Mata Kuliah Prasyarat
Dosen
: Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam (MIPA)
: Kimia
: Enzymologi(SIK224)
: Teori 2 sks, Praktek-sks
: Genap
: Biokimia Umum
: Togu Gultom, M. Pd, M. Si
I. DESKRIPSI MATA KULIAH
Enzimologi berisi uraian bahasan tentang struktur dan fungsi enzim; pengertian tentang enzim;
klasifikasi enzim dan tatanama, enzim monomer dan oligomer, faktor yang mempengaruhi kerja
enzim. Kinetika reaksi enzim mekanisme molekuler enzimatik, mekanisme reaksi tanpa
kofaktor, keterlibatan koenzim dalam reaksi enzimatik, kinetika reaksi enzimatik dengan satu
substrat, hubungan laju reaksi awal dengan konsentrasi, inhibisi, reaksi enzim allosterik.
Aplikasi enzim dalam industri, isolasi dan purifikasi enzim, dan amobilisi enzim.
II. STANDAR KOMPETENSI MATA KULIAH
Mendeskripsikan konsep-konsep dasdr tentang struktur dan fungsi enzim, mejleaskan kinetika
enzim, mendemonstrasikan mekanisme reaksi enzimatik, megisolasi enzim dari bakteri,
mengamobilkan enzim dan mengaplikasikannya dalam industri
III. RENCANA KEGIATAN
Tatap
muka
Kompetensi Dasar
Materi Pokok
ke :
1, 2
Mendeskripsikan struktur san Pengertian dan
fungsi
klasifikasi
9
Strategi
Perkuliahan
1. Diskusi dan
informasi.
Referensi
1A. 2C
3, 4
Menjelaskan pengelompokan
enzim didasarkan kerjanya
Mekanisme kerja
enzim, enzim monomer
oligomer
5, 6
Menjelaskan fungsi
Koenzim, dan Factor yang
mempengaruhi kerja enzim
Koenzim, faktor yang
mempengaruhi enzim
7
UJIAN SISIPAN
Kinetika reaksi enzim
dan inhibisis enzim
8, 9,
10,
11
Menjelaskan pengertian
kinetika reaksi enzim dan
reaksi pengendalian enzim
(Inhibition)
12,
13
Mendeskripsikan amobilisasi
enzim dihubungkan dengan
cara amobilisasi
- Amobilisasi enzim
dalam matriks
14,
15
Mendeskripsikan Isolasi
dengan pemurnian enzim
dari bakteri
Isolasi dan pemurnian
enzim
Diskusi,
Informasi,
tugas
membuat
makalah
Diskusi,
Informasi,
tugas
membuat
makalah
1.A.2.C
Diskusi,
Informasi,
tugas
membuat
makalah
Diskusi,
Informasi,
tugas
membuat
makalah
Diskusi,
Informasi,
tugas
membuat
makalah
1.A.2.C
1.A.2.C
1.A.2.B
2. A
UJIAN AKHIR
IV. REFERENSI/ SUMBER BAHAN
1. Acuan Wajib
a. Togu Gultom, 2003, Pengantar Enzimologi. Yogyakarta : Jurusan Pendidikan Kimia FMIPA UNY,.
2. Acuan Anjuran.
a. Azis Darwis dan E. Sukara. (1990). Isolasi, Purikasi dan Karakterisasi Enzim. Bogor : Pusat Antar
Universitas Bioteknologi.
b. Chibata, I, (1978), Immobilized Enzyme, Research and Development. Tokyo : Kodhansa, Ltd
c. Palmer, T. (1994). Understanding Enzyme. 3th. Edition. Londodn : ellisherword.
V. EVALUASI
Nomor
Komponen Evaluasi
Bobot (%)
1
Partisipasi Kuliah
10%
2
Tugas-tugas
15 %
3
Ujian Tengah Semester
25 %
4
Ujian Akhir Semester
50 %
JUMLAH
100 %
10
V. KETERANGAN
Strategi Perkuliahan
Tatap Muka
1. Perkuliahan tatap muka
2. Diskusi
3. Presentasi
4. Ujian tengah semester
Non Tatap Muka
5. Kerja lab
6. Tugas individu/kelompok
7. Lainnya
Yogyakarta, Februari 2012
Mengetahui
Ketua Jurusan Pendidikan Kimia
Dosen
Dr. Hari Sutrisno
NIP. 19670407 199203 1 002
Togu Gultom, M. Pd, M. Si dkk
NIP. 19500508 197803 1 001
11
UNIVERSITAS NEGERI YOGYAKARTA
FAKULTAS MIPA
SILABI
SIL/SIK224/02
18 Februari 2011
Fakultas
Program Studi
Mata Kuliah/Kode
Jumlah SKS
Semester
Mata Kuliah Prasyarat/Kode
Dosen
: FMIPA
: Pendidikan Kimia
: Enzimologi
: Teori : 2 SKS; Praktek : - SKS
: VII
: Biokimia ; Kode :
: Togu Gultom, M.Pd; M.Si dan Eddy S, Apt, M.Si
I. Diskripsi Mata :
Mata kuliah ini berisi al : Pengertian enzim, Tata nama enzim, Kinetika enzim,
Inhibisi enzim meliputi Michaelis Mnten, Linewaver - Burk, Eddy Hotsfee,
Hanes, dan Dixon, kemudian diikuti amobilisasi ennzim dan isolasi enzim
II. Standar Kompetensi Mata Kuliah
Mampu mendiskripsikan struktur, tata nama, kinetika baik Michaelis Mnten,
Linewaver - Burk, Eddy Hotsfee, Hanes, Dixon dan amobilisasi enzim, serta
isolasi enzim.
III. Rencana Kegiatan
Tatap
muka
ke
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
Kompetensi Dasar
Materi Pokok
Strategi
Standar
Perkuliaha
Beban/Referensi
n
Menjelaskan pengertian Pengantar pengertian enzim Ceramah;
A. Wajib :
enzim
diskusi dan
Mendeskripsikan tatanama Klasifikasi dan tatanama
Tanya
1.Togu
Gultom,
enzim
jawab dan 2011, Pengantar
Menjelaskan mekanisme Mekanisme kerja ennzim
tugas
Enzimologi:
kerja
enzim
dengan
Yogyakarta,
kofaktor
Mekanisme reaksi tanpa
UNY-FMIPA
Menjelaskan mekanisme Kovaktor
A.Tambahan
reaksi tanpa kofaktor
Koenzim turunan vitamin
2. Azis Darwis dan
Menyebutkan
koenzim
Sukara, E. 1990.
turuna vitamin
Koenzim zat anorganik
Isolasi,
Mendeskripsikan koenzim
Purifikasi dan
zat anorganik
Kinetika Reaksi enzim
Karakterisasi
Menjelaskan
kinetika
Enzim, Bogor :
reaksi enzim
Kinetika
Inhibisi
PAU
Menjelaskan
kinetika Irreversibel
Bioteknologi.
reaksi dengan inhibisi
3.Palmer, T, 1984,
irreversibel
Kinetika reaksi reversible
Understanding
Menjelaskan
kinetika
Enzime,
New
reaksi reversible
Kinetika Eddy - Hotsfee
Yorka : The
Menurunkan persamaan
Farmaceutical
12
12
13
14
Reaksi Eddy-Hotsfee
Mendeskripsikan Kinetika
Hanes
Mendeskripsikan kinetika
Dixon
Menjelaskan
proses
amobilisasi enzim
Mendeskripsikan proses
isolasi ennzim
Kinetika Hanes
Press
4. Price C, !984,
Fundamental of
Enzymology,
Oxford : Oxford
Science
Publication
Kinetika Dixon
Amobilisasi Enzim
Isolasi enzim
IV. Referensi/Sumber Bacaan Wajib
A. Wajib
1. Togu Gultom,(2011), Pengantar Enzimologi: Yogyakarta, UNY-FMIPA
B. Lampiran
1. Azis Darwis dan Sukara, E. 1990. Isolasi, Purifikasi dan Karakterisasi Enzim,
Bogor : PAU Biotenologi
2. Palmer, T, 1984, Understanding Enzime, New Yorka : The Farmaceutical Press
3. Price C, !984, Fundamental of Enzymology, Oxford : Oxford Science
V. Evaluasi
No
1
2
3
4
Komponen
Partisipasi kuliah
Tugas-tugas
Ujian tengah semester
Ujian akhir semester
JUmlah
Bobot %
10
15
25
50
100 %
Yogyakarta, Februari 2012
Mengetahui
Ketua Jurusan Pendidikan Kimia
Dosen
Dr. Hari Sutrisno
NIP. 19670407 199203 1 002
Togu Gultom, M. Pd, M. Si dkk
NIP. 19500508 197803 1 001
13
14