Struktur Sel Materi kuliah Bioteknologi Pertanian Kompetensi: 1. Memahami komponen dasar sel, struktur dan fungsinya, 2. Membedakan sel prokariot dan eukariot Jurusan Agribisnis Pertemuan ke 2 Dosen: Kelengkapan materi kuliah: Ir. Sri Sumarsih, MP. Animasi Struktur dan Komponen Sel beserta Fungsi nya DNA E-mail: [email protected] Weblog: Sumarsih07.wordpress.com Website: agriculture.upnyk.ac.id Evaluasi: kapsul flagella pili Membran plasma Dinding sel sitoplasma 1. Pertanyaan lisan 2. Tugas tertulis secara individu Ribosom dlm sitoplasma 1 2 JASAD HIDUP SELULER DAN KLASIFIKASINYA KEANEKARAGAMAN BENTUK KEHIDUPAN DI ALAM – Jasad hidup di alam: non seluler dan seluler – Non seluler: satuan jasad hidup berupa virion bersifat parasit obligat ciri hidup hanya nampak saat berada di dalam sel berupa partikel yang terdiri bahan genetik (DNA/RNA) pada virus dan viroid atau hanya protein pada prion – Seluler: satuan jasad hidup berupa sel ciri hidup tetap nampak tanpa ada interaksi dengan 3 sistem biologis lain – – Semua jasad hidup seluler dapat diidentifikasi sebagai genus dan spesies, misal nama: Canis lupus (serigala) Pengelompokan : kingdom > Phylum > Class > Order > Family > Genus > Species – 6 Kingdom jasad hidup seluler: Sel prokariot •Archaebacteria – bakteri anaerobik •Eubacteria – autotroph dan heterotroph Sel eukariot •Protista – organisme satu sel (awal Eukariot) •Fungi – khamir, mold , mushroom •Plantae - umumnya tumbuhan multiselular •Animalia – hewan multiselular dari sponge sampai manusia 4 Sel tumbuhan yang tersusun membentuk jaringan Sel sperma Penemuan Robert Hooke dan Antonie van Leeuwenhoek Berbagai macam hewan satu sel yang hidup dalam air Animalcule dan Sel yang berisi Juice • Awal penemuan sel: – Galileo melihat mata faset dari insekta – Robert hooke melihat bagian terkecil mahluk hidup yang dia beri nama sel – Van Leeuwenhoek menemukan beberapa tipe sel hidup termasuk sperma – Schleiden and Schwann mengajukan ide bahwa semua kehidupan terdiri sel – Virchow berkesimpulan bahwa sel berasal dari sel 6 Struktur Dasar Sel Jaringan: Kelompok sel yang terorganisasi untuk • Pengorganisasian struktur sel aktivitas khusus Sel : Unit terkecil yang mempunyai kemampuan hidup dan berkembang biak secara mandiri atau bagian dari organisme multiseluler Organel :Isi sel kecuali pada bakteri,yg dikelilingi membran atau bagian terpisah yang punya tugas khusus Molekul: Unit yg terdiri 2 atau lebih atom yang terikat Atom : Unit terkecil unsur yang menyimpan sifat unsur Partikel Subatomik: Elektron, proton, atau netron, yang merupakan penyusun atom 7 – Membran plasma memisahkan sel dari lingkungannya, mengatur aliran molekul yang melalui membran, dan mengandung reseptor yang mempengaruhi aktivitas sel. – Bagian yang mengandung DNA membawa sifat yang diturunkan, dapat digandakan dan diterjemahkan. – Sitoplasma terdapat sistem membran, partikel termasuk ribosom, filamen/ sitoskeleton dan bahan semi-cair – Terdapat 2 macam sel di alam: • Sel Eukariotik yg nampak jelas dapat dibedakan organelnya termasuk membran inti sel • Sel prokariotik / bakteri yang tidak mempunyai inti sel 8 Sel Eukariot Sel Prokariot- Sel Bakteri • Komponen sel utama • Prokariotik berarti sebelum inti, yang menunjukkan keberadaan bakteri sebelum sel berevolusi adalah seperti inti sel; DNA bakteri tersebar dalam plasma (seperti nukleoid) • Bakteri adalah sel terkecil dan paling sederhana – Flagela bakteri terletak pada membran dan merupakan alat gerak. – Dinding sel yang rapuh melindungi dan mengelilingi membran sel, untuk mengatur transport bahan dari dan ke dalam sel. – Ribosome, tempat pembentukan protein, tersebar di dalam sitoplasma. 9 Struktur sel prokariot Ujung hidrofil 1 lapis lipida Ujung hidrofob 1 lapis lipida – Inti yang mengontrol DNA. – Ribosome yang bebas atau terikat membran, tempat pembentukan polipeptida. – Endoplasmic reticule (ER) memodifikasi menjadi protein dan tempat pembentukan lipida/lemak. – Badan golgi juga memodifikasi protein, menyortir dan mengirim protein, dan berperan dalam sekresi atau penggunaan lipida/lemak. – Vesikula untuk transport, penyimpanan dan pencernaan berbagai bahan dalam sel. – Mitochondria membentuk enzim untuk pembentukan ATP. – Sitoskeleton yaitu bentuk sel dan organisasi internal dalam sel; yang menentukan motilitas/ kemampuan bergerak sel 10 Lipid bilayer/ dua lapis lipida MEMBRAN SEL LIPID BILAYER DNA sitoplasma Cairan ekstraseluler kapsul flagella pili Membran plasma Dinding sel sitoplasma Ribosom dlm sitoplasma 12 STRUKTUR SEL TUMBUHAN nuclear enevelope STRUKTUR SEL HEWAN nucleolus NUCLEUS DNA + nucleoplasm Golgi body central vacuole vesicle rough endoplasm reticulum (rough ER) microfilaments (components of cytoskeleton) ribosomes (attached to rough ER) microfilaments vesicle microtubules lysosome components of cytoskeleton rough ER ribosomes (attached to rough ER and free in cytoplasm) ribosomes (free in cytoplasm) smooth endoplasmic reticulum (smooth ER) mitochondrion DNA + nucleoplasm chloroplast nucleolus nuclear envelope NUCLEUS plasma membrane vesicle Golgi body plasma membrane microtubules (components of cytoplasm) pair of centrioles mitochondrion cell wall 20 MACAM ASAM AMINO PENYUSUN PROTEIN KOMPONEN SEL Macam Asam Amino Alanine Arginine Asparagine Asam aspartat Cysteine Glutamine Asam Glutamat Glycine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine Komponen makromolekul penyusun sel terdiri atas: 1. 2. 3. 4. smooth ER Karbohidrat Lemak Protein Asam nukleat Protein adalah polimer asam-asam amino (polipeptida) yang mempunyai berbagai macam fungsi dalam sel: • Sebagai pengatur ekspresi genetik • Protein enzim: biokatalisator reaksi biokimia dalam sel • Sebagai pengangkut molekul kecil dan ion • Berperan dalam sistem pergerakan terkoordinasi • Komponen sistem kekebalan tubuh • Pheromone • Sebagai penerus impuls syaraf • Sebagai komponen pendukung kekuatan regang 15 Simbul 1 Huruf A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V Simbul 3R HurufN Ala Arg Asn Asp Cys Gln Glu Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Ser Thr Trp Tyr Val 16 Kesimpulan • Teori sel: – Semua kehidupan terdiri sel – Sel adalah unit terkecil kehidupan – Sel baru terbentuk hanya dari sel yang sudah ada sebelumnya Kesimpulan… • Membrane tersusun lipid bilayer dan protein tenggelam dalam bilayer atau berada mengambang di permukaannya. • Protein yang menentukan fungsi membran • Sel mempunyai membran plasma, sitoplasma , dan DNA • Protein merupakan komponen sel dengan banyak fungsi • Membran plasma mempertahankan sel sebagai satu kesatuan yang terpisah • Membran dibedakan secara fungsional dengan organel • Sitoplasma terdiri cairan, ribosome and organel dalam sel eukariotik terdapat diantara nucleus dan membran 17 plasma • Membran organel memisahkan reaksi metabolik 18